MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 83922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019779	AAAC	2	8	71389	71396	75 %	0 %	0 %	25 %	428774743
1502	NC_019779	AAG	2	6	71408	71413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774743
1503	NC_019779	AAG	2	6	71432	71437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774743
1504	NC_019779	AGA	2	6	71529	71534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774743
1505	NC_019779	CTC	2	6	71553	71558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428774743
1506	NC_019779	ATCCCT	2	12	71566	71577	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_019779	ATC	2	6	71695	71700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_019779	TGA	2	6	71723	71728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_019779	CTC	2	6	71786	71791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_019779	AAC	2	6	71844	71849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_019779	TGG	2	6	71913	71918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_019779	TGA	2	6	71935	71940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_019779	TCTA	2	8	71976	71983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_019779	GTG	3	9	72014	72022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_019779	CGA	2	6	72032	72037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_019779	TTA	2	6	72074	72079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_019779	AAC	2	6	72121	72126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_019779	CGTT	2	8	72145	72152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_019779	TC	3	6	72186	72191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_019779	CAA	2	6	72212	72217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_019779	TAT	2	6	72277	72282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_019779	GTC	2	6	72306	72311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_019779	AAAC	2	8	72347	72354	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_019779	AAG	2	6	72366	72371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_019779	AAG	2	6	72390	72395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_019779	AAG	2	6	72402	72407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_019779	AAG	2	6	72414	72419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_019779	AAG	2	6	72426	72431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_019779	AGA	2	6	72523	72528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_019779	CTC	2	6	72547	72552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_019779	ATCCCT	2	12	72560	72571	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_019779	ATC	2	6	72689	72694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_019779	TGA	2	6	72717	72722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_019779	CTC	2	6	72779	72784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_019779	AAC	2	6	72837	72842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_019779	TGG	2	6	72906	72911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_019779	TAT	2	6	72941	72946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_019779	AGT	2	6	73006	73011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_019779	AACGC	2	10	73038	73047	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1540	NC_019779	TGTT	2	8	73064	73071	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_019779	GACA	2	8	73111	73118	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_019779	GAG	2	6	73121	73126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_019779	TTG	2	6	73158	73163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_019779	CAA	2	6	73241	73246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_019779	CAAA	2	8	73341	73348	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_019779	TTC	2	6	73446	73451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_019779	GTT	2	6	73462	73467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_019779	AGG	2	6	73577	73582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_019779	GAT	2	6	73637	73642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_019779	TTG	3	9	73653	73661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_019779	CAAG	2	8	73717	73724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_019779	AGT	2	6	73738	73743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_019779	GAA	2	6	73757	73762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_019779	AGA	2	6	73765	73770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_019779	ATT	2	6	73793	73798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_019779	CTTC	2	8	73800	73807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_019779	GAC	3	9	73827	73835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_019779	GAAAAA	2	12	73836	73847	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_019779	AGA	2	6	73870	73875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_019779	CTG	2	6	73972	73977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774744
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1562	NC_019779	TTA	2	6	74043	74048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774744
1563	NC_019779	GGT	2	6	74108	74113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774744
1564	NC_019779	T	6	6	74171	74176	0 %	100 %	0 %	0 %	428774744
1565	NC_019779	ACCA	2	8	74309	74316	50 %	0 %	0 %	50 %	428774744
1566	NC_019779	AGA	2	6	74330	74335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774744
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1569	NC_019779	ACT	2	6	74402	74407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774744
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1573	NC_019779	AAAG	2	8	74540	74547	75 %	0 %	25 %	0 %	428774744
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1580	NC_019779	TAA	2	6	74750	74755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774744
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1583	NC_019779	A	6	6	74956	74961	100 %	0 %	0 %	0 %	428774744
1584	NC_019779	AGT	2	6	75002	75007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774744
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1586	NC_019779	TAT	2	6	75115	75120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1588	NC_019779	AAG	2	6	75204	75209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_019779	AGA	2	6	75349	75354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1593	NC_019779	A	7	7	75511	75517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1602	NC_019779	TCA	2	6	75896	75901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774745
1603	NC_019779	CCA	2	6	75986	75991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774745
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1611	NC_019779	CT	3	6	76232	76237	0 %	50 %	0 %	50 %	428774745
1612	NC_019779	ATG	2	6	76310	76315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774745
1613	NC_019779	TAATTT	2	12	76344	76355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_019779	A	7	7	76369	76375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_019779	TGT	2	6	76507	76512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774746
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1621	NC_019779	CAG	2	6	76809	76814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774746
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1625	NC_019779	CAT	2	6	77076	77081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774746
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