MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 82987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021172	GC	3	6	117150	117155	0 %	0 %	50 %	50 %	488575158
2502	NC_021172	TTG	2	6	117164	117169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575158
2503	NC_021172	CGG	2	6	117246	117251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575158
2504	NC_021172	CAC	2	6	117285	117290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575158
2505	NC_021172	GTG	2	6	117325	117330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575158
2506	NC_021172	CAC	2	6	117354	117359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575158
2507	NC_021172	TCA	2	6	117446	117451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575158
2508	NC_021172	CG	4	8	117537	117544	0 %	0 %	50 %	50 %	488575158
2509	NC_021172	GCC	2	6	117558	117563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575158
2510	NC_021172	GCCG	2	8	117586	117593	0 %	0 %	50 %	50 %	488575158
2511	NC_021172	GCG	2	6	117621	117626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575158
2512	NC_021172	CG	5	10	117625	117634	0 %	0 %	50 %	50 %	488575158
2513	NC_021172	CTC	2	6	117660	117665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575158
2514	NC_021172	CCG	2	6	117709	117714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575158
2515	NC_021172	AGC	2	6	117809	117814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2516	NC_021172	TCT	2	6	117915	117920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575158
2517	NC_021172	CCGGCG	2	12	117992	118003	0 %	0 %	50 %	50 %	488575158
2518	NC_021172	CGC	2	6	118046	118051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575158
2519	NC_021172	TGC	2	6	118061	118066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2520	NC_021172	CGG	2	6	118133	118138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575158
2521	NC_021172	GTC	2	6	118141	118146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2522	NC_021172	CGGC	2	8	118175	118182	0 %	0 %	50 %	50 %	488575158
2523	NC_021172	GAC	2	6	118183	118188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2524	NC_021172	CCT	2	6	118203	118208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575158
2525	NC_021172	GCC	3	9	118240	118248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575158
2526	NC_021172	TGG	2	6	118265	118270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575158
2527	NC_021172	CCG	2	6	118283	118288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575158
2528	NC_021172	AAC	2	6	118297	118302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575158
2529	NC_021172	GCG	2	6	118343	118348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575158
2530	NC_021172	CGAC	2	8	118370	118377	25 %	0 %	25 %	50 %	488575158
2531	NC_021172	TGC	2	6	118433	118438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2532	NC_021172	GCA	2	6	118447	118452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2533	NC_021172	GGT	2	6	118515	118520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575158
2534	NC_021172	AGC	2	6	118608	118613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2535	NC_021172	CGG	2	6	118647	118652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575158
2536	NC_021172	TGC	2	6	118664	118669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2537	NC_021172	CGA	2	6	118740	118745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2538	NC_021172	CGGA	2	8	118754	118761	25 %	0 %	50 %	25 %	488575158
2539	NC_021172	GACATC	2	12	118762	118773	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488575158
2540	NC_021172	GAG	2	6	118810	118815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575158
2541	NC_021172	CGA	2	6	118869	118874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575158
2542	NC_021172	TGGC	2	8	119109	119116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2543	NC_021172	CGGC	2	8	119140	119147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2544	NC_021172	GAG	2	6	119153	119158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_021172	CGC	2	6	119199	119204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2546	NC_021172	TGT	2	6	119233	119238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575159
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2548	NC_021172	GCTC	2	8	119355	119362	0 %	25 %	25 %	50 %	488575159
2549	NC_021172	GAA	2	6	119410	119415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575159
2550	NC_021172	AG	3	6	119449	119454	50 %	0 %	50 %	0 %	488575159
2551	NC_021172	CGT	2	6	119619	119624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575159
2552	NC_021172	ACC	2	6	119705	119710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575159
2553	NC_021172	CAAC	2	8	119766	119773	50 %	0 %	0 %	50 %	488575159
2554	NC_021172	CTG	2	6	119874	119879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575159
2555	NC_021172	TCG	2	6	120002	120007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575159
2556	NC_021172	AAG	2	6	120130	120135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575159
2557	NC_021172	TGCCG	2	10	120151	120160	0 %	20 %	40 %	40 %	488575159
2558	NC_021172	G	6	6	120184	120189	0 %	0 %	100 %	0 %	488575159
2559	NC_021172	CGA	2	6	120207	120212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575159
2560	NC_021172	AAGG	2	8	120217	120224	50 %	0 %	50 %	0 %	488575159
2561	NC_021172	GCG	2	6	120246	120251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575159
2562	NC_021172	CAAT	2	8	120282	120289	50 %	25 %	0 %	25 %	488575159
2563	NC_021172	AC	3	6	120307	120312	50 %	0 %	0 %	50 %	488575159
2564	NC_021172	GCG	2	6	120314	120319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575159
2565	NC_021172	ACG	2	6	120320	120325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575159
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2567	NC_021172	AAGG	2	8	120361	120368	50 %	0 %	50 %	0 %	488575159
2568	NC_021172	GAT	2	6	120437	120442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575159
2569	NC_021172	GC	3	6	120469	120474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2570	NC_021172	GCA	2	6	120517	120522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_021172	AAT	2	6	120538	120543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575160
2572	NC_021172	TCCTG	2	10	120544	120553	0 %	40 %	20 %	40 %	488575160
2573	NC_021172	TCA	2	6	120572	120577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575160
2574	NC_021172	TCGCC	2	10	120597	120606	0 %	20 %	20 %	60 %	488575160
2575	NC_021172	GAGC	2	8	120612	120619	25 %	0 %	50 %	25 %	488575160
2576	NC_021172	TGG	2	6	120624	120629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575160
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2578	NC_021172	GC	3	6	120769	120774	0 %	0 %	50 %	50 %	488575160
2579	NC_021172	GAT	2	6	120802	120807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575160
2580	NC_021172	GT	3	6	120846	120851	0 %	50 %	50 %	0 %	488575160
2581	NC_021172	CAC	2	6	120910	120915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575160
2582	NC_021172	GCG	2	6	120932	120937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575160
2583	NC_021172	GAC	3	9	120972	120980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575160
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2585	NC_021172	GCC	2	6	121101	121106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575160
2586	NC_021172	CGT	2	6	121133	121138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575160
2587	NC_021172	TCG	2	6	121264	121269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575160
2588	NC_021172	ACA	2	6	121311	121316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_021172	GTC	2	6	121362	121367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_021172	GT	3	6	121499	121504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_021172	TTC	2	6	121662	121667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_021172	GAG	2	6	121723	121728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_021172	GCA	2	6	121777	121782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_021172	CGG	2	6	121807	121812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_021172	GAA	2	6	121840	121845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_021172	TC	3	6	121907	121912	0 %	50 %	0 %	50 %	488575161
2597	NC_021172	GTG	2	6	121976	121981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575161
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2599	NC_021172	CCG	2	6	122019	122024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575161
2600	NC_021172	TGA	2	6	122061	122066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575161
2601	NC_021172	CCG	2	6	122067	122072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575161
2602	NC_021172	CGG	3	9	122095	122103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575161
2603	NC_021172	ACC	2	6	122105	122110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575161
2604	NC_021172	GGA	3	9	122146	122154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575161
2605	NC_021172	CCG	2	6	122172	122177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575161
2606	NC_021172	ATCT	2	8	122186	122193	25 %	50 %	0 %	25 %	488575161
2607	NC_021172	TGT	2	6	122206	122211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575161
2608	NC_021172	GCT	3	9	122215	122223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575161
2609	NC_021172	GTT	2	6	122281	122286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575161
2610	NC_021172	TTGC	2	8	122291	122298	0 %	50 %	25 %	25 %	488575161
2611	NC_021172	AAT	2	6	122324	122329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575161
2612	NC_021172	TCA	2	6	122370	122375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575161
2613	NC_021172	CG	3	6	122559	122564	0 %	0 %	50 %	50 %	488575161
2614	NC_021172	GTC	2	6	122594	122599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575161
2615	NC_021172	TCGC	2	8	122609	122616	0 %	25 %	25 %	50 %	488575161
2616	NC_021172	GTC	2	6	122678	122683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575161
2617	NC_021172	ATG	2	6	122744	122749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575161
2618	NC_021172	TAT	2	6	122765	122770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575161
2619	NC_021172	GGC	2	6	122808	122813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575161
2620	NC_021172	ATG	2	6	122816	122821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575161
2621	NC_021172	ATC	2	6	122942	122947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575161
2622	NC_021172	T	6	6	122954	122959	0 %	100 %	0 %	0 %	488575161
2623	NC_021172	TTA	2	6	122983	122988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575161
2624	NC_021172	GC	3	6	123005	123010	0 %	0 %	50 %	50 %	488575161
2625	NC_021172	CAC	2	6	123061	123066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575161
2626	NC_021172	TGT	2	6	123136	123141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575161
2627	NC_021172	TCCG	2	8	123158	123165	0 %	25 %	25 %	50 %	488575161
2628	NC_021172	TGG	2	6	123215	123220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575162
2629	NC_021172	TGC	2	6	123243	123248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575162
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2631	NC_021172	GAC	2	6	123354	123359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575162
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2633	NC_021172	TGC	2	6	123465	123470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575162
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2635	NC_021172	CGT	2	6	123534	123539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575162
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2638	NC_021172	TCT	2	6	123633	123638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575162
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2650	NC_021172	CTG	2	6	124416	124421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575162
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2652	NC_021172	TGG	2	6	124453	124458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575163
2653	NC_021172	AT	3	6	124522	124527	50 %	50 %	0 %	0 %	488575163
2654	NC_021172	GC	3	6	124663	124668	0 %	0 %	50 %	50 %	488575163
2655	NC_021172	TCCG	2	8	124676	124683	0 %	25 %	25 %	50 %	488575163
2656	NC_021172	CG	3	6	124727	124732	0 %	0 %	50 %	50 %	488575163
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2664	NC_021172	GC	3	6	125121	125126	0 %	0 %	50 %	50 %	488575163
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2744	NC_021172	CGA	2	6	128969	128974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575166
2745	NC_021172	CTG	2	6	128979	128984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575166
2746	NC_021172	GTC	2	6	129027	129032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575166
2747	NC_021172	TGG	2	6	129050	129055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575166
2748	NC_021172	GGC	2	6	129182	129187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575167
2749	NC_021172	GGC	2	6	129234	129239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575167
2750	NC_021172	ATG	2	6	129247	129252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575167
2751	NC_021172	ATGG	2	8	129285	129292	25 %	25 %	50 %	0 %	488575167
2752	NC_021172	GCG	2	6	129344	129349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575167
2753	NC_021172	GGC	2	6	129409	129414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575167
2754	NC_021172	ATGT	2	8	129423	129430	25 %	50 %	25 %	0 %	488575167
2755	NC_021172	ATC	2	6	129433	129438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575167
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2758	NC_021172	GCT	2	6	129563	129568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575167
2759	NC_021172	ATC	2	6	129573	129578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575167
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2761	NC_021172	CGC	2	6	129603	129608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575167
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2764	NC_021172	CGTGT	2	10	129684	129693	0 %	40 %	40 %	20 %	488575167
2765	NC_021172	GGA	2	6	129885	129890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575167
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2767	NC_021172	GC	3	6	129989	129994	0 %	0 %	50 %	50 %	488575167
2768	NC_021172	TTG	2	6	130005	130010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575167
2769	NC_021172	CTG	2	6	130071	130076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575167
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2772	NC_021172	GTC	2	6	130149	130154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575167
2773	NC_021172	AAG	2	6	130159	130164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575167
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2775	NC_021172	TC	3	6	130295	130300	0 %	50 %	0 %	50 %	488575167
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2777	NC_021172	CTT	2	6	130394	130399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2778	NC_021172	CCA	2	6	130477	130482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2779	NC_021172	TGC	2	6	130544	130549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2781	NC_021172	AG	3	6	130609	130614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2782	NC_021172	CGC	2	6	130652	130657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575168
2783	NC_021172	TGC	2	6	130691	130696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575168
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2786	NC_021172	GCGCG	2	10	130766	130775	0 %	0 %	60 %	40 %	488575168
2787	NC_021172	TCCT	2	8	130834	130841	0 %	50 %	0 %	50 %	488575168
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2809	NC_021172	ATTGGT	2	12	131768	131779	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	488575169
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2814	NC_021172	TGA	2	6	132136	132141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575170
2815	NC_021172	CACGC	2	10	132151	132160	20 %	0 %	20 %	60 %	488575170
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2821	NC_021172	GC	3	6	132398	132403	0 %	0 %	50 %	50 %	488575170
2822	NC_021172	TCGG	2	8	132416	132423	0 %	25 %	50 %	25 %	488575170
2823	NC_021172	GAC	2	6	132472	132477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575170
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2834	NC_021172	ATCT	2	8	132911	132918	25 %	50 %	0 %	25 %	488575170
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2843	NC_021172	AAG	2	6	133249	133254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2844	NC_021172	AGAA	2	8	133273	133280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2845	NC_021172	CAG	2	6	133452	133457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2846	NC_021172	ACC	2	6	133549	133554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2847	NC_021172	TCG	2	6	133638	133643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2848	NC_021172	TTG	2	6	133683	133688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575171
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2850	NC_021172	TGTGA	2	10	133764	133773	20 %	40 %	40 %	0 %	488575171
2851	NC_021172	TA	3	6	133782	133787	50 %	50 %	0 %	0 %	488575171
2852	NC_021172	TAGC	2	8	133817	133824	25 %	25 %	25 %	25 %	488575171
2853	NC_021172	AG	3	6	133871	133876	50 %	0 %	50 %	0 %	488575171
2854	NC_021172	AAT	2	6	133925	133930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575171
2855	NC_021172	CGA	2	6	133955	133960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575171
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2859	NC_021172	GTCC	2	8	134071	134078	0 %	25 %	25 %	50 %	488575171
2860	NC_021172	GATA	2	8	134081	134088	50 %	25 %	25 %	0 %	488575171
2861	NC_021172	CGC	2	6	134109	134114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575171
2862	NC_021172	CCGGA	2	10	134128	134137	20 %	0 %	40 %	40 %	488575171
2863	NC_021172	ATCCT	2	10	134149	134158	20 %	40 %	0 %	40 %	488575171
2864	NC_021172	CATT	2	8	134203	134210	25 %	50 %	0 %	25 %	488575171
2865	NC_021172	CCG	2	6	134242	134247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575171
2866	NC_021172	CG	3	6	134275	134280	0 %	0 %	50 %	50 %	488575171
2867	NC_021172	TGC	3	9	134315	134323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575171
2868	NC_021172	CGA	2	6	134327	134332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575171
2869	NC_021172	ACG	2	6	134335	134340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575171
2870	NC_021172	GAT	2	6	134406	134411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575171
2871	NC_021172	CGC	2	6	134461	134466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2872	NC_021172	CAG	2	6	134505	134510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2873	NC_021172	CCG	2	6	134512	134517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2874	NC_021172	GA	3	6	134565	134570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2875	NC_021172	CCGA	2	8	134603	134610	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2876	NC_021172	AG	3	6	134723	134728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2877	NC_021172	CGT	2	6	134754	134759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2878	NC_021172	TCG	2	6	134799	134804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2991	NC_021172	GGAG	2	8	140612	140619	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2992	NC_021172	CGC	2	6	140645	140650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2993	NC_021172	TA	3	6	140652	140657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_021172	GC	3	6	140666	140671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2995	NC_021172	ATA	2	6	140726	140731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_021172	GCA	2	6	140754	140759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2997	NC_021172	CTC	2	6	140826	140831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2998	NC_021172	CGG	2	6	140853	140858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2999	NC_021172	GAAT	2	8	141011	141018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3000	NC_021172	CGG	2	6	141156	141161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575181

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