MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi417 chromosome

Total Repeats: 16734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017739	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750445
2	NC_017739	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750445
3	NC_017739	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750445
4	NC_017739	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386750445
5	NC_017739	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386750445
6	NC_017739	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750446
7	NC_017739	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750446
8	NC_017739	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386750446
9	NC_017739	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750446
10	NC_017739	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750446
11	NC_017739	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750447
12	NC_017739	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386750447
13	NC_017739	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386750447
14	NC_017739	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386750447
15	NC_017739	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386750447
16	NC_017739	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386750447
17	NC_017739	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750447
18	NC_017739	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750447
19	NC_017739	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750448
20	NC_017739	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750448
21	NC_017739	ACT	2	6	1862	1867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750448
22	NC_017739	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750448
23	NC_017739	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750448
24	NC_017739	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750448
25	NC_017739	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750448
26	NC_017739	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750448
27	NC_017739	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750448
28	NC_017739	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386750448
29	NC_017739	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017739	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386750449
31	NC_017739	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750449
32	NC_017739	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750449
33	NC_017739	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750449
34	NC_017739	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386750449
35	NC_017739	TTG	2	6	3217	3222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750450
36	NC_017739	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750450
37	NC_017739	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750450
38	NC_017739	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386750450
39	NC_017739	TGG	2	6	3976	3981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750450
40	NC_017739	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017739	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017739	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017739	TGG	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017739	GTG	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017739	ACC	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017739	GGT	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017739	AAT	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017739	TAC	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017739	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017739	CAT	2	6	5441	5446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750451
51	NC_017739	GCC	2	6	5447	5452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386750451
52	NC_017739	TCT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
53	NC_017739	AAT	2	6	5606	5611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750451
54	NC_017739	CTT	2	6	5614	5619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
55	NC_017739	CAT	2	6	5704	5709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750451
56	NC_017739	ATG	2	6	5757	5762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750451
57	NC_017739	TCA	2	6	5781	5786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750451
58	NC_017739	CCA	2	6	5838	5843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386750451
59	NC_017739	CTT	2	6	5854	5859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
60	NC_017739	CAT	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750451
61	NC_017739	CAT	2	6	6058	6063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750451
62	NC_017739	GTG	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750451
63	NC_017739	TTC	2	6	6170	6175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
64	NC_017739	TAA	2	6	6178	6183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750451
65	NC_017739	CCG	2	6	6189	6194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386750451
66	NC_017739	CAC	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386750451
67	NC_017739	GAT	2	6	6332	6337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750451
68	NC_017739	TAG	2	6	6371	6376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750451
69	NC_017739	CTT	2	6	6544	6549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
70	NC_017739	TCT	2	6	6654	6659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
71	NC_017739	CTT	2	6	6670	6675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
72	NC_017739	TAA	2	6	6697	6702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750451
73	NC_017739	CGG	2	6	6826	6831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386750451
74	NC_017739	CTT	2	6	6853	6858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
75	NC_017739	AAT	2	6	7091	7096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017739	ACA	2	6	7173	7178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386750452
77	NC_017739	TCT	2	6	7207	7212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750452
78	NC_017739	CTT	2	6	7289	7294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750452
79	NC_017739	GAT	3	9	7377	7385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750452
80	NC_017739	TCT	2	6	7405	7410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750452
81	NC_017739	CTA	2	6	7421	7426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750452
82	NC_017739	TAA	2	6	7568	7573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017739	ATT	2	6	7587	7592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017739	CAA	2	6	7655	7660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017739	GAA	2	6	7716	7721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017739	TTG	2	6	7836	7841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750453
87	NC_017739	GAA	2	6	7852	7857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750453
88	NC_017739	TTA	2	6	8031	8036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386750453
89	NC_017739	AGA	2	6	8046	8051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750453
90	NC_017739	ACC	2	6	8054	8059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386750453
91	NC_017739	AAG	2	6	8087	8092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750453
92	NC_017739	ATT	2	6	8120	8125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386750453
93	NC_017739	CAT	2	6	8301	8306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750453
94	NC_017739	GTG	2	6	8335	8340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750453
95	NC_017739	ATG	2	6	8615	8620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750453
96	NC_017739	AGG	2	6	8680	8685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386750453
97	NC_017739	AAC	2	6	8707	8712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386750453
98	NC_017739	AGA	2	6	9093	9098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750453
99	NC_017739	TTG	2	6	9106	9111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750453
100	NC_017739	GAC	2	6	9193	9198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386750453
101	NC_017739	TTA	3	9	9214	9222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386750453
102	NC_017739	TTG	2	6	9271	9276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750453
103	NC_017739	TGT	2	6	9457	9462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750454
104	NC_017739	TGT	2	6	9625	9630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750454
105	NC_017739	AAG	2	6	9784	9789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750454
106	NC_017739	GTT	2	6	9899	9904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750454
107	NC_017739	TAA	2	6	10094	10099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750454
108	NC_017739	TGG	3	9	10195	10203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750454
109	NC_017739	GAA	3	9	10212	10220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750454
110	NC_017739	TGG	2	6	10294	10299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750454
111	NC_017739	AGA	2	6	10316	10321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750454
112	NC_017739	AGG	2	6	10541	10546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386750455
113	NC_017739	TTA	2	6	10628	10633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386750456
114	NC_017739	GAA	2	6	10645	10650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750456
115	NC_017739	GTT	2	6	10712	10717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750456
116	NC_017739	ATT	2	6	10735	10740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386750456
117	NC_017739	GAA	2	6	10941	10946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750456
118	NC_017739	AAT	2	6	11017	11022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750456
119	NC_017739	CAA	2	6	11116	11121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386750456
120	NC_017739	CTA	2	6	11174	11179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750456
121	NC_017739	TTG	2	6	11261	11266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750456
122	NC_017739	AGA	2	6	11313	11318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750456
123	NC_017739	ATA	2	6	11478	11483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017739	GTG	2	6	11738	11743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750457
125	NC_017739	GAA	2	6	11829	11834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750458
126	NC_017739	ATT	3	9	12016	12024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386750458
127	NC_017739	GAA	2	6	12155	12160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750459
128	NC_017739	AAC	2	6	12161	12166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386750459
129	NC_017739	ATG	2	6	12180	12185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750459
130	NC_017739	TGG	2	6	12216	12221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750459
131	NC_017739	TCC	2	6	12225	12230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386750459
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133	NC_017739	AAG	2	6	12426	12431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750459
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