MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 7237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021913	C	7	7	117889	117895	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2502	NC_021913	ATC	2	6	117908	117913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_021913	GAC	2	6	117925	117930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_021913	ATGT	2	8	118015	118022	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_021913	CGG	2	6	118030	118035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_021913	GCC	2	6	118064	118069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043544
2507	NC_021913	TCG	2	6	118070	118075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2508	NC_021913	CCA	2	6	118111	118116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043544
2509	NC_021913	TCG	2	6	118142	118147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2510	NC_021913	CCAGTC	2	12	118159	118170	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	529043544
2511	NC_021913	CGG	2	6	118173	118178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043544
2512	NC_021913	CGT	2	6	118191	118196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2513	NC_021913	TCG	2	6	118271	118276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2514	NC_021913	GGC	2	6	118352	118357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043544
2515	NC_021913	CGA	2	6	118359	118364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2516	NC_021913	AGC	2	6	118471	118476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2517	NC_021913	TAG	2	6	118508	118513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043544
2518	NC_021913	GTCGA	2	10	118517	118526	20 %	20 %	40 %	20 %	529043544
2519	NC_021913	CTC	2	6	118552	118557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043544
2520	NC_021913	GAC	2	6	118570	118575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2521	NC_021913	AGT	2	6	118602	118607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043544
2522	NC_021913	CGG	2	6	118608	118613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043544
2523	NC_021913	CTC	2	6	118684	118689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043544
2524	NC_021913	GGA	2	6	118692	118697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043544
2525	NC_021913	CGG	2	6	118700	118705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043544
2526	NC_021913	GTC	2	6	118717	118722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2527	NC_021913	CTCC	2	8	118743	118750	0 %	25 %	0 %	75 %	529043544
2528	NC_021913	CCA	2	6	118860	118865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043544
2529	NC_021913	ATC	2	6	118918	118923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043544
2530	NC_021913	GAT	2	6	118980	118985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043544
2531	NC_021913	CGT	2	6	118986	118991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2532	NC_021913	GCT	2	6	118995	119000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2533	NC_021913	ACG	2	6	119069	119074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2534	NC_021913	TTG	2	6	119096	119101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043544
2535	NC_021913	GTG	2	6	119140	119145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043544
2536	NC_021913	GCT	2	6	119170	119175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2537	NC_021913	TCT	2	6	119178	119183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043544
2538	NC_021913	CGA	2	6	119184	119189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2539	NC_021913	CTC	2	6	119215	119220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043544
2540	NC_021913	CGGA	2	8	119246	119253	25 %	0 %	50 %	25 %	529043544
2541	NC_021913	TCG	3	9	119264	119272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2542	NC_021913	CGA	2	6	119292	119297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2543	NC_021913	GTT	2	6	119335	119340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043544
2544	NC_021913	CGG	2	6	119396	119401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043544
2545	NC_021913	GAA	2	6	119473	119478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043544
2546	NC_021913	TCG	2	6	119582	119587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043544
2547	NC_021913	TGC	2	6	119693	119698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043545
2548	NC_021913	CGT	2	6	119716	119721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043545
2549	NC_021913	TCG	2	6	119756	119761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043545
2550	NC_021913	TGG	2	6	119766	119771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043545
2551	NC_021913	GTCT	2	8	119803	119810	0 %	50 %	25 %	25 %	529043545
2552	NC_021913	TGC	2	6	119841	119846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043545
2553	NC_021913	TC	3	6	119880	119885	0 %	50 %	0 %	50 %	529043545
2554	NC_021913	TG	3	6	119937	119942	0 %	50 %	50 %	0 %	529043545
2555	NC_021913	CA	3	6	119949	119954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2556	NC_021913	GTA	2	6	120066	120071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043546
2557	NC_021913	GAC	2	6	120075	120080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043546
2558	NC_021913	GTG	2	6	120246	120251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043546
2559	NC_021913	CGG	2	6	120335	120340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043546
2560	NC_021913	ACGT	2	8	120418	120425	25 %	25 %	25 %	25 %	529043546
2561	NC_021913	CGG	2	6	120446	120451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043546
2562	NC_021913	CGACCG	2	12	120470	120481	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529043546
2563	NC_021913	CCT	2	6	120485	120490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043546
2564	NC_021913	GTCCC	2	10	120562	120571	0 %	20 %	20 %	60 %	529043546
2565	NC_021913	CGAC	2	8	120614	120621	25 %	0 %	25 %	50 %	529043546
2566	NC_021913	CCG	2	6	120634	120639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043546
2567	NC_021913	TCG	3	9	120664	120672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043546
2568	NC_021913	CG	3	6	120709	120714	0 %	0 %	50 %	50 %	529043546
2569	NC_021913	CGG	2	6	120720	120725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043546
2570	NC_021913	GCAC	2	8	120729	120736	25 %	0 %	25 %	50 %	529043546
2571	NC_021913	ACC	2	6	120743	120748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043546
2572	NC_021913	AGA	2	6	120791	120796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043546
2573	NC_021913	AGA	2	6	120905	120910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043546
2574	NC_021913	CGC	2	6	120921	120926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043546
2575	NC_021913	GGT	2	6	120959	120964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043546
2576	NC_021913	CCG	2	6	121006	121011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043546
2577	NC_021913	GTC	3	9	121071	121079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043546
2578	NC_021913	CGG	2	6	121088	121093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043546
2579	NC_021913	AGT	2	6	121115	121120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043546
2580	NC_021913	CCT	2	6	121151	121156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043546
2581	NC_021913	CGT	2	6	121193	121198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043546
2582	NC_021913	TCG	2	6	121228	121233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043546
2583	NC_021913	ATC	2	6	121239	121244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043546
2584	NC_021913	CCG	2	6	121279	121284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043546
2585	NC_021913	CCG	2	6	121306	121311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043546
2586	NC_021913	TCG	2	6	121354	121359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043546
2587	NC_021913	CGA	2	6	121424	121429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043546
2588	NC_021913	CGC	2	6	121434	121439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043546
2589	NC_021913	TCG	2	6	121459	121464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043546
2590	NC_021913	TCA	2	6	121481	121486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043546
2591	NC_021913	TGG	2	6	121504	121509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043546
2592	NC_021913	GC	3	6	121514	121519	0 %	0 %	50 %	50 %	529043546
2593	NC_021913	CG	3	6	121599	121604	0 %	0 %	50 %	50 %	529043546
2594	NC_021913	GCG	3	9	121735	121743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043546
2595	NC_021913	TCG	2	6	121759	121764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043546
2596	NC_021913	CCG	2	6	121890	121895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043546
2597	NC_021913	CGAG	2	8	121904	121911	25 %	0 %	50 %	25 %	529043546
2598	NC_021913	TCCG	2	8	121951	121958	0 %	25 %	25 %	50 %	529043546
2599	NC_021913	CGA	2	6	121969	121974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043546
2600	NC_021913	CGT	2	6	121988	121993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043546
2601	NC_021913	TCCG	2	8	122075	122082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_021913	TCG	2	6	122141	122146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043547
2603	NC_021913	ACGT	2	8	122180	122187	25 %	25 %	25 %	25 %	529043547
2604	NC_021913	GTG	2	6	122232	122237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043547
2605	NC_021913	TCG	3	9	122273	122281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043547
2606	NC_021913	CGA	2	6	122293	122298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043547
2607	NC_021913	CGC	2	6	122352	122357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043547
2608	NC_021913	TCTCG	2	10	122379	122388	0 %	40 %	20 %	40 %	529043547
2609	NC_021913	CAG	2	6	122407	122412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043547
2610	NC_021913	CCG	2	6	122430	122435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043547
2611	NC_021913	CCG	2	6	122475	122480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043547
2612	NC_021913	TCA	2	6	122484	122489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043547
2613	NC_021913	CCG	2	6	122505	122510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043547
2614	NC_021913	CGTC	2	8	122525	122532	0 %	25 %	25 %	50 %	529043547
2615	NC_021913	CGA	2	6	122574	122579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043547
2616	NC_021913	ACG	2	6	122621	122626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043547
2617	NC_021913	CTT	2	6	122673	122678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043547
2618	NC_021913	GCC	2	6	122692	122697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043547
2619	NC_021913	TCG	2	6	122753	122758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043547
2620	NC_021913	GCCC	2	8	122844	122851	0 %	0 %	25 %	75 %	529043547
2621	NC_021913	GTC	2	6	122929	122934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043547
2622	NC_021913	CGG	2	6	122949	122954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043547
2623	NC_021913	CGC	2	6	123075	123080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043547
2624	NC_021913	GGCT	2	8	123110	123117	0 %	25 %	50 %	25 %	529043547
2625	NC_021913	AGT	2	6	123141	123146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043547
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2627	NC_021913	GGGC	2	8	123225	123232	0 %	0 %	75 %	25 %	529043548
2628	NC_021913	CGG	2	6	123241	123246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043548
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2721	NC_021913	CCG	2	6	127286	127291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2722	NC_021913	GACG	2	8	127298	127305	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2723	NC_021913	CG	3	6	127311	127316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2724	NC_021913	GTA	2	6	127335	127340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2725	NC_021913	GGC	2	6	127341	127346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2726	NC_021913	TAG	2	6	127354	127359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2732	NC_021913	TCG	2	6	127501	127506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
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2742	NC_021913	TCG	2	6	127977	127982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
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2845	NC_021913	CGG	2	6	131925	131930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043552
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2849	NC_021913	CGA	3	9	132075	132083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043552
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2851	NC_021913	CGGA	2	8	132189	132196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2852	NC_021913	G	6	6	132224	132229	0 %	0 %	100 %	0 %	529043553
2853	NC_021913	CGT	2	6	132329	132334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043553
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2856	NC_021913	TCG	3	9	132487	132495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043553
2857	NC_021913	TCG	2	6	132526	132531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043553
2858	NC_021913	TCC	2	6	132553	132558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043553
2859	NC_021913	GA	3	6	132602	132607	50 %	0 %	50 %	0 %	529043553
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2861	NC_021913	CGAC	2	8	132725	132732	25 %	0 %	25 %	50 %	529043553
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2866	NC_021913	T	6	6	132919	132924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2966	NC_021913	TC	3	6	137407	137412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2967	NC_021913	TACG	2	8	137445	137452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2971	NC_021913	AC	3	6	137609	137614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2974	NC_021913	CG	3	6	137750	137755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2975	NC_021913	CGA	2	6	137816	137821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043557
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2978	NC_021913	CTAA	2	8	137940	137947	50 %	25 %	0 %	25 %	529043557
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2984	NC_021913	GCA	2	6	138159	138164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043557
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