MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori XZ274 plasmid pXZ274

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017919	TAAA	2	8	174	181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017919	TTAC	2	8	980	987	25 %	50 %	0 %	25 %	387908783
3	NC_017919	GAAA	2	8	1044	1051	75 %	0 %	25 %	0 %	387908783
4	NC_017919	TAGA	2	8	2024	2031	50 %	25 %	25 %	0 %	387908783
5	NC_017919	CCAA	2	8	2559	2566	50 %	0 %	0 %	50 %	387908784
6	NC_017919	AAGA	2	8	2973	2980	75 %	0 %	25 %	0 %	387908785
7	NC_017919	AAAG	2	8	3159	3166	75 %	0 %	25 %	0 %	387908785
8	NC_017919	TGAA	2	8	3277	3284	50 %	25 %	25 %	0 %	387908785
9	NC_017919	AGTG	2	8	3440	3447	25 %	25 %	50 %	0 %	387908785
10	NC_017919	AAAC	3	12	3695	3706	75 %	0 %	0 %	25 %	387908786
11	NC_017919	TGAA	2	8	3782	3789	50 %	25 %	25 %	0 %	387908786
12	NC_017919	GAAA	2	8	4693	4700	75 %	0 %	25 %	0 %	387908787
13	NC_017919	ATGG	2	8	5116	5123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017919	TTCT	2	8	5318	5325	0 %	75 %	0 %	25 %	387908788
15	NC_017919	TTGT	2	8	5540	5547	0 %	75 %	25 %	0 %	387908788
16	NC_017919	TTTA	2	8	6059	6066	25 %	75 %	0 %	0 %	387908788
17	NC_017919	AAAT	2	8	6383	6390	75 %	25 %	0 %	0 %	387908788
18	NC_017919	AGTG	2	8	6566	6573	25 %	25 %	50 %	0 %	387908788
19	NC_017919	TTAA	2	8	7216	7223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017919	AAGA	2	8	7618	7625	75 %	0 %	25 %	0 %	387908789
21	NC_017919	AAGA	2	8	7654	7661	75 %	0 %	25 %	0 %	387908790
22	NC_017919	AAAG	2	8	7705	7712	75 %	0 %	25 %	0 %	387908790
23	NC_017919	GATT	2	8	9238	9245	25 %	50 %	25 %	0 %	387908791
24	NC_017919	AAAT	2	8	9335	9342	75 %	25 %	0 %	0 %	387908791
25	NC_017919	AAAT	2	8	10302	10309	75 %	25 %	0 %	0 %	387908792
26	NC_017919	TCAA	2	8	11673	11680	50 %	25 %	0 %	25 %	387908795
27	NC_017919	GGCT	2	8	12099	12106	0 %	25 %	50 %	25 %	387908795
28	NC_017919	AGTA	2	8	12334	12341	50 %	25 %	25 %	0 %	387908796
29	NC_017919	TTTC	2	8	12446	12453	0 %	75 %	0 %	25 %	387908796
30	NC_017919	CTTG	2	8	12832	12839	0 %	50 %	25 %	25 %	387908798
31	NC_017919	GTTT	2	8	13743	13750	0 %	75 %	25 %	0 %	387908799
32	NC_017919	TTTG	2	8	14347	14354	0 %	75 %	25 %	0 %	387908800
33	NC_017919	TCAA	2	8	14643	14650	50 %	25 %	0 %	25 %	387908800
34	NC_017919	GATT	2	8	15043	15050	25 %	50 %	25 %	0 %	387908800
35	NC_017919	TTTG	2	8	15154	15161	0 %	75 %	25 %	0 %	387908800
36	NC_017919	CGCT	2	8	15352	15359	0 %	25 %	25 %	50 %	387908800
37	NC_017919	TGCC	2	8	15556	15563	0 %	25 %	25 %	50 %	387908800
38	NC_017919	TCTT	2	8	16777	16784	0 %	75 %	0 %	25 %	387908801
39	NC_017919	TCTT	2	8	17600	17607	0 %	75 %	0 %	25 %	387908803
40	NC_017919	AATC	2	8	17998	18005	50 %	25 %	0 %	25 %	387908803
41	NC_017919	CACT	2	8	18390	18397	25 %	25 %	0 %	50 %	387908803
42	NC_017919	CCTA	2	8	18466	18473	25 %	25 %	0 %	50 %	387908803
43	NC_017919	CTTT	2	8	18909	18916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017919	GTTT	2	8	18959	18966	0 %	75 %	25 %	0 %	387908804
45	NC_017919	GAGC	2	8	19311	19318	25 %	0 %	50 %	25 %	387908804
46	NC_017919	AATA	2	8	19430	19437	75 %	25 %	0 %	0 %	387908804
47	NC_017919	GTCA	2	8	19849	19856	25 %	25 %	25 %	25 %	387908804
48	NC_017919	CATT	2	8	19869	19876	25 %	50 %	0 %	25 %	387908804
49	NC_017919	TTTC	2	8	20183	20190	0 %	75 %	0 %	25 %	387908804
50	NC_017919	TGAT	2	8	20322	20329	25 %	50 %	25 %	0 %	387908804
51	NC_017919	AACT	2	8	20331	20338	50 %	25 %	0 %	25 %	387908804
52	NC_017919	CTTT	2	8	20447	20454	0 %	75 %	0 %	25 %	387908804
53	NC_017919	TTGT	2	8	20659	20666	0 %	75 %	25 %	0 %	387908804
54	NC_017919	AAGA	2	8	21545	21552	75 %	0 %	25 %	0 %	387908805
55	NC_017919	TTCT	2	8	22111	22118	0 %	75 %	0 %	25 %	387908807
56	NC_017919	TAAA	2	8	22375	22382	75 %	25 %	0 %	0 %	387908807

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.