MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori UM037

Total Repeats: 1406

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021217	AAGCC	2	10	1111	1120	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021217	CAATC	2	10	3282	3291	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_021217	TTGAT	2	10	4433	4442	20 %	60 %	20 %	0 %	499087732
4	NC_021217	CGCTG	2	10	5537	5546	0 %	20 %	40 %	40 %	499087731
5	NC_021217	TTTGA	2	10	5684	5693	20 %	60 %	20 %	0 %	499087731
6	NC_021217	GACTT	2	10	6218	6227	20 %	40 %	20 %	20 %	499087731
7	NC_021217	CGCTT	2	10	7127	7136	0 %	40 %	20 %	40 %	499087731
8	NC_021217	TGCGT	2	10	9516	9525	0 %	40 %	40 %	20 %	499087728
9	NC_021217	GAAAA	2	10	9677	9686	80 %	0 %	20 %	0 %	499087728
10	NC_021217	GAAAA	2	10	9995	10004	80 %	0 %	20 %	0 %	499087728
11	NC_021217	TTTTC	2	10	11824	11833	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021217	ATTTT	2	10	12957	12966	20 %	80 %	0 %	0 %	499087723
13	NC_021217	ATGTT	2	10	13039	13048	20 %	60 %	20 %	0 %	499087723
14	NC_021217	AAAAG	2	10	13451	13460	80 %	0 %	20 %	0 %	499087723
15	NC_021217	AAATC	2	10	15475	15484	60 %	20 %	0 %	20 %	499087722
16	NC_021217	AAAAT	2	10	16947	16956	80 %	20 %	0 %	0 %	499087721
17	NC_021217	TTTTC	2	10	19526	19535	0 %	80 %	0 %	20 %	499087717
18	NC_021217	GTAAA	2	10	20078	20087	60 %	20 %	20 %	0 %	499087716
19	NC_021217	TTCTT	2	10	21482	21491	0 %	80 %	0 %	20 %	499087715
20	NC_021217	TCTTT	2	10	21976	21985	0 %	80 %	0 %	20 %	530280363
21	NC_021217	ACTTG	2	10	22189	22198	20 %	40 %	20 %	20 %	530280363
22	NC_021217	TTTTG	2	10	23138	23147	0 %	80 %	20 %	0 %	499087713
23	NC_021217	GCTTG	2	10	24187	24196	0 %	40 %	40 %	20 %	499087713
24	NC_021217	TTTTG	2	10	24847	24856	0 %	80 %	20 %	0 %	499087712
25	NC_021217	CCAAA	2	10	26687	26696	60 %	0 %	0 %	40 %	530280364
26	NC_021217	TTATT	2	10	32109	32118	20 %	80 %	0 %	0 %	499087705
27	NC_021217	ATTTG	2	10	33452	33461	20 %	60 %	20 %	0 %	499087702
28	NC_021217	CAAAT	2	10	35349	35358	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021217	AAAAC	2	10	36073	36082	80 %	0 %	0 %	20 %	499087699
30	NC_021217	AGATT	2	10	37972	37981	40 %	40 %	20 %	0 %	499087697
31	NC_021217	AAGCC	2	10	39310	39319	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_021217	ATTTT	2	10	41638	41647	20 %	80 %	0 %	0 %	499087691
33	NC_021217	GGGTG	2	10	41994	42003	0 %	20 %	80 %	0 %	499087691
34	NC_021217	AAAAT	2	10	42930	42939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021217	ATTCA	2	10	43138	43147	40 %	40 %	0 %	20 %	499087689
36	NC_021217	ATCTT	2	10	46537	46546	20 %	60 %	0 %	20 %	499087686
37	NC_021217	ATATT	2	10	53914	53923	40 %	60 %	0 %	0 %	499087677
38	NC_021217	TTTCC	2	10	53965	53974	0 %	60 %	0 %	40 %	499087677
39	NC_021217	GAATG	2	10	54050	54059	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021217	CCGCA	2	10	54441	54450	20 %	0 %	20 %	60 %	499087676
41	NC_021217	ATTTG	2	10	55928	55937	20 %	60 %	20 %	0 %	530280367
42	NC_021217	GGTGA	2	10	56553	56562	20 %	20 %	60 %	0 %	499087674
43	NC_021217	AAATG	2	10	57488	57497	60 %	20 %	20 %	0 %	499087673
44	NC_021217	TGTAA	2	10	58278	58287	40 %	40 %	20 %	0 %	499087672
45	NC_021217	ATAAA	2	10	59774	59783	80 %	20 %	0 %	0 %	499087671
46	NC_021217	TTTAA	2	10	60137	60146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021217	AAAAG	2	10	60924	60933	80 %	0 %	20 %	0 %	530280368
48	NC_021217	ACCCC	2	10	60989	60998	20 %	0 %	0 %	80 %	530280368
49	NC_021217	TGAAT	2	10	61305	61314	40 %	40 %	20 %	0 %	499087669
50	NC_021217	ATTCA	2	10	66695	66704	40 %	40 %	0 %	20 %	499087664
51	NC_021217	ATTCA	2	10	71523	71532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021217	TCATT	2	10	72302	72311	20 %	60 %	0 %	20 %	499087660
53	NC_021217	CTATT	2	10	73191	73200	20 %	60 %	0 %	20 %	499087658
54	NC_021217	TTTTC	2	10	74251	74260	0 %	80 %	0 %	20 %	499087657
55	NC_021217	TATTT	2	10	78003	78012	20 %	80 %	0 %	0 %	499087652
56	NC_021217	TTTCA	2	10	78660	78669	20 %	60 %	0 %	20 %	499087651
57	NC_021217	CCCTA	2	10	81537	81546	20 %	20 %	0 %	60 %	499087647
58	NC_021217	TTTCT	2	10	82038	82047	0 %	80 %	0 %	20 %	499087647
59	NC_021217	TCATT	2	10	82907	82916	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021217	ATTTA	2	10	85033	85042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021217	AAACA	2	10	85055	85064	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021217	CCCTA	2	10	86391	86400	20 %	20 %	0 %	60 %	499087643
63	NC_021217	TTTCT	2	10	86892	86901	0 %	80 %	0 %	20 %	499087643
64	NC_021217	TCATT	2	10	87761	87770	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021217	TGGGG	2	10	89678	89687	0 %	20 %	80 %	0 %	530280369
66	NC_021217	ATTCT	2	10	92111	92120	20 %	60 %	0 %	20 %	499087639
67	NC_021217	CTTTT	2	10	95115	95124	0 %	80 %	0 %	20 %	499087636
68	NC_021217	TCGGC	2	10	95888	95897	0 %	20 %	40 %	40 %	499087635
69	NC_021217	ATCTT	2	10	96338	96347	20 %	60 %	0 %	20 %	499087635
70	NC_021217	TAAAA	2	10	97266	97275	80 %	20 %	0 %	0 %	499087634
71	NC_021217	TTAGA	2	10	98245	98254	40 %	40 %	20 %	0 %	499087634
72	NC_021217	CCACC	2	10	98791	98800	20 %	0 %	0 %	80 %	499087634
73	NC_021217	TTACA	2	10	98977	98986	40 %	40 %	0 %	20 %	499087633
74	NC_021217	CTCAA	2	10	103314	103323	40 %	20 %	0 %	40 %	530280370
75	NC_021217	GTGGG	2	10	104360	104369	0 %	20 %	80 %	0 %	499087627
76	NC_021217	TGATG	2	10	104550	104559	20 %	40 %	40 %	0 %	499087627
77	NC_021217	GGTTC	2	10	104908	104917	0 %	40 %	40 %	20 %	499087626
78	NC_021217	GATTT	2	10	105861	105870	20 %	60 %	20 %	0 %	499087626
79	NC_021217	AACCA	2	10	106309	106318	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_021217	TGGGG	2	10	106667	106676	0 %	20 %	80 %	0 %	530280371
81	NC_021217	GATTG	2	10	106786	106795	20 %	40 %	40 %	0 %	530280371
82	NC_021217	ATTTT	2	10	109140	109149	20 %	80 %	0 %	0 %	499087623
83	NC_021217	ATTGT	2	10	111697	111706	20 %	60 %	20 %	0 %	499087621
84	NC_021217	GGCGT	2	10	112810	112819	0 %	20 %	60 %	20 %	499087619
85	NC_021217	TTTTG	2	10	112842	112851	0 %	80 %	20 %	0 %	499087619
86	NC_021217	TTTCA	2	10	113284	113293	20 %	60 %	0 %	20 %	499087619
87	NC_021217	TCCAA	2	10	118881	118890	40 %	20 %	0 %	40 %	499087614
88	NC_021217	CTAAC	2	10	120310	120319	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_021217	CAAAA	2	10	121648	121657	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_021217	AAAAC	2	10	122038	122047	80 %	0 %	0 %	20 %	499087611
91	NC_021217	GTCTT	2	10	126521	126530	0 %	60 %	20 %	20 %	499087607
92	NC_021217	ATAAA	2	10	127179	127188	80 %	20 %	0 %	0 %	499087606
93	NC_021217	TGGAT	2	10	127435	127444	20 %	40 %	40 %	0 %	499087605
94	NC_021217	TTGAC	2	10	128578	128587	20 %	40 %	20 %	20 %	499087603
95	NC_021217	AAATT	2	10	130991	131000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021217	TTTTG	2	10	133811	133820	0 %	80 %	20 %	0 %	499087598
97	NC_021217	AAAGA	2	10	134046	134055	80 %	0 %	20 %	0 %	499087598
98	NC_021217	TTTGT	2	10	134135	134144	0 %	80 %	20 %	0 %	499087598
99	NC_021217	CCTTG	2	10	136186	136195	0 %	40 %	20 %	40 %	499087595
100	NC_021217	AAAAT	2	10	136465	136474	80 %	20 %	0 %	0 %	499087595
101	NC_021217	AACCA	2	10	137729	137738	60 %	0 %	0 %	40 %	499087593
102	NC_021217	TCTTT	2	10	138579	138588	0 %	80 %	0 %	20 %	499087593
103	NC_021217	CAATC	2	10	140362	140371	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_021217	AAAAG	2	10	141964	141973	80 %	0 %	20 %	0 %	499087590
105	NC_021217	ATCAA	2	10	144042	144051	60 %	20 %	0 %	20 %	499087587
106	NC_021217	AGGGG	2	10	144289	144298	20 %	0 %	80 %	0 %	499087587
107	NC_021217	ATTGA	2	10	144974	144983	40 %	40 %	20 %	0 %	499087587
108	NC_021217	TAAAA	2	10	145056	145065	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021217	GAGAA	2	10	146157	146166	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021217	TGAGC	2	10	148473	148482	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021217	GTTTT	2	10	152186	152195	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021217	TAGCG	2	10	152872	152881	20 %	20 %	40 %	20 %	499087579
113	NC_021217	CTTTT	2	10	154065	154074	0 %	80 %	0 %	20 %	499087578
114	NC_021217	GTCAT	2	10	154189	154198	20 %	40 %	20 %	20 %	499087578
115	NC_021217	AAGGG	2	10	154898	154907	40 %	0 %	60 %	0 %	499087577
116	NC_021217	TTGGT	2	10	155215	155224	0 %	60 %	40 %	0 %	499087577
117	NC_021217	GATAG	2	10	155715	155724	40 %	20 %	40 %	0 %	499087577
118	NC_021217	TGATT	2	10	157031	157040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021217	TGGTG	2	10	157303	157312	0 %	40 %	60 %	0 %	499087574
120	NC_021217	AATCA	2	10	159457	159466	60 %	20 %	0 %	20 %	499087572
121	NC_021217	TTTTG	2	10	159755	159764	0 %	80 %	20 %	0 %	499087572
122	NC_021217	AATCA	2	10	160783	160792	60 %	20 %	0 %	20 %	499087571
123	NC_021217	AACTT	2	10	161086	161095	40 %	40 %	0 %	20 %	499087571
124	NC_021217	TCAAA	2	10	161349	161358	60 %	20 %	0 %	20 %	499087571
125	NC_021217	GGTTA	2	10	161814	161823	20 %	40 %	40 %	0 %	499087570
126	NC_021217	AAATC	2	10	161852	161861	60 %	20 %	0 %	20 %	499087570
127	NC_021217	CCAAA	2	10	163917	163926	60 %	0 %	0 %	40 %	499087569
128	NC_021217	GGCGT	2	10	164730	164739	0 %	20 %	60 %	20 %	499087567
129	NC_021217	GGAAT	2	10	166369	166378	40 %	20 %	40 %	0 %	499087566
130	NC_021217	TAACA	2	10	168473	168482	60 %	20 %	0 %	20 %	499087565
131	NC_021217	AGTTT	2	10	169416	169425	20 %	60 %	20 %	0 %	499087564
132	NC_021217	TAAAA	2	10	169533	169542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021217	AAGTT	2	10	169583	169592	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021217	TTTTA	2	10	169768	169777	20 %	80 %	0 %	0 %	499087563
135	NC_021217	AGGGT	2	10	171601	171610	20 %	20 %	60 %	0 %	499087562
136	NC_021217	GCTTT	2	10	171667	171676	0 %	60 %	20 %	20 %	499087562
137	NC_021217	ATTCA	2	10	174823	174832	40 %	40 %	0 %	20 %	499087559
138	NC_021217	CTTGC	2	10	176285	176294	0 %	40 %	20 %	40 %	499087557
139	NC_021217	TCAAA	2	10	176998	177007	60 %	20 %	0 %	20 %	499087557
140	NC_021217	CATTT	2	10	177928	177937	20 %	60 %	0 %	20 %	499087556
141	NC_021217	TAATC	2	10	179224	179233	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021217	TATCT	2	10	181652	181661	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021217	GCATG	2	10	183911	183920	20 %	20 %	40 %	20 %	499087548
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145	NC_021217	CAAGG	2	10	185048	185057	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021217	TTCTT	2	10	187697	187706	0 %	80 %	0 %	20 %	499087546
147	NC_021217	TTTTA	2	10	187872	187881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021217	ATGCG	2	10	188217	188226	20 %	20 %	40 %	20 %	499087545
149	NC_021217	TCAAA	2	10	190345	190354	60 %	20 %	0 %	20 %	499087543
150	NC_021217	AATGA	2	10	192068	192077	60 %	20 %	20 %	0 %	499087543
151	NC_021217	ATCCT	2	10	192712	192721	20 %	40 %	0 %	40 %	530280442
152	NC_021217	CGCCT	2	10	193662	193671	0 %	20 %	20 %	60 %	530280442
153	NC_021217	TGAAT	2	10	194897	194906	40 %	40 %	20 %	0 %	499087541
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165	NC_021217	TTTGA	2	10	212080	212089	20 %	60 %	20 %	0 %	499087524
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173	NC_021217	ATTTT	2	10	219915	219924	20 %	80 %	0 %	0 %	499087518
174	NC_021217	TATTT	2	10	220250	220259	20 %	80 %	0 %	0 %	530280443
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177	NC_021217	ATGCA	2	10	224921	224930	40 %	20 %	20 %	20 %	499087514
178	NC_021217	CAATA	2	10	225702	225711	60 %	20 %	0 %	20 %	499087513
179	NC_021217	TTTGA	2	10	225946	225955	20 %	60 %	20 %	0 %	499087512
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239	NC_021217	TGGTG	2	10	292150	292159	0 %	40 %	60 %	0 %	499087457
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253	NC_021217	AGATG	2	10	308269	308278	40 %	20 %	40 %	0 %	499087445
254	NC_021217	AAACC	2	10	309714	309723	60 %	0 %	0 %	40 %	530280377
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257	NC_021217	AAACC	2	10	312338	312347	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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261	NC_021217	AGGGT	2	10	316627	316636	20 %	20 %	60 %	0 %	499087436
262	NC_021217	TGCGC	2	10	317478	317487	0 %	20 %	40 %	40 %	499087434
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267	NC_021217	TCATT	2	10	330854	330863	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
268	NC_021217	TAGGG	2	10	334847	334856	20 %	20 %	60 %	0 %	499087418
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