MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 83922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019779	ATA	2	6	165652	165657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_019779	AGC	2	6	165739	165744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774815
3503	NC_019779	ACCGCA	2	12	165823	165834	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428774815
3504	NC_019779	T	7	7	165867	165873	0 %	100 %	0 %	0 %	428774815
3505	NC_019779	GCT	2	6	165914	165919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774815
3506	NC_019779	TGA	2	6	165940	165945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774815
3507	NC_019779	GAT	2	6	166020	166025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774815
3508	NC_019779	AATCAA	2	12	166039	166050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428774816
3509	NC_019779	TCAG	2	8	166157	166164	25 %	25 %	25 %	25 %	428774816
3510	NC_019779	GAA	2	6	166192	166197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774816
3511	NC_019779	CGT	2	6	166225	166230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774816
3512	NC_019779	CCT	2	6	166265	166270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428774816
3513	NC_019779	AAC	2	6	166314	166319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774816
3514	NC_019779	TGA	2	6	166338	166343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774816
3515	NC_019779	CGCT	2	8	166350	166357	0 %	25 %	25 %	50 %	428774816
3516	NC_019779	TGA	2	6	166371	166376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774816
3517	NC_019779	GAC	2	6	166380	166385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774816
3518	NC_019779	GAA	2	6	166393	166398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774816
3519	NC_019779	AAAT	2	8	166534	166541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_019779	T	6	6	166581	166586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_019779	TAA	2	6	166620	166625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774817
3522	NC_019779	ATT	2	6	166640	166645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774817
3523	NC_019779	TGC	2	6	166670	166675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774817
3524	NC_019779	GAC	2	6	166688	166693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774817
3525	NC_019779	TGT	2	6	166722	166727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774817
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3527	NC_019779	GAT	2	6	166790	166795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774817
3528	NC_019779	TTG	2	6	166869	166874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774817
3529	NC_019779	TGT	2	6	166881	166886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774817
3530	NC_019779	CAT	2	6	166900	166905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774817
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3532	NC_019779	CT	3	6	167171	167176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_019779	AAGA	2	8	167193	167200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_019779	ATT	2	6	167260	167265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_019779	GGA	2	6	167273	167278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_019779	TGT	2	6	167309	167314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774818
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3538	NC_019779	CAC	2	6	167423	167428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774818
3539	NC_019779	GAT	2	6	167502	167507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774818
3540	NC_019779	TCA	2	6	167516	167521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774818
3541	NC_019779	GGAT	2	8	167523	167530	25 %	25 %	50 %	0 %	428774818
3542	NC_019779	GAT	2	6	167615	167620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774818
3543	NC_019779	CT	3	6	167630	167635	0 %	50 %	0 %	50 %	428774818
3544	NC_019779	AGA	2	6	167677	167682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774818
3545	NC_019779	ATT	2	6	167735	167740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774818
3546	NC_019779	TGAT	2	8	167746	167753	25 %	50 %	25 %	0 %	428774818
3547	NC_019779	GAT	2	6	167811	167816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774818
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3550	NC_019779	CTC	2	6	167905	167910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428774818
3551	NC_019779	T	6	6	167961	167966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_019779	CCCTTT	2	12	167979	167990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_019779	TA	3	6	168002	168007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_019779	AAT	2	6	168051	168056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_019779	TC	3	6	168087	168092	0 %	50 %	0 %	50 %	428774819
3556	NC_019779	T	6	6	168097	168102	0 %	100 %	0 %	0 %	428774819
3557	NC_019779	CCTT	2	8	168115	168122	0 %	50 %	0 %	50 %	428774819
3558	NC_019779	ATGGC	2	10	168185	168194	20 %	20 %	40 %	20 %	428774819
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3562	NC_019779	TGT	2	6	168352	168357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774819
3563	NC_019779	TGG	2	6	168385	168390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774819
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3617	NC_019779	T	6	6	170560	170565	0 %	100 %	0 %	0 %	428774820
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3619	NC_019779	ACTG	2	8	170623	170630	25 %	25 %	25 %	25 %	428774820
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