MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori XZ274 chromosome

Total Repeats: 800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017926	TTGCAA	2	12	962	973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017926	CCGCAG	2	12	1138	1149	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387907370
3	NC_017926	ATTATA	2	12	1890	1901	50 %	50 %	0 %	0 %	387907371
4	NC_017926	GCGATA	2	12	3822	3833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387907373
5	NC_017926	AAAAAG	2	12	5236	5247	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017926	GCTTGC	2	12	6372	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907374
7	NC_017926	GTATGT	2	12	6833	6844	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387907374
8	NC_017926	CCGTTC	2	12	7062	7073	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387907374
9	NC_017926	TGAAAC	2	12	7860	7871	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387907375
10	NC_017926	AAATGC	2	12	8098	8109	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387907375
11	NC_017926	AAACAC	2	12	18431	18442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017926	AGAAAA	2	12	18781	18792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387907384
13	NC_017926	GATAAA	2	12	22337	22348	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387907387
14	NC_017926	TTTCTT	2	12	23065	23076	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387907388
15	NC_017926	ATGCAA	2	12	27365	27376	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387907391
16	NC_017926	ACCTTA	2	12	37415	37426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907399
17	NC_017926	AGTGGG	2	12	42126	42137	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	387907402
18	NC_017926	CCCTAA	2	12	42720	42731	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387907403
19	NC_017926	AGTGGC	2	12	42898	42909	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387907403
20	NC_017926	CATGGA	2	12	45148	45159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387907406
21	NC_017926	TTTTAT	2	12	48758	48769	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387907407
22	NC_017926	TTCTTT	2	12	49427	49438	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387907408
23	NC_017926	TGTTGG	2	12	51840	51851	0 %	50 %	50 %	0 %	387907412
24	NC_017926	ACAAAA	2	12	52766	52777	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387907413
25	NC_017926	ATTGAA	2	12	54649	54660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387907415
26	NC_017926	GGCACA	2	12	59595	59606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387907416
27	NC_017926	TGAGCA	2	12	61562	61573	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387907418
28	NC_017926	GTGCCT	2	12	64683	64694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907421
29	NC_017926	GATTTT	2	12	65019	65030	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387907421
30	NC_017926	TCTTTG	2	12	71328	71339	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017926	TGAAAT	2	12	71833	71844	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017926	ATTTGC	2	12	74141	74152	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387907428
33	NC_017926	TAAAAA	2	12	75747	75758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387907429
34	NC_017926	AGATAA	2	12	80391	80402	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017926	AGAAAA	2	12	80496	80507	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017926	GATGTG	2	12	81157	81168	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017926	AGCCAA	2	12	81235	81246	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017926	AAAAGA	2	12	82264	82275	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017926	TTTTGT	2	12	83451	83462	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387907435
40	NC_017926	AAAGAG	2	12	83730	83741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387907435
41	NC_017926	AGAAAA	2	12	85478	85489	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017926	GGACAA	2	12	87023	87034	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387907439
43	NC_017926	AGCGGG	2	12	87650	87661	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017926	ACGCCC	2	12	95463	95474	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387907448
45	NC_017926	TAAGGG	2	12	98180	98191	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387907451
46	NC_017926	CGCTAA	2	12	98544	98555	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017926	AGCGGT	2	12	99735	99746	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017926	GGCATG	2	12	101688	101699	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387907453
49	NC_017926	GCAACG	2	12	102736	102747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387907453
50	NC_017926	ATATTG	2	12	103535	103546	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387907455
51	NC_017926	AAAAGA	2	12	115886	115897	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017926	GAAAAA	2	12	116596	116607	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017926	TTTAAA	2	12	118060	118071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017926	TTAAAA	2	12	118589	118600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017926	AAACCA	2	12	120054	120065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387907466
56	NC_017926	CTAAAA	2	12	120567	120578	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017926	TTTGCT	2	12	121579	121590	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387907469
58	NC_017926	ATTGAA	2	12	124923	124934	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387907472
59	NC_017926	ATTCAA	2	12	125084	125095	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387907472
60	NC_017926	CCTTAG	2	12	125617	125628	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387907472
61	NC_017926	TAGAAC	2	12	127445	127456	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387907473
62	NC_017926	TAGAAG	2	12	127649	127660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387907473
63	NC_017926	GGTTAT	2	12	128086	128097	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387907473
64	NC_017926	GCTCAA	2	12	128706	128717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387907474
65	NC_017926	TAGAAG	2	12	129136	129147	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387907474
66	NC_017926	GGTTAT	2	12	129573	129584	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387907474
67	NC_017926	CGAGCG	2	12	133951	133962	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387907477
68	NC_017926	GGCTTG	2	12	138572	138583	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387907481
69	NC_017926	TAACGC	2	12	144562	144573	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387907487
70	NC_017926	AATATT	2	12	151181	151192	50 %	50 %	0 %	0 %	387907493
71	NC_017926	AATTAA	2	12	153853	153864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907494
72	NC_017926	CACCGC	2	12	154388	154399	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387907494
73	NC_017926	TTTTGA	2	12	155089	155100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387907495
74	NC_017926	TGAGTT	2	12	156586	156597	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387907496
75	NC_017926	TCTAAT	2	12	158461	158472	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387907499
76	NC_017926	ATTTTT	2	12	159965	159976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387907500
77	NC_017926	ATTTGT	2	12	160168	160179	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017926	AAAAAC	2	12	162363	162374	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017926	TTTGAA	2	12	162985	162996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017926	CTCCAG	2	12	164665	164676	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017926	TCATGA	2	12	165059	165070	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387907504
82	NC_017926	CTAATG	2	12	166206	166217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387907505
83	NC_017926	TTAAAA	2	12	171794	171805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017926	ATCCTT	2	12	172286	172297	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387907513
85	NC_017926	TAGCGA	2	12	173734	173745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387907515
86	NC_017926	TTAGCG	2	12	176639	176650	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387907517
87	NC_017926	TATCGC	2	12	176851	176862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387907517
88	NC_017926	GGCTTA	2	12	177500	177511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387907518
89	NC_017926	ATCGCT	2	12	178559	178570	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387907518
90	NC_017926	ATTAAG	2	12	179206	179217	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017926	CCTAAA	2	12	180781	180792	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387907519
92	NC_017926	TTCTAT	2	12	181941	181952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387907520
93	NC_017926	TTGTTT	2	12	184929	184940	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387907525
94	NC_017926	TTGGGT	2	12	190368	190379	0 %	50 %	50 %	0 %	387907531
95	NC_017926	GATTTT	2	12	190880	190891	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387907532
96	NC_017926	TTATAA	2	12	193877	193888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017926	GATGGC	2	12	194110	194121	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387907535
98	NC_017926	CTTTCT	2	12	194362	194373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907535
99	NC_017926	CCGCTC	2	12	196344	196355	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387907537
100	NC_017926	GCTCTC	2	12	198768	198779	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387907540
101	NC_017926	TAAAAA	2	12	199426	199437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017926	TTCTAA	2	12	201089	201100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387907542
103	NC_017926	TCAATA	2	12	202771	202782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387907544
104	NC_017926	CGTTTT	2	12	202880	202891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387907544
105	NC_017926	ATCGTT	2	12	203193	203204	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387907544
106	NC_017926	AATTTC	2	12	203544	203555	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017926	TAAAAT	2	12	204819	204830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907545
108	NC_017926	ATTTTG	2	12	206632	206643	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387907547
109	NC_017926	CGCTTT	2	12	207109	207120	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387907547
110	NC_017926	ACTTAT	2	12	207206	207217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017926	GTTTAA	2	12	207893	207904	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387907548
112	NC_017926	CCGCTC	2	12	210544	210555	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387907551
113	NC_017926	GAAAAA	2	12	214166	214177	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387907554
114	NC_017926	AGGCAT	2	12	214255	214266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387907554
115	NC_017926	GCATTT	2	12	215968	215979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387907556
116	NC_017926	TCAAAC	2	12	216535	216546	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387907557
117	NC_017926	ATAAAG	2	12	216696	216707	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387907557
118	NC_017926	ATTCTT	2	12	217020	217031	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387907558
119	NC_017926	GGTATT	2	12	220480	220491	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387907561
120	NC_017926	TCTAAA	2	12	220710	220721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387907561
121	NC_017926	TGGGCA	2	12	221778	221789	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387907562
122	NC_017926	TTCTAA	2	12	222257	222268	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387907563
123	NC_017926	ATTTTC	2	12	224202	224213	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387907563
124	NC_017926	TGGGGC	2	12	231614	231625	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387907572
125	NC_017926	TTTTTA	2	12	232156	232167	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017926	AATTTT	2	12	235760	235771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017926	TATAAT	2	12	243124	243135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017926	ATTCTA	2	12	243444	243455	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387907580
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135	NC_017926	AGTGAG	2	12	257884	257895	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017926	GATTTT	2	12	297284	297295	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_017926	AAAAAT	2	12	452322	452333	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_017926	CATCGC	2	12	454707	454718	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387907768
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