MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM300

Total Repeats: 910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017943	GTCG	2	8	118	125	0 %	25 %	50 %	25 %	389848588
2	NC_017943	GAGC	2	8	246	253	25 %	0 %	50 %	25 %	389848588
3	NC_017943	GTCA	2	8	333	340	25 %	25 %	25 %	25 %	389848588
4	NC_017943	GAAA	2	8	876	883	75 %	0 %	25 %	0 %	389848588
5	NC_017943	CTCG	2	8	951	958	0 %	25 %	25 %	50 %	389848588
6	NC_017943	TGAG	2	8	1227	1234	25 %	25 %	50 %	0 %	389848588
7	NC_017943	GTCG	3	12	2466	2477	0 %	25 %	50 %	25 %	389848590
8	NC_017943	GGTC	2	8	2497	2504	0 %	25 %	50 %	25 %	389848590
9	NC_017943	AGAC	2	8	3036	3043	50 %	0 %	25 %	25 %	389848590
10	NC_017943	ACTG	2	8	3044	3051	25 %	25 %	25 %	25 %	389848590
11	NC_017943	CTAC	2	8	3204	3211	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017943	TTGA	2	8	3803	3810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017943	AGTC	2	8	3899	3906	25 %	25 %	25 %	25 %	389848591
14	NC_017943	TCGC	2	8	4578	4585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017943	GTCA	2	8	5397	5404	25 %	25 %	25 %	25 %	389848592
16	NC_017943	GTTG	2	8	5787	5794	0 %	50 %	50 %	0 %	389848592
17	NC_017943	CGGA	2	8	5990	5997	25 %	0 %	50 %	25 %	389848592
18	NC_017943	CGAC	2	8	6059	6066	25 %	0 %	25 %	50 %	389848592
19	NC_017943	CGGT	2	8	6200	6207	0 %	25 %	50 %	25 %	389848592
20	NC_017943	ACGA	2	8	7088	7095	50 %	0 %	25 %	25 %	389848593
21	NC_017943	GACG	2	8	8296	8303	25 %	0 %	50 %	25 %	389848595
22	NC_017943	ACCA	2	8	8528	8535	50 %	0 %	0 %	50 %	389848596
23	NC_017943	CGGC	2	8	8973	8980	0 %	0 %	50 %	50 %	389848596
24	NC_017943	GAAC	2	8	9865	9872	50 %	0 %	25 %	25 %	389848596
25	NC_017943	CGGT	2	8	10071	10078	0 %	25 %	50 %	25 %	389848596
26	NC_017943	GACG	2	8	10598	10605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017943	CTCG	2	8	10708	10715	0 %	25 %	25 %	50 %	389848597
28	NC_017943	GCAG	2	8	10760	10767	25 %	0 %	50 %	25 %	389848597
29	NC_017943	GCAA	2	8	10855	10862	50 %	0 %	25 %	25 %	389848597
30	NC_017943	TTCA	2	8	11625	11632	25 %	50 %	0 %	25 %	389848598
31	NC_017943	CAAC	2	8	11719	11726	50 %	0 %	0 %	50 %	389848598
32	NC_017943	CGAC	2	8	11918	11925	25 %	0 %	25 %	50 %	389848598
33	NC_017943	ACTT	2	8	12239	12246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017943	GTCG	2	8	12503	12510	0 %	25 %	50 %	25 %	389848599
35	NC_017943	TTTC	2	8	12577	12584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017943	CAGA	2	8	12739	12746	50 %	0 %	25 %	25 %	389848600
37	NC_017943	GCTG	2	8	13177	13184	0 %	25 %	50 %	25 %	389848600
38	NC_017943	CCAT	2	8	13501	13508	25 %	25 %	0 %	50 %	389848600
39	NC_017943	GATA	2	8	13585	13592	50 %	25 %	25 %	0 %	389848600
40	NC_017943	GTAT	2	8	13877	13884	25 %	50 %	25 %	0 %	389848600
41	NC_017943	CGAG	2	8	14021	14028	25 %	0 %	50 %	25 %	389848600
42	NC_017943	TAGA	2	8	14041	14048	50 %	25 %	25 %	0 %	389848600
43	NC_017943	CCCG	2	8	14741	14748	0 %	0 %	25 %	75 %	389848601
44	NC_017943	ACCG	2	8	14942	14949	25 %	0 %	25 %	50 %	389848601
45	NC_017943	GGAT	2	8	15767	15774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017943	GCAG	2	8	16016	16023	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017943	CGAC	2	8	16102	16109	25 %	0 %	25 %	50 %	389848602
48	NC_017943	GTTC	2	8	16456	16463	0 %	50 %	25 %	25 %	389848602
49	NC_017943	GTGA	2	8	16688	16695	25 %	25 %	50 %	0 %	389848602
50	NC_017943	AGCA	2	8	17117	17124	50 %	0 %	25 %	25 %	389848602
51	NC_017943	CGGT	2	8	17303	17310	0 %	25 %	50 %	25 %	389848603
52	NC_017943	GACT	2	8	17391	17398	25 %	25 %	25 %	25 %	389848603
53	NC_017943	TCTG	2	8	18123	18130	0 %	50 %	25 %	25 %	389848603
54	NC_017943	GTGC	2	8	18196	18203	0 %	25 %	50 %	25 %	389848604
55	NC_017943	ATAG	2	8	18751	18758	50 %	25 %	25 %	0 %	389848604
56	NC_017943	TGCT	2	8	19705	19712	0 %	50 %	25 %	25 %	389848605
57	NC_017943	GGTC	2	8	19767	19774	0 %	25 %	50 %	25 %	389848605
58	NC_017943	CTCG	2	8	20332	20339	0 %	25 %	25 %	50 %	389848605
59	NC_017943	CGAG	2	8	20340	20347	25 %	0 %	50 %	25 %	389848605
60	NC_017943	TAGC	2	8	20774	20781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017943	CGAG	2	8	20930	20937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017943	TGGG	2	8	21588	21595	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017943	GTTC	2	8	21629	21636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017943	TGCC	2	8	21709	21716	0 %	25 %	25 %	50 %	389848606
65	NC_017943	TTTC	2	8	21723	21730	0 %	75 %	0 %	25 %	389848606
66	NC_017943	AACT	2	8	21939	21946	50 %	25 %	0 %	25 %	389848607
67	NC_017943	AGTT	2	8	22065	22072	25 %	50 %	25 %	0 %	389848607
68	NC_017943	ACCA	2	8	22161	22168	50 %	0 %	0 %	50 %	389848608
69	NC_017943	GACG	2	8	22565	22572	25 %	0 %	50 %	25 %	389848608
70	NC_017943	ACGA	2	8	23251	23258	50 %	0 %	25 %	25 %	389848608
71	NC_017943	CGAA	2	8	23416	23423	50 %	0 %	25 %	25 %	389848608
72	NC_017943	CCGG	2	8	23435	23442	0 %	0 %	50 %	50 %	389848608
73	NC_017943	GGTC	2	8	23810	23817	0 %	25 %	50 %	25 %	389848608
74	NC_017943	CGAA	2	8	24223	24230	50 %	0 %	25 %	25 %	389848608
75	NC_017943	CGCT	2	8	24620	24627	0 %	25 %	25 %	50 %	389848609
76	NC_017943	GCCG	2	8	25203	25210	0 %	0 %	50 %	50 %	389848610
77	NC_017943	TCGT	2	8	25321	25328	0 %	50 %	25 %	25 %	389848610
78	NC_017943	CCTG	2	8	25736	25743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017943	CCGG	2	8	26162	26169	0 %	0 %	50 %	50 %	389848612
80	NC_017943	GTGA	2	8	26427	26434	25 %	25 %	50 %	0 %	389848612
81	NC_017943	GGTC	2	8	26690	26697	0 %	25 %	50 %	25 %	389848612
82	NC_017943	TTCC	2	8	26982	26989	0 %	50 %	0 %	50 %	389848612
83	NC_017943	TCGT	2	8	27164	27171	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017943	ATGA	2	8	27319	27326	50 %	25 %	25 %	0 %	389848613
85	NC_017943	GGTC	2	8	28059	28066	0 %	25 %	50 %	25 %	389848613
86	NC_017943	AGCA	2	8	28100	28107	50 %	0 %	25 %	25 %	389848613
87	NC_017943	CTCG	2	8	28714	28721	0 %	25 %	25 %	50 %	389848614
88	NC_017943	CCGC	2	8	28818	28825	0 %	0 %	25 %	75 %	389848614
89	NC_017943	CCTC	2	8	29413	29420	0 %	25 %	0 %	75 %	389848615
90	NC_017943	ACCC	2	8	29595	29602	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_017943	ACGT	2	8	29798	29805	25 %	25 %	25 %	25 %	389848616
92	NC_017943	CGTG	2	8	29918	29925	0 %	25 %	50 %	25 %	389848616
93	NC_017943	CTTC	2	8	30522	30529	0 %	50 %	0 %	50 %	389848616
94	NC_017943	CGAG	2	8	30888	30895	25 %	0 %	50 %	25 %	389848616
95	NC_017943	GGAC	2	8	31560	31567	25 %	0 %	50 %	25 %	389848617
96	NC_017943	GTCG	2	8	32221	32228	0 %	25 %	50 %	25 %	389848617
97	NC_017943	CCTC	2	8	32301	32308	0 %	25 %	0 %	75 %	389848618
98	NC_017943	CGAC	2	8	32758	32765	25 %	0 %	25 %	50 %	389848618
99	NC_017943	GTCC	2	8	33756	33763	0 %	25 %	25 %	50 %	389848619
100	NC_017943	CGGG	2	8	33943	33950	0 %	0 %	75 %	25 %	389848619
101	NC_017943	TGCT	2	8	34183	34190	0 %	50 %	25 %	25 %	389848619
102	NC_017943	TCCA	2	8	34378	34385	25 %	25 %	0 %	50 %	389848619
103	NC_017943	CTCC	2	8	34918	34925	0 %	25 %	0 %	75 %	389848620
104	NC_017943	ATCA	2	8	35146	35153	50 %	25 %	0 %	25 %	389848620
105	NC_017943	TCAC	2	8	35835	35842	25 %	25 %	0 %	50 %	389848620
106	NC_017943	ACTG	2	8	36028	36035	25 %	25 %	25 %	25 %	389848620
107	NC_017943	CGAA	2	8	36371	36378	50 %	0 %	25 %	25 %	389848621
108	NC_017943	CGAG	2	8	36672	36679	25 %	0 %	50 %	25 %	389848621
109	NC_017943	CGGT	2	8	37318	37325	0 %	25 %	50 %	25 %	389848622
110	NC_017943	GAGC	2	8	37512	37519	25 %	0 %	50 %	25 %	389848622
111	NC_017943	TCGT	2	8	37652	37659	0 %	50 %	25 %	25 %	389848622
112	NC_017943	CGCA	2	8	37930	37937	25 %	0 %	25 %	50 %	389848622
113	NC_017943	GCTA	2	8	38248	38255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017943	CTCG	2	8	38268	38275	0 %	25 %	25 %	50 %	389848623
115	NC_017943	GCCG	2	8	38511	38518	0 %	0 %	50 %	50 %	389848623
116	NC_017943	ACCC	2	8	38596	38603	25 %	0 %	0 %	75 %	389848623
117	NC_017943	GACG	2	8	38970	38977	25 %	0 %	50 %	25 %	389848623
118	NC_017943	TCCG	2	8	39021	39028	0 %	25 %	25 %	50 %	389848623
119	NC_017943	TCGC	2	8	39352	39359	0 %	25 %	25 %	50 %	389848623
120	NC_017943	TTGG	2	8	39712	39719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017943	TTGG	2	8	39741	39748	0 %	50 %	50 %	0 %	389848624
122	NC_017943	GCTG	2	8	39981	39988	0 %	25 %	50 %	25 %	389848624
123	NC_017943	CGTA	2	8	40322	40329	25 %	25 %	25 %	25 %	389848624
124	NC_017943	CTCG	2	8	40359	40366	0 %	25 %	25 %	50 %	389848624
125	NC_017943	GCGA	2	8	40591	40598	25 %	0 %	50 %	25 %	389848624
126	NC_017943	ACTG	2	8	41095	41102	25 %	25 %	25 %	25 %	389848624
127	NC_017943	GATG	2	8	41294	41301	25 %	25 %	50 %	0 %	389848625
128	NC_017943	CCCA	2	8	42142	42149	25 %	0 %	0 %	75 %	389848625
129	NC_017943	TCGC	2	8	42615	42622	0 %	25 %	25 %	50 %	389848625
130	NC_017943	GTAG	2	8	42862	42869	25 %	25 %	50 %	0 %	389848625
131	NC_017943	TCCC	2	8	42987	42994	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_017943	GTCC	2	8	43811	43818	0 %	25 %	25 %	50 %	389848626
133	NC_017943	GTCG	2	8	44301	44308	0 %	25 %	50 %	25 %	389848626
134	NC_017943	TCGC	2	8	44320	44327	0 %	25 %	25 %	50 %	389848626
135	NC_017943	GTAG	2	8	44783	44790	25 %	25 %	50 %	0 %	389848626
136	NC_017943	GAAC	2	8	45451	45458	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017943	CTCA	2	8	45783	45790	25 %	25 %	0 %	50 %	389848627
138	NC_017943	CTCG	2	8	46007	46014	0 %	25 %	25 %	50 %	389848627
139	NC_017943	GTCG	2	8	46179	46186	0 %	25 %	50 %	25 %	389848627
140	NC_017943	GCCA	2	8	46364	46371	25 %	0 %	25 %	50 %	389848627
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142	NC_017943	CCTT	2	8	47213	47220	0 %	50 %	0 %	50 %	389848627
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