MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 83922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019779	TGAC	2	8	141482	141489	25 %	25 %	25 %	25 %	428774793
3002	NC_019779	ACC	2	6	141563	141568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774793
3003	NC_019779	CTT	2	6	141582	141587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774793
3004	NC_019779	ATT	2	6	141745	141750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774793
3005	NC_019779	TG	3	6	142177	142182	0 %	50 %	50 %	0 %	428774793
3006	NC_019779	TAA	2	6	142291	142296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774793
3007	NC_019779	GCT	2	6	142328	142333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774793
3008	NC_019779	CG	3	6	142392	142397	0 %	0 %	50 %	50 %	428774793
3009	NC_019779	T	6	6	142401	142406	0 %	100 %	0 %	0 %	428774793
3010	NC_019779	AGAT	2	8	142466	142473	50 %	25 %	25 %	0 %	428774793
3011	NC_019779	ATC	2	6	142474	142479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774793
3012	NC_019779	CCA	2	6	142559	142564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774793
3013	NC_019779	CGA	2	6	142614	142619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774793
3014	NC_019779	GTC	2	6	142668	142673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774793
3015	NC_019779	CAG	2	6	142689	142694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774793
3016	NC_019779	C	6	6	142697	142702	0 %	0 %	0 %	100 %	428774793
3017	NC_019779	CTT	2	6	142749	142754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774793
3018	NC_019779	GCT	3	9	142791	142799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774793
3019	NC_019779	GGT	2	6	142810	142815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774793
3020	NC_019779	TAA	2	6	142854	142859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774793
3021	NC_019779	AGG	2	6	142949	142954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774793
3022	NC_019779	AAC	2	6	143054	143059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774793
3023	NC_019779	C	7	7	143157	143163	0 %	0 %	0 %	100 %	428774793
3024	NC_019779	CAG	2	6	143233	143238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774793
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3027	NC_019779	TGC	2	6	143599	143604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774793
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3029	NC_019779	CTT	2	6	143726	143731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_019779	A	8	8	143775	143782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_019779	AAT	2	6	143809	143814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_019779	TCTCT	2	10	143829	143838	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3033	NC_019779	T	6	6	143845	143850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_019779	TAT	2	6	143868	143873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_019779	TGA	2	6	143876	143881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_019779	GTT	2	6	143886	143891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_019779	CAT	2	6	143965	143970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_019779	TTC	2	6	143992	143997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_019779	AATT	2	8	144008	144015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_019779	TAA	3	9	144043	144051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_019779	CTT	2	6	144248	144253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_019779	TGAC	2	8	144257	144264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_019779	GGTTG	2	10	144282	144291	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_019779	T	6	6	144356	144361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_019779	GAAA	2	8	144417	144424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_019779	CAT	2	6	144480	144485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_019779	TTC	2	6	144529	144534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_019779	ATT	2	6	144594	144599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_019779	CTA	2	6	144658	144663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_019779	CAA	2	6	144728	144733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_019779	CAA	3	9	144762	144770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_019779	TCT	2	6	144805	144810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_019779	ATC	2	6	144880	144885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_019779	TTA	2	6	144921	144926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_019779	AAC	2	6	144995	145000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_019779	AATT	2	8	145009	145016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_019779	TGTT	2	8	145058	145065	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_019779	TGATGT	2	12	145133	145144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_019779	T	6	6	145152	145157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_019779	ATTT	2	8	145216	145223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_019779	GTC	2	6	145225	145230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_019779	A	8	8	145246	145253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_019779	AAT	2	6	145260	145265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_019779	TCG	2	6	145271	145276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3066	NC_019779	AAT	2	6	145318	145323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774794
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3079	NC_019779	TCA	2	6	145942	145947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_019779	CT	4	8	145957	145964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_019779	GA	3	6	146001	146006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_019779	GA	3	6	146037	146042	50 %	0 %	50 %	0 %	428774796
3083	NC_019779	CAG	2	6	146090	146095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774796
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3085	NC_019779	TTAA	2	8	146110	146117	50 %	50 %	0 %	0 %	428774796
3086	NC_019779	GTTG	2	8	146130	146137	0 %	50 %	50 %	0 %	428774796
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3097	NC_019779	ACA	2	6	146766	146771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774796
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3099	NC_019779	TAC	2	6	146822	146827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774796
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3106	NC_019779	TGC	2	6	147191	147196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774796
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3110	NC_019779	CA	3	6	147381	147386	50 %	0 %	0 %	50 %	428774796
3111	NC_019779	TCGC	2	8	147428	147435	0 %	25 %	25 %	50 %	428774796
3112	NC_019779	TTGT	2	8	147569	147576	0 %	75 %	25 %	0 %	428774796
3113	NC_019779	TTA	2	6	147598	147603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774796
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