MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021913	A	6	6	2242	2247	100 %	0 %	0 %	0 %	529043440
2	NC_021913	G	6	6	12205	12210	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021913	A	6	6	15384	15389	100 %	0 %	0 %	0 %	529043446
4	NC_021913	C	6	6	23453	23458	0 %	0 %	0 %	100 %	529043448
5	NC_021913	C	6	6	25302	25307	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_021913	C	6	6	39727	39732	0 %	0 %	0 %	100 %	529043468
7	NC_021913	G	6	6	40759	40764	0 %	0 %	100 %	0 %	529043470
8	NC_021913	T	6	6	44399	44404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021913	C	6	6	44757	44762	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_021913	G	6	6	44785	44790	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021913	G	6	6	46159	46164	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021913	G	6	6	46167	46172	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021913	G	6	6	46234	46239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021913	C	6	6	46543	46548	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_021913	A	6	6	47487	47492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021913	C	6	6	51582	51587	0 %	0 %	0 %	100 %	529043478
17	NC_021913	G	6	6	55123	55128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021913	C	6	6	65251	65256	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_021913	G	6	6	66797	66802	0 %	0 %	100 %	0 %	529043495
20	NC_021913	G	6	6	72721	72726	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021913	C	6	6	77462	77467	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_021913	A	6	6	80186	80191	100 %	0 %	0 %	0 %	529043510
23	NC_021913	G	6	6	85038	85043	0 %	0 %	100 %	0 %	529043516
24	NC_021913	C	6	6	90361	90366	0 %	0 %	0 %	100 %	529043524
25	NC_021913	A	6	6	92349	92354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021913	G	8	8	94268	94275	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021913	C	6	6	105402	105407	0 %	0 %	0 %	100 %	529043536
28	NC_021913	T	6	6	106493	106498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021913	G	6	6	106828	106833	0 %	0 %	100 %	0 %	529043537
30	NC_021913	C	6	6	107669	107674	0 %	0 %	0 %	100 %	529043537
31	NC_021913	C	6	6	108287	108292	0 %	0 %	0 %	100 %	529043537
32	NC_021913	G	6	6	112175	112180	0 %	0 %	100 %	0 %	529043541
33	NC_021913	C	7	7	117889	117895	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_021913	C	6	6	126076	126081	0 %	0 %	0 %	100 %	529043550
35	NC_021913	G	6	6	132224	132229	0 %	0 %	100 %	0 %	529043553
36	NC_021913	T	6	6	132919	132924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021913	A	6	6	134839	134844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021913	C	6	6	135442	135447	0 %	0 %	0 %	100 %	529043556
39	NC_021913	A	6	6	136817	136822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021913	T	6	6	137119	137124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021913	G	6	6	150724	150729	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021913	T	6	6	151419	151424	0 %	100 %	0 %	0 %	529043567
43	NC_021913	A	6	6	159655	159660	100 %	0 %	0 %	0 %	529043572
44	NC_021913	A	6	6	160386	160391	100 %	0 %	0 %	0 %	529043572
45	NC_021913	C	6	6	163372	163377	0 %	0 %	0 %	100 %	529043574
46	NC_021913	G	6	6	164149	164154	0 %	0 %	100 %	0 %	529043574
47	NC_021913	C	6	6	168118	168123	0 %	0 %	0 %	100 %	529043577
48	NC_021913	C	6	6	171760	171765	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_021913	T	6	6	176655	176660	0 %	100 %	0 %	0 %	529043584
50	NC_021913	C	6	6	176845	176850	0 %	0 %	0 %	100 %	529043584
51	NC_021913	A	6	6	179057	179062	100 %	0 %	0 %	0 %	529043585
52	NC_021913	G	6	6	180799	180804	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021913	C	7	7	183311	183317	0 %	0 %	0 %	100 %	529043592
54	NC_021913	A	6	6	187014	187019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021913	C	6	6	187476	187481	0 %	0 %	0 %	100 %	529043597
56	NC_021913	C	6	6	198559	198564	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_021913	G	6	6	198942	198947	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021913	G	6	6	199037	199042	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021913	G	6	6	199095	199100	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021913	G	6	6	199306	199311	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021913	G	6	6	200847	200852	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021913	C	6	6	207853	207858	0 %	0 %	0 %	100 %	529043616
63	NC_021913	A	6	6	211880	211885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021913	G	6	6	225120	225125	0 %	0 %	100 %	0 %	529043638
65	NC_021913	C	6	6	234166	234171	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_021913	A	6	6	237228	237233	100 %	0 %	0 %	0 %	529043649
67	NC_021913	G	6	6	237360	237365	0 %	0 %	100 %	0 %	529043649
68	NC_021913	G	6	6	239588	239593	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021913	G	6	6	240743	240748	0 %	0 %	100 %	0 %	529043652
70	NC_021913	T	6	6	243192	243197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021913	C	6	6	245486	245491	0 %	0 %	0 %	100 %	529043655
72	NC_021913	G	7	7	251460	251466	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021913	G	6	6	252126	252131	0 %	0 %	100 %	0 %	529043657
74	NC_021913	A	6	6	255952	255957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021913	G	6	6	257063	257068	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021913	C	6	6	263992	263997	0 %	0 %	0 %	100 %	529043672
77	NC_021913	A	6	6	269369	269374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021913	T	6	6	270555	270560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021913	A	6	6	271621	271626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021913	G	6	6	279606	279611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021913	G	6	6	281098	281103	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021913	G	6	6	283324	283329	0 %	0 %	100 %	0 %	529043689
83	NC_021913	A	6	6	290841	290846	100 %	0 %	0 %	0 %	529043696
84	NC_021913	G	6	6	291625	291630	0 %	0 %	100 %	0 %	529043697
85	NC_021913	C	6	6	292178	292183	0 %	0 %	0 %	100 %	529043697
86	NC_021913	G	6	6	292614	292619	0 %	0 %	100 %	0 %	529043697
87	NC_021913	C	6	6	304849	304854	0 %	0 %	0 %	100 %	529043703
88	NC_021913	C	6	6	312813	312818	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_021913	T	6	6	320090	320095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021913	C	6	6	328999	329004	0 %	0 %	0 %	100 %	529043716

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.