MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori OK310 DNA

Total Repeats: 4507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020509	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	478429023
2	NC_020509	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	478429024
3	NC_020509	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	478429025
4	NC_020509	ACTC	2	8	1377	1384	25 %	25 %	0 %	50 %	478429025
5	NC_020509	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	478429026
6	NC_020509	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	478429026
7	NC_020509	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	478429026
8	NC_020509	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	478429026
9	NC_020509	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	478429026
10	NC_020509	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	478429027
11	NC_020509	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	478429028
12	NC_020509	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	478429028
13	NC_020509	AGTG	2	8	3344	3351	25 %	25 %	50 %	0 %	478429028
14	NC_020509	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	478429028
15	NC_020509	ATGC	2	8	4283	4290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020509	TAAA	2	8	4692	4699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020509	TCGC	2	8	5382	5389	0 %	25 %	25 %	50 %	478429029
18	NC_020509	CATT	2	8	5455	5462	25 %	50 %	0 %	25 %	478429029
19	NC_020509	GTGC	2	8	6033	6040	0 %	25 %	50 %	25 %	478429029
20	NC_020509	GTTT	2	8	6708	6715	0 %	75 %	25 %	0 %	478429029
21	NC_020509	TGGT	2	8	6908	6915	0 %	50 %	50 %	0 %	478429029
22	NC_020509	ATCG	2	8	7091	7098	25 %	25 %	25 %	25 %	478429029
23	NC_020509	ATTG	2	8	7103	7110	25 %	50 %	25 %	0 %	478429029
24	NC_020509	TTCA	2	8	7891	7898	25 %	50 %	0 %	25 %	478429030
25	NC_020509	TCTT	2	8	8185	8192	0 %	75 %	0 %	25 %	478429030
26	NC_020509	AAGC	2	8	9000	9007	50 %	0 %	25 %	25 %	478429030
27	NC_020509	ATAA	2	8	9687	9694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020509	ATTC	2	8	9890	9897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020509	GATA	2	8	9979	9986	50 %	25 %	25 %	0 %	478429032
30	NC_020509	TCAA	2	8	10086	10093	50 %	25 %	0 %	25 %	478429032
31	NC_020509	ATTG	2	8	10400	10407	25 %	50 %	25 %	0 %	478429032
32	NC_020509	ACAA	2	8	10668	10675	75 %	0 %	0 %	25 %	478429032
33	NC_020509	GCTC	2	8	11529	11536	0 %	25 %	25 %	50 %	478429032
34	NC_020509	ATTG	2	8	11881	11888	25 %	50 %	25 %	0 %	478429033
35	NC_020509	GCAA	2	8	12072	12079	50 %	0 %	25 %	25 %	478429033
36	NC_020509	GCAG	2	8	12215	12222	25 %	0 %	50 %	25 %	478429033
37	NC_020509	TGCT	2	8	12277	12284	0 %	50 %	25 %	25 %	478429033
38	NC_020509	GGCC	2	8	12540	12547	0 %	0 %	50 %	50 %	478429033
39	NC_020509	TGCA	2	8	12757	12764	25 %	25 %	25 %	25 %	478429034
40	NC_020509	AGCA	2	8	12812	12819	50 %	0 %	25 %	25 %	478429034
41	NC_020509	TCTT	2	8	13557	13564	0 %	75 %	0 %	25 %	478429034
42	NC_020509	TTAA	2	8	13704	13711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020509	AGCG	2	8	14027	14034	25 %	0 %	50 %	25 %	478429036
44	NC_020509	GATT	2	8	14135	14142	25 %	50 %	25 %	0 %	478429036
45	NC_020509	CAAA	2	8	14304	14311	75 %	0 %	0 %	25 %	478429037
46	NC_020509	ATGC	2	8	14719	14726	25 %	25 %	25 %	25 %	478429037
47	NC_020509	GAGC	2	8	15024	15031	25 %	0 %	50 %	25 %	478429037
48	NC_020509	TTTA	2	8	15306	15313	25 %	75 %	0 %	0 %	478429037
49	NC_020509	CAGG	2	8	16464	16471	25 %	0 %	50 %	25 %	478429037
50	NC_020509	TGAT	2	8	16508	16515	25 %	50 %	25 %	0 %	478429037
51	NC_020509	AGTT	2	8	16650	16657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020509	GCTT	2	8	17502	17509	0 %	50 %	25 %	25 %	478429038
53	NC_020509	ATCT	2	8	18059	18066	25 %	50 %	0 %	25 %	478429038
54	NC_020509	GTTT	2	8	18277	18284	0 %	75 %	25 %	0 %	478429038
55	NC_020509	TTGA	2	8	18624	18631	25 %	50 %	25 %	0 %	478429039
56	NC_020509	TGCT	2	8	19000	19007	0 %	50 %	25 %	25 %	478429039
57	NC_020509	AGCG	2	8	19172	19179	25 %	0 %	50 %	25 %	478429039
58	NC_020509	TAAA	2	8	20677	20684	75 %	25 %	0 %	0 %	478429041
59	NC_020509	GCGT	2	8	20986	20993	0 %	25 %	50 %	25 %	478429041
60	NC_020509	AGGC	2	8	21118	21125	25 %	0 %	50 %	25 %	478429041
61	NC_020509	TGAT	2	8	21276	21283	25 %	50 %	25 %	0 %	478429042
62	NC_020509	CTTT	2	8	21543	21550	0 %	75 %	0 %	25 %	478429042
63	NC_020509	AAGT	2	8	21855	21862	50 %	25 %	25 %	0 %	478429042
64	NC_020509	GCTT	2	8	21988	21995	0 %	50 %	25 %	25 %	478429042
65	NC_020509	TTTA	2	8	22442	22449	25 %	75 %	0 %	0 %	478429042
66	NC_020509	CTTT	2	8	22620	22627	0 %	75 %	0 %	25 %	478429042
67	NC_020509	ATCA	2	8	22759	22766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020509	GTTT	2	8	23504	23511	0 %	75 %	25 %	0 %	478429044
69	NC_020509	TCCC	2	8	24650	24657	0 %	25 %	0 %	75 %	478429044
70	NC_020509	GATT	2	8	25133	25140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020509	ATTA	2	8	25229	25236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020509	TGAA	2	8	25702	25709	50 %	25 %	25 %	0 %	478429045
73	NC_020509	CAAT	2	8	25932	25939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020509	CCAT	2	8	26060	26067	25 %	25 %	0 %	50 %	478429046
75	NC_020509	TTTG	2	8	26165	26172	0 %	75 %	25 %	0 %	478429046
76	NC_020509	CGCT	2	8	26477	26484	0 %	25 %	25 %	50 %	478429046
77	NC_020509	TTTC	2	8	27038	27045	0 %	75 %	0 %	25 %	478429047
78	NC_020509	ATTC	2	8	28145	28152	25 %	50 %	0 %	25 %	478429047
79	NC_020509	ATCA	2	8	28761	28768	50 %	25 %	0 %	25 %	478429047
80	NC_020509	TTCT	2	8	29466	29473	0 %	75 %	0 %	25 %	478429048
81	NC_020509	CTTT	2	8	29787	29794	0 %	75 %	0 %	25 %	478429048
82	NC_020509	ATGA	2	8	30834	30841	50 %	25 %	25 %	0 %	478429049
83	NC_020509	AGCG	2	8	30925	30932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020509	AGCG	2	8	32919	32926	25 %	0 %	50 %	25 %	478429052
85	NC_020509	TTCA	2	8	33121	33128	25 %	50 %	0 %	25 %	478429052
86	NC_020509	TTTG	2	8	33542	33549	0 %	75 %	25 %	0 %	478429052
87	NC_020509	GTTT	2	8	33734	33741	0 %	75 %	25 %	0 %	478429053
88	NC_020509	GTGC	2	8	34050	34057	0 %	25 %	50 %	25 %	478429053
89	NC_020509	TTGA	2	8	34132	34139	25 %	50 %	25 %	0 %	478429053
90	NC_020509	AGGG	2	8	34425	34432	25 %	0 %	75 %	0 %	478429053
91	NC_020509	TTCA	2	8	35061	35068	25 %	50 %	0 %	25 %	478429054
92	NC_020509	CAAG	2	8	35280	35287	50 %	0 %	25 %	25 %	478429054
93	NC_020509	TTTG	2	8	35583	35590	0 %	75 %	25 %	0 %	478429055
94	NC_020509	TTAC	2	8	35655	35662	25 %	50 %	0 %	25 %	478429055
95	NC_020509	GAGC	2	8	36122	36129	25 %	0 %	50 %	25 %	478429056
96	NC_020509	GTTT	2	8	36981	36988	0 %	75 %	25 %	0 %	478429057
97	NC_020509	CAAC	2	8	37102	37109	50 %	0 %	0 %	50 %	478429057
98	NC_020509	CGCT	2	8	37157	37164	0 %	25 %	25 %	50 %	478429057
99	NC_020509	CGTT	2	8	37477	37484	0 %	50 %	25 %	25 %	478429057
100	NC_020509	GCAG	2	8	38866	38873	25 %	0 %	50 %	25 %	478429058
101	NC_020509	GCTT	2	8	38903	38910	0 %	50 %	25 %	25 %	478429058
102	NC_020509	CATG	2	8	39802	39809	25 %	25 %	25 %	25 %	478429059
103	NC_020509	TTCT	2	8	40152	40159	0 %	75 %	0 %	25 %	478429059
104	NC_020509	TATC	2	8	40225	40232	25 %	50 %	0 %	25 %	478429059
105	NC_020509	TTTA	2	8	40613	40620	25 %	75 %	0 %	0 %	478429060
106	NC_020509	TATT	2	8	41191	41198	25 %	75 %	0 %	0 %	478429060
107	NC_020509	ATTT	2	8	41699	41706	25 %	75 %	0 %	0 %	478429060
108	NC_020509	TTTA	2	8	41738	41745	25 %	75 %	0 %	0 %	478429060
109	NC_020509	AAAG	2	8	42443	42450	75 %	0 %	25 %	0 %	478429061
110	NC_020509	GCAT	2	8	42730	42737	25 %	25 %	25 %	25 %	478429061
111	NC_020509	TTGG	2	8	42863	42870	0 %	50 %	50 %	0 %	478429062
112	NC_020509	GAAA	2	8	43203	43210	75 %	0 %	25 %	0 %	478429062
113	NC_020509	TATT	2	8	43394	43401	25 %	75 %	0 %	0 %	478429063
114	NC_020509	GCAT	2	8	43952	43959	25 %	25 %	25 %	25 %	478429064
115	NC_020509	ATTC	2	8	44458	44465	25 %	50 %	0 %	25 %	478429064
116	NC_020509	GAAA	2	8	44488	44495	75 %	0 %	25 %	0 %	478429064
117	NC_020509	TCCA	2	8	45199	45206	25 %	25 %	0 %	50 %	478429065
118	NC_020509	TTCT	2	8	45370	45377	0 %	75 %	0 %	25 %	478429065
119	NC_020509	ATGA	2	8	45402	45409	50 %	25 %	25 %	0 %	478429065
120	NC_020509	TTTG	2	8	45425	45432	0 %	75 %	25 %	0 %	478429065
121	NC_020509	TTTG	2	8	45598	45605	0 %	75 %	25 %	0 %	478429066
122	NC_020509	GAGC	2	8	45969	45976	25 %	0 %	50 %	25 %	478429066
123	NC_020509	AGCG	2	8	46240	46247	25 %	0 %	50 %	25 %	478429066
124	NC_020509	CTTT	2	8	46453	46460	0 %	75 %	0 %	25 %	478429067
125	NC_020509	CTTG	2	8	46467	46474	0 %	50 %	25 %	25 %	478429067
126	NC_020509	AGCC	2	8	46540	46547	25 %	0 %	25 %	50 %	478429067
127	NC_020509	GCTC	2	8	47019	47026	0 %	25 %	25 %	50 %	478429067
128	NC_020509	AAAG	2	8	48619	48626	75 %	0 %	25 %	0 %	478429067
129	NC_020509	CGCA	2	8	49595	49602	25 %	0 %	25 %	50 %	478429068
130	NC_020509	AAGC	2	8	49800	49807	50 %	0 %	25 %	25 %	478429068
131	NC_020509	TTTG	2	8	50331	50338	0 %	75 %	25 %	0 %	478429069
132	NC_020509	GGTT	2	8	50339	50346	0 %	50 %	50 %	0 %	478429069
133	NC_020509	GCAT	2	8	50995	51002	25 %	25 %	25 %	25 %	478429071
134	NC_020509	TGAA	2	8	52048	52055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020509	TAGA	2	8	52076	52083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020509	TTCT	2	8	52120	52127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020509	TGAA	2	8	52422	52429	50 %	25 %	25 %	0 %	478429073
138	NC_020509	AGCG	2	8	53050	53057	25 %	0 %	50 %	25 %	478429073
139	NC_020509	CGAG	2	8	53058	53065	25 %	0 %	50 %	25 %	478429073
140	NC_020509	TCAA	2	8	53573	53580	50 %	25 %	0 %	25 %	478429074
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142	NC_020509	GTTT	2	8	54493	54500	0 %	75 %	25 %	0 %	478429074
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