MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611 plasmid pHci1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017762	A	7	7	63	69	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017762	T	6	6	1789	1794	0 %	100 %	0 %	0 %	386829697
3	NC_017762	T	6	6	1880	1885	0 %	100 %	0 %	0 %	386829697
4	NC_017762	T	6	6	2082	2087	0 %	100 %	0 %	0 %	386829698
5	NC_017762	T	7	7	2223	2229	0 %	100 %	0 %	0 %	386829699
6	NC_017762	T	6	6	2486	2491	0 %	100 %	0 %	0 %	386829699
7	NC_017762	A	6	6	2526	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	386829699
8	NC_017762	T	6	6	3413	3418	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
9	NC_017762	A	6	6	3608	3613	100 %	0 %	0 %	0 %	386829701
10	NC_017762	T	6	6	3668	3673	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
11	NC_017762	T	7	7	3687	3693	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
12	NC_017762	T	7	7	3719	3725	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
13	NC_017762	T	7	7	3799	3805	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
14	NC_017762	T	6	6	4412	4417	0 %	100 %	0 %	0 %	386829702
15	NC_017762	T	6	6	5260	5265	0 %	100 %	0 %	0 %	386829704
16	NC_017762	A	6	6	5449	5454	100 %	0 %	0 %	0 %	386829704
17	NC_017762	T	6	6	5487	5492	0 %	100 %	0 %	0 %	386829704
18	NC_017762	T	6	6	5689	5694	0 %	100 %	0 %	0 %	386829704
19	NC_017762	T	6	6	5913	5918	0 %	100 %	0 %	0 %	386829705
20	NC_017762	A	6	6	5970	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017762	T	6	6	6476	6481	0 %	100 %	0 %	0 %	386829707
22	NC_017762	T	7	7	6488	6494	0 %	100 %	0 %	0 %	386829707
23	NC_017762	T	6	6	6634	6639	0 %	100 %	0 %	0 %	386829707
24	NC_017762	T	6	6	6746	6751	0 %	100 %	0 %	0 %	386829707
25	NC_017762	A	6	6	6900	6905	100 %	0 %	0 %	0 %	386829707
26	NC_017762	T	7	7	7170	7176	0 %	100 %	0 %	0 %	386829707
27	NC_017762	T	6	6	7909	7914	0 %	100 %	0 %	0 %	386829708
28	NC_017762	T	6	6	8040	8045	0 %	100 %	0 %	0 %	386829708
29	NC_017762	A	6	6	8241	8246	100 %	0 %	0 %	0 %	386829708
30	NC_017762	T	6	6	8923	8928	0 %	100 %	0 %	0 %	386829709
31	NC_017762	A	7	7	10379	10385	100 %	0 %	0 %	0 %	386829709
32	NC_017762	A	6	6	10567	10572	100 %	0 %	0 %	0 %	386829709
33	NC_017762	T	7	7	11087	11093	0 %	100 %	0 %	0 %	386829710
34	NC_017762	A	6	6	11289	11294	100 %	0 %	0 %	0 %	386829710
35	NC_017762	T	6	6	11337	11342	0 %	100 %	0 %	0 %	386829710
36	NC_017762	T	6	6	12578	12583	0 %	100 %	0 %	0 %	386829710
37	NC_017762	T	6	6	12703	12708	0 %	100 %	0 %	0 %	386829711
38	NC_017762	T	7	7	12868	12874	0 %	100 %	0 %	0 %	386829711
39	NC_017762	A	6	6	13503	13508	100 %	0 %	0 %	0 %	386829712
40	NC_017762	A	6	6	13756	13761	100 %	0 %	0 %	0 %	386829712
41	NC_017762	T	6	6	13789	13794	0 %	100 %	0 %	0 %	386829712
42	NC_017762	T	7	7	13886	13892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017762	T	7	7	14100	14106	0 %	100 %	0 %	0 %	386829713
44	NC_017762	A	6	6	14315	14320	100 %	0 %	0 %	0 %	386829713
45	NC_017762	T	6	6	16191	16196	0 %	100 %	0 %	0 %	386829716
46	NC_017762	A	6	6	16404	16409	100 %	0 %	0 %	0 %	386829716
47	NC_017762	A	6	6	16628	16633	100 %	0 %	0 %	0 %	386829716
48	NC_017762	T	6	6	17171	17176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017762	A	6	6	17580	17585	100 %	0 %	0 %	0 %	386829717
50	NC_017762	T	6	6	18639	18644	0 %	100 %	0 %	0 %	386829718
51	NC_017762	T	6	6	18932	18937	0 %	100 %	0 %	0 %	386829718
52	NC_017762	A	7	7	19412	19418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017762	A	6	6	19431	19436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017762	T	6	6	19507	19512	0 %	100 %	0 %	0 %	386829719
55	NC_017762	A	6	6	19684	19689	100 %	0 %	0 %	0 %	386829719
56	NC_017762	A	7	7	19880	19886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017762	A	6	6	19935	19940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017762	A	6	6	19950	19955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017762	A	6	6	20627	20632	100 %	0 %	0 %	0 %	386829720
60	NC_017762	T	6	6	20716	20721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017762	A	6	6	20892	20897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017762	A	6	6	20981	20986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017762	A	6	6	21021	21026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017762	A	6	6	21131	21136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017762	A	6	6	21353	21358	100 %	0 %	0 %	0 %	386829721
66	NC_017762	A	7	7	21459	21465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017762	A	6	6	21630	21635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017762	A	8	8	21695	21702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017762	T	6	6	21778	21783	0 %	100 %	0 %	0 %	386829722
70	NC_017762	A	7	7	22191	22197	100 %	0 %	0 %	0 %	386829723
71	NC_017762	T	6	6	22210	22215	0 %	100 %	0 %	0 %	386829723
72	NC_017762	A	6	6	22549	22554	100 %	0 %	0 %	0 %	386829723
73	NC_017762	T	7	7	22598	22604	0 %	100 %	0 %	0 %	386829723
74	NC_017762	A	8	8	22801	22808	100 %	0 %	0 %	0 %	386829724
75	NC_017762	A	6	6	22967	22972	100 %	0 %	0 %	0 %	386829724

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.