MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi417 chromosome

Total Repeats: 1346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017739	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386750447
2	NC_017739	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	386750448
3	NC_017739	GAAAC	2	10	4645	4654	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017739	TAAAA	2	10	5249	5258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017739	ATAAA	2	10	5268	5277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017739	TTTCT	2	10	6220	6229	0 %	80 %	0 %	20 %	386750451
7	NC_017739	TTGAA	2	10	9718	9727	40 %	40 %	20 %	0 %	386750454
8	NC_017739	TTTTG	2	10	9734	9743	0 %	80 %	20 %	0 %	386750454
9	NC_017739	TGGTG	2	10	10572	10581	0 %	40 %	60 %	0 %	386750456
10	NC_017739	GCTTT	2	10	11399	11408	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017739	TCGAT	2	10	15520	15529	20 %	40 %	20 %	20 %	386750460
12	NC_017739	CAAAA	2	10	16436	16445	80 %	0 %	0 %	20 %	386750461
13	NC_017739	CATCA	2	10	17812	17821	40 %	20 %	0 %	40 %	386750462
14	NC_017739	TGAAA	2	10	18780	18789	60 %	20 %	20 %	0 %	386750463
15	NC_017739	AAAAG	2	10	20796	20805	80 %	0 %	20 %	0 %	386750465
16	NC_017739	CCATG	2	10	20984	20993	20 %	20 %	20 %	40 %	386750466
17	NC_017739	CTCTT	2	10	21014	21023	0 %	60 %	0 %	40 %	386750466
18	NC_017739	ATACC	2	10	23001	23010	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017739	CAAGC	2	10	25609	25618	40 %	0 %	20 %	40 %	386750468
20	NC_017739	TTTTA	2	10	26539	26548	20 %	80 %	0 %	0 %	386750469
21	NC_017739	GATAA	2	10	28627	28636	60 %	20 %	20 %	0 %	386750473
22	NC_017739	GTGGG	2	10	30086	30095	0 %	20 %	80 %	0 %	386750474
23	NC_017739	TGGGG	2	10	31337	31346	0 %	20 %	80 %	0 %	386750476
24	NC_017739	AAGCC	2	10	37112	37121	40 %	0 %	20 %	40 %	386750482
25	NC_017739	AGAAA	2	10	38412	38421	80 %	0 %	20 %	0 %	386750483
26	NC_017739	TACTC	2	10	39265	39274	20 %	40 %	0 %	40 %	386750484
27	NC_017739	TAAAA	2	10	41137	41146	80 %	20 %	0 %	0 %	386750485
28	NC_017739	TCCCA	2	10	42149	42158	20 %	20 %	0 %	60 %	386750486
29	NC_017739	GCTCC	2	10	42470	42479	0 %	20 %	20 %	60 %	386750486
30	NC_017739	TCGCA	2	10	43007	43016	20 %	20 %	20 %	40 %	386750486
31	NC_017739	TGCCT	2	10	45262	45271	0 %	40 %	20 %	40 %	386750488
32	NC_017739	GCTTT	2	10	47541	47550	0 %	60 %	20 %	20 %	386750490
33	NC_017739	TGAAA	2	10	48244	48253	60 %	20 %	20 %	0 %	386750492
34	NC_017739	TCAAA	2	10	48498	48507	60 %	20 %	0 %	20 %	386750492
35	NC_017739	TCGCC	2	10	51241	51250	0 %	20 %	20 %	60 %	386750493
36	NC_017739	TAAAA	2	10	51537	51546	80 %	20 %	0 %	0 %	386750493
37	NC_017739	TCAAA	2	10	52253	52262	60 %	20 %	0 %	20 %	386750493
38	NC_017739	ATTAT	2	10	53220	53229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017739	TTAAA	2	10	53274	53283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017739	ACAAA	2	10	53304	53313	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017739	AAAGA	2	10	53885	53894	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017739	TATCC	2	10	56711	56720	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017739	ATTGG	2	10	59285	59294	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017739	CTACT	2	10	59368	59377	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017739	CAATA	2	10	59507	59516	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017739	AAGAT	2	10	59941	59950	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017739	GACAG	2	10	62285	62294	40 %	0 %	40 %	20 %	386750502
48	NC_017739	GGTGG	2	10	62488	62497	0 %	20 %	80 %	0 %	386750502
49	NC_017739	TCAAT	2	10	65670	65679	40 %	40 %	0 %	20 %	386750505
50	NC_017739	CTTCT	2	10	66512	66521	0 %	60 %	0 %	40 %	386750506
51	NC_017739	TGCCT	2	10	66589	66598	0 %	40 %	20 %	40 %	386750506
52	NC_017739	TCCAA	2	10	67001	67010	40 %	20 %	0 %	40 %	386750507
53	NC_017739	TTTTA	2	10	70280	70289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017739	TTTTG	2	10	70311	70320	0 %	80 %	20 %	0 %	386750510
55	NC_017739	ACGCC	2	10	70617	70626	20 %	0 %	20 %	60 %	386750510
56	NC_017739	AAAGC	2	10	71383	71392	60 %	0 %	20 %	20 %	386750511
57	NC_017739	TTACA	2	10	72165	72174	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017739	ATCTT	2	10	79484	79493	20 %	60 %	0 %	20 %	386750516
59	NC_017739	TGGCT	2	10	80025	80034	0 %	40 %	40 %	20 %	386750516
60	NC_017739	ATGCC	2	10	80448	80457	20 %	20 %	20 %	40 %	386750517
61	NC_017739	TTGAT	2	10	81489	81498	20 %	60 %	20 %	0 %	386750519
62	NC_017739	GGCGT	2	10	83303	83312	0 %	20 %	60 %	20 %	386750521
63	NC_017739	ATTTT	2	10	86347	86356	20 %	80 %	0 %	0 %	386750522
64	NC_017739	ATAAG	2	10	86465	86474	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017739	TAAAA	2	10	86537	86546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017739	CTTTC	2	10	86820	86829	0 %	60 %	0 %	40 %	386750523
67	NC_017739	TTTGA	2	10	89610	89619	20 %	60 %	20 %	0 %	386750526
68	NC_017739	TCTTT	2	10	89821	89830	0 %	80 %	0 %	20 %	386750526
69	NC_017739	GGCTT	2	10	90953	90962	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017739	CGGCA	2	10	93613	93622	20 %	0 %	40 %	40 %	386750529
71	NC_017739	AATTT	2	10	95644	95653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017739	ACGAT	2	10	96092	96101	40 %	20 %	20 %	20 %	386750531
73	NC_017739	TTTTC	2	10	96287	96296	0 %	80 %	0 %	20 %	386750531
74	NC_017739	AATTG	2	10	97943	97952	40 %	40 %	20 %	0 %	386750532
75	NC_017739	TCGTT	2	10	99743	99752	0 %	60 %	20 %	20 %	386750533
76	NC_017739	CAAAA	2	10	102335	102344	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017739	TCTTT	2	10	103047	103056	0 %	80 %	0 %	20 %	386750536
78	NC_017739	TTTAT	2	10	104813	104822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017739	AAAGC	2	10	105814	105823	60 %	0 %	20 %	20 %	386750538
80	NC_017739	GAATG	2	10	107035	107044	40 %	20 %	40 %	0 %	386750540
81	NC_017739	TTTTG	2	10	107847	107856	0 %	80 %	20 %	0 %	386750541
82	NC_017739	CAAAT	2	10	108243	108252	60 %	20 %	0 %	20 %	386750541
83	NC_017739	ACCCT	2	10	109672	109681	20 %	20 %	0 %	60 %	386750542
84	NC_017739	ATGCC	2	10	109804	109813	20 %	20 %	20 %	40 %	386750542
85	NC_017739	TTAAT	2	10	111190	111199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017739	TGATT	2	10	111808	111817	20 %	60 %	20 %	0 %	386750544
87	NC_017739	CTAAA	2	10	112278	112287	60 %	20 %	0 %	20 %	386750546
88	NC_017739	GAATT	2	10	112427	112436	40 %	40 %	20 %	0 %	386750546
89	NC_017739	GGATC	2	10	116302	116311	20 %	20 %	40 %	20 %	386750548
90	NC_017739	AGCTC	2	10	116322	116331	20 %	20 %	20 %	40 %	386750548
91	NC_017739	AAGCC	2	10	118210	118219	40 %	0 %	20 %	40 %	386750549
92	NC_017739	GTTTG	2	10	119571	119580	0 %	60 %	40 %	0 %	386750550
93	NC_017739	CAATC	2	10	120429	120438	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017739	GTTTG	2	10	121020	121029	0 %	60 %	40 %	0 %	386750551
95	NC_017739	TGATC	2	10	121647	121656	20 %	40 %	20 %	20 %	386750551
96	NC_017739	CGCTG	2	10	122549	122558	0 %	20 %	40 %	40 %	386750552
97	NC_017739	TTTGA	2	10	122696	122705	20 %	60 %	20 %	0 %	386750552
98	NC_017739	GACTT	2	10	123230	123239	20 %	40 %	20 %	20 %	386750552
99	NC_017739	ATCTC	2	10	123981	123990	20 %	40 %	0 %	40 %	386750552
100	NC_017739	CGCTT	2	10	124139	124148	0 %	40 %	20 %	40 %	386750552
101	NC_017739	TTTGT	2	10	124499	124508	0 %	80 %	20 %	0 %	386750553
102	NC_017739	TGCGT	2	10	126532	126541	0 %	40 %	40 %	20 %	386750555
103	NC_017739	GAAAA	2	10	126693	126702	80 %	0 %	20 %	0 %	386750555
104	NC_017739	GAAAA	2	10	127011	127020	80 %	0 %	20 %	0 %	386750555
105	NC_017739	ATTTT	2	10	129961	129970	20 %	80 %	0 %	0 %	386750561
106	NC_017739	ATGTT	2	10	130043	130052	20 %	60 %	20 %	0 %	386750561
107	NC_017739	AAAAG	2	10	130455	130464	80 %	0 %	20 %	0 %	386750561
108	NC_017739	TAGGG	2	10	131450	131459	20 %	20 %	60 %	0 %	386750562
109	NC_017739	AAATC	2	10	132715	132724	60 %	20 %	0 %	20 %	386750563
110	NC_017739	AAAAT	2	10	134187	134196	80 %	20 %	0 %	0 %	386750564
111	NC_017739	TTTTC	2	10	136539	136548	0 %	80 %	0 %	20 %	386750569
112	NC_017739	GTAAA	2	10	137091	137100	60 %	20 %	20 %	0 %	386750570
113	NC_017739	TTCTT	2	10	138495	138504	0 %	80 %	0 %	20 %	386750571
114	NC_017739	TCTTT	2	10	138989	138998	0 %	80 %	0 %	20 %	386750572
115	NC_017739	TAATA	2	10	139608	139617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017739	TTTTG	2	10	140151	140160	0 %	80 %	20 %	0 %	386750573
117	NC_017739	AATTC	2	10	140785	140794	40 %	40 %	0 %	20 %	386750573
118	NC_017739	GCGAT	2	10	140944	140953	20 %	20 %	40 %	20 %	386750573
119	NC_017739	GCTTG	2	10	141200	141209	0 %	40 %	40 %	20 %	386750573
120	NC_017739	TTTTG	2	10	141852	141861	0 %	80 %	20 %	0 %	386750574
121	NC_017739	CCAAA	2	10	143692	143701	60 %	0 %	0 %	40 %	386750575
122	NC_017739	TACGC	2	10	147213	147222	20 %	20 %	20 %	40 %	386750577
123	NC_017739	TTATT	2	10	149110	149119	20 %	80 %	0 %	0 %	386750581
124	NC_017739	GCGTT	2	10	149468	149477	0 %	40 %	40 %	20 %	386750583
125	NC_017739	CAAAT	2	10	152342	152351	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017739	AAAAC	2	10	153066	153075	80 %	0 %	0 %	20 %	386750587
127	NC_017739	GGGGA	2	10	153166	153175	20 %	0 %	80 %	0 %	386750587
128	NC_017739	AAGCC	2	10	156302	156311	40 %	0 %	20 %	40 %	386750592
129	NC_017739	GGGTG	2	10	158703	158712	0 %	20 %	80 %	0 %	386750594
130	NC_017739	AACAA	2	10	159605	159614	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017739	ATTCA	2	10	160088	160097	40 %	40 %	0 %	20 %	386750596
132	NC_017739	AAAAC	2	10	162425	162434	80 %	0 %	0 %	20 %	386750598
133	NC_017739	ATCTT	2	10	163490	163499	20 %	60 %	0 %	20 %	386750599
134	NC_017739	TATCA	2	10	171861	171870	40 %	40 %	0 %	20 %	386750608
135	NC_017739	AGCAG	2	10	172518	172527	40 %	0 %	40 %	20 %	386750609
136	NC_017739	ATTTG	2	10	172869	172878	20 %	60 %	20 %	0 %	386750609
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138	NC_017739	TTTCT	2	10	173689	173698	0 %	80 %	0 %	20 %	386750611
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