MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019560	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	425788642
2	NC_019560	GCGATA	2	12	3726	3737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425788644
3	NC_019560	GAAACC	2	12	7478	7489	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	425788646
4	NC_019560	AAACAC	2	12	18069	18080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019560	AGAAAA	2	12	18419	18430	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788655
6	NC_019560	GATAAA	2	12	21969	21980	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	425788658
7	NC_019560	TTTCTT	2	12	22690	22701	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019560	TTTTAG	2	12	29057	29068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425788663
9	NC_019560	GCGTGG	2	12	30885	30896	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	425788667
10	NC_019560	ATTCTA	2	12	30978	30989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788667
11	NC_019560	TTGAAT	2	12	32075	32086	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425788667
12	NC_019560	TAAGGA	2	12	32374	32385	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	425788667
13	NC_019560	TAGGGG	2	12	33877	33888	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	425788670
14	NC_019560	GTTGTG	2	12	35032	35043	0 %	50 %	50 %	0 %	425788671
15	NC_019560	CAAGCG	2	12	35372	35383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425788671
16	NC_019560	AAAGAA	2	12	35389	35400	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788671
17	NC_019560	AAAGAA	2	12	36953	36964	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788674
18	NC_019560	CAAAAT	2	12	39296	39307	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	425788676
19	NC_019560	CGCAAA	2	12	42983	42994	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	425788679
20	NC_019560	TCTTTG	2	12	48459	48470	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	425788684
21	NC_019560	TGAAAT	2	12	48964	48975	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	425788684
22	NC_019560	TAAAAA	2	12	53525	53536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	425788688
23	NC_019560	AGAAAA	2	12	58355	58366	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788691
24	NC_019560	AAAAGA	2	12	58610	58621	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788691
25	NC_019560	AGAAAA	2	12	58634	58645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788691
26	NC_019560	GAAAAC	2	12	59506	59517	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	425788692
27	NC_019560	GATAAA	2	12	60709	60720	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	425788694
28	NC_019560	GATGTG	2	12	60952	60963	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	425788694
29	NC_019560	CCAACA	2	12	62915	62926	50 %	0 %	0 %	50 %	425788694
30	NC_019560	TTTTGT	2	12	63247	63258	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	425788695
31	NC_019560	AAAGAG	2	12	63525	63536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019560	GAAAAA	2	12	65523	65534	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019560	GGACAA	2	12	67066	67077	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	425788699
34	NC_019560	TATTAA	2	12	67939	67950	50 %	50 %	0 %	0 %	425788700
35	NC_019560	TAAGGG	2	12	78190	78201	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	425788711
36	NC_019560	CGCCCA	2	12	78727	78738	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	425788711
37	NC_019560	GCGCAT	2	12	82307	82318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	425788714
38	NC_019560	AGAAAA	2	12	82504	82515	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788714
39	NC_019560	GGAATG	2	12	82595	82606	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	425788714
40	NC_019560	GGCATG	2	12	82619	82630	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788714
41	NC_019560	ACCCTA	2	12	83412	83423	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	425788714
42	NC_019560	GCAACG	2	12	83637	83648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425788714
43	NC_019560	ATATTG	2	12	84383	84394	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425788715
44	NC_019560	AACAGG	2	12	92285	92296	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	425788721
45	NC_019560	GAAAAA	2	12	94854	94865	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788724
46	NC_019560	AAAGAT	4	24	95486	95509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	425788724
47	NC_019560	ATTAGA	2	12	96596	96607	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	425788725
48	NC_019560	TAGCGA	2	12	97369	97380	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019560	GATTTT	2	12	98353	98364	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425788727
50	NC_019560	AAACTC	2	12	98470	98481	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425788727
51	NC_019560	TCAAAA	2	12	99963	99974	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	425788728
52	NC_019560	GCGGTG	2	12	100663	100674	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	425788729
53	NC_019560	CAATAT	2	12	103873	103884	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788730
54	NC_019560	AGCGTT	2	12	110462	110473	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425788735
55	NC_019560	TTTTCT	2	12	116382	116393	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	425788742
56	NC_019560	CGCTCG	2	12	121402	121413	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	425788747
57	NC_019560	TAGGCA	2	12	123939	123950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425788748
58	NC_019560	TTCTAT	2	12	126283	126294	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425788750
59	NC_019560	TGAATT	2	12	128454	128465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425788751
60	NC_019560	TTTCAA	2	12	128613	128624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788751
61	NC_019560	AGCAAA	2	12	131961	131972	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	425788754
62	NC_019560	GTTTTA	2	12	132973	132984	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019560	TCATGA	2	12	134743	134754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	425788758
64	NC_019560	AAAAAT	2	12	141479	141490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	425788766
65	NC_019560	TTAAAA	2	12	141944	141955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788768
66	NC_019560	TAGCGA	2	12	143884	143895	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425788771
67	NC_019560	TTAGCG	2	12	146776	146787	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425788773
68	NC_019560	TATCGC	2	12	146988	146999	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	425788773
69	NC_019560	TTCAAA	2	12	147306	147317	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788774
70	NC_019560	ATCGCT	2	12	148704	148715	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	425788774
71	NC_019560	CCTAAA	2	12	150927	150938	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425788776
72	NC_019560	TTCTAT	2	12	152095	152106	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425788777
73	NC_019560	TTGTTT	2	12	155083	155094	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	425788782
74	NC_019560	CTTGGG	2	12	155744	155755	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	425788784
75	NC_019560	GAATCT	2	12	157239	157250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	425788786
76	NC_019560	TTGGGT	2	12	160519	160530	0 %	50 %	50 %	0 %	425788789
77	NC_019560	GATTTT	2	12	161031	161042	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425788790
78	NC_019560	AATTGA	2	12	161290	161301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	425788790
79	NC_019560	CTTTCT	2	12	164502	164513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788794
80	NC_019560	CCGCTC	2	12	166210	166221	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	425788797
81	NC_019560	GCTCTC	2	12	168639	168650	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	425788799
82	NC_019560	TAAAAA	2	12	169297	169308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019560	TTCTAA	2	12	170952	170963	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788802
84	NC_019560	TCAATA	2	12	172630	172641	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788804
85	NC_019560	ATCGTT	2	12	173052	173063	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425788804
86	NC_019560	AATTTC	2	12	173398	173409	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788805
87	NC_019560	TAAAAT	2	12	174922	174933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788806
88	NC_019560	TTCTTT	2	12	175332	175343	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	425788806
89	NC_019560	ATTTTG	2	12	176727	176738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425788809
90	NC_019560	CGCTTT	2	12	177205	177216	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	425788809
91	NC_019560	GTTTAA	2	12	177989	178000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425788810
92	NC_019560	CCGCTC	2	12	180641	180652	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	425788813
93	NC_019560	AAAGCA	2	12	181837	181848	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	425788814
94	NC_019560	GAAAAA	2	12	184279	184290	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788816
95	NC_019560	AGGCAT	2	12	184368	184379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425788816
96	NC_019560	GCATTT	2	12	186081	186092	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425788818
97	NC_019560	TCAAAC	2	12	186648	186659	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425788819
98	NC_019560	ATAAAG	2	12	186821	186832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	425788819
99	NC_019560	GTTTTG	2	12	188889	188900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019560	GGTATT	2	12	190611	190622	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	425788821
101	NC_019560	TCTAAA	2	12	190841	190852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788821
102	NC_019560	TGGGCA	2	12	191910	191921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788822
103	NC_019560	TTCTAA	2	12	192389	192400	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788823
104	NC_019560	ATTTTC	2	12	194334	194345	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425788823
105	NC_019560	TGGGGC	2	12	201880	201891	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	425788833
106	NC_019560	AAATCC	2	12	203254	203265	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425788835
107	NC_019560	GGAAAA	2	12	207352	207363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788840
108	NC_019560	ATTCTA	2	12	212767	212778	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788846
109	NC_019560	CATAGC	2	12	214523	214534	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	425788847
110	NC_019560	GTTTTG	2	12	215028	215039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788847
111	NC_019560	TTATTT	2	12	216660	216671	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	425788848
112	NC_019560	TAATTA	2	12	219531	219542	50 %	50 %	0 %	0 %	425788851
113	NC_019560	TTTCAT	2	12	220629	220640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425788852
114	NC_019560	GCTAAA	2	12	223038	223049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	425788855
115	NC_019560	AATGCC	2	12	227420	227431	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	425788859
116	NC_019560	GGATTG	2	12	229708	229719	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	425788860
117	NC_019560	GGTGAT	2	12	231659	231670	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	425788861
118	NC_019560	TCAATA	2	12	232081	232092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788862
119	NC_019560	CACGCC	2	12	232561	232572	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	425788862
120	NC_019560	ATAACT	2	12	232687	232698	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788862
121	NC_019560	GCTTTG	2	12	233793	233804	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	425788863
122	NC_019560	GCTAGG	2	12	235169	235180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788864
123	NC_019560	TGGAGG	2	12	235717	235728	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	425788865
124	NC_019560	TCTTTA	2	12	241479	241490	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425788871
125	NC_019560	GTTTTT	2	12	247067	247078	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	425788878
126	NC_019560	ATTTTA	2	12	248527	248538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019560	ATTGTC	2	12	250227	250238	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425788881
128	NC_019560	TCCCGC	2	12	252423	252434	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	425788883
129	NC_019560	TCCCGC	2	12	253236	253247	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	425788883
130	NC_019560	CAAAGC	2	12	254714	254725	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	425788885
131	NC_019560	TTTAGC	2	12	256469	256480	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425788887
132	NC_019560	AAAGAA	2	12	259577	259588	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788890
133	NC_019560	TGAGCG	2	12	261089	261100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788892
134	NC_019560	GATTTT	2	12	266191	266202	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425788895
135	NC_019560	TGAGCG	2	12	269452	269463	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788898
136	NC_019560	AGCTTT	2	12	269600	269611	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425788898
137	NC_019560	GATTTT	2	12	274138	274149	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425788905
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142	NC_019560	AAATCA	2	12	277041	277052	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	425788909
143	NC_019560	GCGTTA	2	12	278803	278814	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425788910
144	NC_019560	AGCGAG	2	12	288019	288030	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	425788917
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146	NC_019560	TATGGA	2	12	292525	292536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788920
147	NC_019560	ATTTGA	2	12	293412	293423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425788920
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149	NC_019560	TAACAT	2	12	295837	295848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788920
150	NC_019560	ATTTCA	2	12	301695	301706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788924
151	NC_019560	GTAGCG	2	12	303025	303036	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788925
152	NC_019560	TTATCG	2	12	305267	305278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425788926
153	NC_019560	GTTTGT	2	12	305409	305420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788926
154	NC_019560	GGCATG	2	12	307395	307406	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788929
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157	NC_019560	GCTATG	2	12	310941	310952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425788932
158	NC_019560	TTGCGT	2	12	313288	313299	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	425788935
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160	NC_019560	CCAAAA	2	12	320685	320696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425788944
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170	NC_019560	CATGAT	2	12	347169	347180	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	425788975
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173	NC_019560	ATAACC	2	12	353015	353026	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425788980
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204	NC_019560	AAAATA	2	12	423734	423745	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
205	NC_019560	GGCTTT	2	12	425660	425671	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	425789055
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212	NC_019560	CCTAAT	2	12	439647	439658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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214	NC_019560	ACTTTG	2	12	440769	440780	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425789065
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219	NC_019560	TTATCA	2	12	446047	446058	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425789070
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225	NC_019560	TTTTCA	2	12	451313	451324	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425789073
226	NC_019560	GCTAAT	2	12	454413	454424	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	425789078
227	NC_019560	ATTACA	2	12	455995	456006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425789079
228	NC_019560	CTCTTT	2	12	458020	458031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425789080
229	NC_019560	CTCTAA	2	12	459565	459576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425789080
230	NC_019560	AGCTTG	2	12	460447	460458	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425789080
231	NC_019560	TCTTGC	2	12	462353	462364	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	425789080
232	NC_019560	TGGCTC	2	12	464284	464295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425789080
233	NC_019560	CTTTAG	2	12	465913	465924	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425789081
234	NC_019560	CTCATT	2	12	467491	467502	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	425789083
235	NC_019560	TTTCTT	2	12	468026	468037	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	425789083
236	NC_019560	CACTCC	2	12	470473	470484	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	425789086
237	NC_019560	AAGGGA	2	12	470893	470904	50 %	0 %	50 %	0 %	425789086
238	NC_019560	CCACAA	2	12	471454	471465	50 %	0 %	0 %	50 %	425789086
239	NC_019560	TTATTG	2	12	472675	472686	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425789087
240	NC_019560	AGTTTT	2	12	473228	473239	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425789088
241	NC_019560	TAAAAA	2	12	482007	482018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_019560	TTCTTT	2	12	484240	484251	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	425789099
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257	NC_019560	CTACAA	2	12	505560	505571	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425789117
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263	NC_019560	TTTTTA	2	12	516236	516247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	425789128
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346	NC_019560	GAATGC	2	12	659536	659547	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425789257
347	NC_019560	TTAGAA	2	12	659849	659860	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	425789258
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349	NC_019560	CATTGG	2	12	661215	661226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425789259
350	NC_019560	ATTACC	2	12	662179	662190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425789260
351	NC_019560	GAATTT	2	12	663958	663969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425789262
352	NC_019560	ACATTC	2	12	663983	663994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425789262
353	NC_019560	CACCAT	2	12	667613	667624	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	425789265
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389	NC_019560	TATCGC	2	12	731786	731797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	425789321
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452	NC_019560	TGCATA	2	12	869432	869443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	425789456
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461	NC_019560	GGTTCC	2	12	891425	891436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425789475
462	NC_019560	GCGTTA	2	12	905617	905628	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425789487
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464	NC_019560	AAAGTG	2	12	911058	911069	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	425789491
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467	NC_019560	TAAAAT	2	12	912360	912371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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