MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Rif1 chromosome

Total Repeats: 2371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018937	CT	3	6	897	902	0 %	50 %	0 %	50 %	410023238
2	NC_018937	CA	3	6	1432	1437	50 %	0 %	0 %	50 %	410023239
3	NC_018937	TC	3	6	1491	1496	0 %	50 %	0 %	50 %	410023239
4	NC_018937	CT	3	6	1767	1772	0 %	50 %	0 %	50 %	410023239
5	NC_018937	GC	3	6	2118	2123	0 %	0 %	50 %	50 %	410023240
6	NC_018937	CA	3	6	2481	2486	50 %	0 %	0 %	50 %	410023240
7	NC_018937	GC	3	6	2996	3001	0 %	0 %	50 %	50 %	410023241
8	NC_018937	AG	3	6	3153	3158	50 %	0 %	50 %	0 %	410023241
9	NC_018937	AG	3	6	3433	3438	50 %	0 %	50 %	0 %	410023242
10	NC_018937	CA	3	6	3981	3986	50 %	0 %	0 %	50 %	410023242
11	NC_018937	GC	3	6	6030	6035	0 %	0 %	50 %	50 %	410023244
12	NC_018937	AC	3	6	6459	6464	50 %	0 %	0 %	50 %	410023244
13	NC_018937	GA	11	22	7221	7242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018937	GC	3	6	7916	7921	0 %	0 %	50 %	50 %	410023245
15	NC_018937	CG	3	6	7981	7986	0 %	0 %	50 %	50 %	410023245
16	NC_018937	AG	3	6	8128	8133	50 %	0 %	50 %	0 %	410023245
17	NC_018937	AG	3	6	10327	10332	50 %	0 %	50 %	0 %	410023247
18	NC_018937	AG	3	6	11144	11149	50 %	0 %	50 %	0 %	410023247
19	NC_018937	GC	3	6	11223	11228	0 %	0 %	50 %	50 %	410023247
20	NC_018937	AG	3	6	11722	11727	50 %	0 %	50 %	0 %	410023248
21	NC_018937	AG	3	6	11782	11787	50 %	0 %	50 %	0 %	410023248
22	NC_018937	GA	3	6	12789	12794	50 %	0 %	50 %	0 %	410023249
23	NC_018937	TG	3	6	13863	13868	0 %	50 %	50 %	0 %	410023250
24	NC_018937	GC	3	6	14506	14511	0 %	0 %	50 %	50 %	410023252
25	NC_018937	TC	3	6	14683	14688	0 %	50 %	0 %	50 %	410023252
26	NC_018937	TC	3	6	14721	14726	0 %	50 %	0 %	50 %	410023252
27	NC_018937	AG	3	6	15108	15113	50 %	0 %	50 %	0 %	410023252
28	NC_018937	CA	3	6	16681	16686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018937	GC	3	6	17189	17194	0 %	0 %	50 %	50 %	410023253
30	NC_018937	TC	3	6	17498	17503	0 %	50 %	0 %	50 %	410023253
31	NC_018937	AG	3	6	19383	19388	50 %	0 %	50 %	0 %	410023255
32	NC_018937	GA	3	6	19574	19579	50 %	0 %	50 %	0 %	410023255
33	NC_018937	CT	3	6	19772	19777	0 %	50 %	0 %	50 %	410023255
34	NC_018937	GC	3	6	20965	20970	0 %	0 %	50 %	50 %	410023256
35	NC_018937	GC	3	6	23091	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018937	GC	3	6	23449	23454	0 %	0 %	50 %	50 %	410023259
37	NC_018937	AG	3	6	24044	24049	50 %	0 %	50 %	0 %	410023259
38	NC_018937	GT	3	6	25516	25521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018937	GC	3	6	26388	26393	0 %	0 %	50 %	50 %	410023260
40	NC_018937	CG	3	6	26463	26468	0 %	0 %	50 %	50 %	410023260
41	NC_018937	AG	3	6	26951	26956	50 %	0 %	50 %	0 %	410023260
42	NC_018937	CA	3	6	27102	27107	50 %	0 %	0 %	50 %	410023260
43	NC_018937	TA	3	6	27502	27507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018937	TG	3	6	27961	27966	0 %	50 %	50 %	0 %	410023261
45	NC_018937	AG	3	6	28201	28206	50 %	0 %	50 %	0 %	410023261
46	NC_018937	AG	3	6	29317	29322	50 %	0 %	50 %	0 %	410023262
47	NC_018937	GC	3	6	29391	29396	0 %	0 %	50 %	50 %	410023262
48	NC_018937	TC	3	6	30179	30184	0 %	50 %	0 %	50 %	410023264
49	NC_018937	AG	3	6	30779	30784	50 %	0 %	50 %	0 %	410023264
50	NC_018937	TC	3	6	31199	31204	0 %	50 %	0 %	50 %	410023264
51	NC_018937	AT	3	6	33563	33568	50 %	50 %	0 %	0 %	410023267
52	NC_018937	GA	3	6	34737	34742	50 %	0 %	50 %	0 %	410023267
53	NC_018937	GC	4	8	34872	34879	0 %	0 %	50 %	50 %	410023267
54	NC_018937	TA	3	6	34958	34963	50 %	50 %	0 %	0 %	410023268
55	NC_018937	AG	3	6	35009	35014	50 %	0 %	50 %	0 %	410023268
56	NC_018937	CA	3	6	35190	35195	50 %	0 %	0 %	50 %	410023268
57	NC_018937	GC	3	6	36484	36489	0 %	0 %	50 %	50 %	410023270
58	NC_018937	GC	3	6	36743	36748	0 %	0 %	50 %	50 %	410023271
59	NC_018937	CT	3	6	36874	36879	0 %	50 %	0 %	50 %	410023271
60	NC_018937	TG	3	6	36987	36992	0 %	50 %	50 %	0 %	410023271
61	NC_018937	TG	3	6	37071	37076	0 %	50 %	50 %	0 %	410023271
62	NC_018937	GA	3	6	38102	38107	50 %	0 %	50 %	0 %	410023272
63	NC_018937	CT	3	6	39210	39215	0 %	50 %	0 %	50 %	410023273
64	NC_018937	CT	3	6	39282	39287	0 %	50 %	0 %	50 %	410023273
65	NC_018937	AG	3	6	40546	40551	50 %	0 %	50 %	0 %	410023274
66	NC_018937	AG	3	6	40629	40634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018937	TG	3	6	40812	40817	0 %	50 %	50 %	0 %	410023275
68	NC_018937	AG	3	6	40893	40898	50 %	0 %	50 %	0 %	410023275
69	NC_018937	AG	3	6	42624	42629	50 %	0 %	50 %	0 %	410023276
70	NC_018937	AG	3	6	43602	43607	50 %	0 %	50 %	0 %	410023277
71	NC_018937	CT	3	6	43663	43668	0 %	50 %	0 %	50 %	410023277
72	NC_018937	GA	3	6	43866	43871	50 %	0 %	50 %	0 %	410023277
73	NC_018937	GT	3	6	44299	44304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018937	GT	3	6	44343	44348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018937	AG	4	8	44457	44464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018937	CT	3	6	44924	44929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018937	AC	3	6	46351	46356	50 %	0 %	0 %	50 %	410023280
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79	NC_018937	AG	3	6	47640	47645	50 %	0 %	50 %	0 %	410023280
80	NC_018937	TC	3	6	47963	47968	0 %	50 %	0 %	50 %	410023280
81	NC_018937	GT	3	6	48376	48381	0 %	50 %	50 %	0 %	410023281
82	NC_018937	TG	3	6	49479	49484	0 %	50 %	50 %	0 %	410023282
83	NC_018937	GT	3	6	50239	50244	0 %	50 %	50 %	0 %	410023283
84	NC_018937	CT	5	10	50599	50608	0 %	50 %	0 %	50 %	410023283
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88	NC_018937	TA	3	6	52792	52797	50 %	50 %	0 %	0 %	410023286
89	NC_018937	TG	3	6	52844	52849	0 %	50 %	50 %	0 %	410023286
90	NC_018937	AG	4	8	52882	52889	50 %	0 %	50 %	0 %	410023286
91	NC_018937	AT	3	6	53297	53302	50 %	50 %	0 %	0 %	410023286
92	NC_018937	TA	3	6	54644	54649	50 %	50 %	0 %	0 %	410023287
93	NC_018937	CT	3	6	54784	54789	0 %	50 %	0 %	50 %	410023287
94	NC_018937	CT	3	6	55212	55217	0 %	50 %	0 %	50 %	410023287
95	NC_018937	TC	3	6	57042	57047	0 %	50 %	0 %	50 %	410023288
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99	NC_018937	TC	3	6	62122	62127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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103	NC_018937	CT	3	6	64652	64657	0 %	50 %	0 %	50 %	410023293
104	NC_018937	AG	3	6	64678	64683	50 %	0 %	50 %	0 %	410023293
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106	NC_018937	GA	4	8	66158	66165	50 %	0 %	50 %	0 %	410023293
107	NC_018937	TC	3	6	66284	66289	0 %	50 %	0 %	50 %	410023293
108	NC_018937	AC	3	6	66318	66323	50 %	0 %	0 %	50 %	410023293
109	NC_018937	AG	3	6	67114	67119	50 %	0 %	50 %	0 %	410023295
110	NC_018937	AG	3	6	67266	67271	50 %	0 %	50 %	0 %	410023295
111	NC_018937	GA	3	6	67549	67554	50 %	0 %	50 %	0 %	410023296
112	NC_018937	GA	3	6	68722	68727	50 %	0 %	50 %	0 %	410023296
113	NC_018937	AC	3	6	68749	68754	50 %	0 %	0 %	50 %	410023296
114	NC_018937	AG	3	6	69608	69613	50 %	0 %	50 %	0 %	410023299
115	NC_018937	TA	3	6	69822	69827	50 %	50 %	0 %	0 %	410023299
116	NC_018937	GT	3	6	70539	70544	0 %	50 %	50 %	0 %	410023299
117	NC_018937	AG	3	6	72189	72194	50 %	0 %	50 %	0 %	410023300
118	NC_018937	GC	3	6	72372	72377	0 %	0 %	50 %	50 %	410023300
119	NC_018937	CT	3	6	73248	73253	0 %	50 %	0 %	50 %	410023301
120	NC_018937	AG	3	6	73977	73982	50 %	0 %	50 %	0 %	410023302
121	NC_018937	GA	3	6	74571	74576	50 %	0 %	50 %	0 %	410023303
122	NC_018937	AG	3	6	75480	75485	50 %	0 %	50 %	0 %	410023305
123	NC_018937	TG	3	6	76490	76495	0 %	50 %	50 %	0 %	410023306
124	NC_018937	TG	4	8	76828	76835	0 %	50 %	50 %	0 %	410023306
125	NC_018937	TC	3	6	77079	77084	0 %	50 %	0 %	50 %	410023306
126	NC_018937	GC	3	6	81408	81413	0 %	0 %	50 %	50 %	410023311
127	NC_018937	TA	4	8	81806	81813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018937	GT	3	6	82095	82100	0 %	50 %	50 %	0 %	410023312
129	NC_018937	AC	3	6	82922	82927	50 %	0 %	0 %	50 %	410023313
130	NC_018937	GA	3	6	83854	83859	50 %	0 %	50 %	0 %	410023313
131	NC_018937	TC	3	6	84143	84148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018937	GA	3	6	87057	87062	50 %	0 %	50 %	0 %	410023316
133	NC_018937	GC	3	6	88140	88145	0 %	0 %	50 %	50 %	410023316
134	NC_018937	AG	3	6	88405	88410	50 %	0 %	50 %	0 %	410023316
135	NC_018937	CA	3	6	88632	88637	50 %	0 %	0 %	50 %	410023316
136	NC_018937	AG	3	6	88749	88754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018937	AG	3	6	88777	88782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018937	AG	3	6	90417	90422	50 %	0 %	50 %	0 %	410023320
139	NC_018937	TG	3	6	91782	91787	0 %	50 %	50 %	0 %	410023321
140	NC_018937	TC	3	6	92144	92149	0 %	50 %	0 %	50 %	410023321
141	NC_018937	CT	3	6	92753	92758	0 %	50 %	0 %	50 %	410023321
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143	NC_018937	AC	3	6	95307	95312	50 %	0 %	0 %	50 %	410023323
144	NC_018937	CA	3	6	95336	95341	50 %	0 %	0 %	50 %	410023323
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