MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 53236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002607	CCACG	2	10	201369	201378	20 %	0 %	20 %	60 %	15789539
4502	NC_002607	CGGG	2	8	201405	201412	0 %	0 %	75 %	25 %	15789539
4503	NC_002607	CAGC	2	8	201474	201481	25 %	0 %	25 %	50 %	15789539
4504	NC_002607	CCG	2	6	201506	201511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789539
4505	NC_002607	CGA	2	6	201525	201530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789539
4506	NC_002607	ACCAGG	2	12	201545	201556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789539
4507	NC_002607	G	6	6	201581	201586	0 %	0 %	100 %	0 %	15789539
4508	NC_002607	G	6	6	201598	201603	0 %	0 %	100 %	0 %	15789539
4509	NC_002607	GAG	2	6	201621	201626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789540
4510	NC_002607	GTC	3	9	201627	201635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789540
4511	NC_002607	GAG	2	6	201636	201641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789540
4512	NC_002607	GCT	2	6	201662	201667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789540
4513	NC_002607	GGC	2	6	201668	201673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789540
4514	NC_002607	ACC	2	6	201768	201773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789540
4515	NC_002607	GAC	2	6	201774	201779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789540
4516	NC_002607	CGC	2	6	201785	201790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789540
4517	NC_002607	GAC	2	6	201792	201797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789540
4518	NC_002607	TCG	2	6	201811	201816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789540
4519	NC_002607	AGC	2	6	201906	201911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789540
4520	NC_002607	GCC	2	6	201936	201941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789540
4521	NC_002607	ACG	2	6	201961	201966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789540
4522	NC_002607	ACG	2	6	201982	201987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789540
4523	NC_002607	GGTGCG	2	12	201998	202009	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15789540
4524	NC_002607	GTC	2	6	202022	202027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789540
4525	NC_002607	CGG	2	6	202084	202089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789540
4526	NC_002607	CGGGT	2	10	202153	202162	0 %	20 %	60 %	20 %	15789540
4527	NC_002607	GTT	2	6	202235	202240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15789540
4528	NC_002607	CG	4	8	202244	202251	0 %	0 %	50 %	50 %	15789540
4529	NC_002607	CCG	2	6	202252	202257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789540
4530	NC_002607	CGC	2	6	202271	202276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789540
4531	NC_002607	CGC	2	6	202307	202312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789540
4532	NC_002607	GGAG	2	8	202352	202359	25 %	0 %	75 %	0 %	15789540
4533	NC_002607	CGA	2	6	202363	202368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789540
4534	NC_002607	CGA	2	6	202370	202375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789540
4535	NC_002607	CCA	2	6	202376	202381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789540
4536	NC_002607	GACGCC	2	12	202401	202412	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15789540
4537	NC_002607	GCC	2	6	202519	202524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789541
4538	NC_002607	CCG	2	6	202543	202548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789541
4539	NC_002607	GTGG	2	8	202605	202612	0 %	25 %	75 %	0 %	15789541
4540	NC_002607	AGC	2	6	202615	202620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789541
4541	NC_002607	GCAACC	2	12	202621	202632	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15789541
4542	NC_002607	CGG	2	6	202667	202672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789541
4543	NC_002607	CCG	2	6	202684	202689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789541
4544	NC_002607	TGC	2	6	202703	202708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789541
4545	NC_002607	CGG	2	6	202721	202726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789541
4546	NC_002607	GGCGT	2	10	202750	202759	0 %	20 %	60 %	20 %	15789541
4547	NC_002607	GGT	2	6	202761	202766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789541
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4551	NC_002607	CGG	2	6	202844	202849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789541
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4553	NC_002607	GA	3	6	202870	202875	50 %	0 %	50 %	0 %	15789541
4554	NC_002607	TCG	2	6	202876	202881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789541
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4557	NC_002607	GC	3	6	202927	202932	0 %	0 %	50 %	50 %	15789541
4558	NC_002607	CGG	2	6	202934	202939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789541
4559	NC_002607	CGA	2	6	202979	202984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789541
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4561	NC_002607	GC	3	6	203036	203041	0 %	0 %	50 %	50 %	15789541
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4564	NC_002607	ACG	2	6	203200	203205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789541
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4578	NC_002607	CGCC	2	8	203741	203748	0 %	0 %	25 %	75 %	15789542
4579	NC_002607	CAC	2	6	203750	203755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789542
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4602	NC_002607	CG	3	6	204276	204281	0 %	0 %	50 %	50 %	15789542
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4606	NC_002607	GC	3	6	204337	204342	0 %	0 %	50 %	50 %	15789542
4607	NC_002607	TGG	2	6	204382	204387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789542
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4747	NC_002607	CTT	2	6	209086	209091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15789546
4748	NC_002607	CGA	3	9	209092	209100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789546
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4990	NC_002607	GCT	2	6	216852	216857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789556
4991	NC_002607	CGCC	2	8	216862	216869	0 %	0 %	25 %	75 %	15789556
4992	NC_002607	TTCG	2	8	216886	216893	0 %	50 %	25 %	25 %	15789556
4993	NC_002607	GCC	2	6	216923	216928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789556
4994	NC_002607	CCG	2	6	216989	216994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789557
4995	NC_002607	AGC	2	6	217013	217018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789557
4996	NC_002607	GCGAC	2	10	217025	217034	20 %	0 %	40 %	40 %	15789557
4997	NC_002607	GC	3	6	217103	217108	0 %	0 %	50 %	50 %	15789557
4998	NC_002607	GCC	2	6	217114	217119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789557
4999	NC_002607	CGA	2	6	217122	217127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789557
5000	NC_002607	GC	3	6	217146	217151	0 %	0 %	50 %	50 %	15789557

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