MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori UM066

Total Repeats: 1343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021218	CATAG	2	10	1013	1022	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021218	TTGCT	2	10	2454	2463	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021218	TTTTC	2	10	2921	2930	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021218	CAATT	2	10	6617	6626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021218	TAAAA	2	10	6722	6731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021218	AAAAC	2	10	8766	8775	80 %	0 %	0 %	20 %	499085038
7	NC_021218	AGAAA	2	10	9413	9422	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021218	TTTTA	2	10	10457	10466	20 %	80 %	0 %	0 %	499085039
9	NC_021218	AAAAC	2	10	11376	11385	80 %	0 %	0 %	20 %	499085039
10	NC_021218	TATGG	2	10	11489	11498	20 %	40 %	40 %	0 %	499085039
11	NC_021218	TAATC	2	10	11545	11554	40 %	40 %	0 %	20 %	499085039
12	NC_021218	GAATT	2	10	12200	12209	40 %	40 %	20 %	0 %	499085039
13	NC_021218	GAAAA	2	10	12948	12957	80 %	0 %	20 %	0 %	499085040
14	NC_021218	CAAAA	2	10	13075	13084	80 %	0 %	0 %	20 %	499085040
15	NC_021218	GGATG	2	10	13823	13832	20 %	20 %	60 %	0 %	499085040
16	NC_021218	TTTGG	2	10	13845	13854	0 %	60 %	40 %	0 %	499085041
17	NC_021218	CTTTG	2	10	14145	14154	0 %	60 %	20 %	20 %	499085041
18	NC_021218	TTTTC	2	10	14582	14591	0 %	80 %	0 %	20 %	499085041
19	NC_021218	TAAAA	2	10	15743	15752	80 %	20 %	0 %	0 %	499085042
20	NC_021218	AATAG	2	10	17439	17448	60 %	20 %	20 %	0 %	499085043
21	NC_021218	TTATG	2	10	17768	17777	20 %	60 %	20 %	0 %	499085044
22	NC_021218	CGCAC	2	10	17803	17812	20 %	0 %	20 %	60 %	499085044
23	NC_021218	AAATG	2	10	18327	18336	60 %	20 %	20 %	0 %	499085045
24	NC_021218	CAATA	2	10	18659	18668	60 %	20 %	0 %	20 %	499085045
25	NC_021218	CCCCA	2	10	21909	21918	20 %	0 %	0 %	80 %	499085047
26	NC_021218	GGATT	2	10	23263	23272	20 %	40 %	40 %	0 %	499085049
27	NC_021218	ATTGA	2	10	23938	23947	40 %	40 %	20 %	0 %	499085049
28	NC_021218	CCTCT	2	10	25724	25733	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_021218	CCAAC	2	10	26113	26122	40 %	0 %	0 %	60 %	528816099
30	NC_021218	CTTTT	2	10	31455	31464	0 %	80 %	0 %	20 %	499085056
31	NC_021218	TTAAA	2	10	32240	32249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021218	TATTC	2	10	32306	32315	20 %	60 %	0 %	20 %	499085057
33	NC_021218	TTTTA	2	10	32602	32611	20 %	80 %	0 %	0 %	499085057
34	NC_021218	ATTAC	2	10	34098	34107	40 %	40 %	0 %	20 %	499085058
35	NC_021218	CATTT	2	10	34889	34898	20 %	60 %	0 %	20 %	499085059
36	NC_021218	TTTTG	2	10	35266	35275	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021218	GATTT	2	10	35284	35293	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021218	AAAGA	2	10	35633	35642	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021218	TCAAA	2	10	36452	36461	60 %	20 %	0 %	20 %	499085061
40	NC_021218	AAGAT	2	10	45840	45849	60 %	20 %	20 %	0 %	499085070
41	NC_021218	GTTTT	2	10	46905	46914	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021218	ATTGA	2	10	49239	49248	40 %	40 %	20 %	0 %	499085073
43	NC_021218	ATTAA	2	10	49403	49412	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021218	CACCC	2	10	50129	50138	20 %	0 %	0 %	80 %	499085074
45	NC_021218	AAAAT	2	10	50485	50494	80 %	20 %	0 %	0 %	499085074
46	NC_021218	AATTT	2	10	50626	50635	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021218	AAAAG	2	10	51778	51787	80 %	0 %	20 %	0 %	499085075
48	NC_021218	CTCAA	2	10	53904	53913	40 %	20 %	0 %	40 %	499085079
49	NC_021218	TTTGC	2	10	53939	53948	0 %	60 %	20 %	20 %	499085079
50	NC_021218	CCAAA	2	10	54048	54057	60 %	0 %	0 %	40 %	499085079
51	NC_021218	TCCCC	2	10	55678	55687	0 %	20 %	0 %	80 %	499085081
52	NC_021218	GTTTT	2	10	55778	55787	0 %	80 %	20 %	0 %	499085081
53	NC_021218	TGATT	2	10	55897	55906	20 %	60 %	20 %	0 %	499085081
54	NC_021218	ATTTG	2	10	56502	56511	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021218	CAAAT	2	10	58398	58407	60 %	20 %	0 %	20 %	499085084
56	NC_021218	AATAA	2	10	59731	59740	80 %	20 %	0 %	0 %	499085087
57	NC_021218	GGCGT	2	10	61627	61636	0 %	20 %	60 %	20 %	499085091
58	NC_021218	AGTGA	2	10	64807	64816	40 %	20 %	40 %	0 %	528816012
59	NC_021218	CAAAA	2	10	66989	66998	80 %	0 %	0 %	20 %	499085094
60	NC_021218	CAAGC	2	10	67650	67659	40 %	0 %	20 %	40 %	499085095
61	NC_021218	ATCGC	2	10	67906	67915	20 %	20 %	20 %	40 %	499085095
62	NC_021218	GAATT	2	10	68065	68074	40 %	40 %	20 %	0 %	499085095
63	NC_021218	CAAAA	2	10	68699	68708	80 %	0 %	0 %	20 %	499085095
64	NC_021218	AAAGA	2	10	69862	69871	80 %	0 %	20 %	0 %	499085096
65	NC_021218	TTTAC	2	10	71760	71769	20 %	60 %	0 %	20 %	499085098
66	NC_021218	GAAAA	2	10	72312	72321	80 %	0 %	20 %	0 %	499085099
67	NC_021218	ATTTT	2	10	74663	74672	20 %	80 %	0 %	0 %	499085103
68	NC_021218	GATTT	2	10	76135	76144	20 %	60 %	20 %	0 %	528816013
69	NC_021218	CTTTT	2	10	78404	78413	0 %	80 %	0 %	20 %	499085106
70	NC_021218	AACAT	2	10	78816	78825	60 %	20 %	0 %	20 %	499085106
71	NC_021218	TCTTT	2	10	81358	81367	0 %	80 %	0 %	20 %	499085109
72	NC_021218	TTTTC	2	10	81863	81872	0 %	80 %	0 %	20 %	499085111
73	NC_021218	TTTTC	2	10	82181	82190	0 %	80 %	0 %	20 %	499085111
74	NC_021218	ACGCA	2	10	82342	82351	40 %	0 %	20 %	40 %	499085111
75	NC_021218	ACAAA	2	10	84375	84384	80 %	0 %	0 %	20 %	528816014
76	NC_021218	AAGCG	2	10	84731	84740	40 %	0 %	40 %	20 %	528816015
77	NC_021218	AAGTC	2	10	85640	85649	40 %	20 %	20 %	20 %	528816015
78	NC_021218	AAATC	2	10	86171	86180	60 %	20 %	0 %	20 %	528816015
79	NC_021218	CAGCG	2	10	86321	86330	20 %	0 %	40 %	40 %	528816015
80	NC_021218	AATCA	2	10	87419	87428	60 %	20 %	0 %	20 %	528816104
81	NC_021218	GATTG	2	10	88484	88493	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021218	AAAAG	2	10	88663	88672	80 %	0 %	20 %	0 %	528816106
83	NC_021218	GGCTT	2	10	90623	90632	0 %	40 %	40 %	20 %	528816016
84	NC_021218	ATTGC	2	10	90661	90670	20 %	40 %	20 %	20 %	528816016
85	NC_021218	GAGCT	2	10	92511	92520	20 %	20 %	40 %	20 %	499085118
86	NC_021218	CGATC	2	10	92530	92539	20 %	20 %	20 %	40 %	499085118
87	NC_021218	TTTGG	2	10	94978	94987	0 %	60 %	40 %	0 %	499085120
88	NC_021218	AAGAT	2	10	95933	95942	60 %	20 %	20 %	0 %	499085120
89	NC_021218	CAATT	2	10	96406	96415	40 %	40 %	0 %	20 %	499085120
90	NC_021218	TTTAG	2	10	96556	96565	20 %	60 %	20 %	0 %	499085120
91	NC_021218	TAAAT	2	10	97816	97825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021218	GGCAT	2	10	99202	99211	20 %	20 %	40 %	20 %	499085124
93	NC_021218	AGGGT	2	10	99334	99343	20 %	20 %	60 %	0 %	499085124
94	NC_021218	TCTAT	2	10	99610	99619	20 %	60 %	0 %	20 %	499085125
95	NC_021218	ATTTG	2	10	100763	100772	20 %	60 %	20 %	0 %	499085125
96	NC_021218	ACAAA	2	10	101158	101167	80 %	0 %	0 %	20 %	499085125
97	NC_021218	AGCGC	2	10	102938	102947	20 %	0 %	40 %	40 %	499085127
98	NC_021218	GCTTT	2	10	103200	103209	0 %	60 %	20 %	20 %	499085128
99	NC_021218	AAAAG	2	10	105976	105985	80 %	0 %	20 %	0 %	499085131
100	NC_021218	TTTTG	2	10	106694	106703	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021218	CAATT	2	10	111108	111117	40 %	40 %	0 %	20 %	499085135
102	NC_021218	ATCGT	2	10	112950	112959	20 %	40 %	20 %	20 %	499085136
103	NC_021218	TGCCG	2	10	115432	115441	0 %	20 %	40 %	40 %	499085138
104	NC_021218	TATGA	2	10	115514	115523	40 %	40 %	20 %	0 %	499085138
105	NC_021218	CAAGC	2	10	118096	118105	40 %	0 %	20 %	40 %	499085141
106	NC_021218	ATCAA	2	10	119413	119422	60 %	20 %	0 %	20 %	499085143
107	NC_021218	ATTTC	2	10	120255	120264	20 %	60 %	0 %	20 %	499085144
108	NC_021218	ATTTT	2	10	122487	122496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021218	TATCT	2	10	122557	122566	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021218	ATTGA	2	10	123168	123177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021218	ACGCC	2	10	125754	125763	20 %	0 %	20 %	60 %	499085148
112	NC_021218	TTTGA	2	10	127066	127075	20 %	60 %	20 %	0 %	499085149
113	NC_021218	ATCAA	2	10	127568	127577	60 %	20 %	0 %	20 %	499085150
114	NC_021218	GGCAT	2	10	128493	128502	20 %	20 %	40 %	20 %	499085152
115	NC_021218	AGCCA	2	10	128915	128924	40 %	0 %	20 %	40 %	499085153
116	NC_021218	AAGAT	2	10	129456	129465	60 %	20 %	20 %	0 %	499085153
117	NC_021218	TGTAA	2	10	137116	137125	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021218	GCTTT	2	10	137898	137907	0 %	60 %	20 %	20 %	499085161
119	NC_021218	GGCGT	2	10	138664	138673	0 %	20 %	60 %	20 %	499085162
120	NC_021218	ACAAA	2	10	138969	138978	80 %	0 %	0 %	20 %	499085162
121	NC_021218	TAAAA	2	10	139001	139010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021218	TTTTG	2	10	141963	141972	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021218	TTTGG	2	10	142274	142283	0 %	60 %	40 %	0 %	499085166
124	NC_021218	AGGCA	2	10	142692	142701	40 %	0 %	40 %	20 %	499085167
125	NC_021218	ATTGA	2	10	143618	143627	40 %	40 %	20 %	0 %	528816111
126	NC_021218	AACGC	2	10	144472	144481	40 %	0 %	20 %	40 %	499085169
127	NC_021218	CCCAC	2	10	146809	146818	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
128	NC_021218	GAGTA	2	10	149501	149510	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021218	ATGAC	2	10	150689	150698	40 %	20 %	20 %	20 %	528816116
130	NC_021218	TATGA	2	10	151593	151602	40 %	40 %	20 %	0 %	528816117
131	NC_021218	GGATA	2	10	152149	152158	40 %	20 %	40 %	0 %	528816117
132	NC_021218	TTTGT	2	10	155220	155229	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021218	TTTAA	2	10	155248	155257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021218	ATTTG	2	10	156270	156279	20 %	60 %	20 %	0 %	499085182
135	NC_021218	AGGCG	2	10	157282	157291	20 %	0 %	60 %	20 %	499085182
136	NC_021218	ATTTG	2	10	160025	160034	20 %	60 %	20 %	0 %	499085183
137	NC_021218	AGGCA	2	10	163271	163280	40 %	0 %	40 %	20 %	499085187
138	NC_021218	AAAGA	2	10	164441	164450	80 %	0 %	20 %	0 %	528816018
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269	NC_021218	AATTA	2	10	324716	324725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_021218	TTTGA	2	10	597773	597782	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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