MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 30260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000921	AAG	2	6	31552	31557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611097
502	NC_000921	GTC	2	6	31574	31579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611097
503	NC_000921	T	6	6	31586	31591	0 %	100 %	0 %	0 %	15611097
504	NC_000921	AAT	2	6	31644	31649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611097
505	NC_000921	TAA	2	6	31675	31680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611097
506	NC_000921	TTG	2	6	31796	31801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611097
507	NC_000921	TCACTC	2	12	31867	31878	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15611097
508	NC_000921	TCA	3	9	31959	31967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611097
509	NC_000921	A	6	6	31977	31982	100 %	0 %	0 %	0 %	15611097
510	NC_000921	TTTA	2	8	32234	32241	25 %	75 %	0 %	0 %	15611098
511	NC_000921	GAT	2	6	32254	32259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611098
512	NC_000921	AGA	3	9	32284	32292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611098
513	NC_000921	AAGGCT	2	12	32294	32305	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15611098
514	NC_000921	A	6	6	32333	32338	100 %	0 %	0 %	0 %	15611098
515	NC_000921	TGATT	2	10	32374	32383	20 %	60 %	20 %	0 %	15611098
516	NC_000921	GCGA	2	8	32432	32439	25 %	0 %	50 %	25 %	15611098
517	NC_000921	TTG	2	6	32484	32489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611098
518	NC_000921	TGT	2	6	32506	32511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611098
519	NC_000921	ACCC	2	8	32543	32550	25 %	0 %	0 %	75 %	15611099
520	NC_000921	CCA	2	6	32551	32556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611099
521	NC_000921	T	7	7	32624	32630	0 %	100 %	0 %	0 %	15611099
522	NC_000921	AGA	2	6	32642	32647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611099
523	NC_000921	CATC	2	8	32669	32676	25 %	25 %	0 %	50 %	15611099
524	NC_000921	AT	3	6	32721	32726	50 %	50 %	0 %	0 %	15611099
525	NC_000921	AAT	2	6	32794	32799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611099
526	NC_000921	TGAA	2	8	32820	32827	50 %	25 %	25 %	0 %	15611100
527	NC_000921	CAC	2	6	32878	32883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611100
528	NC_000921	AGA	3	9	32944	32952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611100
529	NC_000921	ACT	2	6	32985	32990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611100
530	NC_000921	CAA	2	6	32993	32998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611100
531	NC_000921	A	6	6	33010	33015	100 %	0 %	0 %	0 %	15611100
532	NC_000921	CCAA	2	8	33020	33027	50 %	0 %	0 %	50 %	15611100
533	NC_000921	A	7	7	33065	33071	100 %	0 %	0 %	0 %	15611100
534	NC_000921	GCGTGG	2	12	33093	33104	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15611100
535	NC_000921	GAT	2	6	33134	33139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611100
536	NC_000921	TCGT	2	8	33178	33185	0 %	50 %	25 %	25 %	15611100
537	NC_000921	TAA	2	6	33244	33249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611100
538	NC_000921	GAA	2	6	33251	33256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611100
539	NC_000921	A	7	7	33277	33283	100 %	0 %	0 %	0 %	15611100
540	NC_000921	AGA	3	9	33343	33351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611100
541	NC_000921	AAG	2	6	33471	33476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611100
542	NC_000921	A	7	7	33572	33578	100 %	0 %	0 %	0 %	15611100
543	NC_000921	TGA	2	6	33622	33627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611100
544	NC_000921	GCG	2	6	33677	33682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611100
545	NC_000921	AT	3	6	33684	33689	50 %	50 %	0 %	0 %	15611100
546	NC_000921	GAA	2	6	33743	33748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611100
547	NC_000921	C	6	6	33855	33860	0 %	0 %	0 %	100 %	15611100
548	NC_000921	GAA	2	6	33866	33871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611100
549	NC_000921	CAC	2	6	33872	33877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611100
550	NC_000921	CATG	2	8	33934	33941	25 %	25 %	25 %	25 %	15611100
551	NC_000921	ATT	2	6	33970	33975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611100
552	NC_000921	A	6	6	34010	34015	100 %	0 %	0 %	0 %	15611100
553	NC_000921	A	7	7	34019	34025	100 %	0 %	0 %	0 %	15611100
554	NC_000921	TGA	2	6	34033	34038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611100
555	NC_000921	CGCT	2	8	34050	34057	0 %	25 %	25 %	50 %	15611100
556	NC_000921	A	6	6	34097	34102	100 %	0 %	0 %	0 %	15611100
557	NC_000921	A	6	6	34132	34137	100 %	0 %	0 %	0 %	15611100
558	NC_000921	A	6	6	34213	34218	100 %	0 %	0 %	0 %	15611100
559	NC_000921	TTGAAT	2	12	34292	34303	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15611100
560	NC_000921	AAG	2	6	34338	34343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611100
561	NC_000921	G	6	6	34400	34405	0 %	0 %	100 %	0 %	15611100
562	NC_000921	TGC	2	6	34443	34448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611100
563	NC_000921	TGT	2	6	34491	34496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611100
564	NC_000921	CAA	2	6	34537	34542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611100
565	NC_000921	TAAGGA	2	12	34591	34602	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15611100
566	NC_000921	T	6	6	34613	34618	0 %	100 %	0 %	0 %	15611100
567	NC_000921	GGA	2	6	34720	34725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15611100
568	NC_000921	AAG	2	6	34806	34811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611100
569	NC_000921	GA	3	6	34858	34863	50 %	0 %	50 %	0 %	15611100
570	NC_000921	A	7	7	34868	34874	100 %	0 %	0 %	0 %	15611100
571	NC_000921	TCAT	2	8	34875	34882	25 %	50 %	0 %	25 %	15611100
572	NC_000921	A	6	6	34931	34936	100 %	0 %	0 %	0 %	15611100
573	NC_000921	GCTT	2	8	34949	34956	0 %	50 %	25 %	25 %	15611100
574	NC_000921	A	7	7	34962	34968	100 %	0 %	0 %	0 %	15611100
575	NC_000921	GC	3	6	34993	34998	0 %	0 %	50 %	50 %	15611100
576	NC_000921	GAAA	2	8	35008	35015	75 %	0 %	25 %	0 %	15611100
577	NC_000921	TA	3	6	35079	35084	50 %	50 %	0 %	0 %	15611101
578	NC_000921	AG	3	6	35130	35135	50 %	0 %	50 %	0 %	15611101
579	NC_000921	A	7	7	35202	35208	100 %	0 %	0 %	0 %	15611101
580	NC_000921	GCA	2	6	35232	35237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611101
581	NC_000921	ATGA	2	8	35289	35296	50 %	25 %	25 %	0 %	15611101
582	NC_000921	CAAGC	2	10	35315	35324	40 %	0 %	20 %	40 %	15611101
583	NC_000921	A	7	7	35341	35347	100 %	0 %	0 %	0 %	15611101
584	NC_000921	TTA	2	6	35405	35410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611102
585	NC_000921	A	6	6	35420	35425	100 %	0 %	0 %	0 %	15611102
586	NC_000921	AGA	2	6	35440	35445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611102
587	NC_000921	TGG	2	6	35523	35528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611102
588	NC_000921	TGA	2	6	35539	35544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611102
589	NC_000921	AGA	2	6	35554	35559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611102
590	NC_000921	AAG	2	6	35562	35567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611102
591	NC_000921	TGA	2	6	35583	35588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611102
592	NC_000921	AGA	2	6	35617	35622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611102
593	NC_000921	TTA	2	6	35690	35695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611103
594	NC_000921	T	8	8	35713	35720	0 %	100 %	0 %	0 %	15611103
595	NC_000921	T	7	7	35760	35766	0 %	100 %	0 %	0 %	15611103
596	NC_000921	A	6	6	35767	35772	100 %	0 %	0 %	0 %	15611103
597	NC_000921	TAT	2	6	35830	35835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611103
598	NC_000921	TCA	2	6	35864	35869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611103
599	NC_000921	TTG	2	6	35896	35901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611103
600	NC_000921	GC	3	6	35906	35911	0 %	0 %	50 %	50 %	15611103
601	NC_000921	ATT	2	6	36006	36011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611103
602	NC_000921	A	6	6	36053	36058	100 %	0 %	0 %	0 %	15611103
603	NC_000921	A	7	7	36062	36068	100 %	0 %	0 %	0 %	15611103
604	NC_000921	GCTAGG	2	12	36099	36110	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15611103
605	NC_000921	G	6	6	36115	36120	0 %	0 %	100 %	0 %	15611103
606	NC_000921	TCA	2	6	36143	36148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611103
607	NC_000921	CAA	2	6	36163	36168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611103
608	NC_000921	TTA	2	6	36174	36179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611103
609	NC_000921	AGA	2	6	36201	36206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611103
610	NC_000921	TGG	2	6	36221	36226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611103
611	NC_000921	T	6	6	36261	36266	0 %	100 %	0 %	0 %	15611103
612	NC_000921	A	6	6	36267	36272	100 %	0 %	0 %	0 %	15611103
613	NC_000921	GTG	2	6	36331	36336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611103
614	NC_000921	ATCAA	2	10	36386	36395	60 %	20 %	0 %	20 %	15611103
615	NC_000921	G	6	6	36427	36432	0 %	0 %	100 %	0 %	15611103
616	NC_000921	T	6	6	36450	36455	0 %	100 %	0 %	0 %	15611103
617	NC_000921	ATC	2	6	36490	36495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611103
618	NC_000921	T	6	6	36531	36536	0 %	100 %	0 %	0 %	15611103
619	NC_000921	ATT	2	6	36630	36635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611103
620	NC_000921	TGA	2	6	36684	36689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611104
621	NC_000921	TTCT	2	8	36711	36718	0 %	75 %	0 %	25 %	15611104
622	NC_000921	T	6	6	36859	36864	0 %	100 %	0 %	0 %	15611104
623	NC_000921	GC	3	6	36873	36878	0 %	0 %	50 %	50 %	15611104
624	NC_000921	T	6	6	36905	36910	0 %	100 %	0 %	0 %	15611104
625	NC_000921	CTTT	2	8	37040	37047	0 %	75 %	0 %	25 %	15611104
626	NC_000921	ATTTT	2	10	37050	37059	20 %	80 %	0 %	0 %	15611104
627	NC_000921	T	7	7	37125	37131	0 %	100 %	0 %	0 %	15611104
628	NC_000921	T	7	7	37149	37155	0 %	100 %	0 %	0 %	15611104
629	NC_000921	ATC	2	6	37172	37177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611104
630	NC_000921	TG	3	6	37201	37206	0 %	50 %	50 %	0 %	15611104
631	NC_000921	GGA	2	6	37254	37259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15611104
632	NC_000921	A	6	6	37280	37285	100 %	0 %	0 %	0 %	15611104
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634	NC_000921	GTT	2	6	37318	37323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611104
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888	NC_000921	T	7	7	51381	51387	0 %	100 %	0 %	0 %	15611116
889	NC_000921	T	8	8	51469	51476	0 %	100 %	0 %	0 %	15611116
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895	NC_000921	TAAAA	2	10	51747	51756	80 %	20 %	0 %	0 %	15611116
896	NC_000921	ATTTC	2	10	51822	51831	20 %	60 %	0 %	20 %	15611116
897	NC_000921	ATAG	2	8	51905	51912	50 %	25 %	25 %	0 %	15611116
898	NC_000921	GTT	2	6	51952	51957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611116
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900	NC_000921	TTGT	2	8	52065	52072	0 %	75 %	25 %	0 %	15611116
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