MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi112 chromosome

Total Repeats: 4745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017741	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	386753520
2	NC_017741	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	386753520
3	NC_017741	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386753521
4	NC_017741	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386753522
5	NC_017741	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	386753522
6	NC_017741	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	386753523
7	NC_017741	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	386753523
8	NC_017741	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	386753523
9	NC_017741	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	386753523
10	NC_017741	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	386753523
11	NC_017741	TCTT	2	8	2557	2564	0 %	75 %	0 %	25 %	386753524
12	NC_017741	CAAA	2	8	3100	3107	75 %	0 %	0 %	25 %	386753524
13	NC_017741	GAAA	2	8	3247	3254	75 %	0 %	25 %	0 %	386753525
14	NC_017741	GAAA	2	8	3322	3329	75 %	0 %	25 %	0 %	386753525
15	NC_017741	AGTG	2	8	3343	3350	25 %	25 %	50 %	0 %	386753525
16	NC_017741	CAAG	2	8	3823	3830	50 %	0 %	25 %	25 %	386753525
17	NC_017741	ATGC	2	8	4281	4288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017741	TAAA	2	8	4689	4696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017741	CATT	2	8	5282	5289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017741	GTGC	2	8	5860	5867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017741	TTGT	2	8	6331	6338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017741	TGGT	2	8	6631	6638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017741	ATCG	2	8	6805	6812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017741	CGTT	2	8	6840	6847	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017741	TTCA	2	8	7588	7595	25 %	50 %	0 %	25 %	386753526
26	NC_017741	TCTT	2	8	7882	7889	0 %	75 %	0 %	25 %	386753526
27	NC_017741	AAGC	2	8	8697	8704	50 %	0 %	25 %	25 %	386753526
28	NC_017741	ATAA	2	8	9382	9389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017741	ATTC	2	8	9585	9592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017741	GATA	2	8	9674	9681	50 %	25 %	25 %	0 %	386753528
31	NC_017741	TCAA	2	8	9781	9788	50 %	25 %	0 %	25 %	386753528
32	NC_017741	ACAA	2	8	10363	10370	75 %	0 %	0 %	25 %	386753528
33	NC_017741	GCTC	2	8	11224	11231	0 %	25 %	25 %	50 %	386753528
34	NC_017741	ATTG	2	8	11576	11583	25 %	50 %	25 %	0 %	386753529
35	NC_017741	GCAA	2	8	11767	11774	50 %	0 %	25 %	25 %	386753529
36	NC_017741	TGCT	2	8	11972	11979	0 %	50 %	25 %	25 %	386753529
37	NC_017741	GGCC	2	8	12235	12242	0 %	0 %	50 %	50 %	386753529
38	NC_017741	TTTG	2	8	12352	12359	0 %	75 %	25 %	0 %	386753529
39	NC_017741	TGCA	2	8	12453	12460	25 %	25 %	25 %	25 %	386753530
40	NC_017741	GTTT	2	8	12866	12873	0 %	75 %	25 %	0 %	386753530
41	NC_017741	TCTT	2	8	13253	13260	0 %	75 %	0 %	25 %	386753530
42	NC_017741	TTAA	2	8	13401	13408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017741	AGCG	2	8	13726	13733	25 %	0 %	50 %	25 %	386753532
44	NC_017741	GATT	2	8	13834	13841	25 %	50 %	25 %	0 %	386753532
45	NC_017741	CAAA	2	8	14003	14010	75 %	0 %	0 %	25 %	386753533
46	NC_017741	ATGC	2	8	14418	14425	25 %	25 %	25 %	25 %	386753533
47	NC_017741	GAGC	2	8	14723	14730	25 %	0 %	50 %	25 %	386753533
48	NC_017741	TTTA	2	8	15005	15012	25 %	75 %	0 %	0 %	386753533
49	NC_017741	CAGG	2	8	16163	16170	25 %	0 %	50 %	25 %	386753533
50	NC_017741	TGAT	2	8	16207	16214	25 %	50 %	25 %	0 %	386753533
51	NC_017741	AGTT	2	8	16349	16356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017741	GCTT	2	8	17202	17209	0 %	50 %	25 %	25 %	386753534
53	NC_017741	CGAT	2	8	17436	17443	25 %	25 %	25 %	25 %	386753534
54	NC_017741	ATCT	2	8	17759	17766	25 %	50 %	0 %	25 %	386753534
55	NC_017741	GTTT	2	8	17977	17984	0 %	75 %	25 %	0 %	386753534
56	NC_017741	TGAT	2	8	18320	18327	25 %	50 %	25 %	0 %	386753535
57	NC_017741	TGCT	2	8	18695	18702	0 %	50 %	25 %	25 %	386753535
58	NC_017741	AGCG	2	8	18867	18874	25 %	0 %	50 %	25 %	386753535
59	NC_017741	GGAA	2	8	19300	19307	50 %	0 %	50 %	0 %	386753536
60	NC_017741	ACAA	2	8	19432	19439	75 %	0 %	0 %	25 %	386753536
61	NC_017741	TAAA	2	8	20373	20380	75 %	25 %	0 %	0 %	386753537
62	NC_017741	GCGA	2	8	20382	20389	25 %	0 %	50 %	25 %	386753537
63	NC_017741	AGGC	2	8	20814	20821	25 %	0 %	50 %	25 %	386753537
64	NC_017741	TGAT	2	8	20972	20979	25 %	50 %	25 %	0 %	386753538
65	NC_017741	CTTT	2	8	21239	21246	0 %	75 %	0 %	25 %	386753538
66	NC_017741	AAGT	2	8	21551	21558	50 %	25 %	25 %	0 %	386753538
67	NC_017741	GCTT	2	8	21684	21691	0 %	50 %	25 %	25 %	386753538
68	NC_017741	TTTA	2	8	22138	22145	25 %	75 %	0 %	0 %	386753538
69	NC_017741	CTTT	2	8	22316	22323	0 %	75 %	0 %	25 %	386753538
70	NC_017741	AATC	3	12	22454	22465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017741	GTTT	2	8	23276	23283	0 %	75 %	25 %	0 %	386753540
72	NC_017741	TTCC	2	8	24071	24078	0 %	50 %	0 %	50 %	386753540
73	NC_017741	ATTG	2	8	24237	24244	25 %	50 %	25 %	0 %	386753540
74	NC_017741	TCCC	2	8	24413	24420	0 %	25 %	0 %	75 %	386753540
75	NC_017741	AGCT	2	8	24572	24579	25 %	25 %	25 %	25 %	386753540
76	NC_017741	GATT	2	8	24896	24903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017741	ATTA	2	8	24992	24999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017741	CGCT	2	8	25282	25289	0 %	25 %	25 %	50 %	386753541
79	NC_017741	ATAA	2	8	26113	26120	75 %	25 %	0 %	0 %	386753542
80	NC_017741	GCTC	2	8	27638	27645	0 %	25 %	25 %	50 %	386753543
81	NC_017741	ATGG	2	8	28086	28093	25 %	25 %	50 %	0 %	386753543
82	NC_017741	ATGA	2	8	28349	28356	50 %	25 %	25 %	0 %	386753544
83	NC_017741	TTTA	2	8	28723	28730	25 %	75 %	0 %	0 %	386753544
84	NC_017741	CGTT	2	8	28791	28798	0 %	50 %	25 %	25 %	386753545
85	NC_017741	TGGT	2	8	29241	29248	0 %	50 %	50 %	0 %	386753545
86	NC_017741	AGTC	2	8	29522	29529	25 %	25 %	25 %	25 %	386753546
87	NC_017741	AGCA	2	8	29645	29652	50 %	0 %	25 %	25 %	386753546
88	NC_017741	GGTT	2	8	29872	29879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017741	TTTA	2	8	30006	30013	25 %	75 %	0 %	0 %	386753547
90	NC_017741	CAGA	2	8	30042	30049	50 %	0 %	25 %	25 %	386753547
91	NC_017741	TGAT	2	8	30151	30158	25 %	50 %	25 %	0 %	386753547
92	NC_017741	GCGA	2	8	30204	30211	25 %	0 %	50 %	25 %	386753547
93	NC_017741	ACCC	2	8	30328	30335	25 %	0 %	0 %	75 %	386753548
94	NC_017741	CATC	2	8	30454	30461	25 %	25 %	0 %	50 %	386753548
95	NC_017741	TCAA	2	8	30596	30603	50 %	25 %	0 %	25 %	386753549
96	NC_017741	CATG	2	8	31716	31723	25 %	25 %	25 %	25 %	386753549
97	NC_017741	TTGC	2	8	32220	32227	0 %	50 %	25 %	25 %	386753549
98	NC_017741	GCTT	2	8	32731	32738	0 %	50 %	25 %	25 %	386753549
99	NC_017741	GAAA	2	8	32790	32797	75 %	0 %	25 %	0 %	386753549
100	NC_017741	GATC	2	8	32868	32875	25 %	25 %	25 %	25 %	386753550
101	NC_017741	ATGA	2	8	33071	33078	50 %	25 %	25 %	0 %	386753550
102	NC_017741	TTGT	2	8	34660	34667	0 %	75 %	25 %	0 %	386753553
103	NC_017741	CTTT	2	8	34807	34814	0 %	75 %	0 %	25 %	386753553
104	NC_017741	AATA	2	8	35484	35491	75 %	25 %	0 %	0 %	386753553
105	NC_017741	TAAA	2	8	35506	35513	75 %	25 %	0 %	0 %	386753553
106	NC_017741	GAAA	2	8	35636	35643	75 %	0 %	25 %	0 %	386753554
107	NC_017741	GTGA	2	8	35733	35740	25 %	25 %	50 %	0 %	386753554
108	NC_017741	ATGA	2	8	36213	36220	50 %	25 %	25 %	0 %	386753554
109	NC_017741	AAAC	2	8	36221	36228	75 %	0 %	0 %	25 %	386753554
110	NC_017741	TTTG	2	8	36266	36273	0 %	75 %	25 %	0 %	386753554
111	NC_017741	TGAT	2	8	36756	36763	25 %	50 %	25 %	0 %	386753555
112	NC_017741	AACC	2	8	37428	37435	50 %	0 %	0 %	50 %	386753556
113	NC_017741	AAAC	2	8	37642	37649	75 %	0 %	0 %	25 %	386753556
114	NC_017741	CAAA	2	8	37718	37725	75 %	0 %	0 %	25 %	386753556
115	NC_017741	ATTG	2	8	38132	38139	25 %	50 %	25 %	0 %	386753556
116	NC_017741	ATTG	2	8	38198	38205	25 %	50 %	25 %	0 %	386753556
117	NC_017741	ATCA	2	8	38307	38314	50 %	25 %	0 %	25 %	386753556
118	NC_017741	TCAA	2	8	38320	38327	50 %	25 %	0 %	25 %	386753556
119	NC_017741	TTTC	2	8	38411	38418	0 %	75 %	0 %	25 %	386753556
120	NC_017741	TGAG	2	8	38826	38833	25 %	25 %	50 %	0 %	386753557
121	NC_017741	GATT	2	8	38914	38921	25 %	50 %	25 %	0 %	386753557
122	NC_017741	TGTT	2	8	39096	39103	0 %	75 %	25 %	0 %	386753557
123	NC_017741	CTTT	2	8	39689	39696	0 %	75 %	0 %	25 %	386753557
124	NC_017741	GAGC	2	8	39715	39722	25 %	0 %	50 %	25 %	386753557
125	NC_017741	ATAA	2	8	39943	39950	75 %	25 %	0 %	0 %	386753557
126	NC_017741	GAAA	2	8	39963	39970	75 %	0 %	25 %	0 %	386753558
127	NC_017741	GATC	2	8	40092	40099	25 %	25 %	25 %	25 %	386753558
128	NC_017741	ATGA	2	8	41099	41106	50 %	25 %	25 %	0 %	386753558
129	NC_017741	AACG	2	8	41491	41498	50 %	0 %	25 %	25 %	386753559
130	NC_017741	CAAA	2	8	41938	41945	75 %	0 %	0 %	25 %	386753559
131	NC_017741	GATT	2	8	42250	42257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017741	TGAT	2	8	42484	42491	25 %	50 %	25 %	0 %	386753561
133	NC_017741	AAAC	2	8	42497	42504	75 %	0 %	0 %	25 %	386753561
134	NC_017741	CGCT	2	8	42638	42645	0 %	25 %	25 %	50 %	386753561
135	NC_017741	GTTT	2	8	43260	43267	0 %	75 %	25 %	0 %	386753561
136	NC_017741	CAAA	2	8	43756	43763	75 %	0 %	0 %	25 %	386753562
137	NC_017741	AATC	2	8	44554	44561	50 %	25 %	0 %	25 %	386753562
138	NC_017741	TCGC	2	8	44571	44578	0 %	25 %	25 %	50 %	386753562
139	NC_017741	AGGG	2	8	44582	44589	25 %	0 %	75 %	0 %	386753562
140	NC_017741	GCAA	2	8	45235	45242	50 %	0 %	25 %	25 %	386753562
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