MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021521	TCG	2	6	312193	312198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_021521	TTA	2	6	312200	312205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_021521	TAT	2	6	312367	312372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059074
6004	NC_021521	GAT	2	6	312412	312417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059074
6005	NC_021521	TAA	2	6	312444	312449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059074
6006	NC_021521	TTAA	2	8	312598	312605	50 %	50 %	0 %	0 %	514059074
6007	NC_021521	A	6	6	312610	312615	100 %	0 %	0 %	0 %	514059074
6008	NC_021521	TTG	2	6	312620	312625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059074
6009	NC_021521	GGA	2	6	312637	312642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514059074
6010	NC_021521	ATGC	2	8	312682	312689	25 %	25 %	25 %	25 %	514059074
6011	NC_021521	GTTT	2	8	312723	312730	0 %	75 %	25 %	0 %	514059074
6012	NC_021521	AAT	2	6	312914	312919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_021521	AGTT	2	8	312942	312949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_021521	CT	3	6	313000	313005	0 %	50 %	0 %	50 %	514059075
6015	NC_021521	GCAA	2	8	313079	313086	50 %	0 %	25 %	25 %	514059075
6016	NC_021521	ATG	2	6	313093	313098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059075
6017	NC_021521	TTG	2	6	313207	313212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059075
6018	NC_021521	GGT	2	6	313224	313229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059075
6019	NC_021521	ATG	2	6	313282	313287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059075
6020	NC_021521	GCA	3	9	313335	313343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059075
6021	NC_021521	TCT	2	6	313358	313363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059075
6022	NC_021521	CAG	2	6	313420	313425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059075
6023	NC_021521	TTTA	2	8	313477	313484	25 %	75 %	0 %	0 %	514059075
6024	NC_021521	CGG	2	6	313496	313501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059075
6025	NC_021521	CAG	2	6	313519	313524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059075
6026	NC_021521	GCA	2	6	313564	313569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059075
6027	NC_021521	GAT	2	6	313608	313613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059075
6028	NC_021521	TTG	2	6	313618	313623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059075
6029	NC_021521	AG	3	6	313862	313867	50 %	0 %	50 %	0 %	514059075
6030	NC_021521	TAT	2	6	313880	313885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059075
6031	NC_021521	TGGCAG	2	12	313912	313923	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	514059075
6032	NC_021521	GTT	2	6	313972	313977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059075
6033	NC_021521	A	6	6	314019	314024	100 %	0 %	0 %	0 %	514059075
6034	NC_021521	TTC	2	6	314048	314053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059075
6035	NC_021521	AATA	2	8	314076	314083	75 %	25 %	0 %	0 %	514059075
6036	NC_021521	AGA	2	6	314096	314101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059075
6037	NC_021521	AT	3	6	314120	314125	50 %	50 %	0 %	0 %	514059075
6038	NC_021521	GTAAA	2	10	314128	314137	60 %	20 %	20 %	0 %	514059075
6039	NC_021521	TTA	2	6	314142	314147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059075
6040	NC_021521	GAA	2	6	314157	314162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059075
6041	NC_021521	GCA	2	6	314217	314222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059075
6042	NC_021521	A	6	6	314253	314258	100 %	0 %	0 %	0 %	514059075
6043	NC_021521	AG	3	6	314298	314303	50 %	0 %	50 %	0 %	514059075
6044	NC_021521	TGA	2	6	314342	314347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059075
6045	NC_021521	CCA	2	6	314391	314396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059075
6046	NC_021521	GTGG	2	8	314403	314410	0 %	25 %	75 %	0 %	514059075
6047	NC_021521	AGA	2	6	314573	314578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059075
6048	NC_021521	GCGT	2	8	314602	314609	0 %	25 %	50 %	25 %	514059075
6049	NC_021521	TTC	2	6	314614	314619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059075
6050	NC_021521	AGAT	2	8	314672	314679	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_021521	TTA	2	6	314768	314773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_021521	ATG	2	6	314779	314784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059076
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6054	NC_021521	A	6	6	314857	314862	100 %	0 %	0 %	0 %	514059076
6055	NC_021521	ACA	2	6	314871	314876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059076
6056	NC_021521	A	6	6	314895	314900	100 %	0 %	0 %	0 %	514059076
6057	NC_021521	AAG	2	6	314963	314968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059076
6058	NC_021521	GTG	2	6	315020	315025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059076
6059	NC_021521	A	6	6	315047	315052	100 %	0 %	0 %	0 %	514059076
6060	NC_021521	TAA	2	6	315057	315062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059076
6061	NC_021521	TGAAA	2	10	315072	315081	60 %	20 %	20 %	0 %	514059076
6062	NC_021521	CAA	2	6	315115	315120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059076
6063	NC_021521	TCGT	2	8	315134	315141	0 %	50 %	25 %	25 %	514059076
6064	NC_021521	A	6	6	315167	315172	100 %	0 %	0 %	0 %	514059076
6065	NC_021521	TTA	2	6	315181	315186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059076
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6069	NC_021521	A	7	7	315288	315294	100 %	0 %	0 %	0 %	514059076
6070	NC_021521	ACA	2	6	315336	315341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059076
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6073	NC_021521	AAT	2	6	315442	315447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059076
6074	NC_021521	TGC	2	6	315468	315473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059076
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6078	NC_021521	TTA	2	6	315754	315759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059076
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6081	NC_021521	T	6	6	315913	315918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_021521	T	7	7	315925	315931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_021521	GCAG	2	8	316045	316052	25 %	0 %	50 %	25 %	514059077
6084	NC_021521	GCTCA	2	10	316070	316079	20 %	20 %	20 %	40 %	514059077
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6087	NC_021521	GGT	2	6	316127	316132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059077
6088	NC_021521	ATTG	2	8	316150	316157	25 %	50 %	25 %	0 %	514059077
6089	NC_021521	TTG	2	6	316218	316223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059077
6090	NC_021521	TAC	2	6	316245	316250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059077
6091	NC_021521	GAT	2	6	316253	316258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059077
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6093	NC_021521	CGT	2	6	316280	316285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059077
6094	NC_021521	TTTA	2	8	316343	316350	25 %	75 %	0 %	0 %	514059077
6095	NC_021521	ATG	2	6	316367	316372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059077
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6100	NC_021521	TGA	2	6	316633	316638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059077
6101	NC_021521	GAT	2	6	316688	316693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059077
6102	NC_021521	AACC	2	8	316707	316714	50 %	0 %	0 %	50 %	514059077
6103	NC_021521	CAA	2	6	316751	316756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059077
6104	NC_021521	GCA	2	6	316757	316762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059077
6105	NC_021521	TTA	2	6	316969	316974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059077
6106	NC_021521	AAAG	2	8	317018	317025	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_021521	TA	3	6	317159	317164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_021521	AAG	2	6	317212	317217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_021521	ACA	2	6	317222	317227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_021521	ACA	2	6	317305	317310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059078
6111	NC_021521	TAC	2	6	317317	317322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059078
6112	NC_021521	AGA	2	6	317444	317449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059078
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6114	NC_021521	CAA	2	6	317814	317819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059078
6115	NC_021521	TAT	2	6	317907	317912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059078
6116	NC_021521	A	6	6	317923	317928	100 %	0 %	0 %	0 %	514059078
6117	NC_021521	CAA	2	6	317983	317988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_021521	AACA	2	8	318011	318018	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6119	NC_021521	TGCT	2	8	318071	318078	0 %	50 %	25 %	25 %	514059079
6120	NC_021521	CAAG	2	8	318121	318128	50 %	0 %	25 %	25 %	514059079
6121	NC_021521	ACGGC	2	10	318167	318176	20 %	0 %	40 %	40 %	514059079
6122	NC_021521	ATC	2	6	318448	318453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059079
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6250	NC_021521	ACCG	2	8	324660	324667	25 %	0 %	25 %	50 %	514059086
6251	NC_021521	TGT	2	6	324689	324694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059086
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6253	NC_021521	A	6	6	324848	324853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6254	NC_021521	TGC	2	6	324934	324939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6256	NC_021521	TCG	2	6	324984	324989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6265	NC_021521	A	6	6	325607	325612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6291	NC_021521	A	6	6	327041	327046	100 %	0 %	0 %	0 %	514059087
6292	NC_021521	ATC	2	6	327057	327062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059088
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6353	NC_021521	CAA	2	6	330481	330486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6354	NC_021521	ATG	2	6	330511	330516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059093
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6361	NC_021521	GGATA	2	10	331003	331012	40 %	20 %	40 %	0 %	514059094
6362	NC_021521	A	6	6	331079	331084	100 %	0 %	0 %	0 %	514059094
6363	NC_021521	AGG	2	6	331140	331145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6364	NC_021521	CAA	2	6	331195	331200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059095
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6367	NC_021521	GAA	2	6	331372	331377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059095
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6369	NC_021521	ATC	3	9	331544	331552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059096
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6372	NC_021521	AGC	2	6	331649	331654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059096
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6378	NC_021521	TTTA	2	8	332034	332041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6401	NC_021521	TGT	2	6	333088	333093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059099
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6475	NC_021521	TAG	2	6	336598	336603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6500	NC_021521	TGA	2	6	337944	337949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059103

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