MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 34856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018938	TGTTT	2	10	240173	240182	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_018938	TTTA	2	8	240206	240213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_018938	TAA	2	6	240252	240257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_018938	T	9	9	240285	240293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_018938	A	8	8	240300	240307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_018938	TCT	2	6	240397	240402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501237
5007	NC_018938	T	7	7	240451	240457	0 %	100 %	0 %	0 %	410501237
5008	NC_018938	TTC	2	6	240528	240533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501237
5009	NC_018938	G	6	6	240581	240586	0 %	0 %	100 %	0 %	410501237
5010	NC_018938	ACC	2	6	240667	240672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501237
5011	NC_018938	TCA	2	6	240703	240708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501237
5012	NC_018938	TGG	2	6	240746	240751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501237
5013	NC_018938	TAA	2	6	240756	240761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501237
5014	NC_018938	CTT	2	6	240773	240778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501237
5015	NC_018938	A	6	6	240784	240789	100 %	0 %	0 %	0 %	410501237
5016	NC_018938	T	6	6	240826	240831	0 %	100 %	0 %	0 %	410501237
5017	NC_018938	CGC	2	6	240846	240851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501237
5018	NC_018938	TAT	2	6	240875	240880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501237
5019	NC_018938	ATG	2	6	240931	240936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501237
5020	NC_018938	TCA	2	6	240940	240945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501237
5021	NC_018938	CTA	2	6	240968	240973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501237
5022	NC_018938	TCT	2	6	241021	241026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501237
5023	NC_018938	ATC	2	6	241075	241080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501237
5024	NC_018938	TAT	2	6	241118	241123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_018938	TTA	2	6	241144	241149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_018938	GT	3	6	241203	241208	0 %	50 %	50 %	0 %	410501238
5027	NC_018938	CTT	2	6	241220	241225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501238
5028	NC_018938	GAT	2	6	241481	241486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501238
5029	NC_018938	CAA	2	6	241538	241543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501238
5030	NC_018938	CTA	2	6	241608	241613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501238
5031	NC_018938	GTG	2	6	241730	241735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501238
5032	NC_018938	A	6	6	241760	241765	100 %	0 %	0 %	0 %	410501238
5033	NC_018938	AAG	2	6	241779	241784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501238
5034	NC_018938	GCTAGG	2	12	241796	241807	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410501238
5035	NC_018938	GAGC	2	8	241809	241816	25 %	0 %	50 %	25 %	410501238
5036	NC_018938	AAGAT	2	10	241821	241830	60 %	20 %	20 %	0 %	410501238
5037	NC_018938	A	6	6	242003	242008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_018938	GTGG	2	8	242039	242046	0 %	25 %	75 %	0 %	410501239
5039	NC_018938	TGA	2	6	242095	242100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501239
5040	NC_018938	AGA	2	6	242161	242166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501239
5041	NC_018938	GTT	2	6	242189	242194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501239
5042	NC_018938	GAA	2	6	242195	242200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501239
5043	NC_018938	TCA	2	6	242283	242288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501239
5044	NC_018938	AAG	4	12	242289	242300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501239
5045	NC_018938	TAA	2	6	242338	242343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501239
5046	NC_018938	GGAG	2	8	242345	242352	25 %	0 %	75 %	0 %	410501239
5047	NC_018938	GCG	2	6	242399	242404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501239
5048	NC_018938	TAA	2	6	242431	242436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501239
5049	NC_018938	T	6	6	242579	242584	0 %	100 %	0 %	0 %	410501239
5050	NC_018938	TAG	2	6	242590	242595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501239
5051	NC_018938	CTA	2	6	242598	242603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501239
5052	NC_018938	CGG	2	6	242610	242615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501239
5053	NC_018938	TAATT	2	10	242645	242654	40 %	60 %	0 %	0 %	410501239
5054	NC_018938	A	6	6	242666	242671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_018938	AGA	2	6	242712	242717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501240
5056	NC_018938	GAC	2	6	242743	242748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501240
5057	NC_018938	TGA	2	6	242766	242771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501240
5058	NC_018938	TGG	2	6	242774	242779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501240
5059	NC_018938	TC	3	6	242783	242788	0 %	50 %	0 %	50 %	410501240
5060	NC_018938	AAG	2	6	242792	242797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501240
5061	NC_018938	TTA	2	6	242805	242810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501240
5062	NC_018938	T	6	6	242878	242883	0 %	100 %	0 %	0 %	410501240
5063	NC_018938	GAA	3	9	242932	242940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501240
5064	NC_018938	G	6	6	242977	242982	0 %	0 %	100 %	0 %	410501240
5065	NC_018938	CCA	2	6	243029	243034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501240
5066	NC_018938	CGG	2	6	243047	243052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501240
5067	NC_018938	ATG	2	6	243086	243091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501240
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5069	NC_018938	GAA	2	6	243232	243237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501240
5070	NC_018938	T	6	6	243252	243257	0 %	100 %	0 %	0 %	410501240
5071	NC_018938	GCT	2	6	243265	243270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501240
5072	NC_018938	TGA	2	6	243306	243311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501240
5073	NC_018938	AGA	2	6	243327	243332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501240
5074	NC_018938	TGA	2	6	243402	243407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501240
5075	NC_018938	ATG	2	6	243436	243441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501240
5076	NC_018938	T	7	7	243458	243464	0 %	100 %	0 %	0 %	410501240
5077	NC_018938	TCCAA	2	10	243488	243497	40 %	20 %	0 %	40 %	410501240
5078	NC_018938	T	6	6	243501	243506	0 %	100 %	0 %	0 %	410501240
5079	NC_018938	ACC	2	6	243533	243538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501240
5080	NC_018938	A	6	6	243589	243594	100 %	0 %	0 %	0 %	410501240
5081	NC_018938	TAT	2	6	243733	243738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501240
5082	NC_018938	T	6	6	243751	243756	0 %	100 %	0 %	0 %	410501240
5083	NC_018938	GC	3	6	243770	243775	0 %	0 %	50 %	50 %	410501240
5084	NC_018938	G	6	6	243790	243795	0 %	0 %	100 %	0 %	410501240
5085	NC_018938	AAT	2	6	243839	243844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501240
5086	NC_018938	ATG	2	6	243852	243857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501240
5087	NC_018938	T	6	6	243884	243889	0 %	100 %	0 %	0 %	410501241
5088	NC_018938	CTT	2	6	243903	243908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501241
5089	NC_018938	CTA	2	6	243961	243966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501241
5090	NC_018938	A	7	7	243995	244001	100 %	0 %	0 %	0 %	410501241
5091	NC_018938	GAA	2	6	244002	244007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501241
5092	NC_018938	T	6	6	244016	244021	0 %	100 %	0 %	0 %	410501241
5093	NC_018938	AG	3	6	244074	244079	50 %	0 %	50 %	0 %	410501241
5094	NC_018938	CAAA	2	8	244143	244150	75 %	0 %	0 %	25 %	410501241
5095	NC_018938	GC	3	6	244180	244185	0 %	0 %	50 %	50 %	410501241
5096	NC_018938	TCA	2	6	244186	244191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501241
5097	NC_018938	TGC	2	6	244192	244197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501241
5098	NC_018938	T	6	6	244240	244245	0 %	100 %	0 %	0 %	410501241
5099	NC_018938	TTG	2	6	244257	244262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501241
5100	NC_018938	TGG	2	6	244285	244290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501241
5101	NC_018938	GTG	2	6	244338	244343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501241
5102	NC_018938	T	6	6	244393	244398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_018938	AGCG	2	8	244420	244427	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_018938	TAA	2	6	244436	244441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_018938	GA	3	6	244461	244466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_018938	T	6	6	244534	244539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_018938	A	6	6	244540	244545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_018938	CAA	2	6	244563	244568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_018938	T	7	7	244601	244607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_018938	AAC	2	6	244621	244626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_018938	T	6	6	244628	244633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_018938	TAT	2	6	244706	244711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_018938	TG	3	6	244712	244717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_018938	TAA	3	9	244740	244748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_018938	CTAAC	2	10	244868	244877	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5116	NC_018938	AAC	2	6	244917	244922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_018938	A	6	6	244926	244931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_018938	G	7	7	244998	245004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_018938	TGT	2	6	245190	245195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501242
5120	NC_018938	A	6	6	245363	245368	100 %	0 %	0 %	0 %	410501242
5121	NC_018938	T	6	6	245389	245394	0 %	100 %	0 %	0 %	410501242
5122	NC_018938	ACC	2	6	245437	245442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501242
5123	NC_018938	TCA	2	6	245498	245503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501242
5124	NC_018938	CAAA	2	8	245523	245530	75 %	0 %	0 %	25 %	410501242
5125	NC_018938	CG	3	6	245539	245544	0 %	0 %	50 %	50 %	410501242
5126	NC_018938	CAT	2	6	245556	245561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501242
5127	NC_018938	ATA	2	6	245581	245586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501242
5128	NC_018938	TTTG	2	8	245607	245614	0 %	75 %	25 %	0 %	410501242
5129	NC_018938	T	6	6	245685	245690	0 %	100 %	0 %	0 %	410501242
5130	NC_018938	GTA	2	6	245692	245697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501242
5131	NC_018938	ATAA	2	8	245737	245744	75 %	25 %	0 %	0 %	410501242
5132	NC_018938	ACGC	2	8	245780	245787	25 %	0 %	25 %	50 %	410501242
5133	NC_018938	CTT	2	6	245808	245813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501242
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5135	NC_018938	C	6	6	245851	245856	0 %	0 %	0 %	100 %	410501242
5136	NC_018938	ATC	2	6	245878	245883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501242
5137	NC_018938	T	6	6	245917	245922	0 %	100 %	0 %	0 %	410501242
5138	NC_018938	TCAC	2	8	245981	245988	25 %	25 %	0 %	50 %	410501242
5139	NC_018938	T	6	6	246004	246009	0 %	100 %	0 %	0 %	410501242
5140	NC_018938	AAT	2	6	246030	246035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501242
5141	NC_018938	A	6	6	246068	246073	100 %	0 %	0 %	0 %	410501242
5142	NC_018938	A	7	7	246114	246120	100 %	0 %	0 %	0 %	410501242
5143	NC_018938	CTT	2	6	246166	246171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501242
5144	NC_018938	CTT	2	6	246194	246199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5145	NC_018938	CAAAA	2	10	246204	246213	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5146	NC_018938	CTT	2	6	246278	246283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501243
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5151	NC_018938	ATA	2	6	246447	246452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501243
5152	NC_018938	TTG	2	6	246465	246470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501243
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5154	NC_018938	CTT	2	6	246563	246568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501243
5155	NC_018938	ACC	3	9	246584	246592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501243
5156	NC_018938	AAAAC	2	10	246593	246602	80 %	0 %	0 %	20 %	410501243
5157	NC_018938	AAAC	2	8	246612	246619	75 %	0 %	0 %	25 %	410501243
5158	NC_018938	AAC	2	6	246627	246632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501243
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5160	NC_018938	CTT	2	6	246742	246747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501244
5161	NC_018938	GCA	2	6	246869	246874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501244
5162	NC_018938	TCG	2	6	246888	246893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501244
5163	NC_018938	TCT	2	6	246978	246983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501244
5164	NC_018938	GGC	2	6	247024	247029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501244
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5168	NC_018938	ATGC	2	8	247260	247267	25 %	25 %	25 %	25 %	410501244
5169	NC_018938	TTC	2	6	247349	247354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501244
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5172	NC_018938	CACT	2	8	247541	247548	25 %	25 %	0 %	50 %	410501244
5173	NC_018938	T	6	6	247580	247585	0 %	100 %	0 %	0 %	410501245
5174	NC_018938	GTTT	2	8	247609	247616	0 %	75 %	25 %	0 %	410501245
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5178	NC_018938	CG	3	6	247732	247737	0 %	0 %	50 %	50 %	410501245
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5183	NC_018938	CA	4	8	247873	247880	50 %	0 %	0 %	50 %	410501245
5184	NC_018938	ATC	2	6	247887	247892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501245
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5186	NC_018938	A	6	6	247956	247961	100 %	0 %	0 %	0 %	410501245
5187	NC_018938	CT	3	6	248095	248100	0 %	50 %	0 %	50 %	410501245
5188	NC_018938	TCA	2	6	248218	248223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501245
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5190	NC_018938	CT	3	6	248313	248318	0 %	50 %	0 %	50 %	410501245
5191	NC_018938	A	6	6	248397	248402	100 %	0 %	0 %	0 %	410501245
5192	NC_018938	TCTTTA	2	12	248416	248427	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410501245
5193	NC_018938	A	6	6	248478	248483	100 %	0 %	0 %	0 %	410501245
5194	NC_018938	GC	3	6	248498	248503	0 %	0 %	50 %	50 %	410501245
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5196	NC_018938	CTCC	2	8	248674	248681	0 %	25 %	0 %	75 %	410501245
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5201	NC_018938	A	6	6	249160	249165	100 %	0 %	0 %	0 %	410501245
5202	NC_018938	GCAT	2	8	249284	249291	25 %	25 %	25 %	25 %	410501245
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5205	NC_018938	A	6	6	249445	249450	100 %	0 %	0 %	0 %	410501246
5206	NC_018938	TGT	2	6	249482	249487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501246
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5208	NC_018938	CT	3	6	249661	249666	0 %	50 %	0 %	50 %	410501246
5209	NC_018938	TC	3	6	249685	249690	0 %	50 %	0 %	50 %	410501246
5210	NC_018938	ATC	2	6	249705	249710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501246
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5213	NC_018938	A	6	6	249848	249853	100 %	0 %	0 %	0 %	410501246
5214	NC_018938	T	6	6	249909	249914	0 %	100 %	0 %	0 %	410501246
5215	NC_018938	TTC	2	6	249918	249923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501246
5216	NC_018938	TGA	2	6	249932	249937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501246
5217	NC_018938	TGA	2	6	250004	250009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501246
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5219	NC_018938	CTTT	2	8	250063	250070	0 %	75 %	0 %	25 %	410501246
5220	NC_018938	CTT	2	6	250088	250093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501246
5221	NC_018938	CTTG	2	8	250121	250128	0 %	50 %	25 %	25 %	410501246
5222	NC_018938	GCG	2	6	250156	250161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501246
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5227	NC_018938	T	7	7	250370	250376	0 %	100 %	0 %	0 %	410501246
5228	NC_018938	T	7	7	250405	250411	0 %	100 %	0 %	0 %	410501246
5229	NC_018938	TCT	2	6	250752	250757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501247
5230	NC_018938	TAA	2	6	250955	250960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501247
5231	NC_018938	ATC	2	6	250961	250966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501247
5232	NC_018938	ATGCC	2	10	250978	250987	20 %	20 %	20 %	40 %	410501247
5233	NC_018938	TTTA	2	8	251024	251031	25 %	75 %	0 %	0 %	410501247
5234	NC_018938	GTCTT	2	10	251076	251085	0 %	60 %	20 %	20 %	410501247
5235	NC_018938	TTTG	2	8	251104	251111	0 %	75 %	25 %	0 %	410501247
5236	NC_018938	C	6	6	251127	251132	0 %	0 %	0 %	100 %	410501247
5237	NC_018938	AG	3	6	251159	251164	50 %	0 %	50 %	0 %	410501247
5238	NC_018938	AG	4	8	251180	251187	50 %	0 %	50 %	0 %	410501247
5239	NC_018938	AG	3	6	251213	251218	50 %	0 %	50 %	0 %	410501247
5240	NC_018938	A	6	6	251222	251227	100 %	0 %	0 %	0 %	410501247
5241	NC_018938	CAT	3	9	251329	251337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501247
5242	NC_018938	AAG	2	6	251344	251349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501247
5243	NC_018938	T	6	6	251413	251418	0 %	100 %	0 %	0 %	410501247
5244	NC_018938	TAA	2	6	251423	251428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501247
5245	NC_018938	GCA	2	6	251449	251454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501247
5246	NC_018938	AAT	2	6	251478	251483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501247
5247	NC_018938	GTT	2	6	251548	251553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501247
5248	NC_018938	TGCA	2	8	251559	251566	25 %	25 %	25 %	25 %	410501247
5249	NC_018938	A	6	6	251590	251595	100 %	0 %	0 %	0 %	410501248
5250	NC_018938	TCT	2	6	251634	251639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501248
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5252	NC_018938	TTC	2	6	251687	251692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501248
5253	NC_018938	ATAAA	2	10	251734	251743	80 %	20 %	0 %	0 %	410501248
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5255	NC_018938	TGA	2	6	251848	251853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501248
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5284	NC_018938	T	7	7	252788	252794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5322	NC_018938	TTTA	2	8	254812	254819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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