MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi417 chromosome

Total Repeats: 2433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017739	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	386750446
2	NC_017739	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	386750447
3	NC_017739	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	386750447
4	NC_017739	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	386750447
5	NC_017739	TC	3	6	1674	1679	0 %	50 %	0 %	50 %	386750447
6	NC_017739	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	386750449
7	NC_017739	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	386750450
8	NC_017739	CA	3	6	4905	4910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017739	GC	3	6	5751	5756	0 %	0 %	50 %	50 %	386750451
10	NC_017739	AG	3	6	5963	5968	50 %	0 %	50 %	0 %	386750451
11	NC_017739	AG	3	6	8148	8153	50 %	0 %	50 %	0 %	386750453
12	NC_017739	AG	3	6	8965	8970	50 %	0 %	50 %	0 %	386750453
13	NC_017739	AG	3	6	9543	9548	50 %	0 %	50 %	0 %	386750454
14	NC_017739	AG	3	6	9603	9608	50 %	0 %	50 %	0 %	386750454
15	NC_017739	AG	3	6	10430	10435	50 %	0 %	50 %	0 %	386750454
16	NC_017739	AG	3	6	10440	10445	50 %	0 %	50 %	0 %	386750454
17	NC_017739	GA	3	6	10613	10618	50 %	0 %	50 %	0 %	386750456
18	NC_017739	TG	3	6	11686	11691	0 %	50 %	50 %	0 %	386750457
19	NC_017739	GC	3	6	12329	12334	0 %	0 %	50 %	50 %	386750459
20	NC_017739	TC	3	6	12544	12549	0 %	50 %	0 %	50 %	386750459
21	NC_017739	AG	3	6	12763	12768	50 %	0 %	50 %	0 %	386750459
22	NC_017739	AG	4	8	12931	12938	50 %	0 %	50 %	0 %	386750459
23	NC_017739	CA	3	6	14491	14496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017739	GC	3	6	14999	15004	0 %	0 %	50 %	50 %	386750460
25	NC_017739	CG	3	6	15105	15110	0 %	0 %	50 %	50 %	386750460
26	NC_017739	AG	3	6	16382	16387	50 %	0 %	50 %	0 %	386750461
27	NC_017739	CT	3	6	16745	16750	0 %	50 %	0 %	50 %	386750461
28	NC_017739	AG	3	6	17181	17186	50 %	0 %	50 %	0 %	386750462
29	NC_017739	GA	3	6	17372	17377	50 %	0 %	50 %	0 %	386750462
30	NC_017739	GC	3	6	18763	18768	0 %	0 %	50 %	50 %	386750463
31	NC_017739	TC	3	6	21743	21748	0 %	50 %	0 %	50 %	386750466
32	NC_017739	AC	3	6	21834	21839	50 %	0 %	0 %	50 %	386750466
33	NC_017739	GT	3	6	22502	22507	0 %	50 %	50 %	0 %	386750466
34	NC_017739	AG	3	6	23260	23265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017739	GC	3	6	23752	23757	0 %	0 %	50 %	50 %	386750467
36	NC_017739	CG	3	6	23825	23830	0 %	0 %	50 %	50 %	386750467
37	NC_017739	AT	3	6	23833	23838	50 %	50 %	0 %	0 %	386750467
38	NC_017739	GC	3	6	24147	24152	0 %	0 %	50 %	50 %	386750467
39	NC_017739	AC	3	6	24305	24310	50 %	0 %	0 %	50 %	386750467
40	NC_017739	AG	3	6	24315	24320	50 %	0 %	50 %	0 %	386750467
41	NC_017739	CA	3	6	24466	24471	50 %	0 %	0 %	50 %	386750467
42	NC_017739	TA	3	6	24865	24870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017739	TG	3	6	25324	25329	0 %	50 %	50 %	0 %	386750468
44	NC_017739	AG	3	6	25564	25569	50 %	0 %	50 %	0 %	386750468
45	NC_017739	GA	3	6	26196	26201	50 %	0 %	50 %	0 %	386750468
46	NC_017739	AG	3	6	26679	26684	50 %	0 %	50 %	0 %	386750469
47	NC_017739	TC	3	6	26897	26902	0 %	50 %	0 %	50 %	386750470
48	NC_017739	AG	3	6	28589	28594	50 %	0 %	50 %	0 %	386750473
49	NC_017739	AT	3	6	29516	29521	50 %	50 %	0 %	0 %	386750474
50	NC_017739	AG	3	6	30484	30489	50 %	0 %	50 %	0 %	386750474
51	NC_017739	GC	4	8	30825	30832	0 %	0 %	50 %	50 %	386750474
52	NC_017739	AG	3	6	30962	30967	50 %	0 %	50 %	0 %	386750475
53	NC_017739	GC	3	6	31746	31751	0 %	0 %	50 %	50 %	386750477
54	NC_017739	GC	3	6	32454	32459	0 %	0 %	50 %	50 %	386750477
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58	NC_017739	AT	3	6	33398	33403	50 %	50 %	0 %	0 %	386750478
59	NC_017739	AG	3	6	33841	33846	50 %	0 %	50 %	0 %	386750479
60	NC_017739	CT	3	6	35173	35178	0 %	50 %	0 %	50 %	386750480
61	NC_017739	CT	3	6	35245	35250	0 %	50 %	0 %	50 %	386750480
62	NC_017739	TG	3	6	36775	36780	0 %	50 %	50 %	0 %	386750482
63	NC_017739	AG	3	6	36817	36822	50 %	0 %	50 %	0 %	386750482
64	NC_017739	GA	4	8	36911	36918	50 %	0 %	50 %	0 %	386750482
65	NC_017739	AG	3	6	37498	37503	50 %	0 %	50 %	0 %	386750482
66	NC_017739	AG	3	6	38560	38565	50 %	0 %	50 %	0 %	386750483
67	NC_017739	AG	3	6	39538	39543	50 %	0 %	50 %	0 %	386750484
68	NC_017739	CT	3	6	39599	39604	0 %	50 %	0 %	50 %	386750484
69	NC_017739	AG	3	6	40386	40391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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71	NC_017739	CT	3	6	41812	41817	0 %	50 %	0 %	50 %	386750486
72	NC_017739	AG	3	6	43019	43024	50 %	0 %	50 %	0 %	386750486
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81	NC_017739	AG	3	6	48106	48111	50 %	0 %	50 %	0 %	386750492
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83	NC_017739	TG	3	6	49170	49175	0 %	50 %	50 %	0 %	386750492
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89	NC_017739	CT	3	6	56320	56325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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103	NC_017739	AG	3	6	62923	62928	50 %	0 %	50 %	0 %	386750502
104	NC_017739	GA	3	6	62933	62938	50 %	0 %	50 %	0 %	386750502
105	NC_017739	GA	3	6	63520	63525	50 %	0 %	50 %	0 %	386750502
106	NC_017739	TG	3	6	63817	63822	0 %	50 %	50 %	0 %	386750502
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109	NC_017739	GC	3	6	64354	64359	0 %	0 %	50 %	50 %	386750503
110	NC_017739	TC	3	6	64512	64517	0 %	50 %	0 %	50 %	386750503
111	NC_017739	TG	3	6	65193	65198	0 %	50 %	50 %	0 %	386750504
112	NC_017739	CA	3	6	65499	65504	50 %	0 %	0 %	50 %	386750505
113	NC_017739	AG	3	6	65959	65964	50 %	0 %	50 %	0 %	386750505
114	NC_017739	GA	4	8	66541	66548	50 %	0 %	50 %	0 %	386750506
115	NC_017739	AG	3	6	67451	67456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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118	NC_017739	CG	3	6	71400	71405	0 %	0 %	50 %	50 %	386750511
119	NC_017739	TA	5	10	73788	73797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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121	NC_017739	GC	3	6	74803	74808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017739	GA	3	6	75337	75342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017739	CA	3	6	77993	77998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017739	GA	3	6	78165	78170	50 %	0 %	50 %	0 %	386750516
125	NC_017739	GA	3	6	78528	78533	50 %	0 %	50 %	0 %	386750516
126	NC_017739	GC	3	6	79611	79616	0 %	0 %	50 %	50 %	386750516
127	NC_017739	AG	3	6	79876	79881	50 %	0 %	50 %	0 %	386750516
128	NC_017739	CA	3	6	80103	80108	50 %	0 %	0 %	50 %	386750516
129	NC_017739	AG	3	6	80219	80224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017739	GA	3	6	80281	80286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017739	TA	4	8	81244	81251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017739	TA	4	8	81254	81261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017739	AG	3	6	81882	81887	50 %	0 %	50 %	0 %	386750520
134	NC_017739	TG	3	6	83247	83252	0 %	50 %	50 %	0 %	386750521
135	NC_017739	GA	3	6	83961	83966	50 %	0 %	50 %	0 %	386750521
136	NC_017739	CT	3	6	85160	85165	0 %	50 %	0 %	50 %	386750522
137	NC_017739	CT	3	6	86338	86343	0 %	50 %	0 %	50 %	386750522
138	NC_017739	TG	3	6	86359	86364	0 %	50 %	50 %	0 %	386750522
139	NC_017739	CA	3	6	86725	86730	50 %	0 %	0 %	50 %	386750523
140	NC_017739	CA	3	6	86753	86758	50 %	0 %	0 %	50 %	386750523
141	NC_017739	CA	3	6	87315	87320	50 %	0 %	0 %	50 %	386750524
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143	NC_017739	CT	3	6	87819	87824	0 %	50 %	0 %	50 %	386750524
144	NC_017739	CT	3	6	88074	88079	0 %	50 %	0 %	50 %	386750524
145	NC_017739	AG	3	6	88586	88591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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