MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 73186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017941	CTG	2	6	56745	56750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1502	NC_017941	CCATC	2	10	56798	56807	20 %	20 %	0 %	60 %	389845546
1503	NC_017941	CGG	2	6	56851	56856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845546
1504	NC_017941	CCGA	2	8	56862	56869	25 %	0 %	25 %	50 %	389845546
1505	NC_017941	TGC	2	6	56870	56875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1506	NC_017941	GTC	2	6	56880	56885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1507	NC_017941	GAC	2	6	56889	56894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1508	NC_017941	CG	3	6	56907	56912	0 %	0 %	50 %	50 %	389845546
1509	NC_017941	CGT	2	6	56927	56932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1510	NC_017941	TCG	2	6	56987	56992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1511	NC_017941	TCG	2	6	57043	57048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1512	NC_017941	ACG	2	6	57098	57103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1513	NC_017941	CGA	2	6	57107	57112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1514	NC_017941	GCG	2	6	57116	57121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845546
1515	NC_017941	CCT	2	6	57188	57193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845546
1516	NC_017941	GC	3	6	57287	57292	0 %	0 %	50 %	50 %	389845546
1517	NC_017941	CGA	2	6	57326	57331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1518	NC_017941	TCG	2	6	57355	57360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1519	NC_017941	CTG	2	6	57363	57368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1520	NC_017941	GTC	3	9	57381	57389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1521	NC_017941	CAG	2	6	57484	57489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1522	NC_017941	AGT	2	6	57497	57502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845546
1523	NC_017941	GCGGAA	2	12	57528	57539	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	389845546
1524	NC_017941	GAT	2	6	57615	57620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845546
1525	NC_017941	TCG	2	6	57625	57630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1526	NC_017941	GTC	2	6	57646	57651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1527	NC_017941	TCT	2	6	57667	57672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845546
1528	NC_017941	TCG	2	6	57736	57741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1529	NC_017941	TTC	2	6	57802	57807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845546
1530	NC_017941	GC	3	6	57870	57875	0 %	0 %	50 %	50 %	389845546
1531	NC_017941	CGA	2	6	57899	57904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1532	NC_017941	CGAC	2	8	57992	57999	25 %	0 %	25 %	50 %	389845546
1533	NC_017941	CGG	2	6	58058	58063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845546
1534	NC_017941	TCC	2	6	58066	58071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845546
1535	NC_017941	GGT	2	6	58118	58123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389845546
1536	NC_017941	CG	3	6	58125	58130	0 %	0 %	50 %	50 %	389845546
1537	NC_017941	CGC	2	6	58139	58144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845546
1538	NC_017941	CGA	2	6	58157	58162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1539	NC_017941	GTC	2	6	58167	58172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845546
1540	NC_017941	CCT	2	6	58247	58252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845546
1541	NC_017941	CCG	2	6	58330	58335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845546
1542	NC_017941	GAA	2	6	58354	58359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845546
1543	NC_017941	GAA	3	9	58362	58370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845546
1544	NC_017941	GCG	2	6	58399	58404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845546
1545	NC_017941	CAG	2	6	58435	58440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845547
1546	NC_017941	TCG	2	6	58469	58474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845547
1547	NC_017941	ATC	3	9	58511	58519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845547
1548	NC_017941	GCG	2	6	58523	58528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845547
1549	NC_017941	GCG	3	9	58535	58543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845547
1550	NC_017941	CG	3	6	58542	58547	0 %	0 %	50 %	50 %	389845547
1551	NC_017941	CCG	2	6	58593	58598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845547
1552	NC_017941	GTC	2	6	58666	58671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845547
1553	NC_017941	CGA	2	6	58710	58715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845547
1554	NC_017941	GAT	2	6	58729	58734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845547
1555	NC_017941	TCG	3	9	58769	58777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845547
1556	NC_017941	GAC	2	6	58780	58785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845547
1557	NC_017941	GTA	2	6	58804	58809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845547
1558	NC_017941	CGA	2	6	58821	58826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845547
1559	NC_017941	ACGT	2	8	58844	58851	25 %	25 %	25 %	25 %	389845547
1560	NC_017941	GCG	2	6	58868	58873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845547
1561	NC_017941	CGGTGA	2	12	58932	58943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389845547
1562	NC_017941	CGA	2	6	58968	58973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845547
1563	NC_017941	GC	3	6	58984	58989	0 %	0 %	50 %	50 %	389845547
1564	NC_017941	TCG	2	6	59004	59009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845547
1565	NC_017941	CGG	2	6	59010	59015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845547
1566	NC_017941	GTC	3	9	59026	59034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845547
1567	NC_017941	CGGT	2	8	59043	59050	0 %	25 %	50 %	25 %	389845547
1568	NC_017941	TGA	2	6	59094	59099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845547
1569	NC_017941	TCG	2	6	59138	59143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845547
1570	NC_017941	CAC	2	6	59152	59157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845547
1571	NC_017941	GAG	2	6	59165	59170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845547
1572	NC_017941	CGT	2	6	59199	59204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845547
1573	NC_017941	CCT	2	6	59235	59240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845547
1574	NC_017941	C	6	6	59286	59291	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1575	NC_017941	CA	3	6	59326	59331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_017941	A	6	6	59359	59364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017941	GAA	2	6	59468	59473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845548
1578	NC_017941	GTC	2	6	59483	59488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845548
1579	NC_017941	GCA	2	6	59559	59564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845548
1580	NC_017941	CGCA	2	8	59565	59572	25 %	0 %	25 %	50 %	389845548
1581	NC_017941	GAGT	2	8	59576	59583	25 %	25 %	50 %	0 %	389845548
1582	NC_017941	ATTCG	2	10	59705	59714	20 %	40 %	20 %	20 %	389845548
1583	NC_017941	TCA	2	6	59775	59780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845548
1584	NC_017941	TCG	2	6	59781	59786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845548
1585	NC_017941	CCTG	2	8	59811	59818	0 %	25 %	25 %	50 %	389845548
1586	NC_017941	ACC	2	6	59833	59838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845548
1587	NC_017941	CGT	2	6	59839	59844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845548
1588	NC_017941	AGCG	2	8	59858	59865	25 %	0 %	50 %	25 %	389845548
1589	NC_017941	CGC	2	6	59885	59890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845548
1590	NC_017941	CTT	2	6	59896	59901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845548
1591	NC_017941	TCG	2	6	59982	59987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_017941	CGATAC	2	12	60046	60057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	389845549
1593	NC_017941	GTA	2	6	60152	60157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845549
1594	NC_017941	CGG	2	6	60181	60186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845549
1595	NC_017941	GCG	2	6	60235	60240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845549
1596	NC_017941	CGA	2	6	60283	60288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845549
1597	NC_017941	ACG	2	6	60363	60368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845549
1598	NC_017941	GCC	2	6	60418	60423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845549
1599	NC_017941	GTC	2	6	60439	60444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845550
1600	NC_017941	TG	3	6	60459	60464	0 %	50 %	50 %	0 %	389845550
1601	NC_017941	CGTC	2	8	60523	60530	0 %	25 %	25 %	50 %	389845550
1602	NC_017941	GTT	2	6	60558	60563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389845550
1603	NC_017941	CTC	2	6	60586	60591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845550
1604	NC_017941	CTC	2	6	60601	60606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845550
1605	NC_017941	TG	3	6	60654	60659	0 %	50 %	50 %	0 %	389845550
1606	NC_017941	TGTC	2	8	60717	60724	0 %	50 %	25 %	25 %	389845550
1607	NC_017941	GAG	2	6	60742	60747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845550
1608	NC_017941	GTC	3	9	60832	60840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845550
1609	NC_017941	CGG	2	6	60904	60909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845550
1610	NC_017941	CG	3	6	60912	60917	0 %	0 %	50 %	50 %	389845550
1611	NC_017941	GGC	2	6	60923	60928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845550
1612	NC_017941	TCG	2	6	60960	60965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845550
1613	NC_017941	GT	4	8	60997	61004	0 %	50 %	50 %	0 %	389845550
1614	NC_017941	GTC	2	6	61018	61023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845550
1615	NC_017941	ATG	2	6	61052	61057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845550
1616	NC_017941	AG	3	6	61105	61110	50 %	0 %	50 %	0 %	389845550
1617	NC_017941	CTC	2	6	61144	61149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845550
1618	NC_017941	GTC	2	6	61156	61161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845550
1619	NC_017941	TCG	2	6	61214	61219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845550
1620	NC_017941	GCCC	2	8	61278	61285	0 %	0 %	25 %	75 %	389845550
1621	NC_017941	GTA	2	6	61306	61311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845550
1622	NC_017941	CTT	2	6	61317	61322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845550
1623	NC_017941	TG	3	6	61358	61363	0 %	50 %	50 %	0 %	389845550
1624	NC_017941	GAT	2	6	61408	61413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845550
1625	NC_017941	CTT	2	6	61486	61491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845550
1626	NC_017941	CGT	2	6	61510	61515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845550
1627	NC_017941	CGG	2	6	61529	61534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845550
1628	NC_017941	CCG	2	6	61544	61549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845550
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1630	NC_017941	CGA	2	6	61611	61616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845550
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1632	NC_017941	GTA	2	6	61702	61707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845550
1633	NC_017941	TCA	2	6	61767	61772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845550
1634	NC_017941	TG	5	10	61789	61798	0 %	50 %	50 %	0 %	389845550
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1703	NC_017941	CGA	2	6	64823	64828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845553
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1706	NC_017941	CGGA	2	8	64955	64962	25 %	0 %	50 %	25 %	389845553
1707	NC_017941	CGA	2	6	64990	64995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845553
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1744	NC_017941	CGA	2	6	66676	66681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845554
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1995	NC_017941	CGA	2	6	78437	78442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845560
1996	NC_017941	GAA	2	6	78450	78455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845560
1997	NC_017941	GC	3	6	78464	78469	0 %	0 %	50 %	50 %	389845560
1998	NC_017941	GTA	3	9	78477	78485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845560
1999	NC_017941	GCC	2	6	78489	78494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845560
2000	NC_017941	GCT	2	6	78535	78540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845560

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