MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 3240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_001869	CGC	2	6	118273	118278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803652
2002	NC_001869	CG	3	6	118282	118287	0 %	0 %	50 %	50 %	10803652
2003	NC_001869	TCC	2	6	118302	118307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803652
2004	NC_001869	TC	3	6	118354	118359	0 %	50 %	0 %	50 %	10803652
2005	NC_001869	CGA	3	9	118393	118401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2006	NC_001869	GCA	2	6	118419	118424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2007	NC_001869	CGA	2	6	118471	118476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2008	NC_001869	CAC	2	6	118477	118482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803652
2009	NC_001869	AG	3	6	118604	118609	50 %	0 %	50 %	0 %	10803652
2010	NC_001869	C	6	6	118647	118652	0 %	0 %	0 %	100 %	10803652
2011	NC_001869	CGA	2	6	118660	118665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2012	NC_001869	AC	3	6	118725	118730	50 %	0 %	0 %	50 %	10803652
2013	NC_001869	GA	3	6	118767	118772	50 %	0 %	50 %	0 %	10803652
2014	NC_001869	CCA	3	9	118789	118797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803652
2015	NC_001869	G	6	6	118889	118894	0 %	0 %	100 %	0 %	10803652
2016	NC_001869	CGT	2	6	118896	118901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2017	NC_001869	CGA	3	9	118903	118911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2018	NC_001869	GGT	2	6	118918	118923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803652
2019	NC_001869	TTG	2	6	118962	118967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803652
2020	NC_001869	CGG	2	6	118978	118983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803652
2021	NC_001869	TGC	2	6	119065	119070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2022	NC_001869	GAC	2	6	119129	119134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2023	NC_001869	GCT	2	6	119176	119181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2024	NC_001869	GAG	2	6	119183	119188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803652
2025	NC_001869	CGA	2	6	119200	119205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2026	NC_001869	AGC	2	6	119217	119222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2027	NC_001869	ATT	2	6	119230	119235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10803652
2028	NC_001869	CGA	2	6	119256	119261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2029	NC_001869	CGA	2	6	119265	119270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2030	NC_001869	GCT	2	6	119282	119287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2031	NC_001869	CGC	2	6	119323	119328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803652
2032	NC_001869	TTC	2	6	119372	119377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803652
2033	NC_001869	CGGT	2	8	119378	119385	0 %	25 %	50 %	25 %	10803652
2034	NC_001869	AGC	2	6	119451	119456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2035	NC_001869	GC	3	6	119455	119460	0 %	0 %	50 %	50 %	10803652
2036	NC_001869	CGG	2	6	119474	119479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803652
2037	NC_001869	GTGG	2	8	119530	119537	0 %	25 %	75 %	0 %	10803652
2038	NC_001869	CGA	2	6	119545	119550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2039	NC_001869	CGA	2	6	119569	119574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2040	NC_001869	AGG	2	6	119625	119630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803652
2041	NC_001869	GCG	2	6	119681	119686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803652
2042	NC_001869	ACG	2	6	119687	119692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2043	NC_001869	CGG	2	6	119693	119698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803652
2044	NC_001869	GGC	2	6	119704	119709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803652
2045	NC_001869	GAA	2	6	119719	119724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803652
2046	NC_001869	CGC	2	6	119779	119784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803652
2047	NC_001869	GGC	2	6	119824	119829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803652
2048	NC_001869	GC	3	6	119883	119888	0 %	0 %	50 %	50 %	10803652
2049	NC_001869	GCT	2	6	119923	119928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2050	NC_001869	CGA	2	6	119941	119946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
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2052	NC_001869	GAA	2	6	120043	120048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803652
2053	NC_001869	TCG	2	6	120090	120095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2054	NC_001869	GTG	2	6	120136	120141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803652
2055	NC_001869	GA	3	6	120189	120194	50 %	0 %	50 %	0 %	10803652
2056	NC_001869	GCC	2	6	120245	120250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803652
2057	NC_001869	GCG	2	6	120290	120295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803652
2058	NC_001869	AGT	2	6	120307	120312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803652
2059	NC_001869	GAG	2	6	120317	120322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803652
2060	NC_001869	GTG	2	6	120323	120328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803652
2061	NC_001869	CAG	2	6	120347	120352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2062	NC_001869	CCT	2	6	120361	120366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803652
2063	NC_001869	CGT	2	6	120402	120407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803652
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2065	NC_001869	GCA	2	6	120454	120459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
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2068	NC_001869	GTC	2	6	121212	121217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803653
2069	NC_001869	GCC	2	6	121235	121240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803653
2070	NC_001869	CGA	2	6	121309	121314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803653
2071	NC_001869	CTA	2	6	121366	121371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803653
2072	NC_001869	CGA	2	6	121411	121416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803653
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2074	NC_001869	CGA	2	6	121464	121469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803653
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2080	NC_001869	GTG	2	6	121644	121649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803653
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2082	NC_001869	GC	4	8	121689	121696	0 %	0 %	50 %	50 %	10803653
2083	NC_001869	CGT	2	6	121730	121735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803653
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2087	NC_001869	CGC	3	9	121993	122001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803653
2088	NC_001869	GA	3	6	122025	122030	50 %	0 %	50 %	0 %	10803653
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2090	NC_001869	CGA	2	6	122068	122073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803653
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2092	NC_001869	GAG	2	6	122258	122263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803653
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2094	NC_001869	TCGG	2	8	122311	122318	0 %	25 %	50 %	25 %	10803653
2095	NC_001869	CTT	2	6	122789	122794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803654
2096	NC_001869	GTCT	2	8	122852	122859	0 %	50 %	25 %	25 %	10803654
2097	NC_001869	GCG	2	6	122876	122881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803654
2098	NC_001869	GAC	2	6	122964	122969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803654
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2101	NC_001869	TCGG	2	8	123054	123061	0 %	25 %	50 %	25 %	10803654
2102	NC_001869	CAG	2	6	123063	123068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803654
2103	NC_001869	AACA	2	8	123141	123148	75 %	0 %	0 %	25 %	10803654
2104	NC_001869	CG	3	6	123182	123187	0 %	0 %	50 %	50 %	10803654
2105	NC_001869	TCG	2	6	123256	123261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803654
2106	NC_001869	CGGCA	2	10	123542	123551	20 %	0 %	40 %	40 %	10803654
2107	NC_001869	CAT	2	6	123636	123641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803654
2108	NC_001869	CTG	2	6	124245	124250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803655
2109	NC_001869	CGG	2	6	124280	124285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803655
2110	NC_001869	CGT	2	6	124288	124293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803655
2111	NC_001869	CAAG	2	8	124377	124384	50 %	0 %	25 %	25 %	10803655
2112	NC_001869	ATG	2	6	124470	124475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803655
2113	NC_001869	GGA	2	6	124567	124572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803655
2114	NC_001869	TGC	2	6	124610	124615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803656
2115	NC_001869	CGCC	2	8	124626	124633	0 %	0 %	25 %	75 %	10803656
2116	NC_001869	CAG	2	6	124673	124678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803656
2117	NC_001869	GCG	2	6	124710	124715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803656
2118	NC_001869	CGCTG	2	10	124734	124743	0 %	20 %	40 %	40 %	10803656
2119	NC_001869	GAG	2	6	124768	124773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803656
2120	NC_001869	GT	3	6	124794	124799	0 %	50 %	50 %	0 %	10803656
2121	NC_001869	CCA	2	6	124825	124830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803656
2122	NC_001869	GTC	2	6	124916	124921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803656
2123	NC_001869	GC	3	6	124949	124954	0 %	0 %	50 %	50 %	10803656
2124	NC_001869	CCG	2	6	124987	124992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803656
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2127	NC_001869	CT	3	6	125170	125175	0 %	50 %	0 %	50 %	10803656
2128	NC_001869	CAT	2	6	125176	125181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803656
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2131	NC_001869	GAC	2	6	125269	125274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803656
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2236	NC_001869	CT	3	6	132285	132290	0 %	50 %	0 %	50 %	10803665
2237	NC_001869	GTAGCG	2	12	132376	132387	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	10803666
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2245	NC_001869	CAC	2	6	132639	132644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803666
2246	NC_001869	TCC	2	6	132745	132750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803666
2247	NC_001869	GAA	2	6	132753	132758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803666
2248	NC_001869	GTC	2	6	132795	132800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803666
2249	NC_001869	CGA	2	6	132821	132826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803666
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2251	NC_001869	ATC	2	6	132921	132926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803666
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2254	NC_001869	CGT	2	6	133040	133045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803666
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2263	NC_001869	TCA	2	6	133441	133446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803666
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2275	NC_001869	GCTC	2	8	134446	134453	0 %	25 %	25 %	50 %	10803667
2276	NC_001869	CAG	2	6	134454	134459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803667
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2490	NC_001869	GCT	2	6	145872	145877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803678
2491	NC_001869	CTG	3	9	145907	145915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803678
2492	NC_001869	CTC	2	6	145927	145932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803678
2493	NC_001869	GTT	2	6	145992	145997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803678
2494	NC_001869	GAG	2	6	145999	146004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803678
2495	NC_001869	ACG	2	6	146052	146057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803679
2496	NC_001869	CT	3	6	146058	146063	0 %	50 %	0 %	50 %	10803679
2497	NC_001869	ACG	2	6	146064	146069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803679
2498	NC_001869	GAC	2	6	146108	146113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803679
2499	NC_001869	CGGA	2	8	146150	146157	25 %	0 %	50 %	25 %	10803679
2500	NC_001869	CGA	2	6	146176	146181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803679

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