MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi417 chromosome

Total Repeats: 808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017739	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	386750448
2	NC_017739	GAAACC	2	12	5556	5567	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386750451
3	NC_017739	AAACAC	2	12	16121	16132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017739	AGAAAA	2	12	16471	16482	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386750461
5	NC_017739	GATAAA	2	12	20027	20038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386750464
6	NC_017739	GCGTGG	2	12	28931	28942	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386750474
7	NC_017739	TTGGAT	2	12	29041	29052	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386750474
8	NC_017739	TTGAAT	2	12	30124	30135	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386750474
9	NC_017739	TAAGGA	2	12	30423	30434	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386750474
10	NC_017739	TAGGGG	2	12	31947	31958	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386750477
11	NC_017739	TCACTA	2	12	32328	32339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750477
12	NC_017739	CAGCGC	2	12	32705	32716	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386750478
13	NC_017739	AAAGAA	2	12	33459	33470	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386750478
14	NC_017739	TAGACT	3	18	40342	40359	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017739	CGCAAA	2	12	41202	41213	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386750485
16	NC_017739	TCTTTG	2	12	46673	46684	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386750490
17	NC_017739	TGAAAT	2	12	47173	47184	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386750490
18	NC_017739	TAAAAA	2	12	49325	49336	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386750492
19	NC_017739	AGATAA	2	12	53982	53993	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017739	AAAATC	2	12	54299	54310	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017739	AATTTT	2	12	54511	54522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386750496
22	NC_017739	AGACAA	2	12	55063	55074	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386750497
23	NC_017739	GATGTG	2	12	56002	56013	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017739	TTTTGT	2	12	58296	58307	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386750498
25	NC_017739	AAAGAG	2	12	58575	58586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750498
26	NC_017739	GAAAAA	2	12	60399	60410	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017739	GGACAA	2	12	61942	61953	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386750502
28	NC_017739	AGCGGG	2	12	62567	62578	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386750502
29	NC_017739	AGTAAT	2	12	70187	70198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017739	ACGCCC	2	12	70355	70366	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386750510
31	NC_017739	TAAGGG	2	12	73072	73083	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386750513
32	NC_017739	CGCCCA	2	12	73609	73620	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386750513
33	NC_017739	AAAACA	2	12	74123	74134	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386750514
34	NC_017739	GCGCAT	2	12	76102	76113	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386750515
35	NC_017739	GGCATG	2	12	76414	76425	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386750515
36	NC_017739	GCAACG	2	12	77444	77455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386750515
37	NC_017739	ATATTG	2	12	78329	78340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386750516
38	NC_017739	AACAGG	2	12	86268	86279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386750522
39	NC_017739	ATTAGA	2	12	90266	90277	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386750526
40	NC_017739	GATTTT	2	12	92047	92058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386750528
41	NC_017739	TCAAAA	2	12	93647	93658	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386750529
42	NC_017739	GCGGTG	2	12	94345	94356	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386750530
43	NC_017739	TTAATT	2	12	94880	94891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386750530
44	NC_017739	CAATAT	2	12	97560	97571	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386750531
45	NC_017739	AGCGTT	2	12	104157	104168	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386750536
46	NC_017739	TGCATG	2	12	105967	105978	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386750538
47	NC_017739	TTTTCT	2	12	109723	109734	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386750542
48	NC_017739	TGCAAG	2	12	110129	110140	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386750542
49	NC_017739	GTTAAG	2	12	114661	114672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750547
50	NC_017739	CGCTCG	2	12	114737	114748	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386750547
51	NC_017739	GGGAAG	2	12	116130	116141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386750548
52	NC_017739	TAGGCA	2	12	117273	117284	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386750548
53	NC_017739	CTTCTA	2	12	119611	119622	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386750550
54	NC_017739	GTTCTA	2	12	119743	119754	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386750550
55	NC_017739	GTTCTA	2	12	119947	119958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386750550
56	NC_017739	CTTCTA	2	12	121060	121071	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386750551
57	NC_017739	GTTCTA	2	12	121381	121392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386750551
58	NC_017739	CTAAGG	2	12	122677	122688	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386750552
59	NC_017739	TGAATT	2	12	123211	123222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386750552
60	NC_017739	AGCAAA	2	12	126721	126732	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386750555
61	NC_017739	GTTTTA	2	12	127732	127743	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017739	TCATGA	2	12	129491	129502	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386750560
63	NC_017739	AAAAAT	2	12	136032	136043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386750567
64	NC_017739	ATTCAA	2	12	137119	137130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386750570
65	NC_017739	TAGCGA	2	12	138175	138186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386750571
66	NC_017739	TTAGCG	2	12	141066	141077	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386750573
67	NC_017739	TATCGC	2	12	141278	141289	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386750573
68	NC_017739	ATCGCT	2	12	142986	142997	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386750574
69	NC_017739	ATTGAG	2	12	143633	143644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750575
70	NC_017739	CCTAAA	2	12	145209	145220	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386750576
71	NC_017739	TTCTAT	2	12	146369	146380	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386750577
72	NC_017739	TTGTTT	2	12	149357	149368	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386750582
73	NC_017739	CTTGGG	2	12	150018	150029	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386750584
74	NC_017739	TTGGGT	2	12	154796	154807	0 %	50 %	50 %	0 %	386750589
75	NC_017739	GATTTT	2	12	155308	155319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386750590
76	NC_017739	GATGGC	2	12	158527	158538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386750594
77	NC_017739	GATGGC	2	12	158635	158646	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386750594
78	NC_017739	CCGCTC	2	12	160780	160791	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386750597
79	NC_017739	GCTCTC	2	12	163207	163218	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386750599
80	NC_017739	TAAAAA	2	12	163865	163876	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017739	TTCTAA	2	12	165529	165540	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386750602
82	NC_017739	TCAATA	2	12	167211	167222	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386750604
83	NC_017739	ATCGTT	2	12	167633	167644	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386750604
84	NC_017739	AATTTC	2	12	167984	167995	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386750605
85	NC_017739	TAAAAT	2	12	169508	169519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750606
86	NC_017739	GGTAAT	2	12	170476	170487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750607
87	NC_017739	ATTTTG	2	12	171325	171336	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386750608
88	NC_017739	AAAGAG	2	12	171345	171356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750608
89	NC_017739	GTTTAA	2	12	172587	172598	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386750609
90	NC_017739	CCGCTC	2	12	175240	175251	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386750612
91	NC_017739	GAAAAA	2	12	178883	178894	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386750616
92	NC_017739	AGGCAT	2	12	178972	178983	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386750616
93	NC_017739	GCATTT	2	12	180685	180696	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386750618
94	NC_017739	TCAAAC	2	12	181252	181263	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386750619
95	NC_017739	ATTCTT	2	12	181731	181742	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017739	GGTATT	2	12	185169	185180	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386750621
97	NC_017739	TCTAAA	2	12	185399	185410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386750621
98	NC_017739	TGGGCA	2	12	186468	186479	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386750622
99	NC_017739	TTCTAA	2	12	186947	186958	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386750623
100	NC_017739	ATTTTC	2	12	188892	188903	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386750623
101	NC_017739	TGGGGC	2	12	196293	196304	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386750633
102	NC_017739	AAATCC	2	12	197719	197730	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386750635
103	NC_017739	TTTAAG	2	12	202610	202621	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386750637
104	NC_017739	TAAAGA	2	12	206100	206111	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386750640
105	NC_017739	TATAAT	2	12	207722	207733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017739	ATTCTA	2	12	208047	208058	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386750642
107	NC_017739	GTTTTG	2	12	210323	210334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750643
108	NC_017739	TTATTT	2	12	211955	211966	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386750644
109	NC_017739	TAATTA	2	12	214827	214838	50 %	50 %	0 %	0 %	386750647
110	NC_017739	TAAAGA	2	12	215500	215511	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386750648
111	NC_017739	AGGCTA	2	12	218335	218346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386750652
112	NC_017739	ATTAAA	2	12	221159	221170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017739	AATGCC	2	12	222836	222847	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386750656
114	NC_017739	GCTGTA	2	12	225398	225409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386750658
115	NC_017739	GTGCTA	2	12	227021	227032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386750659
116	NC_017739	GGTGAT	2	12	227080	227091	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386750659
117	NC_017739	TCAATA	2	12	227503	227514	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386750660
118	NC_017739	CACGCC	2	12	227983	227994	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386750660
119	NC_017739	GCTTTG	2	12	229219	229230	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386750661
120	NC_017739	GCTAGG	2	12	230600	230611	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386750662
121	NC_017739	TCTTTA	2	12	236944	236955	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386750669
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126	NC_017739	TCCCGC	2	12	248709	248720	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386750681
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131	NC_017739	TGAGCG	2	12	266858	266869	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386750699
132	NC_017739	AGCTTT	2	12	267006	267017	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386750699
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147	NC_017739	GTAGCG	2	12	300435	300446	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386750725
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235	NC_017739	TTTAAT	2	12	473005	473016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_017739	TTTTTA	2	12	473171	473182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386750901
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342	NC_017739	AAGAAA	2	12	673654	673665	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
343	NC_017739	AATGAG	2	12	673690	673701	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
344	NC_017739	TTTCTT	2	12	675678	675689	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386751081
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465	NC_017739	TGTATA	2	12	936387	936398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386751319
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499	NC_017739	GCCAGT	2	12	1013963	1013974	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386751382
500	NC_017739	CGGATG	2	12	1013985	1013996	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386751382

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