MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 11531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017944	AT	3	6	22850	22855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017944	TAA	2	6	22862	22867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017944	CAGC	2	8	22951	22958	25 %	0 %	25 %	50 %	389848903
504	NC_017944	GCG	2	6	23037	23042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848903
505	NC_017944	GTC	2	6	23109	23114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848903
506	NC_017944	CAC	2	6	23190	23195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848903
507	NC_017944	CCT	2	6	23217	23222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848903
508	NC_017944	TC	3	6	23246	23251	0 %	50 %	0 %	50 %	389848903
509	NC_017944	CG	3	6	23324	23329	0 %	0 %	50 %	50 %	389848903
510	NC_017944	CGA	2	6	23385	23390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848903
511	NC_017944	CGC	2	6	23429	23434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848903
512	NC_017944	CGG	2	6	23451	23456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848903
513	NC_017944	GTC	2	6	23457	23462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848903
514	NC_017944	TCG	2	6	23513	23518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848903
515	NC_017944	GA	3	6	23660	23665	50 %	0 %	50 %	0 %	389848903
516	NC_017944	ACC	2	6	23675	23680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848903
517	NC_017944	ACG	2	6	23693	23698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848903
518	NC_017944	TCGC	2	8	23835	23842	0 %	25 %	25 %	50 %	389848903
519	NC_017944	TCG	3	9	23870	23878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848903
520	NC_017944	AT	3	6	24050	24055	50 %	50 %	0 %	0 %	389848904
521	NC_017944	TTC	2	6	24109	24114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848904
522	NC_017944	GTA	2	6	24130	24135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848904
523	NC_017944	TTC	2	6	24180	24185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848904
524	NC_017944	GTC	2	6	24232	24237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848904
525	NC_017944	TCG	2	6	24245	24250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848904
526	NC_017944	GAAT	2	8	24296	24303	50 %	25 %	25 %	0 %	389848904
527	NC_017944	TCT	2	6	24326	24331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848904
528	NC_017944	ATTC	2	8	24391	24398	25 %	50 %	0 %	25 %	389848904
529	NC_017944	GGA	2	6	24414	24419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017944	CGAA	2	8	24450	24457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
531	NC_017944	TCT	3	9	24494	24502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017944	AGCG	2	8	24524	24531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
533	NC_017944	ACTC	2	8	24602	24609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_017944	ACCT	2	8	24632	24639	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_017944	CGGC	2	8	24706	24713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_017944	CTT	2	6	24716	24721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017944	CGA	2	6	24736	24741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017944	GGT	2	6	24752	24757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017944	GTC	2	6	24801	24806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017944	CTT	2	6	24839	24844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017944	TCC	2	6	24877	24882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_017944	AGTG	2	8	25042	25049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017944	TC	3	6	25099	25104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_017944	ACC	2	6	25110	25115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_017944	ACG	2	6	25183	25188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017944	TTC	2	6	25235	25240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017944	AAC	2	6	25274	25279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017944	TG	3	6	25291	25296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017944	ACT	2	6	25361	25366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017944	GC	3	6	25391	25396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_017944	GGT	2	6	25409	25414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017944	CG	3	6	25517	25522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_017944	CT	3	6	25526	25531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_017944	ACTC	2	8	25540	25547	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_017944	TTTATC	2	12	25584	25595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
556	NC_017944	GATG	2	8	25659	25666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017944	GAC	2	6	25725	25730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017944	GAT	2	6	25733	25738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017944	TGA	2	6	25742	25747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848905
560	NC_017944	GCC	2	6	25822	25827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848905
561	NC_017944	CGA	2	6	25839	25844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
562	NC_017944	GGA	2	6	25860	25865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848905
563	NC_017944	ACG	2	6	25889	25894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
564	NC_017944	GAC	3	9	25906	25914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
565	NC_017944	GAC	2	6	25942	25947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
566	NC_017944	CGA	2	6	25992	25997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
567	NC_017944	GAC	2	6	26014	26019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
568	NC_017944	ACG	2	6	26042	26047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
569	NC_017944	GAC	2	6	26074	26079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
570	NC_017944	GAC	2	6	26095	26100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
571	NC_017944	GAC	2	6	26128	26133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
572	NC_017944	CGA	2	6	26148	26153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
573	NC_017944	CGA	2	6	26181	26186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
574	NC_017944	GAC	3	9	26203	26211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
575	NC_017944	GAC	2	6	26236	26241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
576	NC_017944	GAC	2	6	26263	26268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
577	NC_017944	CGA	2	6	26283	26288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
578	NC_017944	CGA	2	6	26331	26336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
579	NC_017944	ACG	2	6	26351	26356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
580	NC_017944	GCG	2	6	26384	26389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848905
581	NC_017944	ATCGAC	2	12	26392	26403	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	389848905
582	NC_017944	CGA	2	6	26412	26417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
583	NC_017944	TCGAAC	2	12	26441	26452	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	389848905
584	NC_017944	AGG	2	6	26453	26458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848905
585	NC_017944	GAC	2	6	26461	26466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
586	NC_017944	GAC	3	9	26479	26487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
587	NC_017944	CGA	3	9	26508	26516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
588	NC_017944	GAC	2	6	26536	26541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
589	NC_017944	CGA	2	6	26562	26567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
590	NC_017944	CGA	2	6	26583	26588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
591	NC_017944	TTCGAG	2	12	26590	26601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	389848905
592	NC_017944	GAC	4	12	26653	26664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
593	NC_017944	CGA	2	6	26679	26684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
594	NC_017944	GAC	2	6	26707	26712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
595	NC_017944	GAC	2	6	26731	26736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
596	NC_017944	AGG	2	6	26750	26755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848905
597	NC_017944	GAC	2	6	26785	26790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
598	NC_017944	GAC	2	6	26809	26814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
599	NC_017944	CGA	2	6	26832	26837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
600	NC_017944	CATCGA	2	12	26838	26849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	389848905
601	NC_017944	CGA	2	6	26856	26861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
602	NC_017944	CGA	2	6	26931	26936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
603	NC_017944	GAC	2	6	26968	26973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
604	NC_017944	ATT	2	6	26989	26994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389848905
605	NC_017944	GAC	2	6	27019	27024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
606	NC_017944	GGACAT	2	12	27039	27050	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	389848905
607	NC_017944	CGA	2	6	27060	27065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
608	NC_017944	CGA	3	9	27099	27107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
609	NC_017944	GAC	2	6	27115	27120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848905
610	NC_017944	ATA	2	6	27229	27234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017944	CTG	2	6	27276	27281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848906
612	NC_017944	CCT	2	6	27304	27309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848906
613	NC_017944	GAAGGG	2	12	27368	27379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848906
614	NC_017944	GTT	2	6	27382	27387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848906
615	NC_017944	ACG	2	6	27456	27461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848906
616	NC_017944	ACT	2	6	27484	27489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848906
617	NC_017944	CGA	2	6	27502	27507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848906
618	NC_017944	GAC	2	6	27527	27532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848906
619	NC_017944	CGA	2	6	27598	27603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848906
620	NC_017944	GAC	2	6	27613	27618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848906
621	NC_017944	GTC	3	9	27701	27709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848906
622	NC_017944	CCCG	2	8	27766	27773	0 %	0 %	25 %	75 %	389848906
623	NC_017944	CTT	2	6	27877	27882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848906
624	NC_017944	ACTG	2	8	27920	27927	25 %	25 %	25 %	25 %	389848906
625	NC_017944	TTC	2	6	27971	27976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848906
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627	NC_017944	AGA	2	6	28105	28110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848906
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