MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 31788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000907	TAC	2	6	30637	30642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272004
502	NC_000907	ATA	2	6	30750	30755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272004
503	NC_000907	TTA	2	6	30782	30787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272004
504	NC_000907	T	7	7	30797	30803	0 %	100 %	0 %	0 %	16272004
505	NC_000907	TTC	2	6	30820	30825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272004
506	NC_000907	AAT	2	6	30838	30843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272004
507	NC_000907	AAT	2	6	30853	30858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272004
508	NC_000907	CG	3	6	30869	30874	0 %	0 %	50 %	50 %	16272004
509	NC_000907	GAA	2	6	30875	30880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272004
510	NC_000907	GTG	2	6	30911	30916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16272004
511	NC_000907	TTG	2	6	30940	30945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272004
512	NC_000907	CAT	2	6	31017	31022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272004
513	NC_000907	ACA	2	6	31031	31036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272004
514	NC_000907	TGA	2	6	31096	31101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272004
515	NC_000907	TAT	2	6	31152	31157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272004
516	NC_000907	TCA	2	6	31200	31205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272004
517	NC_000907	ATAC	2	8	31284	31291	50 %	25 %	0 %	25 %	16272004
518	NC_000907	TGG	2	6	31309	31314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16272004
519	NC_000907	TGT	2	6	31393	31398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272004
520	NC_000907	AATT	2	8	31424	31431	50 %	50 %	0 %	0 %	16272005
521	NC_000907	TTA	2	6	31457	31462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272005
522	NC_000907	T	6	6	31470	31475	0 %	100 %	0 %	0 %	16272005
523	NC_000907	TCA	2	6	31511	31516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272005
524	NC_000907	ATTT	2	8	31539	31546	25 %	75 %	0 %	0 %	16272005
525	NC_000907	TAAT	2	8	31593	31600	50 %	50 %	0 %	0 %	16272005
526	NC_000907	GT	3	6	31698	31703	0 %	50 %	50 %	0 %	16272005
527	NC_000907	TACG	2	8	31917	31924	25 %	25 %	25 %	25 %	16272005
528	NC_000907	TGC	2	6	31990	31995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272005
529	NC_000907	GAT	2	6	32055	32060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272005
530	NC_000907	CTT	2	6	32076	32081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272005
531	NC_000907	T	6	6	32202	32207	0 %	100 %	0 %	0 %	16272005
532	NC_000907	ACC	2	6	32425	32430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16272006
533	NC_000907	TAAA	2	8	32436	32443	75 %	25 %	0 %	0 %	16272006
534	NC_000907	TGT	2	6	32521	32526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272006
535	NC_000907	AAG	2	6	32550	32555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272006
536	NC_000907	AAT	2	6	32590	32595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272006
537	NC_000907	A	6	6	32621	32626	100 %	0 %	0 %	0 %	16272006
538	NC_000907	AAAAT	2	10	32660	32669	80 %	20 %	0 %	0 %	16272006
539	NC_000907	CCA	2	6	32738	32743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16272006
540	NC_000907	AAT	2	6	32810	32815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272006
541	NC_000907	CCA	2	6	32908	32913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16272006
542	NC_000907	CCA	2	6	33081	33086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16272006
543	NC_000907	TAAA	2	8	33214	33221	75 %	25 %	0 %	0 %	16272006
544	NC_000907	TGG	2	6	33250	33255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16272006
545	NC_000907	AAT	2	6	33301	33306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272006
546	NC_000907	TA	3	6	33345	33350	50 %	50 %	0 %	0 %	16272006
547	NC_000907	AAG	2	6	33379	33384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272006
548	NC_000907	ATTT	2	8	33455	33462	25 %	75 %	0 %	0 %	16272006
549	NC_000907	CT	3	6	33468	33473	0 %	50 %	0 %	50 %	16272007
550	NC_000907	T	8	8	33485	33492	0 %	100 %	0 %	0 %	16272007
551	NC_000907	ACC	3	9	33587	33595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16272007
552	NC_000907	T	7	7	33680	33686	0 %	100 %	0 %	0 %	16272007
553	NC_000907	TAT	2	6	33697	33702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272007
554	NC_000907	TAAAC	2	10	33719	33728	60 %	20 %	0 %	20 %	16272007
555	NC_000907	GCA	2	6	33801	33806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16272007
556	NC_000907	AAC	2	6	33809	33814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272007
557	NC_000907	TCA	2	6	33925	33930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272007
558	NC_000907	ATT	2	6	33953	33958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272007
559	NC_000907	GTC	2	6	33969	33974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272007
560	NC_000907	GTG	2	6	33991	33996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16272007
561	NC_000907	TCT	2	6	34107	34112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272007
562	NC_000907	ACCAAA	2	12	34136	34147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272007
563	NC_000907	T	7	7	34261	34267	0 %	100 %	0 %	0 %	16272007
564	NC_000907	GCGG	2	8	34392	34399	0 %	0 %	75 %	25 %	16272007
565	NC_000907	TAA	2	6	34448	34453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272007
566	NC_000907	GGA	2	6	34469	34474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16272007
567	NC_000907	CAA	2	6	34483	34488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272007
568	NC_000907	ATT	2	6	34493	34498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272007
569	NC_000907	ACT	2	6	34532	34537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272007
570	NC_000907	CAG	2	6	34645	34650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16272007
571	NC_000907	ATT	2	6	34685	34690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272007
572	NC_000907	CTT	2	6	34699	34704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272007
573	NC_000907	TAA	2	6	34737	34742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272007
574	NC_000907	TCGT	2	8	34767	34774	0 %	50 %	25 %	25 %	16272007
575	NC_000907	TCAT	2	8	34827	34834	25 %	50 %	0 %	25 %	16272007
576	NC_000907	ATAA	2	8	34876	34883	75 %	25 %	0 %	0 %	16272007
577	NC_000907	TTC	2	6	34955	34960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272007
578	NC_000907	TAA	2	6	34976	34981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272007
579	NC_000907	T	6	6	35095	35100	0 %	100 %	0 %	0 %	16272007
580	NC_000907	A	7	7	35120	35126	100 %	0 %	0 %	0 %	16272007
581	NC_000907	TAA	2	6	35141	35146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272007
582	NC_000907	TAA	2	6	35192	35197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272007
583	NC_000907	A	6	6	35301	35306	100 %	0 %	0 %	0 %	16272007
584	NC_000907	T	6	6	35345	35350	0 %	100 %	0 %	0 %	16272007
585	NC_000907	GAA	2	6	35381	35386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272007
586	NC_000907	T	7	7	35387	35393	0 %	100 %	0 %	0 %	16272007
587	NC_000907	TAT	2	6	35420	35425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272008
588	NC_000907	GAT	2	6	35430	35435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272008
589	NC_000907	GAT	2	6	35439	35444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272008
590	NC_000907	CACG	2	8	35459	35466	25 %	0 %	25 %	50 %	16272008
591	NC_000907	CCA	2	6	35481	35486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16272008
592	NC_000907	GCA	2	6	35543	35548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16272008
593	NC_000907	CAAT	2	8	35583	35590	50 %	25 %	0 %	25 %	16272008
594	NC_000907	AAAC	2	8	35591	35598	75 %	0 %	0 %	25 %	16272008
595	NC_000907	CAT	2	6	35607	35612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272008
596	NC_000907	AGCT	2	8	35635	35642	25 %	25 %	25 %	25 %	16272008
597	NC_000907	GCG	2	6	35643	35648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16272008
598	NC_000907	CTT	2	6	35721	35726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272008
599	NC_000907	T	6	6	35753	35758	0 %	100 %	0 %	0 %	16272008
600	NC_000907	CTG	2	6	35769	35774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272008
601	NC_000907	AAG	2	6	35847	35852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272008
602	NC_000907	CCA	2	6	36020	36025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16272009
603	NC_000907	CAATC	2	10	36026	36035	40 %	20 %	0 %	40 %	16272009
604	NC_000907	CTT	2	6	36050	36055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272009
605	NC_000907	T	6	6	36078	36083	0 %	100 %	0 %	0 %	16272009
606	NC_000907	AATTA	2	10	36093	36102	60 %	40 %	0 %	0 %	16272009
607	NC_000907	AAT	2	6	36144	36149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272009
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609	NC_000907	ATA	2	6	36387	36392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272010
610	NC_000907	ATT	2	6	36416	36421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272010
611	NC_000907	TGC	2	6	36463	36468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272010
612	NC_000907	TCT	2	6	36479	36484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272010
613	NC_000907	GGA	2	6	36512	36517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16272010
614	NC_000907	CAA	2	6	36591	36596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272010
615	NC_000907	CCAT	2	8	36633	36640	25 %	25 %	0 %	50 %	16272010
616	NC_000907	CAA	2	6	36696	36701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272010
617	NC_000907	TGG	2	6	36751	36756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16272010
618	NC_000907	ACC	2	6	36809	36814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16272010
619	NC_000907	TGT	2	6	36944	36949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272010
620	NC_000907	AACT	2	8	37045	37052	50 %	25 %	0 %	25 %	16272010
621	NC_000907	TGA	2	6	37097	37102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272010
622	NC_000907	ACC	2	6	37148	37153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16272010
623	NC_000907	ATC	2	6	37243	37248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272010
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625	NC_000907	CTT	2	6	37341	37346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272010
626	NC_000907	CTTT	2	8	37427	37434	0 %	75 %	0 %	25 %	16272010
627	NC_000907	GCT	2	6	37441	37446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272010
628	NC_000907	AGC	2	6	37462	37467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16272010
629	NC_000907	A	6	6	37489	37494	100 %	0 %	0 %	0 %	16272010
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