MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori PeCan18 chromosome

Total Repeats: 1333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017742	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386755087
2	NC_017742	TCATT	2	10	4918	4927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017742	CAAAA	2	10	5204	5213	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017742	CAAAA	2	10	5314	5323	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017742	CCATG	2	10	5520	5529	20 %	20 %	20 %	40 %	386755091
6	NC_017742	TTGAT	2	10	6410	6419	20 %	60 %	20 %	0 %	386755091
7	NC_017742	TTGCT	2	10	6527	6536	0 %	60 %	20 %	20 %	386755091
8	NC_017742	TTTTA	2	10	7670	7679	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017742	TTTCT	2	10	8598	8607	0 %	80 %	0 %	20 %	386755092
10	NC_017742	AATTT	2	10	9437	9446	40 %	60 %	0 %	0 %	386755092
11	NC_017742	AAAGG	2	10	11071	11080	60 %	0 %	40 %	0 %	386755094
12	NC_017742	TGCCA	2	10	12071	12080	20 %	20 %	20 %	40 %	386755095
13	NC_017742	TTTTG	2	10	12127	12136	0 %	80 %	20 %	0 %	386755095
14	NC_017742	GGGTT	2	10	12349	12358	0 %	40 %	60 %	0 %	386755095
15	NC_017742	TGGTG	2	10	12965	12974	0 %	40 %	60 %	0 %	386755096
16	NC_017742	GCTTT	2	10	13792	13801	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017742	AAACA	2	10	14758	14767	80 %	0 %	0 %	20 %	386755099
18	NC_017742	CCATG	2	10	23702	23711	20 %	20 %	20 %	40 %	386755106
19	NC_017742	CTCTT	2	10	23732	23741	0 %	60 %	0 %	40 %	386755106
20	NC_017742	AGCCT	2	10	26222	26231	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017742	CAAGC	2	10	28404	28413	40 %	0 %	20 %	40 %	386755108
22	NC_017742	GCTGG	2	10	28777	28786	0 %	20 %	60 %	20 %	386755108
23	NC_017742	TTTTA	2	10	29330	29339	20 %	80 %	0 %	0 %	386755109
24	NC_017742	TAGCG	2	10	29992	30001	20 %	20 %	40 %	20 %	386755110
25	NC_017742	TGATT	2	10	32350	32359	20 %	60 %	20 %	0 %	386755112
26	NC_017742	GTGGG	2	10	34230	34239	0 %	20 %	80 %	0 %	386755114
27	NC_017742	ATCAA	2	10	36362	36371	60 %	20 %	0 %	20 %	386755117
28	NC_017742	TTTTG	2	10	38858	38867	0 %	80 %	20 %	0 %	386755121
29	NC_017742	TGAGT	2	10	40878	40887	20 %	40 %	40 %	0 %	386755123
30	NC_017742	CAAAC	2	10	41904	41913	60 %	0 %	0 %	40 %	386755123
31	NC_017742	AGAAA	2	10	42590	42599	80 %	0 %	20 %	0 %	386755124
32	NC_017742	CCCAC	2	10	42954	42963	20 %	0 %	0 %	80 %	386755124
33	NC_017742	TTACT	2	10	43442	43451	20 %	60 %	0 %	20 %	386755125
34	NC_017742	TTGCA	2	10	44535	44544	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017742	ATTGT	2	10	44586	44595	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017742	TAAAA	2	10	45824	45833	80 %	20 %	0 %	0 %	386755127
37	NC_017742	GCTCC	2	10	47157	47166	0 %	20 %	20 %	60 %	386755128
38	NC_017742	AAAAT	2	10	47336	47345	80 %	20 %	0 %	0 %	386755128
39	NC_017742	TCGCA	2	10	47694	47703	20 %	20 %	20 %	40 %	386755128
40	NC_017742	AGGGC	2	10	47937	47946	20 %	0 %	60 %	20 %	386755128
41	NC_017742	CAATA	2	10	49262	49271	60 %	20 %	0 %	20 %	386755129
42	NC_017742	TGCCT	2	10	49949	49958	0 %	40 %	20 %	40 %	386755130
43	NC_017742	GATTG	2	10	50433	50442	20 %	40 %	40 %	0 %	386755131
44	NC_017742	AAATA	2	10	51737	51746	80 %	20 %	0 %	0 %	386755132
45	NC_017742	CCAAA	2	10	52070	52079	60 %	0 %	0 %	40 %	386755133
46	NC_017742	TAAAA	2	10	54127	54136	80 %	20 %	0 %	0 %	386755133
47	NC_017742	ATCAA	2	10	54158	54167	60 %	20 %	0 %	20 %	386755133
48	NC_017742	AATTC	2	10	54299	54308	40 %	40 %	0 %	20 %	386755133
49	NC_017742	TGAAA	2	10	54888	54897	60 %	20 %	20 %	0 %	386755134
50	NC_017742	TCAAA	2	10	55142	55151	60 %	20 %	0 %	20 %	386755134
51	NC_017742	TCGTT	2	10	55952	55961	0 %	60 %	20 %	20 %	386755134
52	NC_017742	CAGCA	2	10	56089	56098	40 %	0 %	20 %	40 %	386755135
53	NC_017742	TCAAA	2	10	58897	58906	60 %	20 %	0 %	20 %	386755135
54	NC_017742	AACGA	2	10	59900	59909	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017742	TTAAA	2	10	59912	59921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017742	ACAAA	2	10	59940	59949	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017742	ATATA	2	10	60253	60262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017742	TATCC	2	10	63378	63387	20 %	40 %	0 %	40 %	386755138
59	NC_017742	GGTGG	2	10	68838	68847	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017742	AAGGG	2	10	70868	70877	40 %	0 %	60 %	0 %	386755143
61	NC_017742	TTTCT	2	10	72621	72630	0 %	80 %	0 %	20 %	386755146
62	NC_017742	CTTGG	2	10	72884	72893	0 %	40 %	40 %	20 %	386755146
63	NC_017742	CTTCT	2	10	72938	72947	0 %	60 %	0 %	40 %	386755146
64	NC_017742	TGCCT	2	10	73015	73024	0 %	40 %	20 %	40 %	386755146
65	NC_017742	TCCAA	2	10	73427	73436	40 %	20 %	0 %	40 %	386755147
66	NC_017742	TTTTG	2	10	76726	76735	0 %	80 %	20 %	0 %	386755151
67	NC_017742	ACGCC	2	10	77032	77041	20 %	0 %	20 %	60 %	386755151
68	NC_017742	AAAGC	2	10	77798	77807	60 %	0 %	20 %	20 %	386755152
69	NC_017742	TTACA	2	10	78580	78589	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017742	TAAAA	2	10	80263	80272	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017742	TTTTC	2	10	86064	86073	0 %	80 %	0 %	20 %	386755159
72	NC_017742	TCTTG	2	10	86218	86227	0 %	60 %	20 %	20 %	386755159
73	NC_017742	ATGCC	2	10	87202	87211	20 %	20 %	20 %	40 %	386755161
74	NC_017742	TTGAT	2	10	88288	88297	20 %	60 %	20 %	0 %	386755163
75	NC_017742	GGCGT	2	10	90102	90111	0 %	20 %	60 %	20 %	386755165
76	NC_017742	ATAAG	2	10	93281	93290	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017742	ATTAT	2	10	93338	93347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017742	TTCCA	2	10	93424	93433	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017742	CTTTC	2	10	93666	93675	0 %	60 %	0 %	40 %	386755167
80	NC_017742	CACAC	2	10	94625	94634	40 %	0 %	0 %	60 %	386755168
81	NC_017742	TGATT	2	10	96461	96470	20 %	60 %	20 %	0 %	386755169
82	NC_017742	TCTTT	2	10	96670	96679	0 %	80 %	0 %	20 %	386755169
83	NC_017742	GGCTT	2	10	97781	97790	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017742	ATAAA	2	10	99788	99797	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017742	AATTT	2	10	102306	102315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017742	ACGAT	2	10	102754	102763	40 %	20 %	20 %	20 %	386755174
87	NC_017742	TTTTC	2	10	102949	102958	0 %	80 %	0 %	20 %	386755174
88	NC_017742	GAATT	2	10	104595	104604	40 %	40 %	20 %	0 %	386755175
89	NC_017742	TCGTT	2	10	106397	106406	0 %	60 %	20 %	20 %	386755176
90	NC_017742	TTAGA	2	10	107408	107417	40 %	40 %	20 %	0 %	386755178
91	NC_017742	AAAAT	2	10	108968	108977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017742	CCACC	2	10	111639	111648	20 %	0 %	0 %	80 %	386755181
93	NC_017742	AAAGC	2	10	112454	112463	60 %	0 %	20 %	20 %	386755181
94	NC_017742	GAATG	2	10	113691	113700	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017742	CAAAT	2	10	115021	115030	60 %	20 %	0 %	20 %	386755183
96	NC_017742	ACCCT	2	10	116449	116458	20 %	20 %	0 %	60 %	386755184
97	NC_017742	ATGCC	2	10	116581	116590	20 %	20 %	20 %	40 %	386755184
98	NC_017742	ATTTA	2	10	117966	117975	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017742	TGATT	2	10	118572	118581	20 %	60 %	20 %	0 %	386755186
100	NC_017742	CTAAA	2	10	119043	119052	60 %	20 %	0 %	20 %	386755188
101	NC_017742	GAATT	2	10	119192	119201	40 %	40 %	20 %	0 %	386755188
102	NC_017742	GATCG	2	10	123054	123063	20 %	20 %	40 %	20 %	386755190
103	NC_017742	AAGCC	2	10	124958	124967	40 %	0 %	20 %	40 %	386755191
104	NC_017742	CCATA	2	10	125836	125845	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017742	TTGAT	2	10	126778	126787	20 %	60 %	20 %	0 %	386755192
106	NC_017742	TGATC	2	10	126954	126963	20 %	40 %	20 %	20 %	386755192
107	NC_017742	TTTGA	2	10	128021	128030	20 %	60 %	20 %	0 %	386755193
108	NC_017742	ATCTC	2	10	129306	129315	20 %	40 %	0 %	40 %	386755193
109	NC_017742	CGCTT	2	10	129464	129473	0 %	40 %	20 %	40 %	386755193
110	NC_017742	TTTGT	2	10	129820	129829	0 %	80 %	20 %	0 %	386755194
111	NC_017742	TGCGT	2	10	131852	131861	0 %	40 %	40 %	20 %	386755196
112	NC_017742	GAAAA	2	10	132013	132022	80 %	0 %	20 %	0 %	386755196
113	NC_017742	CGTTT	2	10	132280	132289	0 %	60 %	20 %	20 %	386755196
114	NC_017742	ATTTT	2	10	134570	134579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017742	ATTTT	2	10	135440	135449	20 %	80 %	0 %	0 %	386755201
116	NC_017742	ATGTT	2	10	135522	135531	20 %	60 %	20 %	0 %	386755201
117	NC_017742	AAAAG	2	10	135934	135943	80 %	0 %	20 %	0 %	386755201
118	NC_017742	AAATC	2	10	137955	137964	60 %	20 %	0 %	20 %	386755202
119	NC_017742	AAAAT	2	10	139427	139436	80 %	20 %	0 %	0 %	386755203
120	NC_017742	ATAAA	2	10	141204	141213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017742	TTTTC	2	10	141981	141990	0 %	80 %	0 %	20 %	386755206
122	NC_017742	TCAAT	2	10	142233	142242	40 %	40 %	0 %	20 %	386755207
123	NC_017742	TTCTT	2	10	143937	143946	0 %	80 %	0 %	20 %	386755208
124	NC_017742	TCTTT	2	10	144431	144440	0 %	80 %	0 %	20 %	386755209
125	NC_017742	GTTTT	2	10	145590	145599	0 %	80 %	20 %	0 %	386755210
126	NC_017742	AATTC	2	10	146225	146234	40 %	40 %	0 %	20 %	386755210
127	NC_017742	GCGAT	2	10	146384	146393	20 %	20 %	40 %	20 %	386755210
128	NC_017742	TTTTG	2	10	147292	147301	0 %	80 %	20 %	0 %	386755211
129	NC_017742	CCAAA	2	10	149132	149141	60 %	0 %	0 %	40 %	386755212
130	NC_017742	TACTT	2	10	152420	152429	20 %	60 %	0 %	20 %	386755214
131	NC_017742	ACGCC	2	10	152654	152663	20 %	0 %	20 %	60 %	386755214
132	NC_017742	ATTTG	2	10	155893	155902	20 %	60 %	20 %	0 %	386755221
133	NC_017742	CAAAT	2	10	158313	158322	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017742	AAAAC	2	10	159037	159046	80 %	0 %	0 %	20 %	386755224
135	NC_017742	AGATT	2	10	160936	160945	40 %	40 %	20 %	0 %	386755226
136	NC_017742	AAGCC	2	10	162274	162283	40 %	0 %	20 %	40 %	386755229
137	NC_017742	ATTCA	2	10	165977	165986	40 %	40 %	0 %	20 %	386755232
138	NC_017742	CACTT	2	10	166181	166190	20 %	40 %	0 %	40 %	386755232
139	NC_017742	AAAAC	2	10	168314	168323	80 %	0 %	0 %	20 %	386755234
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141	NC_017742	TAATT	2	10	173855	173864	40 %	60 %	0 %	0 %	386755241
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267	NC_017742	AATAA	2	10	346622	346631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017742	AATAA	2	10	346634	346643	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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