MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Helicobacter cetorum MIT 00-7128 plasmid pHCW

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017738	A	7	7	385	391	100 %	0 %	0 %	0 %	386748712
2	NC_017738	A	8	8	467	474	100 %	0 %	0 %	0 %	386748712
3	NC_017738	A	7	7	814	820	100 %	0 %	0 %	0 %	386748713
4	NC_017738	A	6	6	1138	1143	100 %	0 %	0 %	0 %	386748713
5	NC_017738	C	6	6	1151	1156	0 %	0 %	0 %	100 %	386748713
6	NC_017738	A	7	7	1170	1176	100 %	0 %	0 %	0 %	386748713
7	NC_017738	A	7	7	1198	1204	100 %	0 %	0 %	0 %	386748713
8	NC_017738	A	6	6	1481	1486	100 %	0 %	0 %	0 %	386748713
9	NC_017738	A	6	6	1872	1877	100 %	0 %	0 %	0 %	386748714
10	NC_017738	A	6	6	1914	1919	100 %	0 %	0 %	0 %	386748714
11	NC_017738	A	6	6	2175	2180	100 %	0 %	0 %	0 %	386748714
12	NC_017738	A	7	7	2261	2267	100 %	0 %	0 %	0 %	386748715
13	NC_017738	A	6	6	2572	2577	100 %	0 %	0 %	0 %	386748716
14	NC_017738	A	7	7	2610	2616	100 %	0 %	0 %	0 %	386748716
15	NC_017738	A	6	6	3185	3190	100 %	0 %	0 %	0 %	386748716
16	NC_017738	A	7	7	3244	3250	100 %	0 %	0 %	0 %	386748716
17	NC_017738	T	6	6	3254	3259	0 %	100 %	0 %	0 %	386748716
18	NC_017738	T	7	7	3304	3310	0 %	100 %	0 %	0 %	386748716
19	NC_017738	A	6	6	3452	3457	100 %	0 %	0 %	0 %	386748716
20	NC_017738	A	6	6	3828	3833	100 %	0 %	0 %	0 %	386748716
21	NC_017738	A	6	6	3898	3903	100 %	0 %	0 %	0 %	386748716
22	NC_017738	A	6	6	3981	3986	100 %	0 %	0 %	0 %	386748716
23	NC_017738	T	6	6	3990	3995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017738	A	7	7	4009	4015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017738	T	6	6	4084	4089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017738	A	6	6	4110	4115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017738	T	6	6	4138	4143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017738	T	7	7	4145	4151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017738	T	7	7	4433	4439	0 %	100 %	0 %	0 %	386748717
30	NC_017738	A	6	6	4576	4581	100 %	0 %	0 %	0 %	386748718
31	NC_017738	A	6	6	4643	4648	100 %	0 %	0 %	0 %	386748718
32	NC_017738	T	6	6	4809	4814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017738	T	6	6	4833	4838	0 %	100 %	0 %	0 %	386748719
34	NC_017738	T	6	6	5225	5230	0 %	100 %	0 %	0 %	386748719
35	NC_017738	T	6	6	5268	5273	0 %	100 %	0 %	0 %	386748719
36	NC_017738	G	6	6	5567	5572	0 %	0 %	100 %	0 %	386748719
37	NC_017738	T	6	6	5994	5999	0 %	100 %	0 %	0 %	386748719
38	NC_017738	T	7	7	6041	6047	0 %	100 %	0 %	0 %	386748719
39	NC_017738	T	6	6	6056	6061	0 %	100 %	0 %	0 %	386748719
40	NC_017738	G	7	7	6139	6145	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017738	T	6	6	6168	6173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017738	T	6	6	6189	6194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017738	T	6	6	6222	6227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017738	A	6	6	6277	6282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017738	T	6	6	6338	6343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017738	T	6	6	6396	6401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017738	T	6	6	6466	6471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017738	T	6	6	6617	6622	0 %	100 %	0 %	0 %	386748720
49	NC_017738	T	6	6	6689	6694	0 %	100 %	0 %	0 %	386748721
50	NC_017738	T	6	6	7888	7893	0 %	100 %	0 %	0 %	386748721
51	NC_017738	T	6	6	7904	7909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017738	A	6	6	7995	8000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017738	A	6	6	8016	8021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017738	A	6	6	8049	8054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017738	T	6	6	8162	8167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017738	A	6	6	9595	9600	100 %	0 %	0 %	0 %	386748722
57	NC_017738	T	6	6	10363	10368	0 %	100 %	0 %	0 %	386748723
58	NC_017738	T	6	6	10370	10375	0 %	100 %	0 %	0 %	386748723
59	NC_017738	T	7	7	10436	10442	0 %	100 %	0 %	0 %	386748723
60	NC_017738	G	6	6	10549	10554	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017738	G	7	7	10559	10565	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017738	A	6	6	10831	10836	100 %	0 %	0 %	0 %	386748724
63	NC_017738	A	6	6	10843	10848	100 %	0 %	0 %	0 %	386748724
64	NC_017738	T	6	6	11255	11260	0 %	100 %	0 %	0 %	386748725
65	NC_017738	T	6	6	11577	11582	0 %	100 %	0 %	0 %	386748725
66	NC_017738	T	6	6	11739	11744	0 %	100 %	0 %	0 %	386748725
67	NC_017738	T	6	6	11857	11862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017738	T	6	6	11869	11874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017738	T	6	6	11889	11894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017738	A	6	6	12101	12106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017738	T	6	6	12114	12119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017738	T	6	6	12180	12185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017738	T	6	6	12283	12288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017738	T	7	7	12318	12324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.