MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B complete genome

Total Repeats: 69231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021921	CAC	2	6	254473	254478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076712
6002	NC_021921	CACCC	2	10	254487	254496	20 %	0 %	0 %	80 %	529076712
6003	NC_021921	TCGC	2	8	254529	254536	0 %	25 %	25 %	50 %	529076712
6004	NC_021921	TCG	2	6	254555	254560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6005	NC_021921	GTCGGC	2	12	254590	254601	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529076712
6006	NC_021921	TCG	2	6	254612	254617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6007	NC_021921	CG	3	6	254622	254627	0 %	0 %	50 %	50 %	529076712
6008	NC_021921	TGA	2	6	254775	254780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076712
6009	NC_021921	AGCG	2	8	254798	254805	25 %	0 %	50 %	25 %	529076712
6010	NC_021921	CG	4	8	254812	254819	0 %	0 %	50 %	50 %	529076712
6011	NC_021921	CCG	2	6	254921	254926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076712
6012	NC_021921	GAG	2	6	254956	254961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076712
6013	NC_021921	GTA	2	6	254986	254991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076712
6014	NC_021921	CGT	2	6	255006	255011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6015	NC_021921	CGT	3	9	255027	255035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6016	NC_021921	GAA	2	6	255046	255051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076712
6017	NC_021921	CCG	2	6	255053	255058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076712
6018	NC_021921	TCT	2	6	255116	255121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076712
6019	NC_021921	CTG	2	6	255136	255141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6020	NC_021921	CGA	2	6	255165	255170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6021	NC_021921	CGC	2	6	255174	255179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076712
6022	NC_021921	AGC	2	6	255191	255196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6023	NC_021921	TCCG	2	8	255208	255215	0 %	25 %	25 %	50 %	529076712
6024	NC_021921	CGAG	2	8	255237	255244	25 %	0 %	50 %	25 %	529076712
6025	NC_021921	TCC	2	6	255248	255253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076712
6026	NC_021921	GTC	2	6	255311	255316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6027	NC_021921	CG	3	6	255342	255347	0 %	0 %	50 %	50 %	529076712
6028	NC_021921	GTT	2	6	255349	255354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529076712
6029	NC_021921	CTC	2	6	255373	255378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076712
6030	NC_021921	CTG	2	6	255403	255408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6031	NC_021921	GCC	3	9	255431	255439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076712
6032	NC_021921	AAC	2	6	255467	255472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529076712
6033	NC_021921	CGA	2	6	255477	255482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6034	NC_021921	CCAC	2	8	255521	255528	25 %	0 %	0 %	75 %	529076712
6035	NC_021921	GAC	2	6	255529	255534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6036	NC_021921	GTC	2	6	255553	255558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6037	NC_021921	CGG	2	6	255613	255618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076712
6038	NC_021921	GCC	3	9	255649	255657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076712
6039	NC_021921	CGA	3	9	255738	255746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6040	NC_021921	GAC	2	6	255797	255802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6041	NC_021921	CGT	3	9	255822	255830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076712
6042	NC_021921	GTCG	2	8	255866	255873	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_021921	AATA	2	8	255879	255886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_021921	GGT	2	6	255952	255957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076713
6045	NC_021921	GC	3	6	256013	256018	0 %	0 %	50 %	50 %	529076713
6046	NC_021921	GC	3	6	256022	256027	0 %	0 %	50 %	50 %	529076713
6047	NC_021921	ATG	2	6	256045	256050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076713
6048	NC_021921	CGG	2	6	256067	256072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076713
6049	NC_021921	GGA	2	6	256085	256090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076713
6050	NC_021921	TTC	2	6	256212	256217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076714
6051	NC_021921	TCT	2	6	256270	256275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076714
6052	NC_021921	TCG	2	6	256289	256294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076714
6053	NC_021921	CGA	2	6	256298	256303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076714
6054	NC_021921	AGC	2	6	256330	256335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076714
6055	NC_021921	GCC	2	6	256375	256380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076714
6056	NC_021921	CTC	2	6	256383	256388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076714
6057	NC_021921	CGCC	2	8	256408	256415	0 %	0 %	25 %	75 %	529076714
6058	NC_021921	CA	3	6	256550	256555	50 %	0 %	0 %	50 %	529076714
6059	NC_021921	GCA	2	6	256559	256564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076714
6060	NC_021921	TCC	2	6	256573	256578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076714
6061	NC_021921	CAG	2	6	256587	256592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076714
6062	NC_021921	TGG	2	6	256666	256671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076714
6063	NC_021921	GAG	2	6	256681	256686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076714
6064	NC_021921	GACG	2	8	256712	256719	25 %	0 %	50 %	25 %	529076714
6065	NC_021921	TCG	2	6	256723	256728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076714
6066	NC_021921	GTC	3	9	256875	256883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076714
6067	NC_021921	GAA	2	6	256890	256895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076714
6068	NC_021921	CGA	2	6	256907	256912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076714
6069	NC_021921	TCG	2	6	256918	256923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076714
6070	NC_021921	GAA	2	6	256995	257000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076714
6071	NC_021921	CG	3	6	257019	257024	0 %	0 %	50 %	50 %	529076714
6072	NC_021921	GAT	2	6	257028	257033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076714
6073	NC_021921	CTCGTC	2	12	257043	257054	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	529076714
6074	NC_021921	CAG	2	6	257160	257165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_021921	GTTC	2	8	257193	257200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6076	NC_021921	AT	3	6	257201	257206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_021921	TTGA	2	8	257207	257214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_021921	ATT	2	6	257221	257226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_021921	GCG	2	6	257234	257239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_021921	CA	3	6	257245	257250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6081	NC_021921	CGAAT	2	10	257261	257270	40 %	20 %	20 %	20 %	529076715
6082	NC_021921	CGA	3	9	257393	257401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076715
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6084	NC_021921	CGA	2	6	257492	257497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076715
6085	NC_021921	GAG	2	6	257529	257534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076715
6086	NC_021921	GGC	2	6	257579	257584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076715
6087	NC_021921	TCC	2	6	257778	257783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076715
6088	NC_021921	GTC	2	6	257798	257803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076716
6089	NC_021921	CGA	2	6	257891	257896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076716
6090	NC_021921	ACT	2	6	257973	257978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076716
6091	NC_021921	CCG	2	6	257985	257990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076716
6092	NC_021921	CG	3	6	257989	257994	0 %	0 %	50 %	50 %	529076716
6093	NC_021921	ACT	2	6	258039	258044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076716
6094	NC_021921	ACCGG	2	10	258061	258070	20 %	0 %	40 %	40 %	529076716
6095	NC_021921	GAC	2	6	258095	258100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076716
6096	NC_021921	ACG	2	6	258105	258110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076716
6097	NC_021921	ACG	2	6	258138	258143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076716
6098	NC_021921	CAC	2	6	258369	258374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076717
6099	NC_021921	TCG	2	6	258390	258395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076717
6100	NC_021921	TCG	2	6	258413	258418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076717
6101	NC_021921	GTT	2	6	258444	258449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529076717
6102	NC_021921	TTC	2	6	258467	258472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076717
6103	NC_021921	CGT	2	6	258516	258521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076717
6104	NC_021921	GCGG	2	8	258579	258586	0 %	0 %	75 %	25 %	529076717
6105	NC_021921	CGC	2	6	258588	258593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076717
6106	NC_021921	CG	3	6	258604	258609	0 %	0 %	50 %	50 %	529076717
6107	NC_021921	GGA	2	6	258657	258662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076717
6108	NC_021921	GAA	2	6	258787	258792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076717
6109	NC_021921	GCC	2	6	258810	258815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076717
6110	NC_021921	GGGC	2	8	258825	258832	0 %	0 %	75 %	25 %	529076717
6111	NC_021921	CCG	2	6	258897	258902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076717
6112	NC_021921	CTC	2	6	258955	258960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076717
6113	NC_021921	CGA	2	6	258963	258968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076717
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6116	NC_021921	CGA	2	6	259053	259058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076717
6117	NC_021921	CGTCG	2	10	259060	259069	0 %	20 %	40 %	40 %	529076717
6118	NC_021921	TCG	3	9	259106	259114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076717
6119	NC_021921	CGACT	2	10	259126	259135	20 %	20 %	20 %	40 %	529076717
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6242	NC_021921	CCG	2	6	263963	263968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076721
6243	NC_021921	ACCCG	2	10	263994	264003	20 %	0 %	20 %	60 %	529076721
6244	NC_021921	CGG	2	6	264018	264023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076721
6245	NC_021921	CGA	2	6	264050	264055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076721
6246	NC_021921	CGT	2	6	264056	264061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076721
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6249	NC_021921	GAC	3	9	264153	264161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076721
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6251	NC_021921	CCG	2	6	264199	264204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076721
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6254	NC_021921	CGT	2	6	264290	264295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076722
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6263	NC_021921	CGT	2	6	264662	264667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076722
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6358	NC_021921	GACGGC	2	12	268186	268197	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529076726
6359	NC_021921	TCG	2	6	268200	268205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076726
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6361	NC_021921	CTG	2	6	268310	268315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076726
6362	NC_021921	TCG	2	6	268323	268328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076726
6363	NC_021921	GAA	2	6	268390	268395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6364	NC_021921	CAG	2	6	268404	268409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6365	NC_021921	AGG	2	6	268432	268437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6366	NC_021921	GAG	2	6	268441	268446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6367	NC_021921	CTCC	2	8	268466	268473	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6368	NC_021921	TCAGA	2	10	268474	268483	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6369	NC_021921	CTG	2	6	268514	268519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6393	NC_021921	TAC	2	6	269711	269716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076727
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6397	NC_021921	CT	3	6	269950	269955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6398	NC_021921	GTA	2	6	269987	269992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076729
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6481	NC_021921	GAA	2	6	273187	273192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076732
6482	NC_021921	CGT	2	6	273298	273303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076732
6483	NC_021921	ACG	2	6	273329	273334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076732
6484	NC_021921	GAT	2	6	273394	273399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076732
6485	NC_021921	TCCA	2	8	273407	273414	25 %	25 %	0 %	50 %	529076732
6486	NC_021921	ACC	2	6	273426	273431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076732
6487	NC_021921	ACCG	2	8	273453	273460	25 %	0 %	25 %	50 %	529076732
6488	NC_021921	GAC	2	6	273625	273630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076732
6489	NC_021921	GGA	2	6	273645	273650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076732
6490	NC_021921	CGA	2	6	273798	273803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076732
6491	NC_021921	GTAC	2	8	273847	273854	25 %	25 %	25 %	25 %	529076732
6492	NC_021921	ATC	2	6	273923	273928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076732
6493	NC_021921	GAA	2	6	273949	273954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076732
6494	NC_021921	C	6	6	274079	274084	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6495	NC_021921	GCCG	2	8	274105	274112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6496	NC_021921	GCCG	2	8	274142	274149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6497	NC_021921	TCC	2	6	274195	274200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6498	NC_021921	GTC	2	6	274237	274242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6499	NC_021921	CCCG	2	8	274285	274292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6500	NC_021921	CGAG	2	8	274359	274366	25 %	0 %	50 %	25 %	529076733

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