MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae KR494

Total Repeats: 24761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022356	TGG	2	6	180	185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543951067
2	NC_022356	ATG	2	6	366	371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951067
3	NC_022356	CTG	2	6	411	416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951067
4	NC_022356	CAG	2	6	462	467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022356	ATT	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951068
6	NC_022356	TGC	2	6	569	574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951068
7	NC_022356	ATC	2	6	599	604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951068
8	NC_022356	ATA	2	6	621	626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951068
9	NC_022356	GCT	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951068
10	NC_022356	CAT	2	6	772	777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951068
11	NC_022356	TCT	2	6	837	842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951068
12	NC_022356	GTT	2	6	904	909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951068
13	NC_022356	AAT	2	6	930	935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951068
14	NC_022356	GAA	2	6	982	987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543951068
15	NC_022356	CTT	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951068
16	NC_022356	ATA	2	6	1208	1213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951068
17	NC_022356	TTC	2	6	1235	1240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951068
18	NC_022356	TGC	2	6	1268	1273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951068
19	NC_022356	CAT	2	6	1310	1315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951068
20	NC_022356	CTT	2	6	1341	1346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022356	TAA	2	6	1415	1420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022356	ATT	2	6	1447	1452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022356	AAT	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022356	TCA	2	6	1506	1511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951069
25	NC_022356	TAG	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951069
26	NC_022356	TCT	2	6	1566	1571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951069
27	NC_022356	TTG	2	6	1598	1603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951069
28	NC_022356	ATA	2	6	1701	1706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951069
29	NC_022356	TCA	2	6	1717	1722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951069
30	NC_022356	GAT	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951069
31	NC_022356	ATA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951070
32	NC_022356	TCA	2	6	2211	2216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951070
33	NC_022356	ATT	2	6	2540	2545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951070
34	NC_022356	CCA	2	6	2557	2562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543951070
35	NC_022356	ATC	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951070
36	NC_022356	TTG	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951070
37	NC_022356	AAT	2	6	2774	2779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951070
38	NC_022356	GAC	2	6	2926	2931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951071
39	NC_022356	ATA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951071
40	NC_022356	TTC	2	6	2972	2977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
41	NC_022356	CAT	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951071
42	NC_022356	TGG	3	9	3088	3096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543951071
43	NC_022356	TTG	2	6	3181	3186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951071
44	NC_022356	CTT	2	6	3238	3243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
45	NC_022356	ACC	2	6	3290	3295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543951071
46	NC_022356	AAT	2	6	3320	3325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951071
47	NC_022356	TCT	2	6	3354	3359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
48	NC_022356	TTC	2	6	3360	3365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
49	NC_022356	AAT	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951071
50	NC_022356	TTC	2	6	3455	3460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
51	NC_022356	TAA	2	6	3464	3469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951071
52	NC_022356	TTC	2	6	3593	3598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
53	NC_022356	ATT	2	6	3632	3637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951071
54	NC_022356	TAA	2	6	3715	3720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951071
55	NC_022356	CTT	2	6	3850	3855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951071
56	NC_022356	AAC	2	6	4065	4070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543951071
57	NC_022356	AAT	2	6	4141	4146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951071
58	NC_022356	GCT	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951071
59	NC_022356	ACG	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951071
60	NC_022356	GTT	2	6	4357	4362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951071
61	NC_022356	CAT	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951071
62	NC_022356	TTA	2	6	4437	4442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951071
63	NC_022356	TCT	2	6	4619	4624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951072
64	NC_022356	TGA	2	6	4655	4660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951072
65	NC_022356	ACC	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543951072
66	NC_022356	GAA	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543951072
67	NC_022356	ATA	2	6	4963	4968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951072
68	NC_022356	ATC	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951072
69	NC_022356	TCG	2	6	5055	5060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951072
70	NC_022356	AAT	2	6	5249	5254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022356	GAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543951073
72	NC_022356	GAT	2	6	5402	5407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951073
73	NC_022356	TTG	2	6	5477	5482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951073
74	NC_022356	AAT	2	6	5622	5627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951073
75	NC_022356	TAT	2	6	5760	5765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
76	NC_022356	TTG	2	6	5782	5787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951074
77	NC_022356	TTC	2	6	5788	5793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
78	NC_022356	CAG	2	6	5907	5912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951074
79	NC_022356	TGG	2	6	5919	5924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543951074
80	NC_022356	GTT	2	6	6143	6148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951074
81	NC_022356	CAT	2	6	6198	6203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951074
82	NC_022356	TTC	2	6	6249	6254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
83	NC_022356	TGA	2	6	6344	6349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951074
84	NC_022356	TAT	2	6	6561	6566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
85	NC_022356	GCT	2	6	6656	6661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951074
86	NC_022356	ATT	2	6	6823	6828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
87	NC_022356	CTT	2	6	6894	6899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
88	NC_022356	CAT	2	6	6921	6926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951074
89	NC_022356	TAC	2	6	6940	6945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951074
90	NC_022356	TCT	2	6	7010	7015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
91	NC_022356	ATT	2	6	7156	7161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
92	NC_022356	ATT	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
93	NC_022356	CGC	2	6	7300	7305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543951074
94	NC_022356	TAT	2	6	7338	7343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
95	NC_022356	ATT	3	9	7429	7437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
96	NC_022356	CAG	2	6	7620	7625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951074
97	NC_022356	ATT	2	6	7678	7683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951074
98	NC_022356	CTT	2	6	7704	7709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
99	NC_022356	TCT	2	6	7787	7792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
100	NC_022356	TAA	2	6	7890	7895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951074
101	NC_022356	CTT	2	6	7959	7964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
102	NC_022356	GTT	2	6	8048	8053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951074
103	NC_022356	TAA	3	9	8091	8099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951074
104	NC_022356	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951074
105	NC_022356	CTT	2	6	8223	8228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951074
106	NC_022356	GTA	2	6	8309	8314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951074
107	NC_022356	TGT	2	6	8345	8350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951074
108	NC_022356	TGT	2	6	8360	8365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951074
109	NC_022356	CCT	2	6	8452	8457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543951075
110	NC_022356	AAT	2	6	8711	8716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951075
111	NC_022356	ACC	2	6	8793	8798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543951075
112	NC_022356	TGT	2	6	8956	8961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951075
113	NC_022356	TAA	2	6	9029	9034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951075
114	NC_022356	TTG	2	6	9102	9107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951075
115	NC_022356	TGA	2	6	9124	9129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951075
116	NC_022356	TTG	2	6	9173	9178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951075
117	NC_022356	CAA	2	6	9183	9188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543951075
118	NC_022356	ACC	2	6	9240	9245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543951075
119	NC_022356	AAT	2	6	9311	9316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951075
120	NC_022356	ATT	2	6	9393	9398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951075
121	NC_022356	CAG	2	6	9410	9415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951075
122	NC_022356	TTG	2	6	9439	9444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951075
123	NC_022356	CAT	2	6	9566	9571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951075
124	NC_022356	TGT	2	6	9630	9635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543951075
125	NC_022356	GGT	2	6	9751	9756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543951075
126	NC_022356	ATT	3	9	9780	9788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951075
127	NC_022356	ACT	2	6	9889	9894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951075
128	NC_022356	AAT	2	6	9991	9996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951075
129	NC_022356	CGC	2	6	10551	10556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543951076
130	NC_022356	CAA	2	6	10687	10692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543951076
131	NC_022356	ATT	2	6	10729	10734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951076
132	NC_022356	CAT	2	6	10764	10769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951076
133	NC_022356	CAT	2	6	11211	11216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951076
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156	NC_022356	TAA	2	6	12451	12456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_022356	TAT	2	6	18649	18654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951083
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246	NC_022356	AAT	2	6	18752	18757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951083
247	NC_022356	TTC	2	6	18809	18814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543951083
248	NC_022356	CTA	2	6	18889	18894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951083
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250	NC_022356	TTA	2	6	19134	19139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951084
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252	NC_022356	ACG	2	6	19438	19443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951084
253	NC_022356	CAT	2	6	19521	19526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951084
254	NC_022356	ATT	2	6	19636	19641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_022356	ACA	2	6	19725	19730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543951085
256	NC_022356	ATT	2	6	19739	19744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951085
257	NC_022356	ATC	2	6	19747	19752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951085
258	NC_022356	TAT	2	6	19757	19762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951085
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260	NC_022356	TTA	2	6	19775	19780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951085
261	NC_022356	ATT	2	6	19835	19840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543951085
262	NC_022356	CTA	2	6	19841	19846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951085
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264	NC_022356	CGG	2	6	19974	19979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543951085
265	NC_022356	AAT	2	6	20150	20155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543951085
266	NC_022356	TGA	2	6	20169	20174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543951086
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272	NC_022356	AAT	2	6	20604	20609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_022356	GCA	2	6	20613	20618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543951087
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352	NC_022356	AAT	2	6	29784	29789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_022356	GTG	2	6	31331	31336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543951093
380	NC_022356	TCA	2	6	31482	31487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543951093
381	NC_022356	GTT	2	6	31520	31525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
382	NC_022356	TAG	2	6	31621	31626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
383	NC_022356	TAA	3	9	31653	31661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
384	NC_022356	CTA	2	6	31707	31712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
385	NC_022356	AGC	2	6	31713	31718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
386	NC_022356	TCG	2	6	31899	31904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543951094
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