MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 3240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_001869	ATCGG	2	10	27632	27641	20 %	20 %	40 %	20 %	10803577
502	NC_001869	CGA	2	6	27651	27656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803577
503	NC_001869	CGG	2	6	27795	27800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803577
504	NC_001869	CGA	2	6	27912	27917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803577
505	NC_001869	ATCCCC	2	12	27919	27930	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	10803577
506	NC_001869	GCG	2	6	28034	28039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803577
507	NC_001869	CCT	2	6	28062	28067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803577
508	NC_001869	ATG	2	6	28225	28230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803577
509	NC_001869	TCC	2	6	28244	28249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803577
510	NC_001869	GC	3	6	28278	28283	0 %	0 %	50 %	50 %	10803577
511	NC_001869	GAG	2	6	28285	28290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803577
512	NC_001869	CGA	2	6	28386	28391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803577
513	NC_001869	CTG	2	6	28402	28407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803577
514	NC_001869	CTT	2	6	28413	28418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803577
515	NC_001869	TGCT	2	8	28429	28436	0 %	50 %	25 %	25 %	10803577
516	NC_001869	GTC	2	6	28522	28527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803577
517	NC_001869	GGT	2	6	28540	28545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803577
518	NC_001869	TTC	2	6	28567	28572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803577
519	NC_001869	CCT	2	6	28587	28592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803577
520	NC_001869	CCT	2	6	28608	28613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803577
521	NC_001869	AT	3	6	28621	28626	50 %	50 %	0 %	0 %	10803577
522	NC_001869	ATC	2	6	28646	28651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803577
523	NC_001869	CTT	2	6	28734	28739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803577
524	NC_001869	GCT	2	6	28767	28772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803577
525	NC_001869	TGCGC	2	10	28776	28785	0 %	20 %	40 %	40 %	10803577
526	NC_001869	CAG	2	6	28822	28827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803577
527	NC_001869	CGG	2	6	28875	28880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803577
528	NC_001869	AGTCGT	2	12	29016	29027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	10803577
529	NC_001869	TCG	2	6	29030	29035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803577
530	NC_001869	GTC	2	6	29086	29091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803577
531	NC_001869	C	11	11	29165	29175	0 %	0 %	0 %	100 %	10803577
532	NC_001869	GATT	2	8	29323	29330	25 %	50 %	25 %	0 %	10803577
533	NC_001869	GTC	2	6	29369	29374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803577
534	NC_001869	TGT	2	6	29390	29395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803577
535	NC_001869	GAC	2	6	29404	29409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803577
536	NC_001869	CGA	2	6	29413	29418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803577
537	NC_001869	ACCATC	2	12	30062	30073	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	10803578
538	NC_001869	TC	3	6	30115	30120	0 %	50 %	0 %	50 %	10803578
539	NC_001869	CGA	2	6	30190	30195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803578
540	NC_001869	GTCG	2	8	30199	30206	0 %	25 %	50 %	25 %	10803578
541	NC_001869	GCT	2	6	30211	30216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803578
542	NC_001869	TCA	2	6	30237	30242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803578
543	NC_001869	CGG	2	6	30244	30249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803578
544	NC_001869	GGA	2	6	30301	30306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803578
545	NC_001869	AGCG	2	8	30652	30659	25 %	0 %	50 %	25 %	10803579
546	NC_001869	GCG	2	6	30723	30728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803579
547	NC_001869	GTG	2	6	30729	30734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803579
548	NC_001869	CGC	2	6	30793	30798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803579
549	NC_001869	TCA	2	6	30824	30829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803579
550	NC_001869	AGC	2	6	30872	30877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803579
551	NC_001869	CAG	2	6	30880	30885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803579
552	NC_001869	CAC	2	6	30907	30912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803579
553	NC_001869	CAACT	2	10	30973	30982	40 %	20 %	0 %	40 %	10803579
554	NC_001869	CCG	2	6	31014	31019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803579
555	NC_001869	GGT	2	6	31056	31061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803579
556	NC_001869	GTC	2	6	31063	31068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803579
557	NC_001869	TCG	2	6	31076	31081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803579
558	NC_001869	CGA	2	6	31089	31094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803579
559	NC_001869	TTCGAC	2	12	31150	31161	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	10803579
560	NC_001869	ATC	2	6	31189	31194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803579
561	NC_001869	GCT	2	6	31209	31214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803579
562	NC_001869	TCG	2	6	31316	31321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803579
563	NC_001869	CGG	2	6	31334	31339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803579
564	NC_001869	CTC	2	6	31498	31503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803579
565	NC_001869	GA	3	6	31526	31531	50 %	0 %	50 %	0 %	10803579
566	NC_001869	ATC	2	6	31565	31570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803579
567	NC_001869	TCG	2	6	31622	31627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803579
568	NC_001869	CGA	2	6	31638	31643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803579
569	NC_001869	GCG	2	6	31766	31771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803579
570	NC_001869	TGA	2	6	33430	33435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803580
571	NC_001869	TCA	2	6	33441	33446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803580
572	NC_001869	CTCC	2	8	33502	33509	0 %	25 %	0 %	75 %	10803580
573	NC_001869	CTGC	2	8	33604	33611	0 %	25 %	25 %	50 %	10803580
574	NC_001869	CCG	2	6	33633	33638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803580
575	NC_001869	ATTTCA	2	12	33642	33653	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10803580
576	NC_001869	TCG	2	6	33726	33731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803580
577	NC_001869	TAG	3	9	33735	33743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803580
578	NC_001869	TCG	2	6	33834	33839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803580
579	NC_001869	TGC	2	6	33931	33936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803580
580	NC_001869	AGT	2	6	33989	33994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803580
581	NC_001869	GCT	2	6	33996	34001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803580
582	NC_001869	AT	3	6	34014	34019	50 %	50 %	0 %	0 %	10803580
583	NC_001869	CGA	2	6	34024	34029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803580
584	NC_001869	GAC	2	6	34079	34084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803580
585	NC_001869	ATC	2	6	34085	34090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803580
586	NC_001869	TGA	2	6	34212	34217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803580
587	NC_001869	GAA	2	6	34557	34562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803581
588	NC_001869	CGC	2	6	34608	34613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803581
589	NC_001869	GGC	2	6	34627	34632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803581
590	NC_001869	CTG	2	6	34708	34713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803581
591	NC_001869	CA	3	6	34724	34729	50 %	0 %	0 %	50 %	10803581
592	NC_001869	TGC	3	9	34823	34831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803581
593	NC_001869	CGC	2	6	34866	34871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803581
594	NC_001869	CGACG	2	10	34875	34884	20 %	0 %	40 %	40 %	10803581
595	NC_001869	TTC	2	6	34885	34890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803581
596	NC_001869	AGCA	2	8	34906	34913	50 %	0 %	25 %	25 %	10803581
597	NC_001869	ACC	2	6	34954	34959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803581
598	NC_001869	TCG	2	6	34964	34969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803581
599	NC_001869	AC	3	6	35024	35029	50 %	0 %	0 %	50 %	10803581
600	NC_001869	CGCC	2	8	35046	35053	0 %	0 %	25 %	75 %	10803581
601	NC_001869	CGC	2	6	35079	35084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803581
602	NC_001869	TGGA	2	8	35101	35108	25 %	25 %	50 %	0 %	10803581
603	NC_001869	CG	3	6	35190	35195	0 %	0 %	50 %	50 %	10803581
604	NC_001869	TG	3	6	35228	35233	0 %	50 %	50 %	0 %	10803581
605	NC_001869	TCT	2	6	35240	35245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803581
606	NC_001869	CGA	2	6	35246	35251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803581
607	NC_001869	CGTG	2	8	35274	35281	0 %	25 %	50 %	25 %	10803581
608	NC_001869	GTC	2	6	35326	35331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803581
609	NC_001869	CGA	2	6	36019	36024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803582
610	NC_001869	CT	3	6	36026	36031	0 %	50 %	0 %	50 %	10803582
611	NC_001869	GA	3	6	36081	36086	50 %	0 %	50 %	0 %	10803582
612	NC_001869	GAT	2	6	36092	36097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803582
613	NC_001869	CGC	2	6	36202	36207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803582
614	NC_001869	CGC	2	6	36217	36222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803582
615	NC_001869	CTGAA	2	10	36240	36249	40 %	20 %	20 %	20 %	10803582
616	NC_001869	GTT	2	6	36397	36402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803582
617	NC_001869	CGG	2	6	36421	36426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803582
618	NC_001869	GAA	2	6	36473	36478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803582
619	NC_001869	CGA	2	6	36538	36543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803582
620	NC_001869	GAG	2	6	36650	36655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803582
621	NC_001869	ACG	2	6	36693	36698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803582
622	NC_001869	GC	3	6	36705	36710	0 %	0 %	50 %	50 %	10803582
623	NC_001869	GC	3	6	36734	36739	0 %	0 %	50 %	50 %	10803582
624	NC_001869	CTG	2	6	36752	36757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803582
625	NC_001869	AGGG	2	8	36762	36769	25 %	0 %	75 %	0 %	10803582
626	NC_001869	GAT	2	6	36840	36845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803582
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628	NC_001869	CGG	2	6	36946	36951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803583
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750	NC_001869	GTC	2	6	45540	45545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803589
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753	NC_001869	CTC	2	6	45978	45983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803590
754	NC_001869	ACGTC	2	10	46033	46042	20 %	20 %	20 %	40 %	10803590
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756	NC_001869	CGA	2	6	46082	46087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
757	NC_001869	CGA	2	6	46109	46114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
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