MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 10238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019779	TTGA	2	8	783	790	25 %	50 %	25 %	0 %	428774688
2	NC_019779	TCAT	2	8	1208	1215	25 %	50 %	0 %	25 %	428774689
3	NC_019779	CGCC	2	8	1402	1409	0 %	0 %	25 %	75 %	428774689
4	NC_019779	TTCG	2	8	1500	1507	0 %	50 %	25 %	25 %	428774689
5	NC_019779	GAAA	2	8	1527	1534	75 %	0 %	25 %	0 %	428774689
6	NC_019779	AAGT	2	8	1555	1562	50 %	25 %	25 %	0 %	428774689
7	NC_019779	TAAT	2	8	2739	2746	50 %	50 %	0 %	0 %	428774690
8	NC_019779	TCAA	2	8	3465	3472	50 %	25 %	0 %	25 %	428774690
9	NC_019779	TCCA	2	8	3700	3707	25 %	25 %	0 %	50 %	428774691
10	NC_019779	TGGG	2	8	3800	3807	0 %	25 %	75 %	0 %	428774691
11	NC_019779	AAAT	2	8	4066	4073	75 %	25 %	0 %	0 %	428774691
12	NC_019779	TTCA	2	8	4630	4637	25 %	50 %	0 %	25 %	428774691
13	NC_019779	GTTG	2	8	4811	4818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019779	AAGC	2	8	5049	5056	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019779	AATG	2	8	5103	5110	50 %	25 %	25 %	0 %	428774692
16	NC_019779	GTCC	2	8	5704	5711	0 %	25 %	25 %	50 %	428774692
17	NC_019779	GGCG	2	8	6226	6233	0 %	0 %	75 %	25 %	428774692
18	NC_019779	GTTC	2	8	6651	6658	0 %	50 %	25 %	25 %	428774693
19	NC_019779	TCAT	2	8	6827	6834	25 %	50 %	0 %	25 %	428774693
20	NC_019779	CTTC	2	8	7121	7128	0 %	50 %	0 %	50 %	428774693
21	NC_019779	ATCG	2	8	7213	7220	25 %	25 %	25 %	25 %	428774693
22	NC_019779	GTTT	2	8	7391	7398	0 %	75 %	25 %	0 %	428774693
23	NC_019779	CCGT	2	8	7497	7504	0 %	25 %	25 %	50 %	428774693
24	NC_019779	CGAA	2	8	7591	7598	50 %	0 %	25 %	25 %	428774693
25	NC_019779	GTTT	2	8	7877	7884	0 %	75 %	25 %	0 %	428774693
26	NC_019779	CCGC	2	8	8168	8175	0 %	0 %	25 %	75 %	428774693
27	NC_019779	CTTT	2	8	8759	8766	0 %	75 %	0 %	25 %	428774693
28	NC_019779	GAGT	2	8	8904	8911	25 %	25 %	50 %	0 %	428774693
29	NC_019779	ATCA	2	8	9071	9078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019779	CGAT	2	8	9461	9468	25 %	25 %	25 %	25 %	428774694
31	NC_019779	GTTT	2	8	10063	10070	0 %	75 %	25 %	0 %	428774694
32	NC_019779	CTCA	2	8	10448	10455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019779	GAAT	2	8	10714	10721	50 %	25 %	25 %	0 %	428774695
34	NC_019779	TGCG	2	8	10942	10949	0 %	25 %	50 %	25 %	428774695
35	NC_019779	GCCT	2	8	11533	11540	0 %	25 %	25 %	50 %	428774696
36	NC_019779	GATT	2	8	11613	11620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019779	AAGC	2	8	11679	11686	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019779	CGTT	2	8	11808	11815	0 %	50 %	25 %	25 %	428774697
39	NC_019779	TTAG	2	8	11886	11893	25 %	50 %	25 %	0 %	428774697
40	NC_019779	TCCA	2	8	11965	11972	25 %	25 %	0 %	50 %	428774697
41	NC_019779	AATT	2	8	12041	12048	50 %	50 %	0 %	0 %	428774697
42	NC_019779	AATT	2	8	12646	12653	50 %	50 %	0 %	0 %	428774697
43	NC_019779	TTTA	2	8	12656	12663	25 %	75 %	0 %	0 %	428774697
44	NC_019779	AATA	2	8	13624	13631	75 %	25 %	0 %	0 %	428774697
45	NC_019779	AGCA	2	8	13645	13652	50 %	0 %	25 %	25 %	428774697
46	NC_019779	CAAT	2	8	13689	13696	50 %	25 %	0 %	25 %	428774697
47	NC_019779	GATT	2	8	13723	13730	25 %	50 %	25 %	0 %	428774697
48	NC_019779	ATTC	2	8	13814	13821	25 %	50 %	0 %	25 %	428774698
49	NC_019779	TAAT	2	8	14155	14162	50 %	50 %	0 %	0 %	428774698
50	NC_019779	TTGG	2	8	14297	14304	0 %	50 %	50 %	0 %	428774698
51	NC_019779	TTCA	2	8	15174	15181	25 %	50 %	0 %	25 %	428774699
52	NC_019779	CAAT	2	8	15197	15204	50 %	25 %	0 %	25 %	428774699
53	NC_019779	CAAC	2	8	15572	15579	50 %	0 %	0 %	50 %	428774699
54	NC_019779	AATC	2	8	15912	15919	50 %	25 %	0 %	25 %	428774699
55	NC_019779	GAAT	2	8	16124	16131	50 %	25 %	25 %	0 %	428774699
56	NC_019779	AAAC	2	8	16404	16411	75 %	0 %	0 %	25 %	428774699
57	NC_019779	TCAA	2	8	16585	16592	50 %	25 %	0 %	25 %	428774700
58	NC_019779	TTGA	2	8	16953	16960	25 %	50 %	25 %	0 %	428774700
59	NC_019779	GCAA	2	8	17074	17081	50 %	0 %	25 %	25 %	428774700
60	NC_019779	AGCA	2	8	17247	17254	50 %	0 %	25 %	25 %	428774700
61	NC_019779	ACCT	2	8	17805	17812	25 %	25 %	0 %	50 %	428774701
62	NC_019779	ATTT	2	8	18171	18178	25 %	75 %	0 %	0 %	428774701
63	NC_019779	CTGG	2	8	18636	18643	0 %	25 %	50 %	25 %	428774702
64	NC_019779	ATTG	2	8	20054	20061	25 %	50 %	25 %	0 %	428774703
65	NC_019779	GAAA	2	8	21062	21069	75 %	0 %	25 %	0 %	428774703
66	NC_019779	GGTT	2	8	21378	21385	0 %	50 %	50 %	0 %	428774703
67	NC_019779	TTGA	2	8	21618	21625	25 %	50 %	25 %	0 %	428774703
68	NC_019779	AAAT	2	8	21781	21788	75 %	25 %	0 %	0 %	428774703
69	NC_019779	GATC	2	8	22100	22107	25 %	25 %	25 %	25 %	428774703
70	NC_019779	TATG	2	8	22184	22191	25 %	50 %	25 %	0 %	428774703
71	NC_019779	ATAG	2	8	22362	22369	50 %	25 %	25 %	0 %	428774703
72	NC_019779	TTTG	2	8	22399	22406	0 %	75 %	25 %	0 %	428774703
73	NC_019779	TGAA	2	8	22585	22592	50 %	25 %	25 %	0 %	428774703
74	NC_019779	GATC	2	8	22661	22668	25 %	25 %	25 %	25 %	428774703
75	NC_019779	TAAT	2	8	22699	22706	50 %	50 %	0 %	0 %	428774703
76	NC_019779	CAAC	2	8	23639	23646	50 %	0 %	0 %	50 %	428774703
77	NC_019779	TGAA	2	8	23818	23825	50 %	25 %	25 %	0 %	428774703
78	NC_019779	AGTG	2	8	24151	24158	25 %	25 %	50 %	0 %	428774704
79	NC_019779	ATCA	2	8	24640	24647	50 %	25 %	0 %	25 %	428774705
80	NC_019779	AAGC	2	8	24724	24731	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019779	GAAA	2	8	25656	25663	75 %	0 %	25 %	0 %	428774707
82	NC_019779	CCAA	2	8	25859	25866	50 %	0 %	0 %	50 %	428774707
83	NC_019779	AGCC	2	8	25899	25906	25 %	0 %	25 %	50 %	428774707
84	NC_019779	TTCC	2	8	25979	25986	0 %	50 %	0 %	50 %	428774707
85	NC_019779	TTTA	2	8	26260	26267	25 %	75 %	0 %	0 %	428774708
86	NC_019779	TCAT	2	8	27383	27390	25 %	50 %	0 %	25 %	428774709
87	NC_019779	CGAT	2	8	28465	28472	25 %	25 %	25 %	25 %	428774710
88	NC_019779	AGAA	2	8	28678	28685	75 %	0 %	25 %	0 %	428774710
89	NC_019779	AACG	2	8	28692	28699	50 %	0 %	25 %	25 %	428774710
90	NC_019779	ATCG	2	8	29669	29676	25 %	25 %	25 %	25 %	428774710
91	NC_019779	TAAC	2	8	30129	30136	50 %	25 %	0 %	25 %	428774710
92	NC_019779	TTAT	2	8	30479	30486	25 %	75 %	0 %	0 %	428774710
93	NC_019779	GTTT	2	8	30630	30637	0 %	75 %	25 %	0 %	428774710
94	NC_019779	AAGA	2	8	30867	30874	75 %	0 %	25 %	0 %	428774710
95	NC_019779	TTAA	2	8	30935	30942	50 %	50 %	0 %	0 %	428774710
96	NC_019779	AATC	2	8	30943	30950	50 %	25 %	0 %	25 %	428774710
97	NC_019779	CAAA	2	8	31637	31644	75 %	0 %	0 %	25 %	428774712
98	NC_019779	TTAG	2	8	32532	32539	25 %	50 %	25 %	0 %	428774712
99	NC_019779	GTTT	2	8	33038	33045	0 %	75 %	25 %	0 %	428774712
100	NC_019779	CAAT	2	8	33432	33439	50 %	25 %	0 %	25 %	428774713
101	NC_019779	AGAA	2	8	33467	33474	75 %	0 %	25 %	0 %	428774713
102	NC_019779	AGAA	2	8	34283	34290	75 %	0 %	25 %	0 %	428774713
103	NC_019779	CGAT	2	8	35478	35485	25 %	25 %	25 %	25 %	428774713
104	NC_019779	ACTT	2	8	36061	36068	25 %	50 %	0 %	25 %	428774714
105	NC_019779	TAAC	2	8	36992	36999	50 %	25 %	0 %	25 %	428774714
106	NC_019779	CAAT	2	8	37110	37117	50 %	25 %	0 %	25 %	428774714
107	NC_019779	CAAC	2	8	37285	37292	50 %	0 %	0 %	50 %	428774714
108	NC_019779	AAGG	2	8	37394	37401	50 %	0 %	50 %	0 %	428774714
109	NC_019779	TTGT	2	8	37487	37494	0 %	75 %	25 %	0 %	428774714
110	NC_019779	AATT	2	8	38002	38009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019779	AAAT	2	8	38356	38363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019779	TAAA	2	8	38446	38453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019779	GTTT	2	8	39174	39181	0 %	75 %	25 %	0 %	428774715
114	NC_019779	ATTG	2	8	39693	39700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019779	TTAA	2	8	39726	39733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019779	TTTC	2	8	40463	40470	0 %	75 %	0 %	25 %	428774716
117	NC_019779	TCCG	2	8	40992	40999	0 %	25 %	25 %	50 %	428774716
118	NC_019779	AACA	2	8	41747	41754	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019779	TGGT	2	8	41883	41890	0 %	50 %	50 %	0 %	428774718
120	NC_019779	AGCC	2	8	43914	43921	25 %	0 %	25 %	50 %	428774719
121	NC_019779	AAAT	2	8	43938	43945	75 %	25 %	0 %	0 %	428774719
122	NC_019779	ATTA	2	8	44121	44128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019779	TTAC	2	8	44251	44258	25 %	50 %	0 %	25 %	428774720
124	NC_019779	TGAG	2	8	44320	44327	25 %	25 %	50 %	0 %	428774720
125	NC_019779	ATTT	2	8	44352	44359	25 %	75 %	0 %	0 %	428774720
126	NC_019779	TAAT	2	8	44407	44414	50 %	50 %	0 %	0 %	428774720
127	NC_019779	GTTA	2	8	44648	44655	25 %	50 %	25 %	0 %	428774720
128	NC_019779	TTAC	2	8	44938	44945	25 %	50 %	0 %	25 %	428774720
129	NC_019779	CTGA	2	8	45078	45085	25 %	25 %	25 %	25 %	428774720
130	NC_019779	AACA	2	8	45148	45155	75 %	0 %	0 %	25 %	428774720
131	NC_019779	TAAT	2	8	45628	45635	50 %	50 %	0 %	0 %	428774720
132	NC_019779	CTGA	2	8	46220	46227	25 %	25 %	25 %	25 %	428774721
133	NC_019779	AAGC	2	8	46679	46686	50 %	0 %	25 %	25 %	428774722
134	NC_019779	GTCG	2	8	47239	47246	0 %	25 %	50 %	25 %	428774723
135	NC_019779	TTAG	2	8	47388	47395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019779	TCAG	2	8	47655	47662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019779	GGAT	2	8	47682	47689	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019779	TTAA	2	8	48043	48050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019779	AAAT	2	8	48129	48136	75 %	25 %	0 %	0 %	428774724
140	NC_019779	GTTC	2	8	48211	48218	0 %	50 %	25 %	25 %	428774724
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