MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021913	CCTC	2	8	692	699	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_021913	ACGA	2	8	979	986	50 %	0 %	25 %	25 %	529043438
3	NC_021913	CGAG	2	8	1117	1124	25 %	0 %	50 %	25 %	529043438
4	NC_021913	CGAA	2	8	1161	1168	50 %	0 %	25 %	25 %	529043438
5	NC_021913	CGGT	2	8	1661	1668	0 %	25 %	50 %	25 %	529043440
6	NC_021913	AGTC	2	8	2387	2394	25 %	25 %	25 %	25 %	529043440
7	NC_021913	GCTG	2	8	2765	2772	0 %	25 %	50 %	25 %	529043440
8	NC_021913	CTCG	2	8	3053	3060	0 %	25 %	25 %	50 %	529043441
9	NC_021913	GAGC	2	8	3574	3581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021913	TCGT	2	8	3661	3668	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021913	CAGT	2	8	3909	3916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021913	TGTC	2	8	4566	4573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021913	TCGT	2	8	5271	5278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021913	TCGT	2	8	5289	5296	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021913	GCCG	2	8	5616	5623	0 %	0 %	50 %	50 %	529043442
16	NC_021913	TGGA	2	8	6017	6024	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021913	GATC	2	8	7167	7174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021913	TCGA	2	8	7235	7242	25 %	25 %	25 %	25 %	529043444
19	NC_021913	GAGT	2	8	7401	7408	25 %	25 %	50 %	0 %	529043444
20	NC_021913	GCTG	2	8	7519	7526	0 %	25 %	50 %	25 %	529043444
21	NC_021913	TGGC	2	8	7791	7798	0 %	25 %	50 %	25 %	529043444
22	NC_021913	TGGT	2	8	8469	8476	0 %	50 %	50 %	0 %	529043444
23	NC_021913	ATTG	2	8	8855	8862	25 %	50 %	25 %	0 %	529043444
24	NC_021913	CGGT	2	8	8871	8878	0 %	25 %	50 %	25 %	529043444
25	NC_021913	AGGT	2	8	8929	8936	25 %	25 %	50 %	0 %	529043444
26	NC_021913	CGCT	2	8	9726	9733	0 %	25 %	25 %	50 %	529043444
27	NC_021913	TTGG	2	8	10334	10341	0 %	50 %	50 %	0 %	529043444
28	NC_021913	GATT	2	8	10734	10741	25 %	50 %	25 %	0 %	529043445
29	NC_021913	CTTC	2	8	10983	10990	0 %	50 %	0 %	50 %	529043445
30	NC_021913	TGGT	2	8	11026	11033	0 %	50 %	50 %	0 %	529043445
31	NC_021913	TAGT	2	8	11360	11367	25 %	50 %	25 %	0 %	529043445
32	NC_021913	GTTC	2	8	11413	11420	0 %	50 %	25 %	25 %	529043445
33	NC_021913	AGGA	2	8	11927	11934	50 %	0 %	50 %	0 %	529043445
34	NC_021913	CAAA	2	8	12493	12500	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021913	GACC	2	8	13196	13203	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021913	CGAA	3	12	13323	13334	50 %	0 %	25 %	25 %	529043446
37	NC_021913	TGAG	2	8	14999	15006	25 %	25 %	50 %	0 %	529043446
38	NC_021913	TCGA	2	8	15106	15113	25 %	25 %	25 %	25 %	529043446
39	NC_021913	CAGA	2	8	15216	15223	50 %	0 %	25 %	25 %	529043446
40	NC_021913	TCGT	2	8	15581	15588	0 %	50 %	25 %	25 %	529043446
41	NC_021913	CGGC	2	8	15993	16000	0 %	0 %	50 %	50 %	529043446
42	NC_021913	CGAA	2	8	16142	16149	50 %	0 %	25 %	25 %	529043446
43	NC_021913	TCAC	2	8	16431	16438	25 %	25 %	0 %	50 %	529043447
44	NC_021913	CAGC	2	8	16756	16763	25 %	0 %	25 %	50 %	529043447
45	NC_021913	CGAT	2	8	17986	17993	25 %	25 %	25 %	25 %	529043447
46	NC_021913	ACAT	2	8	18386	18393	50 %	25 %	0 %	25 %	529043447
47	NC_021913	CTTC	2	8	18875	18882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021913	ATTT	2	8	19764	19771	25 %	75 %	0 %	0 %	529043448
49	NC_021913	TTTC	2	8	19820	19827	0 %	75 %	0 %	25 %	529043448
50	NC_021913	CGAT	2	8	19963	19970	25 %	25 %	25 %	25 %	529043448
51	NC_021913	ATCG	2	8	20282	20289	25 %	25 %	25 %	25 %	529043448
52	NC_021913	GCAA	2	8	21222	21229	50 %	0 %	25 %	25 %	529043448
53	NC_021913	TGAG	2	8	21580	21587	25 %	25 %	50 %	0 %	529043448
54	NC_021913	TGAG	2	8	21713	21720	25 %	25 %	50 %	0 %	529043448
55	NC_021913	GACA	2	8	21745	21752	50 %	0 %	25 %	25 %	529043448
56	NC_021913	ACAA	2	8	22242	22249	75 %	0 %	0 %	25 %	529043448
57	NC_021913	ACGT	2	8	22681	22688	25 %	25 %	25 %	25 %	529043448
58	NC_021913	GGAG	2	8	23056	23063	25 %	0 %	75 %	0 %	529043448
59	NC_021913	GATT	2	8	23115	23122	25 %	50 %	25 %	0 %	529043448
60	NC_021913	GCTC	2	8	23212	23219	0 %	25 %	25 %	50 %	529043448
61	NC_021913	GATA	2	8	23540	23547	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021913	AAGT	2	8	23558	23565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021913	TTAC	2	8	23658	23665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021913	TTGA	2	8	23756	23763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021913	CCAG	2	8	23768	23775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021913	TAGT	2	8	23816	23823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021913	CGGA	2	8	23961	23968	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021913	AAGC	2	8	24292	24299	50 %	0 %	25 %	25 %	529043449
69	NC_021913	TCAC	2	8	24312	24319	25 %	25 %	0 %	50 %	529043449
70	NC_021913	CGTT	2	8	24828	24835	0 %	50 %	25 %	25 %	529043450
71	NC_021913	TGGT	2	8	24999	25006	0 %	50 %	50 %	0 %	529043450
72	NC_021913	GATT	2	8	25020	25027	25 %	50 %	25 %	0 %	529043450
73	NC_021913	CGTC	2	8	26995	27002	0 %	25 %	25 %	50 %	529043452
74	NC_021913	CAGA	2	8	27038	27045	50 %	0 %	25 %	25 %	529043452
75	NC_021913	GACC	2	8	27407	27414	25 %	0 %	25 %	50 %	529043452
76	NC_021913	GACC	2	8	28006	28013	25 %	0 %	25 %	50 %	529043452
77	NC_021913	ATTC	2	8	28057	28064	25 %	50 %	0 %	25 %	529043452
78	NC_021913	CGAG	2	8	29404	29411	25 %	0 %	50 %	25 %	529043454
79	NC_021913	GACT	2	8	29821	29828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021913	GCCC	2	8	30170	30177	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_021913	GAGG	2	8	30378	30385	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021913	GGCA	2	8	30414	30421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021913	GCGG	2	8	30795	30802	0 %	0 %	75 %	25 %	529043456
84	NC_021913	GATA	2	8	31680	31687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021913	GGAT	2	8	31728	31735	25 %	25 %	50 %	0 %	529043458
86	NC_021913	CGAT	2	8	32286	32293	25 %	25 %	25 %	25 %	529043458
87	NC_021913	CACG	2	8	32397	32404	25 %	0 %	25 %	50 %	529043459
88	NC_021913	TCGA	2	8	32686	32693	25 %	25 %	25 %	25 %	529043459
89	NC_021913	TCAC	2	8	33089	33096	25 %	25 %	0 %	50 %	529043460
90	NC_021913	TGCC	2	8	33386	33393	0 %	25 %	25 %	50 %	529043461
91	NC_021913	GGTG	2	8	33435	33442	0 %	25 %	75 %	0 %	529043461
92	NC_021913	TCGA	2	8	33577	33584	25 %	25 %	25 %	25 %	529043461
93	NC_021913	GACC	2	8	33702	33709	25 %	0 %	25 %	50 %	529043461
94	NC_021913	CGGG	2	8	34007	34014	0 %	0 %	75 %	25 %	529043461
95	NC_021913	GCCG	2	8	34626	34633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021913	CGCT	2	8	34910	34917	0 %	25 %	25 %	50 %	529043462
97	NC_021913	GCTG	2	8	35194	35201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021913	CACC	2	8	35927	35934	25 %	0 %	0 %	75 %	529043464
99	NC_021913	CCGG	2	8	36049	36056	0 %	0 %	50 %	50 %	529043464
100	NC_021913	GGAA	2	8	36474	36481	50 %	0 %	50 %	0 %	529043464
101	NC_021913	TTGC	2	8	37155	37162	0 %	50 %	25 %	25 %	529043465
102	NC_021913	TTCC	2	8	38022	38029	0 %	50 %	0 %	50 %	529043466
103	NC_021913	CCGG	2	8	38447	38454	0 %	0 %	50 %	50 %	529043466
104	NC_021913	GTGG	2	8	39534	39541	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021913	CGAA	2	8	39756	39763	50 %	0 %	25 %	25 %	529043468
106	NC_021913	TTCG	2	8	40347	40354	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021913	CCCA	2	8	41264	41271	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_021913	CGGG	2	8	41783	41790	0 %	0 %	75 %	25 %	529043472
109	NC_021913	GAAC	2	8	42885	42892	50 %	0 %	25 %	25 %	529043474
110	NC_021913	GATG	2	8	43053	43060	25 %	25 %	50 %	0 %	529043474
111	NC_021913	CCAA	2	8	44304	44311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021913	AGAT	2	8	44407	44414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021913	CACC	2	8	44464	44471	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_021913	GAGT	2	8	44896	44903	25 %	25 %	50 %	0 %	529043475
115	NC_021913	GGTT	2	8	45057	45064	0 %	50 %	50 %	0 %	529043475
116	NC_021913	CAGT	2	8	45102	45109	25 %	25 %	25 %	25 %	529043475
117	NC_021913	AAGT	2	8	45374	45381	50 %	25 %	25 %	0 %	529043475
118	NC_021913	TCGC	2	8	45558	45565	0 %	25 %	25 %	50 %	529043475
119	NC_021913	CCAT	2	8	45917	45924	25 %	25 %	0 %	50 %	529043475
120	NC_021913	GGTT	2	8	46346	46353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021913	GAAG	2	8	46376	46383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021913	TTGG	2	8	46511	46518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021913	AGCG	2	8	46924	46931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021913	CACT	2	8	47102	47109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021913	CAAA	2	8	47679	47686	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021913	TCGA	2	8	48268	48275	25 %	25 %	25 %	25 %	529043476
127	NC_021913	CTGA	2	8	49300	49307	25 %	25 %	25 %	25 %	529043476
128	NC_021913	TCGA	2	8	49309	49316	25 %	25 %	25 %	25 %	529043476
129	NC_021913	TCGA	2	8	49572	49579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021913	CCTT	2	8	50560	50567	0 %	50 %	0 %	50 %	529043477
131	NC_021913	ACAA	2	8	51200	51207	75 %	0 %	0 %	25 %	529043477
132	NC_021913	GTTC	2	8	51283	51290	0 %	50 %	25 %	25 %	529043477
133	NC_021913	CGCA	2	8	51519	51526	25 %	0 %	25 %	50 %	529043478
134	NC_021913	TCGC	2	8	51679	51686	0 %	25 %	25 %	50 %	529043478
135	NC_021913	CTCG	3	12	51785	51796	0 %	25 %	25 %	50 %	529043478
136	NC_021913	CGAC	2	8	52704	52711	25 %	0 %	25 %	50 %	529043480
137	NC_021913	TGAC	2	8	52765	52772	25 %	25 %	25 %	25 %	529043480
138	NC_021913	CATC	2	8	52866	52873	25 %	25 %	0 %	50 %	529043480
139	NC_021913	GTTG	2	8	52948	52955	0 %	50 %	50 %	0 %	529043480
140	NC_021913	GATG	2	8	53800	53807	25 %	25 %	50 %	0 %	529043482
141	NC_021913	GCCA	2	8	54147	54154	25 %	0 %	25 %	50 %	529043482
142	NC_021913	AGGG	2	8	54158	54165	25 %	0 %	75 %	0 %	529043482
143	NC_021913	GGTC	2	8	54418	54425	0 %	25 %	50 %	25 %	529043482
144	NC_021913	TGAG	2	8	54555	54562	25 %	25 %	50 %	0 %	529043482
145	NC_021913	TCGA	2	8	55044	55051	25 %	25 %	25 %	25 %	529043482
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154	NC_021913	ACGC	2	8	57871	57878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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159	NC_021913	ACAG	2	8	60831	60838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_021913	GTTC	2	8	61177	61184	0 %	50 %	25 %	25 %	529043489
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176	NC_021913	GCCG	2	8	65880	65887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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179	NC_021913	GGGT	2	8	68318	68325	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_021913	TGAG	2	8	71408	71415	25 %	25 %	50 %	0 %	529043501
187	NC_021913	TCGA	2	8	71481	71488	25 %	25 %	25 %	25 %	529043501
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195	NC_021913	GTGG	2	8	76553	76560	0 %	25 %	75 %	0 %	529043507
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260	NC_021913	AGGC	2	8	102350	102357	25 %	0 %	50 %	25 %	529043534
261	NC_021913	TGCA	2	8	102371	102378	25 %	25 %	25 %	25 %	529043534
262	NC_021913	ACGT	2	8	102925	102932	25 %	25 %	25 %	25 %	529043534
263	NC_021913	CAGC	2	8	103029	103036	25 %	0 %	25 %	50 %	529043534
264	NC_021913	ACCC	2	8	103265	103272	25 %	0 %	0 %	75 %	529043534
265	NC_021913	GTCC	2	8	103936	103943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
266	NC_021913	AGTC	2	8	104085	104092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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269	NC_021913	TCCA	2	8	105100	105107	25 %	25 %	0 %	50 %	529043536
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272	NC_021913	TCGA	2	8	105287	105294	25 %	25 %	25 %	25 %	529043536
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