MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 82987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021172	CAGAA	2	10	91416	91425	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2002	NC_021172	GGGA	2	8	91433	91440	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_021172	GGA	2	6	91472	91477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575130
2004	NC_021172	CGG	2	6	91567	91572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575130
2005	NC_021172	TCG	2	6	91602	91607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575130
2006	NC_021172	GGC	2	6	91612	91617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575130
2007	NC_021172	GTTT	2	8	91668	91675	0 %	75 %	25 %	0 %	488575130
2008	NC_021172	GCG	2	6	91689	91694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575130
2009	NC_021172	ATC	2	6	91736	91741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575130
2010	NC_021172	GTG	2	6	91756	91761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575130
2011	NC_021172	TGGC	2	8	91766	91773	0 %	25 %	50 %	25 %	488575130
2012	NC_021172	GCC	3	9	91808	91816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575130
2013	NC_021172	GATC	2	8	91893	91900	25 %	25 %	25 %	25 %	488575130
2014	NC_021172	TGGC	2	8	91928	91935	0 %	25 %	50 %	25 %	488575130
2015	NC_021172	CTG	2	6	91976	91981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575130
2016	NC_021172	TTC	2	6	92078	92083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575130
2017	NC_021172	CGGTG	2	10	92086	92095	0 %	20 %	60 %	20 %	488575130
2018	NC_021172	TCA	2	6	92103	92108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575130
2019	NC_021172	TCG	2	6	92193	92198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575130
2020	NC_021172	GTG	2	6	92201	92206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575130
2021	NC_021172	ATT	2	6	92238	92243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575130
2022	NC_021172	GGC	2	6	92263	92268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575130
2023	NC_021172	GCG	2	6	92336	92341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575130
2024	NC_021172	TCT	2	6	92421	92426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575130
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2030	NC_021172	GGCT	2	8	92678	92685	0 %	25 %	50 %	25 %	488575130
2031	NC_021172	GGAC	2	8	92739	92746	25 %	0 %	50 %	25 %	488575130
2032	NC_021172	GCTT	2	8	92763	92770	0 %	50 %	25 %	25 %	488575130
2033	NC_021172	CGA	2	6	92790	92795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575130
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2035	NC_021172	CTG	2	6	92824	92829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575130
2036	NC_021172	CAT	2	6	92833	92838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575130
2037	NC_021172	CCTGAA	2	12	92848	92859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488575130
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2039	NC_021172	GCATC	2	10	92872	92881	20 %	20 %	20 %	40 %	488575130
2040	NC_021172	CTC	2	6	92921	92926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575130
2041	NC_021172	TC	3	6	92944	92949	0 %	50 %	0 %	50 %	488575130
2042	NC_021172	CGG	2	6	93024	93029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575130
2043	NC_021172	GCA	2	6	93088	93093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575130
2044	NC_021172	CGA	2	6	93100	93105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575130
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2048	NC_021172	TTGA	2	8	93263	93270	25 %	50 %	25 %	0 %	488575131
2049	NC_021172	CCG	2	6	93287	93292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575131
2050	NC_021172	TCG	2	6	93402	93407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575131
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2052	NC_021172	GCAA	2	8	93524	93531	50 %	0 %	25 %	25 %	488575131
2053	NC_021172	ATTG	2	8	93583	93590	25 %	50 %	25 %	0 %	488575131
2054	NC_021172	TGC	2	6	93640	93645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575131
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2057	NC_021172	CGGTG	2	10	93798	93807	0 %	20 %	60 %	20 %	488575131
2058	NC_021172	CTT	2	6	93827	93832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575131
2059	NC_021172	GCTTT	2	10	93998	94007	0 %	60 %	20 %	20 %	488575132
2060	NC_021172	TCT	2	6	94037	94042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575132
2061	NC_021172	CG	4	8	94082	94089	0 %	0 %	50 %	50 %	488575132
2062	NC_021172	TGA	2	6	94109	94114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575132
2063	NC_021172	ATCAG	2	10	94139	94148	40 %	20 %	20 %	20 %	488575132
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2066	NC_021172	CATG	2	8	94188	94195	25 %	25 %	25 %	25 %	488575132
2067	NC_021172	CGAT	2	8	94250	94257	25 %	25 %	25 %	25 %	488575132
2068	NC_021172	CGGG	2	8	94286	94293	0 %	0 %	75 %	25 %	488575132
2069	NC_021172	GAT	2	6	94317	94322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575132
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2072	NC_021172	GAT	2	6	94530	94535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575132
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2090	NC_021172	TTCTC	2	10	95757	95766	0 %	60 %	0 %	40 %	488575133
2091	NC_021172	ATGA	2	8	95789	95796	50 %	25 %	25 %	0 %	488575133
2092	NC_021172	GCC	2	6	95851	95856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575133
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2096	NC_021172	A	6	6	95972	95977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_021172	GC	3	6	96037	96042	0 %	0 %	50 %	50 %	488575134
2098	NC_021172	TCGGA	2	10	96074	96083	20 %	20 %	40 %	20 %	488575134
2099	NC_021172	CGA	2	6	96128	96133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575134
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2115	NC_021172	CGAA	2	8	97377	97384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2116	NC_021172	CCG	2	6	97429	97434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2117	NC_021172	GAT	2	6	97443	97448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_021172	CGT	2	6	97459	97464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2120	NC_021172	CAT	2	6	97594	97599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575135
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2123	NC_021172	TA	3	6	97716	97721	50 %	50 %	0 %	0 %	488575135
2124	NC_021172	CTGG	2	8	97795	97802	0 %	25 %	50 %	25 %	488575135
2125	NC_021172	TGCA	2	8	97805	97812	25 %	25 %	25 %	25 %	488575135
2126	NC_021172	CGAT	2	8	97818	97825	25 %	25 %	25 %	25 %	488575135
2127	NC_021172	ACGA	2	8	97910	97917	50 %	0 %	25 %	25 %	488575135
2128	NC_021172	CTT	2	6	97931	97936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575135
2129	NC_021172	CGA	2	6	97984	97989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NC_021172	GAA	2	6	98075	98080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_021172	CGA	2	6	98093	98098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2132	NC_021172	CGT	2	6	98108	98113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2133	NC_021172	CT	3	6	98174	98179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2134	NC_021172	CAG	2	6	98328	98333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2135	NC_021172	A	6	6	98358	98363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2136	NC_021172	TC	3	6	98383	98388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2137	NC_021172	C	6	6	98393	98398	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2138	NC_021172	ATAA	2	8	98404	98411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_021172	CGC	2	6	98506	98511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2140	NC_021172	CGGG	2	8	98659	98666	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2141	NC_021172	CAA	3	9	98687	98695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575136
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2144	NC_021172	TCGA	2	8	98746	98753	25 %	25 %	25 %	25 %	488575136
2145	NC_021172	GGC	2	6	98855	98860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575136
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2154	NC_021172	GAT	2	6	99352	99357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575137
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2170	NC_021172	AGTG	2	8	100335	100342	25 %	25 %	50 %	0 %	488575139
2171	NC_021172	TG	3	6	100341	100346	0 %	50 %	50 %	0 %	488575139
2172	NC_021172	AGCC	2	8	100360	100367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2173	NC_021172	TGC	2	6	100445	100450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2179	NC_021172	GCA	2	6	100716	100721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575140
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2213	NC_021172	GAC	2	6	102734	102739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2215	NC_021172	ATC	3	9	102796	102804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2217	NC_021172	TGATG	2	10	103023	103032	20 %	40 %	40 %	0 %	488575141
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2234	NC_021172	GTT	2	6	103530	103535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575141
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2236	NC_021172	TCGCGC	2	12	103705	103716	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2237	NC_021172	CCA	2	6	103720	103725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2238	NC_021172	GCA	2	6	103738	103743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2239	NC_021172	TGA	2	6	103795	103800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2240	NC_021172	CAT	3	9	103816	103824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2241	NC_021172	AGC	2	6	103909	103914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575142
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2243	NC_021172	TCG	2	6	103972	103977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575142
2244	NC_021172	CCGT	2	8	104087	104094	0 %	25 %	25 %	50 %	488575142
2245	NC_021172	CCGG	2	8	104119	104126	0 %	0 %	50 %	50 %	488575142
2246	NC_021172	CAT	2	6	104214	104219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575142
2247	NC_021172	CTG	2	6	104259	104264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575142
2248	NC_021172	TC	3	6	104291	104296	0 %	50 %	0 %	50 %	488575142
2249	NC_021172	TTC	2	6	104305	104310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575142
2250	NC_021172	CTTC	2	8	104393	104400	0 %	50 %	0 %	50 %	488575142
2251	NC_021172	CGC	2	6	104414	104419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575142
2252	NC_021172	GC	3	6	104493	104498	0 %	0 %	50 %	50 %	488575142
2253	NC_021172	GGC	2	6	104588	104593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575142
2254	NC_021172	ACCA	2	8	104617	104624	50 %	0 %	0 %	50 %	488575142
2255	NC_021172	TGCT	2	8	104628	104635	0 %	50 %	25 %	25 %	488575142
2256	NC_021172	AGC	2	6	104752	104757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575142
2257	NC_021172	AGC	2	6	104793	104798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575142
2258	NC_021172	CCG	2	6	104845	104850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2259	NC_021172	CCG	2	6	104881	104886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2260	NC_021172	GAG	2	6	104939	104944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575143
2261	NC_021172	A	8	8	104990	104997	100 %	0 %	0 %	0 %	488575143
2262	NC_021172	GATC	2	8	104998	105005	25 %	25 %	25 %	25 %	488575143
2263	NC_021172	CGG	2	6	105006	105011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575143
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2267	NC_021172	TCCG	2	8	105119	105126	0 %	25 %	25 %	50 %	488575143
2268	NC_021172	CGCA	2	8	105159	105166	25 %	0 %	25 %	50 %	488575143
2269	NC_021172	GGCGA	2	10	105170	105179	20 %	0 %	60 %	20 %	488575143
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2271	NC_021172	GAT	2	6	105296	105301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575143
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2273	NC_021172	GC	3	6	105372	105377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2274	NC_021172	ATA	2	6	105382	105387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2275	NC_021172	TA	3	6	105386	105391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2276	NC_021172	CCG	2	6	105527	105532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2277	NC_021172	CAG	2	6	105582	105587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2279	NC_021172	CAGAT	2	10	105622	105631	40 %	20 %	20 %	20 %	488575144
2280	NC_021172	TGA	2	6	105653	105658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575144
2281	NC_021172	ATCG	2	8	105865	105872	25 %	25 %	25 %	25 %	488575144
2282	NC_021172	CGC	2	6	105923	105928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575144
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2295	NC_021172	TGACC	2	10	106616	106625	20 %	20 %	20 %	40 %	488575144
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2306	NC_021172	AG	3	6	107065	107070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2307	NC_021172	AGGT	2	8	107072	107079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2308	NC_021172	CCA	2	6	107122	107127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2309	NC_021172	CAC	2	6	107131	107136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2310	NC_021172	TGT	2	6	107146	107151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2311	NC_021172	AATA	2	8	107171	107178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2312	NC_021172	AT	3	6	107189	107194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2313	NC_021172	GCT	2	6	107299	107304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575145
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2320	NC_021172	CG	3	6	107657	107662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2321	NC_021172	CGT	2	6	107699	107704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2322	NC_021172	A	6	6	107867	107872	100 %	0 %	0 %	0 %	488575146
2323	NC_021172	GCA	2	6	107882	107887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575146
2324	NC_021172	GATCA	2	10	107922	107931	40 %	20 %	20 %	20 %	488575146
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2328	NC_021172	ATCC	2	8	108118	108125	25 %	25 %	0 %	50 %	488575146
2329	NC_021172	TGC	2	6	108141	108146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575146
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2357	NC_021172	TTC	2	6	109691	109696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2358	NC_021172	TGT	2	6	109705	109710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2359	NC_021172	TTCA	2	8	109712	109719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2360	NC_021172	TGCC	2	8	109736	109743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2361	NC_021172	AAG	2	6	109801	109806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2362	NC_021172	CTT	2	6	109854	109859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575147
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2367	NC_021172	ATC	2	6	110127	110132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575148
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2370	NC_021172	CAC	2	6	110376	110381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2371	NC_021172	CGA	2	6	110490	110495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2372	NC_021172	GCGA	2	8	110509	110516	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2373	NC_021172	TCG	2	6	110577	110582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2374	NC_021172	GTTG	2	8	110613	110620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2375	NC_021172	GAAA	2	8	110699	110706	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2376	NC_021172	TTGA	2	8	110824	110831	25 %	50 %	25 %	0 %	488575149
2377	NC_021172	CTTC	2	8	110870	110877	0 %	50 %	0 %	50 %	488575149
2378	NC_021172	CGT	2	6	110927	110932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575149
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2392	NC_021172	CGTC	2	8	111925	111932	0 %	25 %	25 %	50 %	488575150
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2497	NC_021172	TGA	2	6	116905	116910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2498	NC_021172	CTAAT	2	10	117002	117011	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2499	NC_021172	GAAA	2	8	117069	117076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2500	NC_021172	T	6	6	117091	117096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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