MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter cetorum MIT 00-7128 plasmid pHCW

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017738	GGA	2	6	1	6	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017738	TTA	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017738	CTG	2	6	116	121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017738	AGT	2	6	148	153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017738	AAC	2	6	190	195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748712
6	NC_017738	ATT	2	6	224	229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748712
7	NC_017738	AGA	2	6	230	235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386748712
8	NC_017738	CAA	2	6	395	400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748712
9	NC_017738	AAC	2	6	435	440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748712
10	NC_017738	GTT	2	6	499	504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017738	ATG	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017738	GAT	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748713
13	NC_017738	ACT	2	6	800	805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748713
14	NC_017738	GAT	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748713
15	NC_017738	TGA	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748713
16	NC_017738	TAA	3	9	1020	1028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748713
17	NC_017738	TGA	2	6	1032	1037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748713
18	NC_017738	CCA	2	6	1184	1189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386748713
19	NC_017738	ACA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748713
20	NC_017738	TTA	2	6	1242	1247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748713
21	NC_017738	ACT	2	6	1291	1296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748713
22	NC_017738	AAG	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386748713
23	NC_017738	ACA	2	6	1629	1634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017738	TTA	2	6	1741	1746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017738	TTA	2	6	1776	1781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017738	ACT	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748714
27	NC_017738	TAA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748714
28	NC_017738	TTG	2	6	2029	2034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748714
29	NC_017738	CAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748714
30	NC_017738	ACA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748714
31	NC_017738	TGA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748714
32	NC_017738	TGA	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748715
33	NC_017738	GAT	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748715
34	NC_017738	ACC	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386748716
35	NC_017738	ATT	2	6	2582	2587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748716
36	NC_017738	TAG	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748716
37	NC_017738	CCA	2	6	2691	2696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386748716
38	NC_017738	TGA	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748716
39	NC_017738	AAT	2	6	2795	2800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748716
40	NC_017738	ACC	2	6	2814	2819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386748716
41	NC_017738	TTA	2	6	2835	2840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748716
42	NC_017738	CAA	2	6	2845	2850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748716
43	NC_017738	ATG	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748716
44	NC_017738	TAA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748716
45	NC_017738	TGA	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748716
46	NC_017738	GAA	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386748716
47	NC_017738	CTA	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748716
48	NC_017738	ACC	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386748716
49	NC_017738	TTG	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017738	CTT	2	6	4458	4463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748717
51	NC_017738	TGA	2	6	4599	4604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748718
52	NC_017738	CAA	2	6	4639	4644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748718
53	NC_017738	TTG	2	6	4729	4734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748718
54	NC_017738	TAA	2	6	4857	4862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748719
55	NC_017738	CTT	2	6	5096	5101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748719
56	NC_017738	TAA	2	6	5219	5224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748719
57	NC_017738	CTA	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748719
58	NC_017738	TTG	2	6	5368	5373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748719
59	NC_017738	ATA	2	6	5535	5540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748719
60	NC_017738	TTA	2	6	5707	5712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748719
61	NC_017738	ATC	2	6	5736	5741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748719
62	NC_017738	TAG	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748719
63	NC_017738	ACT	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017738	ACT	2	6	6184	6189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017738	ACT	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017738	TAA	2	6	6267	6272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017738	GTA	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017738	TTG	2	6	6483	6488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017738	TAA	2	6	6713	6718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748721
70	NC_017738	CTT	2	6	6952	6957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748721
71	NC_017738	TAA	2	6	7075	7080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748721
72	NC_017738	CTA	2	6	7201	7206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748721
73	NC_017738	TTG	2	6	7224	7229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748721
74	NC_017738	ATA	2	6	7391	7396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748721
75	NC_017738	TAA	2	6	7454	7459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748721
76	NC_017738	TTG	2	6	7563	7568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748721
77	NC_017738	TCT	2	6	7593	7598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748721
78	NC_017738	CAA	2	6	7600	7605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748721
79	NC_017738	TTA	2	6	7819	7824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748721
80	NC_017738	GTT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748722
81	NC_017738	TTG	2	6	8351	8356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748722
82	NC_017738	AAG	2	6	8362	8367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386748722
83	NC_017738	GTT	2	6	8475	8480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748722
84	NC_017738	TTG	2	6	8564	8569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748722
85	NC_017738	TAG	2	6	8690	8695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748722
86	NC_017738	CTG	2	6	8791	8796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386748722
87	NC_017738	GTA	2	6	8869	8874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748722
88	NC_017738	CTT	2	6	8905	8910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748722
89	NC_017738	CTT	2	6	9046	9051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748722
90	NC_017738	ATG	2	6	9126	9131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748722
91	NC_017738	TTG	2	6	9231	9236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748722
92	NC_017738	TTG	2	6	9243	9248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748722
93	NC_017738	TGT	2	6	9290	9295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748722
94	NC_017738	TAG	2	6	9322	9327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748722
95	NC_017738	GTT	2	6	9329	9334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748722
96	NC_017738	ATT	2	6	9408	9413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748722
97	NC_017738	GTA	2	6	9495	9500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748722
98	NC_017738	ATG	2	6	9604	9609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748722
99	NC_017738	GTT	2	6	9713	9718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748722
100	NC_017738	TGT	2	6	9917	9922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748722
101	NC_017738	TCA	2	6	9991	9996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748722
102	NC_017738	GTT	2	6	10209	10214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748723
103	NC_017738	TGA	2	6	10220	10225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748723
104	NC_017738	TTA	2	6	10271	10276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748723
105	NC_017738	TTA	2	6	10343	10348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748723
106	NC_017738	CTT	2	6	10997	11002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748724
107	NC_017738	AGG	2	6	11093	11098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386748724
108	NC_017738	TAT	2	6	11106	11111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748725
109	NC_017738	AGT	2	6	11615	11620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748725
110	NC_017738	AAC	2	6	11780	11785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748725
111	NC_017738	GTT	2	6	11896	11901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017738	CTA	2	6	11907	11912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017738	ATC	2	6	11994	11999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017738	ATT	2	6	12064	12069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017738	TAT	2	6	12074	12079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017738	TAA	2	6	12354	12359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017738	GTT	2	6	12382	12387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.