MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 20559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000907	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271977
2	NC_000907	TGA	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
3	NC_000907	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
4	NC_000907	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16271977
5	NC_000907	ACA	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271977
6	NC_000907	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271977
7	NC_000907	GCG	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16271977
8	NC_000907	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271977
9	NC_000907	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271977
10	NC_000907	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271977
11	NC_000907	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
12	NC_000907	TGT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271977
13	NC_000907	TAG	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
14	NC_000907	CAA	3	9	1247	1255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
15	NC_000907	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271978
16	NC_000907	TCG	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271978
17	NC_000907	TCA	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271978
18	NC_000907	CCA	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271978
19	NC_000907	ACA	2	6	1642	1647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
20	NC_000907	TTA	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271978
21	NC_000907	CAA	2	6	1700	1705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
22	NC_000907	ATT	2	6	1757	1762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271978
23	NC_000907	GGC	2	6	1918	1923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16271978
24	NC_000907	TTC	2	6	1929	1934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271978
25	NC_000907	AGA	2	6	1960	1965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
26	NC_000907	TGC	2	6	2047	2052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271978
27	NC_000907	GAA	2	6	2173	2178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
28	NC_000907	ATT	2	6	2224	2229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271978
29	NC_000907	ATG	2	6	2246	2251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271978
30	NC_000907	GGA	2	6	2258	2263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16271978
31	NC_000907	AAC	2	6	2341	2346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
32	NC_000907	AAT	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271978
33	NC_000907	TGA	2	6	2466	2471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271978
34	NC_000907	AAG	2	6	2483	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
35	NC_000907	AGA	2	6	2491	2496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
36	NC_000907	CAC	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271978
37	NC_000907	ATC	2	6	2684	2689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271978
38	NC_000907	GAA	2	6	2744	2749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
39	NC_000907	ACT	2	6	2791	2796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271978
40	NC_000907	AAG	2	6	3003	3008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
41	NC_000907	ATT	2	6	3049	3054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
42	NC_000907	TCT	2	6	3066	3071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271979
43	NC_000907	ATT	2	6	3095	3100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
44	NC_000907	AAT	2	6	3241	3246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
45	NC_000907	TCT	2	6	3375	3380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271979
46	NC_000907	AAT	2	6	3389	3394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
47	NC_000907	TCA	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271979
48	NC_000907	ATT	2	6	3509	3514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
49	NC_000907	TAA	2	6	3519	3524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
50	NC_000907	CAC	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271979
51	NC_000907	CAA	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271979
52	NC_000907	ATT	2	6	3656	3661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
53	NC_000907	TAA	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
54	NC_000907	CAT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271979
55	NC_000907	ATT	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271980
56	NC_000907	ATC	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271980
57	NC_000907	TTC	2	6	3923	3928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271980
58	NC_000907	GAC	2	6	4048	4053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271980
59	NC_000907	ACG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271981
60	NC_000907	ACA	2	6	5144	5149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271981
61	NC_000907	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271981
62	NC_000907	CAT	2	6	5239	5244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271981
63	NC_000907	TTG	2	6	5311	5316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271981
64	NC_000907	ATA	2	6	8745	8750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271982
65	NC_000907	TTA	2	6	8787	8792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271982
66	NC_000907	CAC	2	6	8823	8828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271982
67	NC_000907	GTT	2	6	8907	8912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271982
68	NC_000907	GAA	2	6	9023	9028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271982
69	NC_000907	GTT	2	6	9087	9092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271982
70	NC_000907	AGA	2	6	9334	9339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271982
71	NC_000907	AAC	2	6	9357	9362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271982
72	NC_000907	TCC	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16271982
73	NC_000907	ACT	2	6	9591	9596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271982
74	NC_000907	AGA	3	9	9616	9624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271982
75	NC_000907	ATC	3	9	9633	9641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271982
76	NC_000907	GAA	2	6	9650	9655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271982
77	NC_000907	AAT	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271982
78	NC_000907	TTC	2	6	9801	9806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271983
79	NC_000907	TTC	2	6	9888	9893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271983
80	NC_000907	TTA	2	6	10074	10079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271983
81	NC_000907	CAT	2	6	10088	10093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271983
82	NC_000907	TTG	2	6	10243	10248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271983
83	NC_000907	CAC	2	6	10281	10286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271983
84	NC_000907	GAA	2	6	10302	10307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271983
85	NC_000907	ATC	2	6	10600	10605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271984
86	NC_000907	ATT	2	6	10615	10620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271984
87	NC_000907	TAT	2	6	10621	10626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271984
88	NC_000907	TGC	2	6	10628	10633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271984
89	NC_000907	TGA	2	6	10778	10783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271984
90	NC_000907	TGC	2	6	10811	10816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271984
91	NC_000907	AGA	2	6	10856	10861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271984
92	NC_000907	CAG	2	6	10901	10906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271984
93	NC_000907	AGC	2	6	10955	10960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271984
94	NC_000907	CAA	2	6	10962	10967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271984
95	NC_000907	ATA	2	6	10975	10980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271984
96	NC_000907	GAA	2	6	11178	11183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271984
97	NC_000907	ATG	2	6	11235	11240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271984
98	NC_000907	GAT	2	6	11277	11282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271984
99	NC_000907	GAA	2	6	11313	11318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271984
100	NC_000907	AGA	2	6	11363	11368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271984
101	NC_000907	CCA	2	6	11451	11456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271985
102	NC_000907	ATA	2	6	11468	11473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271985
103	NC_000907	AAT	2	6	11604	11609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271985
104	NC_000907	ATT	2	6	11708	11713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271985
105	NC_000907	ATT	2	6	11750	11755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271985
106	NC_000907	ATA	2	6	11844	11849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271985
107	NC_000907	GCT	2	6	11862	11867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271986
108	NC_000907	TTG	2	6	11872	11877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271986
109	NC_000907	TGA	2	6	11897	11902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271986
110	NC_000907	TGC	2	6	11915	11920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271986
111	NC_000907	CAA	2	6	12106	12111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271986
112	NC_000907	AGA	2	6	12242	12247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271986
113	NC_000907	TAT	2	6	12428	12433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271987
114	NC_000907	TCA	2	6	12484	12489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271987
115	NC_000907	TAT	2	6	12583	12588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271987
116	NC_000907	TCG	2	6	12750	12755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271987
117	NC_000907	GCG	2	6	12880	12885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16271987
118	NC_000907	ATA	2	6	12926	12931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271987
119	NC_000907	TCC	2	6	13152	13157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16271987
120	NC_000907	TCA	2	6	13202	13207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271987
121	NC_000907	ACA	2	6	13290	13295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271987
122	NC_000907	TCA	3	9	13460	13468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271988
123	NC_000907	TTC	2	6	13699	13704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271988
124	NC_000907	ATT	2	6	13733	13738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271988
125	NC_000907	TCT	2	6	13778	13783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271988
126	NC_000907	ATG	2	6	13789	13794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271988
127	NC_000907	ATT	2	6	13843	13848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271988
128	NC_000907	TAA	2	6	13908	13913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271988
129	NC_000907	CAA	2	6	13918	13923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271988
130	NC_000907	ATC	2	6	13924	13929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271988
131	NC_000907	TCA	2	6	14009	14014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271988
132	NC_000907	AAT	2	6	14047	14052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271988
133	NC_000907	ACT	2	6	14074	14079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271988
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