MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobaculum sp. HO

Total Repeats: 34577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_020411	ATG	2	6	848264	848269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944107
19003	NC_020411	TCT	2	6	848303	848308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452944108
19004	NC_020411	GGT	2	6	848360	848365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452944108
19005	NC_020411	T	6	6	848380	848385	0 %	100 %	0 %	0 %	452944108
19006	NC_020411	TAG	2	6	848490	848495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944108
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19012	NC_020411	TTTG	2	8	848785	848792	0 %	75 %	25 %	0 %	452944108
19013	NC_020411	TGG	2	6	848835	848840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452944108
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19015	NC_020411	TA	3	6	848932	848937	50 %	50 %	0 %	0 %	452944108
19016	NC_020411	ATAG	2	8	848960	848967	50 %	25 %	25 %	0 %	452944108
19017	NC_020411	TAG	2	6	849009	849014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944108
19018	NC_020411	AGA	2	6	849100	849105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452944108
19019	NC_020411	TAG	2	6	849169	849174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944108
19020	NC_020411	A	6	6	849179	849184	100 %	0 %	0 %	0 %	452944108
19021	NC_020411	CTTT	2	8	849189	849196	0 %	75 %	0 %	25 %	452944108
19022	NC_020411	GAT	2	6	849280	849285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944108
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19024	NC_020411	CTTA	2	8	849296	849303	25 %	50 %	0 %	25 %	452944108
19025	NC_020411	GCA	2	6	849377	849382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452944108
19026	NC_020411	GAC	2	6	849407	849412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452944108
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19031	NC_020411	TAA	2	6	849647	849652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452944109
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19033	NC_020411	A	7	7	849727	849733	100 %	0 %	0 %	0 %	452944109
19034	NC_020411	AGT	2	6	849741	849746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944109
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19037	NC_020411	GTA	2	6	849892	849897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944109
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19039	NC_020411	AAC	2	6	849989	849994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452944109
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19048	NC_020411	CAGG	2	8	850345	850352	25 %	0 %	50 %	25 %	452944109
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19052	NC_020411	TATC	2	8	850567	850574	25 %	50 %	0 %	25 %	452944109
19053	NC_020411	GAA	2	6	850585	850590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452944109
19054	NC_020411	AAGT	2	8	850610	850617	50 %	25 %	25 %	0 %	452944109
19055	NC_020411	TGC	2	6	850710	850715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452944109
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19057	NC_020411	TTTG	2	8	850758	850765	0 %	75 %	25 %	0 %	452944109
19058	NC_020411	AGTT	2	8	850776	850783	25 %	50 %	25 %	0 %	452944109
19059	NC_020411	AAG	2	6	850829	850834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452944109
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19075	NC_020411	GAA	2	6	851938	851943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452944109
19076	NC_020411	TA	3	6	851998	852003	50 %	50 %	0 %	0 %	452944109
19077	NC_020411	CT	3	6	852063	852068	0 %	50 %	0 %	50 %	452944109
19078	NC_020411	ATC	2	6	852099	852104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944109
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19081	NC_020411	ACA	2	6	852341	852346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452944109
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19089	NC_020411	AAG	2	6	852898	852903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452944110
19090	NC_020411	T	6	6	852911	852916	0 %	100 %	0 %	0 %	452944110
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19093	NC_020411	T	6	6	852998	853003	0 %	100 %	0 %	0 %	452944110
19094	NC_020411	CAT	2	6	853042	853047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944110
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19096	NC_020411	T	8	8	853066	853073	0 %	100 %	0 %	0 %	452944110
19097	NC_020411	TA	3	6	853177	853182	50 %	50 %	0 %	0 %	452944110
19098	NC_020411	TGG	2	6	853205	853210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452944110
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19100	NC_020411	AT	3	6	853273	853278	50 %	50 %	0 %	0 %	452944111
19101	NC_020411	A	6	6	853283	853288	100 %	0 %	0 %	0 %	452944111
19102	NC_020411	CTA	2	6	853293	853298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944111
19103	NC_020411	CTTT	2	8	853321	853328	0 %	75 %	0 %	25 %	452944111
19104	NC_020411	AGA	2	6	853348	853353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452944111
19105	NC_020411	CCA	2	6	853361	853366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452944111
19106	NC_020411	ATC	2	6	853379	853384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944111
19107	NC_020411	AGCGC	2	10	853433	853442	20 %	0 %	40 %	40 %	452944111
19108	NC_020411	A	6	6	853454	853459	100 %	0 %	0 %	0 %	452944111
19109	NC_020411	T	6	6	853469	853474	0 %	100 %	0 %	0 %	452944111
19110	NC_020411	ATC	2	6	853495	853500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944111
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19112	NC_020411	GCA	2	6	853658	853663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452944111
19113	NC_020411	A	6	6	853721	853726	100 %	0 %	0 %	0 %	452944111
19114	NC_020411	ACC	2	6	853738	853743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452944111
19115	NC_020411	AGGCA	2	10	853777	853786	40 %	0 %	40 %	20 %	452944111
19116	NC_020411	TGT	2	6	853852	853857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452944111
19117	NC_020411	TTA	2	6	853905	853910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452944111
19118	NC_020411	ACC	2	6	853939	853944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452944111
19119	NC_020411	CAAA	2	8	853947	853954	75 %	0 %	0 %	25 %	452944111
19120	NC_020411	A	7	7	853959	853965	100 %	0 %	0 %	0 %	452944111
19121	NC_020411	T	6	6	853986	853991	0 %	100 %	0 %	0 %	452944111
19122	NC_020411	A	6	6	854022	854027	100 %	0 %	0 %	0 %	452944112
19123	NC_020411	AT	3	6	854060	854065	50 %	50 %	0 %	0 %	452944112
19124	NC_020411	AAG	2	6	854102	854107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452944112
19125	NC_020411	CTTTAT	2	12	854138	854149	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452944112
19126	NC_020411	T	6	6	854175	854180	0 %	100 %	0 %	0 %	452944112
19127	NC_020411	T	6	6	854241	854246	0 %	100 %	0 %	0 %	452944112
19128	NC_020411	T	6	6	854255	854260	0 %	100 %	0 %	0 %	452944112
19129	NC_020411	AGAA	2	8	854266	854273	75 %	0 %	25 %	0 %	452944112
19130	NC_020411	TA	4	8	854280	854287	50 %	50 %	0 %	0 %	452944112
19131	NC_020411	TCT	2	6	854325	854330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452944112
19132	NC_020411	AT	4	8	854334	854341	50 %	50 %	0 %	0 %	452944112
19133	NC_020411	TA	3	6	854370	854375	50 %	50 %	0 %	0 %	452944112
19134	NC_020411	TCT	3	9	854416	854424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452944112
19135	NC_020411	GGT	2	6	854427	854432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452944112
19136	NC_020411	ATG	2	6	854461	854466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944112
19137	NC_020411	TA	3	6	854520	854525	50 %	50 %	0 %	0 %	452944112
19138	NC_020411	GC	3	6	854597	854602	0 %	0 %	50 %	50 %	452944112
19139	NC_020411	TTG	2	6	854773	854778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452944112
19140	NC_020411	GTG	2	6	854779	854784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452944112
19141	NC_020411	AAC	2	6	854889	854894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452944112
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19144	NC_020411	ATCCAA	2	12	855125	855136	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452944112
19145	NC_020411	GTT	2	6	855193	855198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452944112
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19147	NC_020411	CAAA	2	8	855290	855297	75 %	0 %	0 %	25 %	452944112
19148	NC_020411	ACGT	2	8	855298	855305	25 %	25 %	25 %	25 %	452944112
19149	NC_020411	A	9	9	855402	855410	100 %	0 %	0 %	0 %	452944112
19150	NC_020411	CTA	2	6	855464	855469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944112
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19153	NC_020411	TTG	2	6	855550	855555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452944112
19154	NC_020411	AG	3	6	855589	855594	50 %	0 %	50 %	0 %	452944112
19155	NC_020411	AAGT	2	8	855625	855632	50 %	25 %	25 %	0 %	452944112
19156	NC_020411	CAT	2	6	855699	855704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944112
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19159	NC_020411	TAA	2	6	855757	855762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452944112
19160	NC_020411	CAA	2	6	855819	855824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452944112
19161	NC_020411	ACA	2	6	855909	855914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452944113
19162	NC_020411	GCT	2	6	855932	855937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452944113
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19164	NC_020411	ATT	2	6	855957	855962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452944113
19165	NC_020411	TAT	2	6	855983	855988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452944113
19166	NC_020411	ACT	2	6	855993	855998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944113
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19168	NC_020411	A	6	6	856020	856025	100 %	0 %	0 %	0 %	452944113
19169	NC_020411	ATA	2	6	856029	856034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452944113
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19172	NC_020411	TAA	2	6	856143	856148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452944114
19173	NC_020411	AT	3	6	856176	856181	50 %	50 %	0 %	0 %	452944114
19174	NC_020411	CTA	2	6	856278	856283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944114
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19179	NC_020411	AT	3	6	856377	856382	50 %	50 %	0 %	0 %	452944114
19180	NC_020411	TCT	2	6	856415	856420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452944114
19181	NC_020411	TCT	2	6	856493	856498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452944114
19182	NC_020411	TAG	2	6	856521	856526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944114
19183	NC_020411	GAAT	2	8	856602	856609	50 %	25 %	25 %	0 %	452944114
19184	NC_020411	ATATCC	2	12	856610	856621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944114
19185	NC_020411	CCAGGA	2	12	856661	856672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452944114
19186	NC_020411	TGT	2	6	856684	856689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452944114
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19188	NC_020411	ACC	2	6	856711	856716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452944114
19189	NC_020411	TA	3	6	856726	856731	50 %	50 %	0 %	0 %	452944114
19190	NC_020411	AT	3	6	856771	856776	50 %	50 %	0 %	0 %	452944114
19191	NC_020411	TTC	2	6	856808	856813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452944115
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19194	NC_020411	CCT	2	6	857027	857032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19195	NC_020411	TTA	2	6	857044	857049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19196	NC_020411	ACC	2	6	857192	857197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452944116
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19199	NC_020411	CTG	2	6	857299	857304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452944116
19200	NC_020411	CTT	2	6	857308	857313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452944116
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19205	NC_020411	CTG	2	6	857704	857709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452944116
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19211	NC_020411	CTT	2	6	857902	857907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452944116
19212	NC_020411	CCT	2	6	857969	857974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19213	NC_020411	CTTC	2	8	858063	858070	0 %	50 %	0 %	50 %	452944117
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19217	NC_020411	CAC	2	6	858259	858264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452944117
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19222	NC_020411	ATC	2	6	858476	858481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944117
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19225	NC_020411	CAAA	2	8	858604	858611	75 %	0 %	0 %	25 %	452944117
19226	NC_020411	AG	3	6	858635	858640	50 %	0 %	50 %	0 %	452944117
19227	NC_020411	ATG	2	6	858693	858698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944117
19228	NC_020411	CTC	2	6	858722	858727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452944117
19229	NC_020411	ACC	2	6	858737	858742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452944117
19230	NC_020411	ATCT	2	8	858778	858785	25 %	50 %	0 %	25 %	452944117
19231	NC_020411	ACT	2	6	858849	858854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944117
19232	NC_020411	TCA	2	6	858924	858929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944117
19233	NC_020411	ACC	2	6	858990	858995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452944117
19234	NC_020411	GCT	2	6	859020	859025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452944117
19235	NC_020411	CTT	2	6	859033	859038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452944117
19236	NC_020411	AGC	2	6	859049	859054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452944117
19237	NC_020411	ATTTTG	2	12	859170	859181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19238	NC_020411	TA	3	6	859227	859232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19239	NC_020411	ATT	2	6	859247	859252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19240	NC_020411	T	7	7	859255	859261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19241	NC_020411	T	6	6	859341	859346	0 %	100 %	0 %	0 %	452944118
19242	NC_020411	ATC	2	6	859469	859474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944118
19243	NC_020411	CCT	2	6	859548	859553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452944118
19244	NC_020411	TAA	3	9	859616	859624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452944118
19245	NC_020411	TCA	2	6	859654	859659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944118
19246	NC_020411	ATT	2	6	859690	859695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452944119
19247	NC_020411	T	6	6	859694	859699	0 %	100 %	0 %	0 %	452944119
19248	NC_020411	TAA	2	6	859797	859802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452944119
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19250	NC_020411	TAA	2	6	859908	859913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452944119
19251	NC_020411	GTA	2	6	859916	859921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944119
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19255	NC_020411	T	6	6	860107	860112	0 %	100 %	0 %	0 %	452944119
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19266	NC_020411	TCTT	2	8	860653	860660	0 %	75 %	0 %	25 %	452944120
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19276	NC_020411	TTG	2	6	861079	861084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452944120
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19281	NC_020411	TGAT	2	8	861383	861390	25 %	50 %	25 %	0 %	452944120
19282	NC_020411	ATA	2	6	861416	861421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452944120
19283	NC_020411	TA	3	6	861429	861434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19284	NC_020411	CCA	2	6	861483	861488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452944121
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19311	NC_020411	TAA	2	6	862990	862995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452944122
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19314	NC_020411	T	7	7	863156	863162	0 %	100 %	0 %	0 %	452944122
19315	NC_020411	ATC	2	6	863172	863177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944122
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19318	NC_020411	TATCAA	2	12	863311	863322	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452944122
19319	NC_020411	ATA	2	6	863491	863496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452944123
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19324	NC_020411	TA	3	6	863658	863663	50 %	50 %	0 %	0 %	452944123
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19329	NC_020411	AT	3	6	863957	863962	50 %	50 %	0 %	0 %	452944123
19330	NC_020411	A	6	6	864049	864054	100 %	0 %	0 %	0 %	452944123
19331	NC_020411	T	7	7	864089	864095	0 %	100 %	0 %	0 %	452944123
19332	NC_020411	CA	3	6	864173	864178	50 %	0 %	0 %	50 %	452944123
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19337	NC_020411	CTC	3	9	864272	864280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452944123
19338	NC_020411	TCT	2	6	864288	864293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452944123
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19340	NC_020411	TGA	2	6	864352	864357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944123
19341	NC_020411	TTTTG	2	10	864413	864422	0 %	80 %	20 %	0 %	452944123
19342	NC_020411	AAAG	2	8	864430	864437	75 %	0 %	25 %	0 %	452944123
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19348	NC_020411	ATC	2	6	864729	864734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452944124
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19350	NC_020411	A	7	7	864812	864818	100 %	0 %	0 %	0 %	452944124
19351	NC_020411	CCA	2	6	864886	864891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452944124
19352	NC_020411	TG	3	6	864907	864912	0 %	50 %	50 %	0 %	452944124
19353	NC_020411	TAT	2	6	864914	864919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452944124
19354	NC_020411	TAT	2	6	864972	864977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19355	NC_020411	ATA	2	6	864978	864983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19356	NC_020411	AG	3	6	864995	865000	50 %	0 %	50 %	0 %	452944125
19357	NC_020411	T	6	6	865017	865022	0 %	100 %	0 %	0 %	452944125
19358	NC_020411	TA	4	8	865127	865134	50 %	50 %	0 %	0 %	452944125
19359	NC_020411	ATG	2	6	865193	865198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944125
19360	NC_020411	T	6	6	865375	865380	0 %	100 %	0 %	0 %	452944125
19361	NC_020411	GAT	3	9	865481	865489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452944125
19362	NC_020411	TTAG	2	8	865499	865506	25 %	50 %	25 %	0 %	452944125
19363	NC_020411	CAA	2	6	865532	865537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452944125
19364	NC_020411	A	6	6	865547	865552	100 %	0 %	0 %	0 %	452944125
19365	NC_020411	CTTT	2	8	865558	865565	0 %	75 %	0 %	25 %	452944125
19366	NC_020411	ACG	2	6	865566	865571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452944125
19367	NC_020411	AGA	2	6	865604	865609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452944125
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19493	NC_020411	GTT	2	6	871421	871426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452944132
19494	NC_020411	ACA	2	6	871429	871434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452944132
19495	NC_020411	TCT	2	6	871445	871450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452944132
19496	NC_020411	TCT	2	6	871466	871471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452944132
19497	NC_020411	TAA	2	6	871630	871635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452944132
19498	NC_020411	AACTA	2	10	871756	871765	60 %	20 %	0 %	20 %	452944132
19499	NC_020411	T	7	7	871822	871828	0 %	100 %	0 %	0 %	452944132
19500	NC_020411	AAGA	2	8	871849	871856	75 %	0 %	25 %	0 %	452944132

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