MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 11531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017944	TG	4	8	45491	45498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017944	CCT	2	6	45578	45583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848918
1003	NC_017944	TTG	2	6	45599	45604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848918
1004	NC_017944	ACG	2	6	45658	45663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848918
1005	NC_017944	CGG	2	6	45851	45856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848918
1006	NC_017944	TTGC	2	8	45928	45935	0 %	50 %	25 %	25 %	389848918
1007	NC_017944	ACG	2	6	45997	46002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848918
1008	NC_017944	GTCG	2	8	46005	46012	0 %	25 %	50 %	25 %	389848918
1009	NC_017944	AC	3	6	46080	46085	50 %	0 %	0 %	50 %	389848918
1010	NC_017944	CGT	2	6	46088	46093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848918
1011	NC_017944	TCG	2	6	46096	46101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848918
1012	NC_017944	GC	3	6	46107	46112	0 %	0 %	50 %	50 %	389848918
1013	NC_017944	GTC	2	6	46233	46238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848918
1014	NC_017944	TCC	2	6	46263	46268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848918
1015	NC_017944	CGA	2	6	46295	46300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848918
1016	NC_017944	CCTG	2	8	46331	46338	0 %	25 %	25 %	50 %	389848918
1017	NC_017944	TTG	2	6	46471	46476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848918
1018	NC_017944	TCT	2	6	46628	46633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848918
1019	NC_017944	GTG	2	6	46640	46645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848918
1020	NC_017944	TACT	2	8	46648	46655	25 %	50 %	0 %	25 %	389848918
1021	NC_017944	TGCT	2	8	46798	46805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_017944	CCA	2	6	46868	46873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_017944	CTG	2	6	46886	46891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017944	GAA	2	6	46931	46936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017944	TC	3	6	46953	46958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_017944	CATG	2	8	46970	46977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_017944	ATT	2	6	46985	46990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017944	TTC	2	6	46999	47004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017944	AC	3	6	47135	47140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_017944	AGCC	2	8	47175	47182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_017944	TAG	2	6	47198	47203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017944	CTA	2	6	47272	47277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017944	AAG	2	6	47309	47314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017944	AG	3	6	47313	47318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017944	CA	3	6	47361	47366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_017944	GT	3	6	47381	47386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017944	CTG	2	6	47397	47402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017944	CGA	2	6	47415	47420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017944	GGT	2	6	47502	47507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017944	GTT	2	6	47513	47518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017944	ATA	2	6	47554	47559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017944	GGT	2	6	47653	47658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848919
1043	NC_017944	CCG	2	6	47676	47681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848919
1044	NC_017944	CGTT	2	8	47688	47695	0 %	50 %	25 %	25 %	389848919
1045	NC_017944	CTC	2	6	47732	47737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848919
1046	NC_017944	GCT	2	6	47741	47746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848919
1047	NC_017944	TGA	2	6	47787	47792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848919
1048	NC_017944	CAC	2	6	47900	47905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848919
1049	NC_017944	ATTCG	2	10	47999	48008	20 %	40 %	20 %	20 %	389848919
1050	NC_017944	CTG	2	6	48024	48029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848919
1051	NC_017944	CTG	2	6	48213	48218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848919
1052	NC_017944	CG	3	6	48221	48226	0 %	0 %	50 %	50 %	389848919
1053	NC_017944	A	7	7	48254	48260	100 %	0 %	0 %	0 %	389848919
1054	NC_017944	CGA	2	6	48301	48306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848919
1055	NC_017944	TGC	2	6	48319	48324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848919
1056	NC_017944	CGC	2	6	48376	48381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848919
1057	NC_017944	TGGC	2	8	48516	48523	0 %	25 %	50 %	25 %	389848919
1058	NC_017944	GTG	2	6	48576	48581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848919
1059	NC_017944	GAA	2	6	48659	48664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848919
1060	NC_017944	CGG	2	6	48862	48867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848919
1061	NC_017944	GAC	2	6	49010	49015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017944	CGGT	2	8	49025	49032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_017944	TA	3	6	49061	49066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017944	AT	3	6	49100	49105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017944	GAT	2	6	49176	49181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017944	ACG	2	6	49223	49228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848920
1067	NC_017944	AG	3	6	49367	49372	50 %	0 %	50 %	0 %	389848920
1068	NC_017944	TCG	2	6	49503	49508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848920
1069	NC_017944	AGG	2	6	49512	49517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848920
1070	NC_017944	CCA	2	6	49600	49605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848920
1071	NC_017944	GAA	3	9	49643	49651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848920
1072	NC_017944	ATC	2	6	49661	49666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848920
1073	NC_017944	TGG	2	6	49680	49685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848920
1074	NC_017944	CGGT	2	8	49833	49840	0 %	25 %	50 %	25 %	389848920
1075	NC_017944	AGG	2	6	49876	49881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848920
1076	NC_017944	CGA	2	6	49924	49929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848920
1077	NC_017944	G	6	6	49952	49957	0 %	0 %	100 %	0 %	389848920
1078	NC_017944	CT	3	6	50052	50057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_017944	CGG	2	6	50091	50096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848921
1080	NC_017944	CGG	2	6	50195	50200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848921
1081	NC_017944	ATC	2	6	50215	50220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848921
1082	NC_017944	TC	3	6	50334	50339	0 %	50 %	0 %	50 %	389848921
1083	NC_017944	GAC	2	6	50355	50360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848921
1084	NC_017944	CTG	2	6	50372	50377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848921
1085	NC_017944	GAAG	2	8	50425	50432	50 %	0 %	50 %	0 %	389848921
1086	NC_017944	AGTT	2	8	50441	50448	25 %	50 %	25 %	0 %	389848921
1087	NC_017944	GTC	2	6	50476	50481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848921
1088	NC_017944	GTC	2	6	50551	50556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848921
1089	NC_017944	AGA	2	6	50598	50603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848921
1090	NC_017944	TCA	2	6	50678	50683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848921
1091	NC_017944	AAC	2	6	50702	50707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848921
1092	NC_017944	AAC	2	6	50735	50740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848921
1093	NC_017944	CT	3	6	50765	50770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_017944	CGT	2	6	50793	50798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_017944	T	6	6	50849	50854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017944	CTA	2	6	50939	50944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848922
1097	NC_017944	ACGG	2	8	51017	51024	25 %	0 %	50 %	25 %	389848922
1098	NC_017944	TTC	2	6	51047	51052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848922
1099	NC_017944	TCT	2	6	51057	51062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848922
1100	NC_017944	TGT	2	6	51153	51158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848922
1101	NC_017944	GT	3	6	51195	51200	0 %	50 %	50 %	0 %	389848922
1102	NC_017944	TAGT	2	8	51240	51247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017944	TCG	2	6	51288	51293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017944	GTGG	2	8	51340	51347	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017944	TAT	2	6	51639	51644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017944	GTTC	2	8	51739	51746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_017944	TTCC	2	8	51800	51807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_017944	GA	3	6	51811	51816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017944	C	6	6	51870	51875	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1110	NC_017944	AAC	2	6	51892	51897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017944	TCC	2	6	51918	51923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_017944	GATT	2	8	51924	51931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017944	TCT	2	6	51947	51952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017944	GT	3	6	51974	51979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017944	AC	3	6	52026	52031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_017944	GTT	2	6	52117	52122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848923
1117	NC_017944	TCG	2	6	52208	52213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848923
1118	NC_017944	TCG	2	6	52256	52261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848923
1119	NC_017944	CTG	2	6	52280	52285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848923
1120	NC_017944	TCGT	2	8	52351	52358	0 %	50 %	25 %	25 %	389848923
1121	NC_017944	ACG	2	6	52384	52389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848923
1122	NC_017944	GTG	2	6	52411	52416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848923
1123	NC_017944	CG	3	6	52469	52474	0 %	0 %	50 %	50 %	389848923
1124	NC_017944	CGA	2	6	52485	52490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848923
1125	NC_017944	CTT	2	6	52494	52499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848923
1126	NC_017944	GAGCC	2	10	52513	52522	20 %	0 %	40 %	40 %	389848923
1127	NC_017944	CGA	2	6	52617	52622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848923
1128	NC_017944	CGC	2	6	52626	52631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848923
1129	NC_017944	GT	3	6	52653	52658	0 %	50 %	50 %	0 %	389848923
1130	NC_017944	TCG	3	9	52661	52669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848923
1131	NC_017944	TCG	2	6	52688	52693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848923
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1253	NC_017944	TAT	2	6	58055	58060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1256	NC_017944	ATT	2	6	58247	58252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1467	NC_017944	CTCA	2	8	67567	67574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1492	NC_017944	TCG	2	6	68771	68776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848939
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1497	NC_017944	GTC	2	6	69139	69144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848939
1498	NC_017944	CGAA	2	8	69147	69154	50 %	0 %	25 %	25 %	389848939
1499	NC_017944	GAA	2	6	69313	69318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848939
1500	NC_017944	TCG	2	6	69392	69397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848939

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