MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 plasmid pHCD

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017736	ATTTA	2	10	203	212	40 %	60 %	0 %	0 %	386747021
2	NC_017736	ATTTT	2	10	561	570	20 %	80 %	0 %	0 %	386747021
3	NC_017736	ACTAC	2	10	1140	1149	40 %	20 %	0 %	40 %	386747021
4	NC_017736	AAATC	2	10	2516	2525	60 %	20 %	0 %	20 %	386747024
5	NC_017736	TTGAT	2	10	2963	2972	20 %	60 %	20 %	0 %	386747025
6	NC_017736	CAAGG	2	10	3253	3262	40 %	0 %	40 %	20 %	386747025
7	NC_017736	AATTA	2	10	5752	5761	60 %	40 %	0 %	0 %	386747026
8	NC_017736	ATTTA	2	10	6351	6360	40 %	60 %	0 %	0 %	386747027
9	NC_017736	ATTTT	2	10	6709	6718	20 %	80 %	0 %	0 %	386747027
10	NC_017736	ACTAC	2	10	7288	7297	40 %	20 %	0 %	40 %	386747027
11	NC_017736	ATCAT	2	10	9116	9125	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017736	TCAAA	2	10	10392	10401	60 %	20 %	0 %	20 %	386747031
13	NC_017736	TAATG	2	10	10525	10534	40 %	40 %	20 %	0 %	386747031
14	NC_017736	TTGTT	2	10	10633	10642	0 %	80 %	20 %	0 %	386747031
15	NC_017736	ACAAG	2	10	12630	12639	60 %	0 %	20 %	20 %	386747035
16	NC_017736	AAAAT	2	10	12906	12915	80 %	20 %	0 %	0 %	386747035
17	NC_017736	AACCT	2	10	13062	13071	40 %	20 %	0 %	40 %	386747035
18	NC_017736	CCAAG	2	10	13532	13541	40 %	0 %	20 %	40 %	386747035
19	NC_017736	AACAA	2	10	13552	13561	80 %	0 %	0 %	20 %	386747035
20	NC_017736	ATTTG	2	10	14026	14035	20 %	60 %	20 %	0 %	386747035

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.