MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halovivax ruber XH-70

Total Repeats: 83712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_019964	CT	3	6	226313	226318	0 %	50 %	0 %	50 %	433637221
6003	NC_019964	GCA	2	6	226369	226374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637221
6004	NC_019964	CGT	2	6	226405	226410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637221
6005	NC_019964	CGG	2	6	226417	226422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637221
6006	NC_019964	CGA	2	6	226429	226434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637221
6007	NC_019964	CCGT	2	8	226470	226477	0 %	25 %	25 %	50 %	433637221
6008	NC_019964	CGT	2	6	226508	226513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637221
6009	NC_019964	GTC	2	6	226572	226577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637221
6010	NC_019964	CGTC	2	8	226591	226598	0 %	25 %	25 %	50 %	433637221
6011	NC_019964	CGA	2	6	226609	226614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637221
6012	NC_019964	GAC	2	6	226637	226642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637221
6013	NC_019964	CACG	2	8	226655	226662	25 %	0 %	25 %	50 %	433637221
6014	NC_019964	TCG	2	6	226704	226709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637221
6015	NC_019964	GGAC	2	8	226732	226739	25 %	0 %	50 %	25 %	433637221
6016	NC_019964	CGA	2	6	226771	226776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637221
6017	NC_019964	TCG	2	6	226833	226838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637221
6018	NC_019964	GCC	2	6	226844	226849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637221
6019	NC_019964	ACT	2	6	227032	227037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_019964	TGG	2	6	227065	227070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_019964	GTT	2	6	227118	227123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_019964	CGG	2	6	227159	227164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_019964	AC	4	8	227206	227213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_019964	CGG	2	6	227316	227321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637222
6025	NC_019964	CCTCG	2	10	227377	227386	0 %	20 %	20 %	60 %	433637222
6026	NC_019964	CGA	2	6	227425	227430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637222
6027	NC_019964	CTCGC	2	10	227504	227513	0 %	20 %	20 %	60 %	433637222
6028	NC_019964	GGC	2	6	227519	227524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637222
6029	NC_019964	CGG	2	6	227565	227570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637222
6030	NC_019964	CGAC	2	8	227596	227603	25 %	0 %	25 %	50 %	433637222
6031	NC_019964	TCG	2	6	227604	227609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637222
6032	NC_019964	CGCC	2	8	227659	227666	0 %	0 %	25 %	75 %	433637222
6033	NC_019964	TCG	2	6	227688	227693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637222
6034	NC_019964	GACG	2	8	227698	227705	25 %	0 %	50 %	25 %	433637222
6035	NC_019964	CGA	2	6	227728	227733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637222
6036	NC_019964	CGA	2	6	227763	227768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637222
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6038	NC_019964	TCG	2	6	227898	227903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637222
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6042	NC_019964	GGA	2	6	227983	227988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637222
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6050	NC_019964	GAC	2	6	228254	228259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637222
6051	NC_019964	CGA	2	6	228274	228279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637222
6052	NC_019964	CGG	2	6	228310	228315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637222
6053	NC_019964	CGA	2	6	228436	228441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637222
6054	NC_019964	GCGG	2	8	228497	228504	0 %	0 %	75 %	25 %	433637222
6055	NC_019964	TCG	2	6	228555	228560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_019964	TCG	2	6	228584	228589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_019964	TCG	2	6	228808	228813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637223
6058	NC_019964	CGG	2	6	228908	228913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637223
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6061	NC_019964	TCG	2	6	228949	228954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637223
6062	NC_019964	GGTC	2	8	228976	228983	0 %	25 %	50 %	25 %	433637223
6063	NC_019964	CGT	2	6	228995	229000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637223
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6065	NC_019964	CTACGC	2	12	229070	229081	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433637223
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6073	NC_019964	GGCC	2	8	229277	229284	0 %	0 %	50 %	50 %	433637223
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6093	NC_019964	TCT	2	6	230111	230116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_019964	CGA	2	6	230129	230134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_019964	GAG	2	6	230139	230144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_019964	CCT	2	6	230163	230168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_019964	CGGC	2	8	230177	230184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_019964	AGCG	2	8	230196	230203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6099	NC_019964	CG	3	6	230239	230244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_019964	GCC	2	6	230282	230287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_019964	ATA	2	6	230376	230381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_019964	TTG	2	6	230386	230391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_019964	CTCG	2	8	230459	230466	0 %	25 %	25 %	50 %	433637224
6104	NC_019964	CCG	2	6	230485	230490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637224
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6106	NC_019964	GAAG	2	8	230588	230595	50 %	0 %	50 %	0 %	433637224
6107	NC_019964	ACG	2	6	230602	230607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637224
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6109	NC_019964	CGT	2	6	230644	230649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637224
6110	NC_019964	CGTC	2	8	230653	230660	0 %	25 %	25 %	50 %	433637224
6111	NC_019964	ACG	2	6	230698	230703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637224
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6117	NC_019964	CCG	2	6	231195	231200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_019964	CTC	2	6	231216	231221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637225
6119	NC_019964	TCG	3	9	231244	231252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637225
6120	NC_019964	GGC	2	6	231336	231341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637225
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6122	NC_019964	CCT	2	6	231383	231388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637225
6123	NC_019964	CGT	2	6	231389	231394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637225
6124	NC_019964	CGT	3	9	231417	231425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637225
6125	NC_019964	TGC	2	6	231434	231439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637225
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6127	NC_019964	TCG	2	6	231473	231478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637225
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6132	NC_019964	GTC	2	6	231637	231642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637225
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6142	NC_019964	GTC	2	6	231915	231920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637225
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6151	NC_019964	GTC	2	6	232239	232244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637225
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6213	NC_019964	TCGA	2	8	234431	234438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6214	NC_019964	CTG	2	6	234450	234455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6216	NC_019964	CCT	2	6	234489	234494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637228
6217	NC_019964	CGT	2	6	234500	234505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637228
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6219	NC_019964	CAG	3	9	234575	234583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
6220	NC_019964	GAG	2	6	234596	234601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637228
6221	NC_019964	CGA	2	6	234607	234612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
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6223	NC_019964	CGA	3	9	234649	234657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
6224	NC_019964	CGC	2	6	234679	234684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637228
6225	NC_019964	AG	3	6	234689	234694	50 %	0 %	50 %	0 %	433637228
6226	NC_019964	CGAG	2	8	234727	234734	25 %	0 %	50 %	25 %	433637228
6227	NC_019964	CAG	2	6	234738	234743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
6228	NC_019964	CGA	2	6	234787	234792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
6229	NC_019964	CGA	2	6	234808	234813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
6230	NC_019964	ACG	2	6	234825	234830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
6231	NC_019964	GTG	2	6	234865	234870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637228
6232	NC_019964	CGGC	2	8	234882	234889	0 %	0 %	50 %	50 %	433637228
6233	NC_019964	GACGC	2	10	234890	234899	20 %	0 %	40 %	40 %	433637228
6234	NC_019964	CGC	2	6	235090	235095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637228
6235	NC_019964	ATC	2	6	235167	235172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637228
6236	NC_019964	GCC	2	6	235235	235240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637228
6237	NC_019964	GGC	2	6	235241	235246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637228
6238	NC_019964	GAC	3	9	235382	235390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
6239	NC_019964	CTC	2	6	235430	235435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637228
6240	NC_019964	GAC	3	9	235436	235444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637228
6241	NC_019964	GCC	2	6	235448	235453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637228
6242	NC_019964	CCGT	2	8	235461	235468	0 %	25 %	25 %	50 %	433637228
6243	NC_019964	AGG	2	6	235506	235511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637228
6244	NC_019964	CTG	2	6	235559	235564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637228
6245	NC_019964	CGTC	2	8	235605	235612	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6246	NC_019964	TCA	2	6	235652	235657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6247	NC_019964	TCCGA	2	10	235660	235669	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6248	NC_019964	ATCG	2	8	235671	235678	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6249	NC_019964	GCCA	2	8	235719	235726	25 %	0 %	25 %	50 %	433637229
6250	NC_019964	CCCG	2	8	235760	235767	0 %	0 %	25 %	75 %	433637229
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6255	NC_019964	GTA	2	6	236094	236099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637229
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6262	NC_019964	CGG	2	6	236420	236425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637229
6263	NC_019964	CGGCGA	2	12	236468	236479	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6264	NC_019964	TCGA	2	8	236626	236633	25 %	25 %	25 %	25 %	433637230
6265	NC_019964	CGTC	2	8	236640	236647	0 %	25 %	25 %	50 %	433637230
6266	NC_019964	TTG	2	6	236732	236737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433637230
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6268	NC_019964	GGTC	2	8	236766	236773	0 %	25 %	50 %	25 %	433637230
6269	NC_019964	TCG	2	6	236774	236779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637230
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6282	NC_019964	GT	3	6	237236	237241	0 %	50 %	50 %	0 %	433637230
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6296	NC_019964	TCG	2	6	237728	237733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637230
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6299	NC_019964	CGG	2	6	238017	238022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6300	NC_019964	AC	3	6	238043	238048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6301	NC_019964	CGGTC	2	10	238076	238085	0 %	20 %	40 %	40 %	433637231
6302	NC_019964	CGT	2	6	238120	238125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637231
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6307	NC_019964	CGGC	2	8	238294	238301	0 %	0 %	50 %	50 %	433637231
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6322	NC_019964	TCGC	2	8	238837	238844	0 %	25 %	25 %	50 %	433637231
6323	NC_019964	GAT	2	6	238850	238855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637231
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6335	NC_019964	TCG	2	6	239234	239239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637231
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6340	NC_019964	CAG	2	6	239441	239446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6341	NC_019964	GTGG	2	8	239511	239518	0 %	25 %	75 %	0 %	433637232
6342	NC_019964	GGA	2	6	239525	239530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637232
6343	NC_019964	TCT	2	6	239635	239640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433637233
6344	NC_019964	TTG	2	6	239655	239660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433637233
6345	NC_019964	CGG	2	6	239688	239693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637233
6346	NC_019964	ACGT	2	8	239726	239733	25 %	25 %	25 %	25 %	433637233
6347	NC_019964	AAG	2	6	239777	239782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637233
6348	NC_019964	CA	3	6	239803	239808	50 %	0 %	0 %	50 %	433637233
6349	NC_019964	AGG	2	6	239886	239891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637233
6350	NC_019964	GATG	2	8	239908	239915	25 %	25 %	50 %	0 %	433637233
6351	NC_019964	CGG	2	6	239934	239939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637233
6352	NC_019964	GTC	2	6	240078	240083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6353	NC_019964	GTT	2	6	240131	240136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6354	NC_019964	TCCG	2	8	240154	240161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6355	NC_019964	GCC	2	6	240210	240215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637234
6356	NC_019964	GTC	2	6	240232	240237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
6357	NC_019964	CG	3	6	240289	240294	0 %	0 %	50 %	50 %	433637234
6358	NC_019964	TCG	2	6	240307	240312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
6359	NC_019964	CGA	2	6	240323	240328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637234
6360	NC_019964	CGAG	3	12	240342	240353	25 %	0 %	50 %	25 %	433637234
6361	NC_019964	CGT	2	6	240431	240436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
6362	NC_019964	TCG	2	6	240457	240462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
6363	NC_019964	GAT	2	6	240525	240530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637234
6364	NC_019964	TCG	2	6	240568	240573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
6365	NC_019964	GCC	2	6	240585	240590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637234
6366	NC_019964	CGG	2	6	240713	240718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637234
6367	NC_019964	TG	3	6	240734	240739	0 %	50 %	50 %	0 %	433637234
6368	NC_019964	GAC	2	6	240744	240749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637234
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6376	NC_019964	TCG	2	6	241180	241185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
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6378	NC_019964	CGT	2	6	241217	241222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
6379	NC_019964	CGA	2	6	241238	241243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637234
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6384	NC_019964	CGG	2	6	241412	241417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637234
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6392	NC_019964	TCG	2	6	241645	241650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
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6395	NC_019964	CGA	2	6	241766	241771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637234
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6397	NC_019964	GTCG	2	8	241824	241831	0 %	25 %	50 %	25 %	433637234
6398	NC_019964	GCC	2	6	241897	241902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637234
6399	NC_019964	TTCGA	2	10	241959	241968	20 %	40 %	20 %	20 %	433637234
6400	NC_019964	GCG	2	6	241971	241976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637234
6401	NC_019964	TC	3	6	242063	242068	0 %	50 %	0 %	50 %	433637234
6402	NC_019964	CCG	2	6	242092	242097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637234
6403	NC_019964	GTC	2	6	242100	242105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637234
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6406	NC_019964	ACG	2	6	242375	242380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6407	NC_019964	ACT	2	6	242419	242424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6412	NC_019964	CGC	2	6	242595	242600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637235
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6452	NC_019964	CCG	2	6	244402	244407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637237
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6481	NC_019964	CG	3	6	245327	245332	0 %	0 %	50 %	50 %	433637237
6482	NC_019964	CGA	2	6	245425	245430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637237
6483	NC_019964	ACG	2	6	245518	245523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637237
6484	NC_019964	CGCC	2	8	245569	245576	0 %	0 %	25 %	75 %	433637237
6485	NC_019964	CGAC	2	8	245659	245666	25 %	0 %	25 %	50 %	433637237
6486	NC_019964	GGC	2	6	245701	245706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637237
6487	NC_019964	GCCG	2	8	245714	245721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6488	NC_019964	CGA	2	6	245948	245953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637238
6489	NC_019964	GTC	2	6	245958	245963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637238
6490	NC_019964	TCGGCG	2	12	245971	245982	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433637238
6491	NC_019964	CGG	2	6	246007	246012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637238
6492	NC_019964	CGA	2	6	246043	246048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637238
6493	NC_019964	CG	3	6	246049	246054	0 %	0 %	50 %	50 %	433637238
6494	NC_019964	CGT	2	6	246128	246133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637238
6495	NC_019964	CGGG	2	8	246139	246146	0 %	0 %	75 %	25 %	433637238
6496	NC_019964	CGA	2	6	246178	246183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637238
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6498	NC_019964	ACG	2	6	246291	246296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637238
6499	NC_019964	CG	3	6	246295	246300	0 %	0 %	50 %	50 %	433637238
6500	NC_019964	GAA	2	6	246323	246328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637238

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