MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 82987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021172	CGT	2	6	67011	67016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575101
1502	NC_021172	GAGTA	2	10	67028	67037	40 %	20 %	40 %	0 %	488575101
1503	NC_021172	AGC	2	6	67061	67066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575101
1504	NC_021172	GCC	2	6	67130	67135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575101
1505	NC_021172	GCG	2	6	67250	67255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_021172	CTT	2	6	67285	67290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_021172	TGC	2	6	67319	67324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_021172	CGA	2	6	67532	67537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1509	NC_021172	GC	3	6	67551	67556	0 %	0 %	50 %	50 %	488575102
1510	NC_021172	CGC	3	9	67554	67562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575102
1511	NC_021172	GC	3	6	67576	67581	0 %	0 %	50 %	50 %	488575102
1512	NC_021172	TTC	2	6	67591	67596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575102
1513	NC_021172	GTC	2	6	67620	67625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1514	NC_021172	CGA	2	6	67639	67644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1515	NC_021172	TC	3	6	67673	67678	0 %	50 %	0 %	50 %	488575102
1516	NC_021172	CGA	2	6	67705	67710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1517	NC_021172	GTG	2	6	67716	67721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575102
1518	NC_021172	GCG	2	6	67754	67759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575102
1519	NC_021172	TGC	2	6	67765	67770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1520	NC_021172	TCA	2	6	67780	67785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575102
1521	NC_021172	CGG	3	9	67865	67873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575102
1522	NC_021172	GTC	2	6	67899	67904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1523	NC_021172	CGT	2	6	67910	67915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1524	NC_021172	GCC	2	6	67916	67921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575102
1525	NC_021172	TTC	2	6	67947	67952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575102
1526	NC_021172	CGG	2	6	67994	67999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575102
1527	NC_021172	TCG	2	6	68005	68010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1528	NC_021172	TCA	2	6	68038	68043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575102
1529	NC_021172	GAC	2	6	68105	68110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1530	NC_021172	CGT	2	6	68165	68170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1531	NC_021172	CAT	2	6	68171	68176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575102
1532	NC_021172	GC	3	6	68199	68204	0 %	0 %	50 %	50 %	488575102
1533	NC_021172	GCT	2	6	68294	68299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1534	NC_021172	TCGCGA	2	12	68329	68340	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1535	NC_021172	TCGG	2	8	68343	68350	0 %	25 %	50 %	25 %	488575102
1536	NC_021172	GATC	2	8	68377	68384	25 %	25 %	25 %	25 %	488575102
1537	NC_021172	GTC	2	6	68409	68414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1538	NC_021172	CGA	2	6	68428	68433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1539	NC_021172	GAT	2	6	68456	68461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575102
1540	NC_021172	ATC	2	6	68499	68504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575102
1541	NC_021172	TGA	2	6	68551	68556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575102
1542	NC_021172	AGC	2	6	68698	68703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1543	NC_021172	ACG	2	6	68724	68729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1544	NC_021172	TCGA	2	8	68735	68742	25 %	25 %	25 %	25 %	488575102
1545	NC_021172	GCG	2	6	68760	68765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575102
1546	NC_021172	CG	3	6	69040	69045	0 %	0 %	50 %	50 %	488575102
1547	NC_021172	CTCG	2	8	69053	69060	0 %	25 %	25 %	50 %	488575102
1548	NC_021172	TCG	2	6	69076	69081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1549	NC_021172	CGA	2	6	69239	69244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1550	NC_021172	GC	3	6	69253	69258	0 %	0 %	50 %	50 %	488575102
1551	NC_021172	GGC	2	6	69290	69295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575102
1552	NC_021172	TCG	2	6	69313	69318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1553	NC_021172	GCCGC	2	10	69334	69343	0 %	0 %	40 %	60 %	488575102
1554	NC_021172	TTG	2	6	69354	69359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575102
1555	NC_021172	GAC	2	6	69372	69377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575102
1556	NC_021172	CG	3	6	69426	69431	0 %	0 %	50 %	50 %	488575102
1557	NC_021172	GTAA	2	8	69488	69495	50 %	25 %	25 %	0 %	488575102
1558	NC_021172	AAGCT	2	10	69498	69507	40 %	20 %	20 %	20 %	488575103
1559	NC_021172	GACG	2	8	69558	69565	25 %	0 %	50 %	25 %	488575103
1560	NC_021172	TCC	2	6	69574	69579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575103
1561	NC_021172	GCA	2	6	69611	69616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575103
1562	NC_021172	CGC	2	6	69628	69633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575103
1563	NC_021172	CGGCG	2	10	69660	69669	0 %	0 %	60 %	40 %	488575103
1564	NC_021172	CTT	2	6	69675	69680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575103
1565	NC_021172	GCC	2	6	69850	69855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575103
1566	NC_021172	CGATG	2	10	69962	69971	20 %	20 %	40 %	20 %	488575103
1567	NC_021172	GCCGA	2	10	69999	70008	20 %	0 %	40 %	40 %	488575103
1568	NC_021172	TGG	2	6	70097	70102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575103
1569	NC_021172	AG	3	6	70127	70132	50 %	0 %	50 %	0 %	488575103
1570	NC_021172	CTT	2	6	70440	70445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_021172	AGC	2	6	70453	70458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_021172	TCT	2	6	70591	70596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_021172	CGG	2	6	70604	70609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_021172	CCTG	2	8	70685	70692	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_021172	GC	3	6	70734	70739	0 %	0 %	50 %	50 %	488575104
1576	NC_021172	TGC	3	9	70772	70780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1577	NC_021172	GGC	2	6	70827	70832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575104
1578	NC_021172	GCA	2	6	70847	70852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1579	NC_021172	TGG	2	6	70873	70878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575104
1580	NC_021172	ATG	2	6	70915	70920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575104
1581	NC_021172	TGC	2	6	70933	70938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1582	NC_021172	ACG	2	6	71032	71037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1583	NC_021172	TGCG	2	8	71127	71134	0 %	25 %	50 %	25 %	488575104
1584	NC_021172	CAG	2	6	71154	71159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1585	NC_021172	CGT	2	6	71189	71194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1586	NC_021172	ACCG	2	8	71216	71223	25 %	0 %	25 %	50 %	488575104
1587	NC_021172	GCAT	2	8	71231	71238	25 %	25 %	25 %	25 %	488575104
1588	NC_021172	GCC	2	6	71388	71393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575104
1589	NC_021172	A	8	8	71399	71406	100 %	0 %	0 %	0 %	488575104
1590	NC_021172	CGA	2	6	71438	71443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1591	NC_021172	GTC	2	6	71454	71459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1592	NC_021172	A	6	6	71466	71471	100 %	0 %	0 %	0 %	488575104
1593	NC_021172	AGC	2	6	71494	71499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1594	NC_021172	GC	3	6	71504	71509	0 %	0 %	50 %	50 %	488575104
1595	NC_021172	GGC	2	6	71513	71518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575104
1596	NC_021172	CTT	2	6	71562	71567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575104
1597	NC_021172	CGCC	2	8	71578	71585	0 %	0 %	25 %	75 %	488575104
1598	NC_021172	TGCGGC	2	12	71621	71632	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	488575104
1599	NC_021172	GCG	2	6	71658	71663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575104
1600	NC_021172	TGC	2	6	71675	71680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1601	NC_021172	GGC	2	6	71696	71701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575104
1602	NC_021172	CGG	2	6	71707	71712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575104
1603	NC_021172	GGC	2	6	71750	71755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575104
1604	NC_021172	GGA	2	6	71773	71778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575104
1605	NC_021172	TCA	2	6	71797	71802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575104
1606	NC_021172	CGA	2	6	71879	71884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1607	NC_021172	CG	3	6	71963	71968	0 %	0 %	50 %	50 %	488575104
1608	NC_021172	AAG	2	6	72003	72008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575104
1609	NC_021172	CCGA	2	8	72042	72049	25 %	0 %	25 %	50 %	488575104
1610	NC_021172	CCG	2	6	72064	72069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575104
1611	NC_021172	CCG	2	6	72090	72095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575104
1612	NC_021172	CGA	2	6	72152	72157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1613	NC_021172	TCG	2	6	72196	72201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1614	NC_021172	GC	3	6	72223	72228	0 %	0 %	50 %	50 %	488575104
1615	NC_021172	AAG	2	6	72231	72236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575104
1616	NC_021172	GAT	2	6	72270	72275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575104
1617	NC_021172	ATT	2	6	72283	72288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575104
1618	NC_021172	ACG	2	6	72289	72294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575104
1619	NC_021172	CGG	2	6	72339	72344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575104
1620	NC_021172	TTC	2	6	72363	72368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575104
1621	NC_021172	TGG	2	6	72372	72377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575104
1622	NC_021172	GTC	2	6	72461	72466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575105
1623	NC_021172	GAA	2	6	72481	72486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575105
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1625	NC_021172	GGGT	2	8	72554	72561	0 %	25 %	75 %	0 %	488575105
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1872	NC_021172	CG	3	6	84395	84400	0 %	0 %	50 %	50 %	488575119
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1877	NC_021172	T	7	7	84678	84684	0 %	100 %	0 %	0 %	488575120
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