MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 83922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019779	ATTT	2	8	218851	218858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_019779	CAA	2	6	218867	218872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_019779	TGA	2	6	218931	218936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774856
4504	NC_019779	TAT	2	6	218941	218946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774856
4505	NC_019779	TGA	2	6	218976	218981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774856
4506	NC_019779	TGC	2	6	218985	218990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774856
4507	NC_019779	AGA	2	6	219048	219053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774856
4508	NC_019779	A	6	6	219067	219072	100 %	0 %	0 %	0 %	428774856
4509	NC_019779	TCA	2	6	219089	219094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_019779	ATA	2	6	219095	219100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_019779	ATT	2	6	219125	219130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_019779	CTCCCT	2	12	219135	219146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_019779	AACCAC	2	12	219256	219267	50 %	0 %	0 %	50 %	428774857
4514	NC_019779	AGA	2	6	219295	219300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774857
4515	NC_019779	CTTT	2	8	219302	219309	0 %	75 %	0 %	25 %	428774857
4516	NC_019779	TGA	2	6	219349	219354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774857
4517	NC_019779	GTG	2	6	219380	219385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774857
4518	NC_019779	GATT	2	8	219406	219413	25 %	50 %	25 %	0 %	428774857
4519	NC_019779	GAA	2	6	219461	219466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774857
4520	NC_019779	CGG	2	6	219557	219562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428774857
4521	NC_019779	GGA	2	6	219563	219568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774857
4522	NC_019779	ATT	2	6	219641	219646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774857
4523	NC_019779	GAA	2	6	219656	219661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774857
4524	NC_019779	TC	3	6	219857	219862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_019779	CAA	2	6	219920	219925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774858
4526	NC_019779	ATTT	2	8	219986	219993	25 %	75 %	0 %	0 %	428774858
4527	NC_019779	TTG	2	6	220203	220208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774858
4528	NC_019779	GTT	2	6	220241	220246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774859
4529	NC_019779	T	7	7	220302	220308	0 %	100 %	0 %	0 %	428774859
4530	NC_019779	TAA	2	6	220323	220328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774859
4531	NC_019779	CAA	2	6	220335	220340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774859
4532	NC_019779	GTA	2	6	220350	220355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774859
4533	NC_019779	TCG	2	6	220414	220419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774859
4534	NC_019779	TGAG	2	8	220508	220515	25 %	25 %	50 %	0 %	428774859
4535	NC_019779	CTT	2	6	220599	220604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774859
4536	NC_019779	T	6	6	220683	220688	0 %	100 %	0 %	0 %	428774859
4537	NC_019779	CCAT	2	8	220757	220764	25 %	25 %	0 %	50 %	428774859
4538	NC_019779	T	6	6	220803	220808	0 %	100 %	0 %	0 %	428774859
4539	NC_019779	CTT	2	6	220815	220820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774859
4540	NC_019779	GTTT	2	8	221066	221073	0 %	75 %	25 %	0 %	428774859
4541	NC_019779	CGA	2	6	221093	221098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774859
4542	NC_019779	ATA	2	6	221133	221138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_019779	TA	3	6	221155	221160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_019779	A	6	6	221223	221228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_019779	TG	3	6	221230	221235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_019779	TGC	2	6	221239	221244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_019779	TAG	2	6	221259	221264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_019779	CG	3	6	221344	221349	0 %	0 %	50 %	50 %	428774860
4549	NC_019779	TCA	2	6	221388	221393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774860
4550	NC_019779	GAT	2	6	221488	221493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774860
4551	NC_019779	GTGA	2	8	221521	221528	25 %	25 %	50 %	0 %	428774860
4552	NC_019779	TGA	2	6	221532	221537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774860
4553	NC_019779	TTGT	2	8	221688	221695	0 %	75 %	25 %	0 %	428774860
4554	NC_019779	TGG	2	6	221696	221701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774860
4555	NC_019779	GAGG	2	8	221727	221734	25 %	0 %	75 %	0 %	428774860
4556	NC_019779	AAG	2	6	221765	221770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774860
4557	NC_019779	TGA	2	6	221831	221836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774860
4558	NC_019779	TTC	2	6	221856	221861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774860
4559	NC_019779	AGA	2	6	221874	221879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774860
4560	NC_019779	ATT	2	6	221958	221963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774860
4561	NC_019779	TTTG	2	8	221967	221974	0 %	75 %	25 %	0 %	428774860
4562	NC_019779	GAATT	2	10	222011	222020	40 %	40 %	20 %	0 %	428774860
4563	NC_019779	TGG	2	6	222067	222072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774860
4564	NC_019779	CAA	2	6	222078	222083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774860
4565	NC_019779	CGT	2	6	222114	222119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774860
4566	NC_019779	TAG	2	6	222150	222155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774860
4567	NC_019779	AGG	2	6	222270	222275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774860
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4570	NC_019779	TTA	2	6	222595	222600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774860
4571	NC_019779	GAA	2	6	222733	222738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774860
4572	NC_019779	CGT	2	6	222748	222753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774860
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4574	NC_019779	CAG	2	6	222791	222796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774860
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4576	NC_019779	TGA	2	6	222876	222881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774860
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4578	NC_019779	ATT	2	6	223017	223022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774860
4579	NC_019779	ATT	2	6	223058	223063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774860
4580	NC_019779	GCA	2	6	223075	223080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774860
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4582	NC_019779	ATG	2	6	223204	223209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774860
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4584	NC_019779	CTTT	2	8	223267	223274	0 %	75 %	0 %	25 %	428774860
4585	NC_019779	T	7	7	223284	223290	0 %	100 %	0 %	0 %	428774860
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4588	NC_019779	ATG	2	6	223505	223510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774860
4589	NC_019779	T	6	6	223531	223536	0 %	100 %	0 %	0 %	428774860
4590	NC_019779	GCT	2	6	223537	223542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774860
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4593	NC_019779	GAT	2	6	223630	223635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774860
4594	NC_019779	AG	3	6	223636	223641	50 %	0 %	50 %	0 %	428774860
4595	NC_019779	GAT	2	6	223726	223731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774860
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4597	NC_019779	A	6	6	223781	223786	100 %	0 %	0 %	0 %	428774860
4598	NC_019779	TGA	2	6	223794	223799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774860
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4600	NC_019779	CGG	2	6	223823	223828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428774860
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4604	NC_019779	CT	3	6	224038	224043	0 %	50 %	0 %	50 %	428774860
4605	NC_019779	AGA	2	6	224052	224057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774860
4606	NC_019779	T	6	6	224108	224113	0 %	100 %	0 %	0 %	428774860
4607	NC_019779	GA	3	6	224144	224149	50 %	0 %	50 %	0 %	428774860
4608	NC_019779	TC	3	6	224305	224310	0 %	50 %	0 %	50 %	428774860
4609	NC_019779	TGGT	2	8	224345	224352	0 %	50 %	50 %	0 %	428774860
4610	NC_019779	AACCGT	2	12	224400	224411	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428774860
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4612	NC_019779	CAA	2	6	224539	224544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774860
4613	NC_019779	CAT	2	6	224577	224582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774861
4614	NC_019779	A	6	6	224683	224688	100 %	0 %	0 %	0 %	428774861
4615	NC_019779	GTT	2	6	224959	224964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774861
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4617	NC_019779	TAAT	2	8	224992	224999	50 %	50 %	0 %	0 %	428774861
4618	NC_019779	GGCG	2	8	225050	225057	0 %	0 %	75 %	25 %	428774861
4619	NC_019779	CTTG	2	8	225086	225093	0 %	50 %	25 %	25 %	428774861
4620	NC_019779	ATA	2	6	225113	225118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774861
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4622	NC_019779	AGA	2	6	225219	225224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774861
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