MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae KR494

Total Repeats: 1543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022356	ACGAA	2	10	1155	1164	60 %	0 %	20 %	20 %	543951068
2	NC_022356	GCGAA	2	10	1658	1667	40 %	0 %	40 %	20 %	543951069
3	NC_022356	CTTTT	2	10	3335	3344	0 %	80 %	0 %	20 %	543951071
4	NC_022356	ATTGA	2	10	3956	3965	40 %	40 %	20 %	0 %	543951071
5	NC_022356	TCCTT	2	10	7250	7259	0 %	60 %	0 %	40 %	543951074
6	NC_022356	CTGTA	2	10	7774	7783	20 %	40 %	20 %	20 %	543951074
7	NC_022356	ATTTA	2	10	8431	8440	40 %	60 %	0 %	0 %	543951074
8	NC_022356	TTCGC	2	10	9508	9517	0 %	40 %	20 %	40 %	543951075
9	NC_022356	CAAAA	2	10	10092	10101	80 %	0 %	0 %	20 %	543951075
10	NC_022356	TAAAC	2	10	10285	10294	60 %	20 %	0 %	20 %	543951076
11	NC_022356	TGATC	2	10	10899	10908	20 %	40 %	20 %	20 %	543951076
12	NC_022356	TTGGT	2	10	13992	14001	0 %	60 %	40 %	0 %	543951078
13	NC_022356	TGCGT	2	10	14010	14019	0 %	40 %	40 %	20 %	543951078
14	NC_022356	GCCAA	2	10	14911	14920	40 %	0 %	20 %	40 %	543951079
15	NC_022356	ATATT	2	10	15312	15321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022356	CTTCA	2	10	15633	15642	20 %	40 %	0 %	40 %	543951080
17	NC_022356	TAAAA	2	10	16147	16156	80 %	20 %	0 %	0 %	543951080
18	NC_022356	TAAAA	2	10	16644	16653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022356	AGATT	2	10	16816	16825	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022356	ATTGA	2	10	17338	17347	40 %	40 %	20 %	0 %	543951082
21	NC_022356	ATTGG	2	10	18225	18234	20 %	40 %	40 %	0 %	543951083
22	NC_022356	TTCAA	2	10	19617	19626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022356	TAAAA	2	10	21517	21526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022356	CGCAC	2	10	24072	24081	20 %	0 %	20 %	60 %	543951089
25	NC_022356	TTATT	2	10	25138	25147	20 %	80 %	0 %	0 %	543951090
26	NC_022356	AGATT	2	10	25208	25217	40 %	40 %	20 %	0 %	543951090
27	NC_022356	ACGCC	2	10	28098	28107	20 %	0 %	20 %	60 %	543951091
28	NC_022356	CAGAT	2	10	29757	29766	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022356	TTTAT	2	10	29795	29804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022356	GTTTC	2	10	30138	30147	0 %	60 %	20 %	20 %	543951092
31	NC_022356	TTCAA	2	10	30379	30388	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022356	GCGAT	2	10	31470	31479	20 %	20 %	40 %	20 %	543951093
33	NC_022356	AAAAC	2	10	34517	34526	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022356	GCATT	2	10	40692	40701	20 %	40 %	20 %	20 %	543951102
35	NC_022356	CCTTT	2	10	42109	42118	0 %	60 %	0 %	40 %	543951103
36	NC_022356	TTAAT	2	10	42820	42829	40 %	60 %	0 %	0 %	543951104
37	NC_022356	AGTGC	2	10	42948	42957	20 %	20 %	40 %	20 %	543951104
38	NC_022356	GCGGA	2	10	43907	43916	20 %	0 %	60 %	20 %	543951106
39	NC_022356	TGAAA	2	10	47152	47161	60 %	20 %	20 %	0 %	543951110
40	NC_022356	AATGA	2	10	49480	49489	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022356	GCAAT	2	10	50888	50897	40 %	20 %	20 %	20 %	543951114
42	NC_022356	ACGAA	2	10	51724	51733	60 %	0 %	20 %	20 %	543951115
43	NC_022356	TAATT	2	10	52651	52660	40 %	60 %	0 %	0 %	543951116
44	NC_022356	AATTA	2	10	53029	53038	60 %	40 %	0 %	0 %	543951116
45	NC_022356	AAAAG	2	10	56240	56249	80 %	0 %	20 %	0 %	543951119
46	NC_022356	GAACA	2	10	56488	56497	60 %	0 %	20 %	20 %	543951119
47	NC_022356	ACGAC	2	10	58261	58270	40 %	0 %	20 %	40 %	543951121
48	NC_022356	AGAAA	2	10	58388	58397	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022356	TCGTA	2	10	59249	59258	20 %	40 %	20 %	20 %	543951122
50	NC_022356	TTGCA	2	10	64576	64585	20 %	40 %	20 %	20 %	543951129
51	NC_022356	CGATA	2	10	65721	65730	40 %	20 %	20 %	20 %	543951130
52	NC_022356	TTTTG	2	10	67509	67518	0 %	80 %	20 %	0 %	543951131
53	NC_022356	TTAAT	2	10	71189	71198	40 %	60 %	0 %	0 %	543951133
54	NC_022356	TTTTA	2	10	72098	72107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022356	TTTTC	2	10	75053	75062	0 %	80 %	0 %	20 %	543951137
56	NC_022356	AAAAT	2	10	75666	75675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022356	GCGAT	2	10	77197	77206	20 %	20 %	40 %	20 %	543951139
58	NC_022356	AATTT	2	10	78390	78399	40 %	60 %	0 %	0 %	543951140
59	NC_022356	AATAA	2	10	83357	83366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022356	AATCA	2	10	84994	85003	60 %	20 %	0 %	20 %	543951148
61	NC_022356	ATTAT	2	10	85212	85221	40 %	60 %	0 %	0 %	543951148
62	NC_022356	AAGAT	2	10	88148	88157	60 %	20 %	20 %	0 %	543951151
63	NC_022356	GTTTA	2	10	88614	88623	20 %	60 %	20 %	0 %	543951151
64	NC_022356	TATTT	2	10	88743	88752	20 %	80 %	0 %	0 %	543951151
65	NC_022356	GCTGG	2	10	88885	88894	0 %	20 %	60 %	20 %	543951151
66	NC_022356	CTTTA	2	10	88931	88940	20 %	60 %	0 %	20 %	543951151
67	NC_022356	GCTAT	2	10	89228	89237	20 %	40 %	20 %	20 %	543951151
68	NC_022356	ATTTT	2	10	89602	89611	20 %	80 %	0 %	0 %	543951151
69	NC_022356	ACGGC	2	10	89892	89901	20 %	0 %	40 %	40 %	543951152
70	NC_022356	TTACT	2	10	90137	90146	20 %	60 %	0 %	20 %	543951152
71	NC_022356	TGTGG	2	10	91290	91299	0 %	40 %	60 %	0 %	543951153
72	NC_022356	ATGGC	2	10	92840	92849	20 %	20 %	40 %	20 %	543951154
73	NC_022356	GCAAA	2	10	94496	94505	60 %	0 %	20 %	20 %	543951155
74	NC_022356	ATGCT	2	10	95712	95721	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022356	TTGTA	2	10	96526	96535	20 %	60 %	20 %	0 %	543951158
76	NC_022356	GTGCG	2	10	96951	96960	0 %	20 %	60 %	20 %	543951158
77	NC_022356	GCAAC	2	10	99286	99295	40 %	0 %	20 %	40 %	543951161
78	NC_022356	GATAA	2	10	100882	100891	60 %	20 %	20 %	0 %	543951163
79	NC_022356	CAAAA	2	10	102221	102230	80 %	0 %	0 %	20 %	543951165
80	NC_022356	GCAAA	2	10	102953	102962	60 %	0 %	20 %	20 %	543951166
81	NC_022356	CAGCA	2	10	105516	105525	40 %	0 %	20 %	40 %	543951167
82	NC_022356	TATGC	2	10	106697	106706	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022356	CGCCA	2	10	109230	109239	20 %	0 %	20 %	60 %	543951172
84	NC_022356	GGACT	2	10	110445	110454	20 %	20 %	40 %	20 %	543951173
85	NC_022356	AGTAA	2	10	111246	111255	60 %	20 %	20 %	0 %	543951173
86	NC_022356	CGCTT	2	10	112833	112842	0 %	40 %	20 %	40 %	543951177
87	NC_022356	AATGT	2	10	114365	114374	40 %	40 %	20 %	0 %	543951177
88	NC_022356	GTAAC	2	10	115813	115822	40 %	20 %	20 %	20 %	543951178
89	NC_022356	TTTGT	2	10	116004	116013	0 %	80 %	20 %	0 %	543951178
90	NC_022356	CAAAA	2	10	117129	117138	80 %	0 %	0 %	20 %	543951179
91	NC_022356	CATTT	2	10	117690	117699	20 %	60 %	0 %	20 %	543951181
92	NC_022356	CATTT	2	10	118209	118218	20 %	60 %	0 %	20 %	543951181
93	NC_022356	AATAA	2	10	118375	118384	80 %	20 %	0 %	0 %	543951181
94	NC_022356	CTTAA	2	10	120189	120198	40 %	40 %	0 %	20 %	543951183
95	NC_022356	TTTTC	2	10	120847	120856	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022356	TCCTT	2	10	120870	120879	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_022356	GATTT	2	10	121345	121354	20 %	60 %	20 %	0 %	543951184
98	NC_022356	CTTTG	2	10	123504	123513	0 %	60 %	20 %	20 %	543951187
99	NC_022356	AGGCA	2	10	124396	124405	40 %	0 %	40 %	20 %	543951188
100	NC_022356	GCAGG	2	10	124422	124431	20 %	0 %	60 %	20 %	543951188
101	NC_022356	CCTGA	2	10	127721	127730	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_022356	CTATT	2	10	128826	128835	20 %	60 %	0 %	20 %	543951192
103	NC_022356	TTCAC	2	10	129229	129238	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_022356	TGTAT	2	10	129316	129325	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022356	TATAA	2	10	129355	129364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022356	ATATT	2	10	129366	129375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022356	ATTTA	2	10	130502	130511	40 %	60 %	0 %	0 %	543951195
108	NC_022356	TTCAC	2	10	131689	131698	20 %	40 %	0 %	40 %	543951196
109	NC_022356	AACGG	2	10	132411	132420	40 %	0 %	40 %	20 %	543951196
110	NC_022356	ACGCC	2	10	132518	132527	20 %	0 %	20 %	60 %	543951196
111	NC_022356	GTTTT	2	10	133399	133408	0 %	80 %	20 %	0 %	543951197
112	NC_022356	ATTGA	2	10	133596	133605	40 %	40 %	20 %	0 %	543951197
113	NC_022356	GCAAA	2	10	134218	134227	60 %	0 %	20 %	20 %	543951198
114	NC_022356	AAAAT	2	10	134510	134519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022356	TCCCC	2	10	137824	137833	0 %	20 %	0 %	80 %	543951200
116	NC_022356	AAAAT	2	10	138649	138658	80 %	20 %	0 %	0 %	543951201
117	NC_022356	TTGTA	2	10	138863	138872	20 %	60 %	20 %	0 %	543951201
118	NC_022356	AAATT	2	10	139242	139251	60 %	40 %	0 %	0 %	543951202
119	NC_022356	AATTC	2	10	141964	141973	40 %	40 %	0 %	20 %	543951204
120	NC_022356	GAAAA	2	10	142275	142284	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022356	TACAA	2	10	142339	142348	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022356	TTACA	2	10	142361	142370	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_022356	TTTTA	2	10	143370	143379	20 %	80 %	0 %	0 %	543951205
124	NC_022356	TCTGC	2	10	144165	144174	0 %	40 %	20 %	40 %	543951206
125	NC_022356	TTAAA	2	10	144186	144195	60 %	40 %	0 %	0 %	543951206
126	NC_022356	TTTCA	2	10	145032	145041	20 %	60 %	0 %	20 %	543951207
127	NC_022356	ATTCA	2	10	145654	145663	40 %	40 %	0 %	20 %	543951208
128	NC_022356	CTTCA	2	10	146272	146281	20 %	40 %	0 %	40 %	543951208
129	NC_022356	AATTT	2	10	148176	148185	40 %	60 %	0 %	0 %	543951210
130	NC_022356	TAAGC	2	10	148596	148605	40 %	20 %	20 %	20 %	543951210
131	NC_022356	AAGTT	2	10	149399	149408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022356	TACGT	2	10	149973	149982	20 %	40 %	20 %	20 %	543951213
133	NC_022356	GCATT	2	10	150042	150051	20 %	40 %	20 %	20 %	543951213
134	NC_022356	ATTCA	2	10	150829	150838	40 %	40 %	0 %	20 %	543951215
135	NC_022356	TAAAA	2	10	151924	151933	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022356	TTGTA	2	10	152491	152500	20 %	60 %	20 %	0 %	543951217
137	NC_022356	AATTT	2	10	154097	154106	40 %	60 %	0 %	0 %	543951220
138	NC_022356	TTCTT	2	10	154757	154766	0 %	80 %	0 %	20 %	543951220
139	NC_022356	TGTGG	2	10	156018	156027	0 %	40 %	60 %	0 %	543951221
140	NC_022356	GATGT	2	10	156474	156483	20 %	40 %	40 %	0 %	543951221
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142	NC_022356	AGTTT	2	10	162388	162397	20 %	60 %	20 %	0 %	543951223
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151	NC_022356	AGCCT	2	10	170212	170221	20 %	20 %	20 %	40 %	543951233
152	NC_022356	GAAAC	2	10	170262	170271	60 %	0 %	20 %	20 %	543951233
153	NC_022356	TAATT	2	10	170870	170879	40 %	60 %	0 %	0 %	543951233
154	NC_022356	TAAAT	2	10	171298	171307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022356	AAAAT	2	10	171354	171363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022356	TTTGA	2	10	171876	171885	20 %	60 %	20 %	0 %	543951234
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159	NC_022356	AAAAC	2	10	174005	174014	80 %	0 %	0 %	20 %	543951235
160	NC_022356	GCCGT	2	10	174200	174209	0 %	20 %	40 %	40 %	543951235
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162	NC_022356	GAATT	2	10	176987	176996	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_022356	CTCTT	2	10	179186	179195	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
165	NC_022356	TAACC	2	10	180687	180696	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
166	NC_022356	CGACT	2	10	181015	181024	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
167	NC_022356	TCGGT	2	10	181390	181399	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
168	NC_022356	GTTTT	2	10	182251	182260	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_022356	TTCAA	2	10	184377	184386	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_022356	AAGTG	2	10	187131	187140	40 %	20 %	40 %	0 %	543951245
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174	NC_022356	TAAAT	2	10	188642	188651	60 %	40 %	0 %	0 %	543951246
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182	NC_022356	GAAAA	2	10	196639	196648	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022356	TAATT	2	10	197685	197694	40 %	60 %	0 %	0 %	543951258
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210	NC_022356	CTCTT	2	10	235477	235486	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
211	NC_022356	TAACC	2	10	236978	236987	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
212	NC_022356	CGACT	2	10	237306	237315	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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217	NC_022356	TTCAA	2	10	240668	240677	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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230	NC_022356	GCGAT	2	10	257503	257512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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232	NC_022356	TTCAT	2	10	258091	258100	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
233	NC_022356	AAAAT	2	10	260157	260166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_022356	TATTT	2	10	260528	260537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_022356	TCTGG	2	10	264376	264385	0 %	40 %	40 %	20 %	543951322
236	NC_022356	TTGAT	2	10	264712	264721	20 %	60 %	20 %	0 %	543951322
237	NC_022356	TCGTA	2	10	265241	265250	20 %	40 %	20 %	20 %	543951322
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239	NC_022356	AAAAG	2	10	267562	267571	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
240	NC_022356	GTTTG	2	10	267682	267691	0 %	60 %	40 %	0 %	543951324
241	NC_022356	AAAAC	2	10	269053	269062	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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248	NC_022356	CCATT	2	10	277066	277075	20 %	40 %	0 %	40 %	543951335
249	NC_022356	CAATA	2	10	277258	277267	60 %	20 %	0 %	20 %	543951335
250	NC_022356	ATTTA	2	10	282358	282367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_022356	GTTTA	2	10	284480	284489	20 %	60 %	20 %	0 %	543951340
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253	NC_022356	AATCA	2	10	287782	287791	60 %	20 %	0 %	20 %	543951343
254	NC_022356	AAATC	2	10	287901	287910	60 %	20 %	0 %	20 %	543951343
255	NC_022356	AAAGA	2	10	288888	288897	80 %	0 %	20 %	0 %	543951345
256	NC_022356	GAATC	2	10	292186	292195	40 %	20 %	20 %	20 %	543951350
257	NC_022356	TTCAT	2	10	293265	293274	20 %	60 %	0 %	20 %	543951351
258	NC_022356	AACTG	2	10	294624	294633	40 %	20 %	20 %	20 %	543951353
259	NC_022356	TATAA	2	10	295875	295884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_022356	ACTGA	2	10	296824	296833	40 %	20 %	20 %	20 %	543951356
261	NC_022356	TTGGT	2	10	297066	297075	0 %	60 %	40 %	0 %	543951356
262	NC_022356	TTATT	2	10	303172	303181	20 %	80 %	0 %	0 %	543951360
263	NC_022356	ATTTT	2	10	303685	303694	20 %	80 %	0 %	0 %	543951360
264	NC_022356	GATGC	2	10	304591	304600	20 %	20 %	40 %	20 %	543951361
265	NC_022356	TTTCT	2	10	305470	305479	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_022356	CCAAA	2	10	308249	308258	60 %	0 %	0 %	40 %	543951368
267	NC_022356	TTTTA	2	10	308404	308413	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_022356	CTCTA	2	10	309375	309384	20 %	40 %	0 %	40 %	543951370
269	NC_022356	TTTCA	2	10	311201	311210	20 %	60 %	0 %	20 %	543951371
270	NC_022356	TTTGA	2	10	311342	311351	20 %	60 %	20 %	0 %	543951371
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272	NC_022356	TTAAA	2	10	312930	312939	60 %	40 %	0 %	0 %	543951373
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400	NC_022356	TTAAT	2	10	494717	494726	40 %	60 %	0 %	0 %	543951555
401	NC_022356	ATTCA	2	10	494736	494745	40 %	40 %	0 %	20 %	543951555
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