MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 plasmid p1HPAKL117

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019561	TC	3	6	3	8	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019561	GC	3	6	682	687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019561	CT	3	6	890	895	0 %	50 %	0 %	50 %	425790161
4	NC_019561	GT	3	6	1493	1498	0 %	50 %	50 %	0 %	425790162
5	NC_019561	AT	3	6	1817	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	425790162
6	NC_019561	TA	3	6	2375	2380	50 %	50 %	0 %	0 %	425790162
7	NC_019561	TG	3	6	3876	3881	0 %	50 %	50 %	0 %	425790164
8	NC_019561	TG	3	6	4290	4295	0 %	50 %	50 %	0 %	425790164
9	NC_019561	TG	3	6	4454	4459	0 %	50 %	50 %	0 %	425790164
10	NC_019561	TA	3	6	4659	4664	50 %	50 %	0 %	0 %	425790164
11	NC_019561	TG	3	6	5214	5219	0 %	50 %	50 %	0 %	425790165
12	NC_019561	GT	3	6	7122	7127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019561	AC	3	6	7478	7483	50 %	0 %	0 %	50 %	425790167
14	NC_019561	TA	3	6	8619	8624	50 %	50 %	0 %	0 %	425790167
15	NC_019561	AC	3	6	8959	8964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019561	GC	3	6	9254	9259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019561	AC	3	6	10014	10019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019561	CT	3	6	10287	10292	0 %	50 %	0 %	50 %	425790168
19	NC_019561	TA	3	6	10337	10342	50 %	50 %	0 %	0 %	425790168
20	NC_019561	AT	3	6	10354	10359	50 %	50 %	0 %	0 %	425790168
21	NC_019561	AC	3	6	10768	10773	50 %	0 %	0 %	50 %	425790168
22	NC_019561	AC	3	6	11082	11087	50 %	0 %	0 %	50 %	425790168
23	NC_019561	AT	3	6	11449	11454	50 %	50 %	0 %	0 %	425790168
24	NC_019561	CA	3	6	12117	12122	50 %	0 %	0 %	50 %	425790169
25	NC_019561	AT	3	6	12559	12564	50 %	50 %	0 %	0 %	425790169
26	NC_019561	TC	3	6	12888	12893	0 %	50 %	0 %	50 %	425790169
27	NC_019561	AG	3	6	13157	13162	50 %	0 %	50 %	0 %	425790169
28	NC_019561	AC	3	6	13417	13422	50 %	0 %	0 %	50 %	425790169
29	NC_019561	TC	3	6	13591	13596	0 %	50 %	0 %	50 %	425790170
30	NC_019561	TC	3	6	14007	14012	0 %	50 %	0 %	50 %	425790170
31	NC_019561	CT	3	6	14017	14022	0 %	50 %	0 %	50 %	425790170
32	NC_019561	TG	3	6	14051	14056	0 %	50 %	50 %	0 %	425790170
33	NC_019561	CT	3	6	14077	14082	0 %	50 %	0 %	50 %	425790170
34	NC_019561	CT	3	6	14227	14232	0 %	50 %	0 %	50 %	425790170
35	NC_019561	TC	3	6	14634	14639	0 %	50 %	0 %	50 %	425790170
36	NC_019561	CT	3	6	14665	14670	0 %	50 %	0 %	50 %	425790170
37	NC_019561	TC	3	6	15259	15264	0 %	50 %	0 %	50 %	425790170
38	NC_019561	TG	3	6	15313	15318	0 %	50 %	50 %	0 %	425790170
39	NC_019561	TG	3	6	15356	15361	0 %	50 %	50 %	0 %	425790170
40	NC_019561	AG	4	8	15467	15474	50 %	0 %	50 %	0 %	425790170
41	NC_019561	AG	3	6	15825	15830	50 %	0 %	50 %	0 %	425790171
42	NC_019561	CA	3	6	16048	16053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019561	GA	4	8	16264	16271	50 %	0 %	50 %	0 %	425790172
44	NC_019561	AG	3	6	16351	16356	50 %	0 %	50 %	0 %	425790172
45	NC_019561	CA	3	6	16560	16565	50 %	0 %	0 %	50 %	425790173
46	NC_019561	AG	3	6	16590	16595	50 %	0 %	50 %	0 %	425790173
47	NC_019561	TA	3	6	16626	16631	50 %	50 %	0 %	0 %	425790173
48	NC_019561	CT	3	6	16802	16807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019561	AT	3	6	16949	16954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019561	AG	3	6	18132	18137	50 %	0 %	50 %	0 %	425790175
51	NC_019561	GA	3	6	18212	18217	50 %	0 %	50 %	0 %	425790175
52	NC_019561	AG	3	6	18450	18455	50 %	0 %	50 %	0 %	425790175
53	NC_019561	AG	3	6	18472	18477	50 %	0 %	50 %	0 %	425790175

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.