MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 7237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021913	CCAT	2	8	45917	45924	25 %	25 %	0 %	50 %	529043475
1002	NC_021913	TCA	2	6	46088	46093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_021913	TAA	2	6	46095	46100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021913	TAG	2	6	46108	46113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021913	TGA	2	6	46116	46121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021913	AG	3	6	46149	46154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021913	G	6	6	46159	46164	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021913	G	6	6	46167	46172	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021913	CAG	2	6	46220	46225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021913	G	6	6	46234	46239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021913	TA	3	6	46334	46339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021913	GGTT	2	8	46346	46353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021913	GAAG	2	8	46376	46383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021913	CTA	2	6	46417	46422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_021913	TTGG	2	8	46511	46518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021913	C	6	6	46543	46548	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1017	NC_021913	ATC	2	6	46570	46575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_021913	AAC	2	6	46661	46666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021913	CA	3	6	46672	46677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_021913	GAG	2	6	46727	46732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021913	CGG	2	6	46802	46807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_021913	TC	3	6	46811	46816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_021913	CTC	2	6	46827	46832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_021913	GCC	2	6	46897	46902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_021913	GGC	2	6	46916	46921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_021913	AGCG	2	8	46924	46931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_021913	CACT	2	8	47102	47109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_021913	CTT	2	6	47124	47129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021913	ATT	2	6	47286	47291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021913	CT	3	6	47396	47401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_021913	AG	3	6	47418	47423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021913	GA	3	6	47463	47468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021913	A	6	6	47487	47492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021913	AC	3	6	47496	47501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_021913	GA	3	6	47586	47591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021913	AGA	2	6	47603	47608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021913	AGA	2	6	47673	47678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021913	CAAA	2	8	47679	47686	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_021913	GT	4	8	47709	47716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021913	TCT	2	6	47724	47729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021913	AGA	3	9	47738	47746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021913	GAAGA	2	10	47749	47758	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021913	CT	3	6	47803	47808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_021913	GT	4	8	47914	47921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021913	CTT	2	6	47930	47935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_021913	ATC	2	6	48018	48023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_021913	CA	3	6	48040	48045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_021913	ATC	2	6	48135	48140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043476
1049	NC_021913	GGAGAC	2	12	48141	48152	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	529043476
1050	NC_021913	CCT	2	6	48181	48186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043476
1051	NC_021913	TCGA	2	8	48268	48275	25 %	25 %	25 %	25 %	529043476
1052	NC_021913	TGA	2	6	48351	48356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043476
1053	NC_021913	TCG	2	6	48365	48370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043476
1054	NC_021913	AAC	2	6	48380	48385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529043476
1055	NC_021913	TCGCG	2	10	48408	48417	0 %	20 %	40 %	40 %	529043476
1056	NC_021913	TCA	2	6	48479	48484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043476
1057	NC_021913	CAA	2	6	48604	48609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529043476
1058	NC_021913	CGT	2	6	48714	48719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043476
1059	NC_021913	CGA	2	6	48729	48734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043476
1060	NC_021913	TCG	2	6	48746	48751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043476
1061	NC_021913	CGA	3	9	48816	48824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043476
1062	NC_021913	GAT	2	6	48870	48875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043476
1063	NC_021913	CGA	2	6	48930	48935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043476
1064	NC_021913	ACG	2	6	48938	48943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043476
1065	NC_021913	CGC	3	9	48967	48975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043476
1066	NC_021913	ACG	2	6	48989	48994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043476
1067	NC_021913	CGT	2	6	48996	49001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043476
1068	NC_021913	GGA	2	6	49005	49010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043476
1069	NC_021913	GCG	2	6	49027	49032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043476
1070	NC_021913	CGC	2	6	49035	49040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043476
1071	NC_021913	CGA	2	6	49113	49118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043476
1072	NC_021913	AAC	2	6	49130	49135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529043476
1073	NC_021913	GAA	2	6	49164	49169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043476
1074	NC_021913	CAC	2	6	49197	49202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043476
1075	NC_021913	AGA	2	6	49205	49210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043476
1076	NC_021913	CGG	2	6	49229	49234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043476
1077	NC_021913	CTGTCG	2	12	49235	49246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043476
1078	NC_021913	GACGG	2	10	49255	49264	20 %	0 %	60 %	20 %	529043476
1079	NC_021913	CTGA	2	8	49300	49307	25 %	25 %	25 %	25 %	529043476
1080	NC_021913	TCGA	2	8	49309	49316	25 %	25 %	25 %	25 %	529043476
1081	NC_021913	GAC	2	6	49365	49370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043476
1082	NC_021913	TC	3	6	49375	49380	0 %	50 %	0 %	50 %	529043476
1083	NC_021913	GGT	2	6	49521	49526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043476
1084	NC_021913	CGAAA	2	10	49540	49549	60 %	0 %	20 %	20 %	529043476
1085	NC_021913	TCGA	2	8	49572	49579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_021913	CGT	2	6	49637	49642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_021913	CCA	2	6	49766	49771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_021913	AGG	2	6	49870	49875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021913	GCA	2	6	49901	49906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_021913	TGA	2	6	49915	49920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021913	CGT	2	6	49938	49943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_021913	CTG	2	6	49963	49968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021913	GTT	2	6	50020	50025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043477
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1096	NC_021913	GAA	2	6	50120	50125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043477
1097	NC_021913	CGA	2	6	50191	50196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043477
1098	NC_021913	GAC	2	6	50222	50227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043477
1099	NC_021913	CGA	2	6	50302	50307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043477
1100	NC_021913	CGA	2	6	50356	50361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043477
1101	NC_021913	TCG	2	6	50385	50390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043477
1102	NC_021913	ACT	2	6	50439	50444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043477
1103	NC_021913	CCTT	2	8	50560	50567	0 %	50 %	0 %	50 %	529043477
1104	NC_021913	GC	3	6	50644	50649	0 %	0 %	50 %	50 %	529043477
1105	NC_021913	CGA	2	6	50719	50724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043477
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1107	NC_021913	CAG	2	6	50896	50901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043477
1108	NC_021913	TTC	2	6	50928	50933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043477
1109	NC_021913	CGC	2	6	50947	50952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043477
1110	NC_021913	GA	3	6	51047	51052	50 %	0 %	50 %	0 %	529043477
1111	NC_021913	AG	3	6	51077	51082	50 %	0 %	50 %	0 %	529043477
1112	NC_021913	AGG	2	6	51148	51153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043477
1113	NC_021913	TCG	2	6	51174	51179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043477
1114	NC_021913	TC	3	6	51192	51197	0 %	50 %	0 %	50 %	529043477
1115	NC_021913	ACAA	2	8	51200	51207	75 %	0 %	0 %	25 %	529043477
1116	NC_021913	AGT	2	6	51235	51240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043477
1117	NC_021913	ATC	2	6	51251	51256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043477
1118	NC_021913	GTTC	2	8	51283	51290	0 %	50 %	25 %	25 %	529043477
1119	NC_021913	CTG	2	6	51308	51313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043477
1120	NC_021913	CAG	2	6	51326	51331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043477
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1125	NC_021913	TCC	2	6	51566	51571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043478
1126	NC_021913	C	6	6	51582	51587	0 %	0 %	0 %	100 %	529043478
1127	NC_021913	CGG	2	6	51594	51599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043478
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1131	NC_021913	GGT	2	6	51690	51695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043478
1132	NC_021913	TCG	2	6	51710	51715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043478
1133	NC_021913	GTC	2	6	51730	51735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043478
1134	NC_021913	CTCG	3	12	51785	51796	0 %	25 %	25 %	50 %	529043478
1135	NC_021913	GAC	2	6	51810	51815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043478
1136	NC_021913	CGA	2	6	51905	51910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043478
1137	NC_021913	CGC	2	6	52017	52022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043478
1138	NC_021913	CT	3	6	52080	52085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_021913	GAC	2	6	52184	52189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_021913	ATC	2	6	52212	52217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043479
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1143	NC_021913	CGA	2	6	52376	52381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043480
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1145	NC_021913	CTC	3	9	52497	52505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043480
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1152	NC_021913	GTTG	2	8	52948	52955	0 %	50 %	50 %	0 %	529043480
1153	NC_021913	GTC	2	6	53148	53153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1154	NC_021913	ACT	2	6	53205	53210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1155	NC_021913	CT	3	6	53232	53237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1156	NC_021913	GA	4	8	53244	53251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_021913	GTC	2	6	53252	53257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1158	NC_021913	ACGATC	2	12	53265	53276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1160	NC_021913	CGC	2	6	53421	53426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1161	NC_021913	TCC	2	6	53444	53449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1162	NC_021913	CGC	2	6	53588	53593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043481
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1165	NC_021913	CCG	2	6	53859	53864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043482
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1169	NC_021913	GTC	2	6	53972	53977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043482
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1173	NC_021913	GAT	2	6	54041	54046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043482
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1202	NC_021913	G	6	6	55123	55128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1220	NC_021913	AAT	2	6	56071	56076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1222	NC_021913	CGACT	2	10	56217	56226	20 %	20 %	20 %	40 %	529043484
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1234	NC_021913	GACA	2	8	56800	56807	50 %	0 %	25 %	25 %	529043485
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1242	NC_021913	CGTCGA	2	12	57096	57107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529043485
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1245	NC_021913	CGC	2	6	57357	57362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1246	NC_021913	CCAG	2	8	57364	57371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1247	NC_021913	GTT	2	6	57395	57400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_021913	GTC	2	6	57443	57448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043486
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1250	NC_021913	CGCC	2	8	57640	57647	0 %	0 %	25 %	75 %	529043486
1251	NC_021913	CCG	2	6	57711	57716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043486
1252	NC_021913	GGAG	2	8	57776	57783	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_021913	GAGGG	2	10	57836	57845	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_021913	ACGC	2	8	57871	57878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1255	NC_021913	GTA	2	6	57886	57891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_021913	TGA	2	6	57943	57948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_021913	CGAG	2	8	58143	58150	25 %	0 %	50 %	25 %	529043487
1258	NC_021913	TGT	2	6	58156	58161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043487
1259	NC_021913	GTT	2	6	58219	58224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_021913	CGA	2	6	58240	58245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1261	NC_021913	CGG	2	6	58323	58328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1262	NC_021913	CGG	2	6	58355	58360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_021913	GTC	2	6	58448	58453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_021913	GTA	2	6	58492	58497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_021913	CGA	2	6	58498	58503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_021913	GCG	2	6	58510	58515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1268	NC_021913	TGC	2	6	58537	58542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_021913	TGC	3	9	58559	58567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1271	NC_021913	GTC	2	6	58648	58653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_021913	TCT	2	6	58727	58732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1273	NC_021913	AAC	2	6	58753	58758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1274	NC_021913	CGC	2	6	58779	58784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1275	NC_021913	CTG	2	6	59057	59062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1277	NC_021913	GAT	2	6	59196	59201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1279	NC_021913	GGT	2	6	59236	59241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1280	NC_021913	TCATT	2	10	59421	59430	20 %	60 %	0 %	20 %	529043488
1281	NC_021913	GAC	2	6	59437	59442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043488
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1289	NC_021913	GA	3	6	59607	59612	50 %	0 %	50 %	0 %	529043488
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1293	NC_021913	CT	3	6	59751	59756	0 %	50 %	0 %	50 %	529043488
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1352	NC_021913	TGACG	2	10	63311	63320	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1353	NC_021913	ACC	2	6	63331	63336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1355	NC_021913	GA	3	6	63445	63450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1356	NC_021913	GCTC	2	8	63482	63489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1357	NC_021913	CGA	2	6	63524	63529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1361	NC_021913	GTA	2	6	63651	63656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1362	NC_021913	TTC	2	6	63675	63680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043492
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1385	NC_021913	GCTT	2	8	64570	64577	0 %	50 %	25 %	25 %	529043492
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1428	NC_021913	GACA	2	8	65844	65851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1429	NC_021913	GCCG	2	8	65880	65887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1432	NC_021913	CCAGG	2	10	65914	65923	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1433	NC_021913	AG	3	6	66034	66039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_021913	G	6	6	66797	66802	0 %	0 %	100 %	0 %	529043495
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1477	NC_021913	ACT	2	6	67973	67978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1479	NC_021913	CGA	2	6	68052	68057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043497
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1482	NC_021913	AGC	2	6	68241	68246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043497
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1484	NC_021913	GA	3	6	68264	68269	50 %	0 %	50 %	0 %	529043497
1485	NC_021913	GGGT	2	8	68318	68325	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1486	NC_021913	TGCGG	2	10	68566	68575	0 %	20 %	60 %	20 %	529043498
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1499	NC_021913	ACGACC	2	12	69167	69178	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	529043498
1500	NC_021913	CAG	2	6	69182	69187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043498

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