MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 4069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000921	GAGC	2	8	68	75	25 %	0 %	50 %	25 %	15611072
2	NC_000921	CATT	2	8	154	161	25 %	50 %	0 %	25 %	15611072
3	NC_000921	TCTG	2	8	850	857	0 %	50 %	25 %	25 %	15611073
4	NC_000921	AAAT	2	8	952	959	75 %	25 %	0 %	0 %	15611074
5	NC_000921	GCTT	2	8	1495	1502	0 %	50 %	25 %	25 %	15611074
6	NC_000921	CCTG	2	8	1850	1857	0 %	25 %	25 %	50 %	15611075
7	NC_000921	CCAA	2	8	1874	1881	50 %	0 %	0 %	50 %	15611075
8	NC_000921	TTAT	2	8	1896	1903	25 %	75 %	0 %	0 %	15611075
9	NC_000921	TGAA	2	8	1914	1921	50 %	25 %	25 %	0 %	15611075
10	NC_000921	AATG	2	8	2104	2111	50 %	25 %	25 %	0 %	15611075
11	NC_000921	ATTC	2	8	2389	2396	25 %	50 %	0 %	25 %	15611075
12	NC_000921	TCTT	2	8	2596	2603	0 %	75 %	0 %	25 %	15611076
13	NC_000921	CAAA	2	8	3139	3146	75 %	0 %	0 %	25 %	15611076
14	NC_000921	GAAA	2	8	3285	3292	75 %	0 %	25 %	0 %	15611077
15	NC_000921	GAAA	2	8	3360	3367	75 %	0 %	25 %	0 %	15611077
16	NC_000921	AGAA	2	8	3816	3823	75 %	0 %	25 %	0 %	15611077
17	NC_000921	ATAG	2	8	3871	3878	50 %	25 %	25 %	0 %	15611077
18	NC_000921	TCGC	2	8	5572	5579	0 %	25 %	25 %	50 %	15611078
19	NC_000921	CATT	2	8	5645	5652	25 %	50 %	0 %	25 %	15611078
20	NC_000921	TTGT	2	8	5925	5932	0 %	75 %	25 %	0 %	15611078
21	NC_000921	ATCG	2	8	7200	7207	25 %	25 %	25 %	25 %	15611078
22	NC_000921	CGTT	2	8	7235	7242	0 %	50 %	25 %	25 %	15611078
23	NC_000921	TTCA	2	8	8004	8011	25 %	50 %	0 %	25 %	15611079
24	NC_000921	GATA	2	8	10105	10112	50 %	25 %	25 %	0 %	15611081
25	NC_000921	TCAA	2	8	10212	10219	50 %	25 %	0 %	25 %	15611081
26	NC_000921	ATTG	2	8	10567	10574	25 %	50 %	25 %	0 %	15611081
27	NC_000921	TTTG	2	8	11032	11039	0 %	75 %	25 %	0 %	15611081
28	NC_000921	CTTT	2	8	11660	11667	0 %	75 %	0 %	25 %	15611081
29	NC_000921	ATTG	2	8	12007	12014	25 %	50 %	25 %	0 %	15611082
30	NC_000921	GCAA	2	8	12198	12205	50 %	0 %	25 %	25 %	15611082
31	NC_000921	TGCT	2	8	12403	12410	0 %	50 %	25 %	25 %	15611082
32	NC_000921	GCCA	2	8	12643	12650	25 %	0 %	25 %	50 %	15611082
33	NC_000921	TGCA	2	8	12882	12889	25 %	25 %	25 %	25 %	15611083
34	NC_000921	AGCA	2	8	12937	12944	50 %	0 %	25 %	25 %	15611083
35	NC_000921	GTTT	2	8	13295	13302	0 %	75 %	25 %	0 %	15611083
36	NC_000921	TCTT	2	8	13682	13689	0 %	75 %	0 %	25 %	15611083
37	NC_000921	AGCG	2	8	14154	14161	25 %	0 %	50 %	25 %	15611085
38	NC_000921	GATT	2	8	14262	14269	25 %	50 %	25 %	0 %	15611085
39	NC_000921	CAAA	2	8	14431	14438	75 %	0 %	0 %	25 %	15611086
40	NC_000921	CACT	2	8	14800	14807	25 %	25 %	0 %	50 %	15611086
41	NC_000921	TTTA	2	8	15433	15440	25 %	75 %	0 %	0 %	15611086
42	NC_000921	CAGG	2	8	16591	16598	25 %	0 %	50 %	25 %	15611086
43	NC_000921	TGAT	2	8	16635	16642	25 %	50 %	25 %	0 %	15611086
44	NC_000921	AGTT	2	8	16763	16770	25 %	50 %	25 %	0 %	15611086
45	NC_000921	GCTT	2	8	17618	17625	0 %	50 %	25 %	25 %	15611087
46	NC_000921	TGAT	2	8	17852	17859	25 %	50 %	25 %	0 %	15611087
47	NC_000921	GTTT	2	8	18393	18400	0 %	75 %	25 %	0 %	15611087
48	NC_000921	TTGA	2	8	18746	18753	25 %	50 %	25 %	0 %	15611088
49	NC_000921	AGCG	2	8	19294	19301	25 %	0 %	50 %	25 %	15611088
50	NC_000921	GATA	2	8	20301	20308	50 %	25 %	25 %	0 %	15611089
51	NC_000921	TAAA	2	8	20854	20861	75 %	25 %	0 %	0 %	15611090
52	NC_000921	GCGA	2	8	20863	20870	25 %	0 %	50 %	25 %	15611090
53	NC_000921	AGGC	2	8	21295	21302	25 %	0 %	50 %	25 %	15611090
54	NC_000921	TAAA	2	8	21614	21621	75 %	25 %	0 %	0 %	15611091
55	NC_000921	CTTT	2	8	21720	21727	0 %	75 %	0 %	25 %	15611091
56	NC_000921	AAGT	2	8	22032	22039	50 %	25 %	25 %	0 %	15611091
57	NC_000921	CTTT	2	8	22797	22804	0 %	75 %	0 %	25 %	15611091
58	NC_000921	GTTT	2	8	24008	24015	0 %	75 %	25 %	0 %	15611092
59	NC_000921	ACTG	2	8	24305	24312	25 %	25 %	25 %	25 %	15611092
60	NC_000921	ATTG	2	8	24978	24985	25 %	50 %	25 %	0 %	15611092
61	NC_000921	ATAA	2	8	27035	27042	75 %	25 %	0 %	0 %	15611093
62	NC_000921	GCTC	2	8	28563	28570	0 %	25 %	25 %	50 %	15611094
63	NC_000921	ATGG	2	8	29011	29018	25 %	25 %	50 %	0 %	15611094
64	NC_000921	GAAT	2	8	29265	29272	50 %	25 %	25 %	0 %	15611095
65	NC_000921	TGGC	2	8	29488	29495	0 %	25 %	50 %	25 %	15611095
66	NC_000921	TTTA	2	8	29641	29648	25 %	75 %	0 %	0 %	15611095
67	NC_000921	TGCT	2	8	30548	30555	0 %	50 %	25 %	25 %	15611097
68	NC_000921	AGCA	2	8	30659	30666	50 %	0 %	25 %	25 %	15611097
69	NC_000921	GCTT	2	8	30749	30756	0 %	50 %	25 %	25 %	15611097
70	NC_000921	TTGA	2	8	31172	31179	25 %	50 %	25 %	0 %	15611097
71	NC_000921	TTTA	2	8	32234	32241	25 %	75 %	0 %	0 %	15611098
72	NC_000921	GCGA	2	8	32432	32439	25 %	0 %	50 %	25 %	15611098
73	NC_000921	ACCC	2	8	32543	32550	25 %	0 %	0 %	75 %	15611099
74	NC_000921	CATC	2	8	32669	32676	25 %	25 %	0 %	50 %	15611099
75	NC_000921	TGAA	2	8	32820	32827	50 %	25 %	25 %	0 %	15611100
76	NC_000921	CCAA	2	8	33020	33027	50 %	0 %	0 %	50 %	15611100
77	NC_000921	TCGT	2	8	33178	33185	0 %	50 %	25 %	25 %	15611100
78	NC_000921	CATG	2	8	33934	33941	25 %	25 %	25 %	25 %	15611100
79	NC_000921	CGCT	2	8	34050	34057	0 %	25 %	25 %	50 %	15611100
80	NC_000921	TCAT	2	8	34875	34882	25 %	50 %	0 %	25 %	15611100
81	NC_000921	GCTT	2	8	34949	34956	0 %	50 %	25 %	25 %	15611100
82	NC_000921	GAAA	2	8	35008	35015	75 %	0 %	25 %	0 %	15611100
83	NC_000921	ATGA	2	8	35289	35296	50 %	25 %	25 %	0 %	15611101
84	NC_000921	TTCT	2	8	36711	36718	0 %	75 %	0 %	25 %	15611104
85	NC_000921	CTTT	2	8	37040	37047	0 %	75 %	0 %	25 %	15611104
86	NC_000921	CTCA	2	8	37529	37536	25 %	25 %	0 %	50 %	15611104
87	NC_000921	TAAA	2	8	37739	37746	75 %	25 %	0 %	0 %	15611104
88	NC_000921	GAAA	2	8	37869	37876	75 %	0 %	25 %	0 %	15611105
89	NC_000921	TGAA	2	8	38447	38454	50 %	25 %	25 %	0 %	15611105
90	NC_000921	TTTG	2	8	38499	38506	0 %	75 %	25 %	0 %	15611105
91	NC_000921	TGAT	2	8	38604	38611	25 %	50 %	25 %	0 %	15611105
92	NC_000921	CGAA	2	8	38689	38696	50 %	0 %	25 %	25 %	15611106
93	NC_000921	TGAT	2	8	38989	38996	25 %	50 %	25 %	0 %	15611106
94	NC_000921	ATTG	2	8	40389	40396	25 %	50 %	25 %	0 %	15611107
95	NC_000921	ATTG	2	8	40455	40462	25 %	50 %	25 %	0 %	15611107
96	NC_000921	ATCA	2	8	40564	40571	50 %	25 %	0 %	25 %	15611107
97	NC_000921	TCAA	2	8	40577	40584	50 %	25 %	0 %	25 %	15611107
98	NC_000921	TGTT	2	8	41351	41358	0 %	75 %	25 %	0 %	15611108
99	NC_000921	CTTT	2	8	41944	41951	0 %	75 %	0 %	25 %	15611108
100	NC_000921	ACAG	2	8	42179	42186	50 %	0 %	25 %	25 %	15611108
101	NC_000921	GAAA	2	8	42244	42251	75 %	0 %	25 %	0 %	15611109
102	NC_000921	GATC	2	8	42373	42380	25 %	25 %	25 %	25 %	15611109
103	NC_000921	TTTG	2	8	42775	42782	0 %	75 %	25 %	0 %	15611109
104	NC_000921	CACC	2	8	42975	42982	25 %	0 %	0 %	75 %	15611109
105	NC_000921	ATGA	2	8	43380	43387	50 %	25 %	25 %	0 %	15611109
106	NC_000921	CAAA	2	8	44219	44226	75 %	0 %	0 %	25 %	15611110
107	NC_000921	TTGA	2	8	45364	45371	25 %	50 %	25 %	0 %	15611111
108	NC_000921	CGCT	2	8	45519	45526	0 %	25 %	25 %	50 %	15611111
109	NC_000921	GTTT	2	8	46141	46148	0 %	75 %	25 %	0 %	15611111
110	NC_000921	CAAA	2	8	46637	46644	75 %	0 %	0 %	25 %	15611112
111	NC_000921	CGCT	2	8	46985	46992	0 %	25 %	25 %	50 %	15611112
112	NC_000921	TCGC	2	8	47452	47459	0 %	25 %	25 %	50 %	15611112
113	NC_000921	AGGG	2	8	47463	47470	25 %	0 %	75 %	0 %	15611112
114	NC_000921	TTTA	2	8	48797	48804	25 %	75 %	0 %	0 %	15611113
115	NC_000921	CGAG	2	8	48810	48817	25 %	0 %	50 %	25 %	15611113
116	NC_000921	AGCT	2	8	49489	49496	25 %	25 %	25 %	25 %	15611114
117	NC_000921	CTTT	2	8	49775	49782	0 %	75 %	0 %	25 %	15611114
118	NC_000921	GATT	2	8	49961	49968	25 %	50 %	25 %	0 %	15611114
119	NC_000921	TTGC	2	8	50251	50258	0 %	50 %	25 %	25 %	15611115
120	NC_000921	TGCT	2	8	50537	50544	0 %	50 %	25 %	25 %	15611115
121	NC_000921	AAAC	2	8	51184	51191	75 %	0 %	0 %	25 %	15611116
122	NC_000921	TCAA	2	8	51501	51508	50 %	25 %	0 %	25 %	15611116
123	NC_000921	ATAG	2	8	51905	51912	50 %	25 %	25 %	0 %	15611116
124	NC_000921	TTGT	2	8	52065	52072	0 %	75 %	25 %	0 %	15611116
125	NC_000921	GCTT	2	8	52517	52524	0 %	50 %	25 %	25 %	15611117
126	NC_000921	GTTT	2	8	52631	52638	0 %	75 %	25 %	0 %	15611117
127	NC_000921	AATC	2	8	52867	52874	50 %	25 %	0 %	25 %	15611117
128	NC_000921	AAAC	2	8	53475	53482	75 %	0 %	0 %	25 %	15611118
129	NC_000921	CGCT	2	8	53501	53508	0 %	25 %	25 %	50 %	15611118
130	NC_000921	AGCC	2	8	53675	53682	25 %	0 %	25 %	50 %	15611118
131	NC_000921	CAAG	2	8	54154	54161	50 %	0 %	25 %	25 %	15611118
132	NC_000921	AAGA	2	8	54196	54203	75 %	0 %	25 %	0 %	15611118
133	NC_000921	CACT	2	8	54443	54450	25 %	25 %	0 %	50 %	15611118
134	NC_000921	TCGC	2	8	54721	54728	0 %	25 %	25 %	50 %	15611118
135	NC_000921	ATTT	2	8	54918	54925	25 %	75 %	0 %	0 %	15611119
136	NC_000921	TGCT	2	8	55090	55097	0 %	50 %	25 %	25 %	15611119
137	NC_000921	TCGT	2	8	55253	55260	0 %	50 %	25 %	25 %	15611119
138	NC_000921	TCTG	2	8	56213	56220	0 %	50 %	25 %	25 %	15611119
139	NC_000921	GTTT	2	8	57081	57088	0 %	75 %	25 %	0 %	15611119
140	NC_000921	AAAG	2	8	57203	57210	75 %	0 %	25 %	0 %	15611119
141	NC_000921	CTTT	2	8	57657	57664	0 %	75 %	0 %	25 %	15611119
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143	NC_000921	GCTC	2	8	58402	58409	0 %	25 %	25 %	50 %	15611119
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