MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori PeCan18 chromosome

Total Repeats: 16741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017742	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755085
2	NC_017742	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755085
3	NC_017742	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755085
4	NC_017742	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755085
5	NC_017742	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755085
6	NC_017742	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755086
7	NC_017742	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755086
8	NC_017742	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755086
9	NC_017742	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755086
10	NC_017742	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755087
11	NC_017742	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755087
12	NC_017742	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755087
13	NC_017742	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755087
14	NC_017742	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755087
15	NC_017742	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755087
16	NC_017742	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386755087
17	NC_017742	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755087
18	NC_017742	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755087
19	NC_017742	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755087
20	NC_017742	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755088
21	NC_017742	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755088
22	NC_017742	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755088
23	NC_017742	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755088
24	NC_017742	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755088
25	NC_017742	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755088
26	NC_017742	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755088
27	NC_017742	TTC	2	6	2459	2464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017742	TGA	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755089
29	NC_017742	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755089
30	NC_017742	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755089
31	NC_017742	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755089
32	NC_017742	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755089
33	NC_017742	TGC	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755090
34	NC_017742	GTT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755090
35	NC_017742	ATC	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755090
36	NC_017742	CAG	2	6	3824	3829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386755090
37	NC_017742	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755090
38	NC_017742	TGT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755090
39	NC_017742	GGC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386755090
40	NC_017742	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017742	TAT	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017742	AAT	2	6	4155	4160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017742	TGG	2	6	4173	4178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017742	TGG	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017742	GTG	2	6	4420	4425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017742	ACC	2	6	4452	4457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017742	GGT	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017742	TAA	2	6	4817	4822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017742	TTA	2	6	4826	4831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017742	TGT	2	6	4907	4912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017742	AAG	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017742	TAA	2	6	5175	5180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017742	ATT	2	6	5638	5643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755091
54	NC_017742	TGG	2	6	5736	5741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755091
55	NC_017742	CTT	2	6	5876	5881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755091
56	NC_017742	GTT	2	6	5938	5943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755091
57	NC_017742	TTA	2	6	6065	6070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755091
58	NC_017742	GTG	2	6	6134	6139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755091
59	NC_017742	CAA	2	6	6202	6207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755091
60	NC_017742	TGT	2	6	6255	6260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755091
61	NC_017742	GCG	2	6	6513	6518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386755091
62	NC_017742	CGA	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386755091
63	NC_017742	TCA	2	6	6683	6688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755091
64	NC_017742	TTG	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755091
65	NC_017742	ACT	2	6	6811	6816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755091
66	NC_017742	CAC	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755091
67	NC_017742	TCG	2	6	7068	7073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755091
68	NC_017742	AAC	2	6	7099	7104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755091
69	NC_017742	CCG	2	6	7179	7184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755091
70	NC_017742	GCT	2	6	7294	7299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755091
71	NC_017742	GTT	2	6	7324	7329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755091
72	NC_017742	AGC	2	6	7474	7479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017742	GGT	2	6	7646	7651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017742	AAG	2	6	7771	7776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017742	CAT	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755092
76	NC_017742	GCC	2	6	7825	7830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755092
77	NC_017742	TCT	2	6	7886	7891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
78	NC_017742	AAT	2	6	7984	7989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755092
79	NC_017742	CTT	2	6	7992	7997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
80	NC_017742	CAT	2	6	8082	8087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755092
81	NC_017742	ATG	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755092
82	NC_017742	TCA	2	6	8159	8164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755092
83	NC_017742	CTT	2	6	8232	8237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
84	NC_017742	CCG	2	6	8241	8246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755092
85	NC_017742	CAT	2	6	8436	8441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755092
86	NC_017742	GTG	2	6	8468	8473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755092
87	NC_017742	TTC	2	6	8548	8553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
88	NC_017742	CCG	2	6	8567	8572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755092
89	NC_017742	CAC	2	6	8668	8673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755092
90	NC_017742	GAT	2	6	8710	8715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755092
91	NC_017742	TAG	2	6	8749	8754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755092
92	NC_017742	GGA	2	6	8757	8762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386755092
93	NC_017742	TCT	2	6	9032	9037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
94	NC_017742	CTT	2	6	9153	9158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
95	NC_017742	CTT	2	6	9231	9236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
96	NC_017742	TAA	3	9	9467	9475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017742	TCT	2	6	9588	9593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755093
98	NC_017742	GAT	3	9	9758	9766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755093
99	NC_017742	TCT	2	6	9786	9791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755093
100	NC_017742	CTA	2	6	9802	9807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755093
101	NC_017742	TTA	2	6	9889	9894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017742	ATT	2	6	9968	9973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017742	TTA	2	6	9994	9999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017742	CAA	2	6	10036	10041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017742	TTG	2	6	10229	10234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755094
106	NC_017742	GAA	2	6	10245	10250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755094
107	NC_017742	TTA	2	6	10424	10429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755094
108	NC_017742	AGA	2	6	10439	10444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755094
109	NC_017742	ACC	2	6	10447	10452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755094
110	NC_017742	AAG	2	6	10480	10485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755094
111	NC_017742	ATT	2	6	10513	10518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755094
112	NC_017742	CAT	2	6	10694	10699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755094
113	NC_017742	ATG	2	6	11008	11013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755094
114	NC_017742	GGC	2	6	11033	11038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386755094
115	NC_017742	AAC	2	6	11100	11105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755094
116	NC_017742	ATC	2	6	11131	11136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755094
117	NC_017742	AGA	2	6	11486	11491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755094
118	NC_017742	GAC	2	6	11586	11591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386755094
119	NC_017742	TTA	3	9	11607	11615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755094
120	NC_017742	TTG	2	6	11664	11669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755094
121	NC_017742	TGT	2	6	11850	11855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755095
122	NC_017742	ACG	2	6	12012	12017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386755095
123	NC_017742	TGT	2	6	12018	12023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755095
124	NC_017742	AAG	2	6	12177	12182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755095
125	NC_017742	TAA	2	6	12487	12492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755095
126	NC_017742	TGG	3	9	12588	12596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755095
127	NC_017742	GAA	3	9	12605	12613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755095
128	NC_017742	AGA	2	6	12709	12714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755095
129	NC_017742	AGG	2	6	12934	12939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017742	TTA	2	6	13021	13026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755096
131	NC_017742	GAA	2	6	13038	13043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755096
132	NC_017742	GTT	2	6	13061	13066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755096
133	NC_017742	GTT	2	6	13105	13110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755096
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255	NC_017742	ATT	2	6	26078	26083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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