MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM300

Total Repeats: 7248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017943	CGG	2	6	43778	43783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848626
1003	NC_017943	GTC	2	6	43792	43797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848626
1004	NC_017943	GTCC	2	8	43811	43818	0 %	25 %	25 %	50 %	389848626
1005	NC_017943	CCG	2	6	43918	43923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848626
1006	NC_017943	CGG	2	6	43979	43984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848626
1007	NC_017943	GTC	2	6	44077	44082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848626
1008	NC_017943	GTC	2	6	44085	44090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848626
1009	NC_017943	CGC	2	6	44148	44153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848626
1010	NC_017943	GT	3	6	44214	44219	0 %	50 %	50 %	0 %	389848626
1011	NC_017943	GTA	2	6	44280	44285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848626
1012	NC_017943	CGA	2	6	44288	44293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848626
1013	NC_017943	GTCG	2	8	44301	44308	0 %	25 %	50 %	25 %	389848626
1014	NC_017943	CCG	2	6	44314	44319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848626
1015	NC_017943	TCGC	2	8	44320	44327	0 %	25 %	25 %	50 %	389848626
1016	NC_017943	TGA	2	6	44330	44335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848626
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1018	NC_017943	GTC	2	6	44364	44369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848626
1019	NC_017943	GA	3	6	44417	44422	50 %	0 %	50 %	0 %	389848626
1020	NC_017943	TGA	2	6	44525	44530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848626
1021	NC_017943	ACG	2	6	44549	44554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848626
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1023	NC_017943	TCG	2	6	44575	44580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848626
1024	NC_017943	CTCGG	2	10	44617	44626	0 %	20 %	40 %	40 %	389848626
1025	NC_017943	CCA	2	6	44637	44642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848626
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1031	NC_017943	TG	3	6	44844	44849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017943	CA	4	8	44884	44891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_017943	TAA	2	6	44895	44900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017943	AT	3	6	44927	44932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017943	ACG	2	6	44969	44974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017943	GAT	2	6	45013	45018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017943	GAC	2	6	45134	45139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017943	TAG	2	6	45172	45177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017943	AAT	2	6	45195	45200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017943	CGT	2	6	45206	45211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017943	TGC	2	6	45236	45241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_017943	GT	3	6	45278	45283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017943	CAGCT	2	10	45338	45347	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1044	NC_017943	GAAC	2	8	45451	45458	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_017943	CAG	2	6	45465	45470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1047	NC_017943	TTG	2	6	45675	45680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017943	AAC	2	6	45695	45700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017943	AT	3	6	45705	45710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017943	TG	3	6	45728	45733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017943	ATT	2	6	45737	45742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017943	CTCA	2	8	45783	45790	25 %	25 %	0 %	50 %	389848627
1053	NC_017943	G	6	6	45865	45870	0 %	0 %	100 %	0 %	389848627
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1057	NC_017943	GCC	2	6	46020	46025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848627
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1060	NC_017943	GCA	2	6	46080	46085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848627
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1062	NC_017943	CGA	2	6	46104	46109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848627
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1066	NC_017943	GCA	2	6	46329	46334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848627
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1087	NC_017943	CAGC	2	8	47241	47248	25 %	0 %	25 %	50 %	389848627
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1091	NC_017943	CT	3	6	47308	47313	0 %	50 %	0 %	50 %	389848627
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1100	NC_017943	TCCTCG	2	12	47707	47718	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	389848628
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1105	NC_017943	TCCCG	2	10	47958	47967	0 %	20 %	20 %	60 %	389848628
1106	NC_017943	GAC	2	6	47973	47978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848628
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1111	NC_017943	GGTCGC	2	12	48128	48139	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	389848628
1112	NC_017943	CGG	2	6	48148	48153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848628
1113	NC_017943	CAG	2	6	48204	48209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848628
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1116	NC_017943	CGAG	2	8	48330	48337	25 %	0 %	50 %	25 %	389848628
1117	NC_017943	GTCGGC	2	12	48357	48368	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	389848628
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1122	NC_017943	CGT	2	6	48620	48625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848628
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1127	NC_017943	TCG	2	6	48797	48802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848628
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1497	NC_017943	GTC	2	6	64861	64866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848641
1498	NC_017943	CGG	2	6	64875	64880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848641
1499	NC_017943	CGA	2	6	64905	64910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848641
1500	NC_017943	GTT	2	6	64954	64959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848641

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